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改进残差网络的肾细胞癌ISUP分级研究

计算机工程与应用 2024年第2期60卷 221-230页

作者：孙振铎张明洋王向辉赵磊刘爽崔振宇杨昆刘琨河北大学质量技术监督学院河北保定071002 河北省新能源汽车动力系统轻量化技术创新中心河北保定071002 河北大学光学工程博士后科研流动站河北保定071002 河北大学附属医院泌尿外科河北保定071000

术前预测透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)的分级可有效评估患者的预后并指导临床治疗,但实现精准预测是目前本领域内的一项重要问题。该研究首先确定最优建模的CT类型与网络层数,提出了一种基于改进残差网络的... 详细信息

术前预测透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)的分级可有效评估患者的预后并指导临床治疗,但实现精准预测是目前本领域内的一项重要问题。该研究首先确定最优建模的CT类型与网络层数,提出了一种基于改进残差网络的ccRCC的CT影像分级模型,具体包括:利用大卷积操作对图像进行原始特征提取,利用混合注意力模块通过计算特征图中当前空间和临近空间以及当前空间和远距离空间之间的信息交互获取更多有用的特征,使得原始图像特征图在通道维度与空间维度上进行自适应特征细化,利用四个深度卷积网络层提取图像深度特征,并利用改进通道注意力模块产生通道注意力特征图信息,提取更多通道上的交互信息。实验结果表明,增强CT实质期图像和34层残差网络最有利于分级预测模型的开发,所提出的模型的总体加权准确率、AUC、精度、召回率和F1分数分别为90.8%、0.897、90.5%、90.8%、90.9%,各项指标优于其他常见网络结构,因此,该模型在预测ccRCC的国际泌尿病理学学会(International Society of Urological Pathology,ISUP)分级方面有良好的效能,对患者的临床辅助诊断和预后治疗具有重要的理论指导意义。

关键词：透明细胞肾细胞癌(ccRCC) ISUP分级 CT 增强CT实质期通道注意力空间注意力

微塑料PVC与磺胺甲恶唑联合暴露大型溞引发的急慢性毒理效应

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水生生物学报 2024年第3期48卷 413-425页

作者：修文洁闫淼顾冀海柳峰松张玉明河北大学生命科学学院保定071002 河北省动物系统学与应用重点实验室保定071002

为研究微塑料和抗生素的联合毒性效应与机制,文章以大型溞(Daphnia magna)为受试生物,以聚氯乙烯(Polyvinyl chloride,PVC)和磺胺甲恶唑(Sulfamethoxazole,SMZ)为代表性污染物,开展污染物吸附互作和联合暴露实验(包括48h急性和21d慢性... 详细信息

为研究微塑料和抗生素的联合毒性效应与机制,文章以大型溞(Daphnia magna)为受试生物,以聚氯乙烯(Polyvinyl chloride,PVC)和磺胺甲恶唑(Sulfamethoxazole,SMZ)为代表性污染物,开展污染物吸附互作和联合暴露实验(包括48h急性和21d慢性毒性实验),关注污染物暴露对大型溞的生长生殖、氧化应激、肠道损伤和行为运动指标变化。结果显示,PVC对SMZ具有物理吸附作用;在48h急性毒理实验中,PVC(1 mg/L)的存在减少了大型溞体内SMZ的含量,从而降低了SMZ的致死率;在21d慢性毒理实验中,SMZ单独或者与PVC(1 mg/L)联合暴露对大型溞致死率、蜕皮数和体长无明显影响,但均会引发大型溞氧化应激和肠道损伤,降低其运动能力,并且PVC会加剧SMZ诱发的上述毒性效应。研究发现,与短期暴露(48h)相比,慢性毒性实验(21d)更能真实反馈PVC和SMZ的联合毒性;两类污染物在水环境中长期共存时,微塑料对抗生素的毒性增强作用需引起重视。研究可为微塑料-抗生素共存时的环境健康风险评估提供数据参考。

关键词：磺胺甲恶唑微塑料大型溞肠道损伤运动行为

河北省典型湿地沉积物中抗生素抗性基因分布特征及其影响因素

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中国生态农业学报(中英文) 2024年

作者：刘韵超胡亚宁龚玉敏郑子英丁林李银辉刘瑾王凤花河北师范大学地理科学学院/河北省环境演变与生态建设重点实验室/河北省环境变化遥感识别技术创新中心/河北省地理科学实验教学示范中心

抗生素抗性基因（antibiotic resistance genes， ARGs）在环境中的污染扩散导致的生态安全和健康风险已成为全球关注的热点问题。湿地生态系统作为人类活动与自然环境之间重要的生态屏障，具有较高的生态、社会和经济价值。本文以河... 详细信息

抗生素抗性基因（antibiotic resistance genes， ARGs）在环境中的污染扩散导致的生态安全和健康风险已成为全球关注的热点问题。湿地生态系统作为人类活动与自然环境之间重要的生态屏障，具有较高的生态、社会和经济价值。本文以河北省典型滨海湖泊湿地（曹妃甸和南大港）和内陆淡水湿地（白洋淀和衡水湖）为研究区域，采集表层沉积物样品，采用定量PCR和高通量测序技术，解析了河北省典型湿地沉积物ARGs的分布特征及其影响因素。结果表明，在所有湿地沉积物中均检出2种磺胺类、8种四环素类ARGs和1种整合酶基因（intI1）。南大港湿地沉积物中ARGs总丰度[4.14×108copies·g-1（干土）]显著高于曹妃甸[1.21×108copies·g-1（干土）]、白洋淀[1.11×108copies·g-1（干土）]和衡水湖[1.97×108copies·g-1（干土）]沉积物ARGs总丰度（P＜0.05）。四环素类ARGs绝对丰度为8.91×103（tetM）～8.42×107（tetX） copies·g-1（干土），磺胺类ARGs绝对丰度为9.63×105（sul2）～2.62×107（sul1） copies·g-1（干土）。intI1基因检出丰度为3.26×105～1.11×108copies·g-1（干土），且intI1基因与tetA、tetL、sul1、sul2基因显著正相关（P＜0.05），说明intI1基因在湿地沉积物ARGs的传播中起着重要作用。此外，高通量测序结果表明曹妃甸和南大港沉积物细菌的Shannon和Simpson指数显著高于衡水湖。非度量多维度分析（NMDS）结果表明，曹妃甸、南大港、白洋淀和衡水湖沉积物细菌Beta多样性无显著差异（ANOSIM: P＞0.05）。进一步通过方差分解分析发现，沉积物理化性质（pH、TP等）和细菌群落对ARGs分布的总解释率为60.78%，其中细菌群落解释率为37.42%，说明细菌群落是影响ARGs分布的重要因素。本研究为评估河北省典型湿地沉积物中ARGs的污染现状提供了数据参考，为保护湿地生态系统安全提供了科学依据。

关键词：湿地沉积物抗生素抗性基因 intI1基因细菌群落结构

脂肪干细胞源性外泌体对体外巨噬细胞迁移能力的影响

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吉林大学学报（医学版） 2024年第3期50卷 718-727页

作者：袁博谢佳忆江思瑜孟亚军朱清华李晓飞付秀美谢利德承德医学院基础医学院人体解剖学教研室河北承德067000 承德护理职业学院病原生物与免疫教研室河北承德067000 河北省神经损伤与修复重点实验室河北承德067000 清华大学信息科学技术学院自动化系北京100062 河北医科大学第一医院中心实验室河北石家庄050000

目的:探讨脂肪干细胞源性外泌体(ADSC-Exos)对巨噬细胞RAW264.7迁移能力的影响,阐明其促进巨噬细胞功能的作用。方法:分离SD大鼠附睾旁脂肪组织,进行脂肪源性干细胞(ADSCs)原代培养,通过成脂和成骨分化诱导,结合油红O和茜素红染色检测AD... 详细信息

目的:探讨脂肪干细胞源性外泌体(ADSC-Exos)对巨噬细胞RAW264.7迁移能力的影响,阐明其促进巨噬细胞功能的作用。方法:分离SD大鼠附睾旁脂肪组织,进行脂肪源性干细胞(ADSCs)原代培养,通过成脂和成骨分化诱导,结合油红O和茜素红染色检测ADSCs的多向分化潜能。采用Western blotting法和免疫荧光法检测ADSCs标记物CD29及CD44阳性表达情况,采用外泌体(Exos)分离试剂盒提取ADSC-Exos,透射电子显微镜和纳米颗粒跟踪分析仪检测ADSC-Exos的形态大小和粒径分布范围,Western blotting法检测Exos特异性标记物CD9和TSG101蛋白表达情况,示踪法观察巨噬细胞摄取ADSC-Exos情况。将巨噬细胞RAW264.7分为对照组、10 mg·L^(-1)ADSCExos组、20 mg·L^(-1)ADSC-Exos组和40 mg·L^(-1)ADSC-Exos组。5-乙基-2'-脱氧尿苷(EdU)染色检测各组巨噬细胞活性,Transwell小室实验检测各组巨噬细胞迁移细胞数,荧光显微镜观察各组巨噬细胞黏附情况。结果:原代ADSCs培养24 h后细胞贴壁生长,呈散在、长梭形;培养7 d,贴壁细胞呈齿梳状、旋涡状有序排列,呈成纤维细胞样外观;培养10代后ADSCs形态不规则,增殖速度减慢。分离提取的ADSCs具有成骨和成脂分化潜能,CD29和CD44蛋白表达阳性。透射电子显微镜下ADSC-Exos呈茶碟状,ADSC-Exos的粒径主峰分布于132 nm附近,ADSC-Exos中CD9和TSG101蛋白表达阳性,即ADSC-Exos提取成功。荧光显微镜下RAW264.7细胞核周围可检测到红色荧光信号,即ADSC-Exos可以被巨噬细胞摄取。与对照组比较,10、20和40 mg·L^(-1)ADSC-Exos组EdU阳性细胞率均明显升高(P<0.05);与10 mg·L^(-1)ADSC-Exos组比较,20 mg·L^(-1)ADSC-Exos组EdU阳性细胞率均明显升高(P<0.05)。与对照组比较,10、20和40 mg·L^(-1)ADSC-Exos组巨噬细胞迁移细胞数均明显增加(P<0.05);与10 mg·L^(-1)ADSC-Exos组比较,20和40 mg·L^(-1)ADSC-Exos组巨噬细胞迁移细胞数均明显增加(P<0.05)。与对照组比较,10、20和40 mg·L^(-1)ADSC-Exos组巨噬细胞黏附细胞数均明显增加(P<0.05);与10 mg·L^(-1)ADSC-Exos组比较,20 mg·L^(-1)ADSCExos组巨噬细胞黏附细胞数明显增加(P<0.05)。结论:ADSC-Exos可被巨噬细胞摄取,其通过影响细胞黏附提高巨噬细胞的迁移能力。

关键词：脂肪干细胞外泌体巨噬细胞细胞迁移细胞黏附

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城市街尘重金属分布特征、风险评价及源解析——以石家庄市为例

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中国生态农业学报(中英文) 2024年

作者：刘红丁林吴赞刘瑾王凤花河北师范大学地理科学学院/河北省环境演变与生态建设重点实验室北京市科学技术研究院分析测试研究所/北京市理化分析测试中心

为了从源头有效控制城市重金属污染，本研究于夏冬两季测定了石家庄市不同功能区街尘中的重金属（Pb、Cr、Cu、Mn、Cd、Zn）含量，结合单因子污染指数、内梅罗综合污染指数、潜在生态风险指数法和正交矩阵因子模型，分析其时空分布... 详细信息

为了从源头有效控制城市重金属污染，本研究于夏冬两季测定了石家庄市不同功能区街尘中的重金属（Pb、Cr、Cu、Mn、Cd、Zn）含量，结合单因子污染指数、内梅罗综合污染指数、潜在生态风险指数法和正交矩阵因子模型，分析其时空分布特征、污染程度、生态风险及可能污染源。结果表明， 1)除冬季Mn外，其余重金属平均含量均高于石家庄市土壤背景值。其中，冬季Cd平均含量为0.95 mg·kg-1，是背景值的10.56倍，超标率高达86%。总体上，冬季各重金属的生态风险程度均高于夏季，其中夏冬两季Cd的单因子生态风险指数分别为177.81和316.93，属强生态风险，冬季Pb为中等生态风险，其余重金属为轻微生态风险。2)不同城市功能区街尘重金属污染程度均为重度污染， Cd和Pb是主要重金属污染物，公园区污染最严重，其次为商业区。各城市功能区街尘重金属的综合潜在生态风险程度冬季较夏季均有增加趋势。其中，冬季公园区为极强生态风险区域。3)交通释放、工业排放、燃料燃烧是重金属Pb、Cu、Cd和Zn的主要来源，自然源是Cr和Mn的主要贡献源。城市街尘污染控制应重点关注冬季公园区以及人流车流量大的区域，在降低生态风险方面应侧重对街尘中的Cd和Pb进行精准控制。

关键词：街尘重金属时空变化污染评价源解析

基于Cook距离的阻尼多道奇异谱分析分离绕射波

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石油地球物理勘探 2024年第4期59卷 771-781页

作者：霍伟光曹静杰陈雪赵惊涛赵石峰蔡志成河北地质大学自然资源部京津冀城市群地下空间智能探测与装备重点实验室河北石家庄050031 河北地质大学河北省战略性关键矿产资源重点实验室河北石家庄050031 河北地质大学数理教学部河北石家庄050031 河北地质大学地球科学学院河北石家庄050031 中国矿业大学(北京)地球科学与测绘工程学院北京100083 河北省煤田地质局物测地质队河北邢台054000

地震绕射是提升小尺度不规则地质体成像横向分辨率的重要手段。常规地震记录中的绕射波会被能量强的反射波掩盖,因此需要分离出绕射波并成像。阻尼多道奇异谱分析是一种秩约束类的去噪方法,其原理为地震数据经过Hankel变换后做奇异值分... 详细信息

地震绕射是提升小尺度不规则地质体成像横向分辨率的重要手段。常规地震记录中的绕射波会被能量强的反射波掩盖,因此需要分离出绕射波并成像。阻尼多道奇异谱分析是一种秩约束类的去噪方法,其原理为地震数据经过Hankel变换后做奇异值分解,反射波和绕射波分别对应着数值较大和较小的奇异值。然而该算法依赖人工确定反射波场的秩,不适用于海量地震数据处理。为了克服人工选择奇异值的问题,提出使用Cook距离作为自动计算反射波场秩的解决方案。将Cook距离和阻尼多道奇异谱分析算法相结合以实现反射和绕射波分离。模拟共炮检距道集和叠后实际数据实验表明,该方法能够有效获得高质量绕射波场。

关键词：绕射波分离秩约束阻尼多道奇异谱分析 Cook距离

加减补阳还五汤通过激活自噬促进Nrf2核转移改善糖尿病肾病足细胞损伤

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中药药理与临床 2024年

作者：杨帆张晓云娄菲菲马赟黄家安刘利飞赵炳武王月华河北中医药大学河北省中西医结合肝肾病证研究重点实验室河北省人民医院河北省中医院

目的：探讨加减补阳还五汤是否通过激活自噬促进核因子E2相关因子2（Nrf2）核转移改善糖尿病肾病（DKD）小鼠足细胞损伤。方法：选取11-12周龄的db/db小鼠24只，经适应性喂养1周并检测尿蛋白均阳性后，随机分为模型对照组、加减补阳还五... 详细信息

目的：探讨加减补阳还五汤是否通过激活自噬促进核因子E2相关因子2（Nrf2）核转移改善糖尿病肾病（DKD）小鼠足细胞损伤。方法：选取11-12周龄的db/db小鼠24只，经适应性喂养1周并检测尿蛋白均阳性后，随机分为模型对照组、加减补阳还五汤16 g/kg组、雷帕霉素-海藻糖组，同时设立db/m组小鼠作为正常对照组，每组8只，连续给药8周。检测小鼠血糖（FBG）、总胆固醇（TC）、甘油三脂（TG）、超氧化物歧化酶（SOD）、丙二醛（MDA）、谷胱甘肽过氧化物酶（GSH-PX）、尿素氮（BUN）、肌酐（Scr）、肾损伤分子-1（KIM-1）、尿微量白蛋白（mALB）含量；HE染色观察肾脏的病理形态学；qRT-PCR法检测Wilms肿瘤基因（Wt1）、nephrin、podocin的mRNA表达；Western blot法检测小鼠肾组织P62/SQSTM1抗体、beclin1抗体、微管相关蛋白1轻链3-II抗体（LC3-II）、溶酶体相关膜蛋白1抗体（LAMP1）、Nrf2、Kelch样ECH关联蛋白1（Keap1）、醌氧化还原酶1（NQO-1）、血红素加氧酶-1（HO-1）的表达；免疫荧光观察Nrf2核转移变化。结果：与正常对照组比较，模型对照组小鼠肾组织出现病理损伤，血清FBG、TC、TG、MDA、BUN、Scr、KIM-1及mALB含量显著升高，SOD、GSH-PX活力显著降低（P＜0.01），肾组织P62表达升高，LC3-II、beclin1、LAMP1表达降低（P＜0.01），Wt1、nephrin、podocin的mRNA表达降低（P＜0.01），肾组织Nrf2-Keap1通路活化（P＜0.01）；与模型对照组比较，经加减补阳还五汤干预后，DKD小鼠肾脏病理损伤改善（P＜0.01），血清TC、TG、MDA、BUN、Scr、KIM-1及mALB含量显著降低，SOD、GSH-PX活力升高（P＜0.01），肾组织P62表达降低，LC3-II、beclin1、LAMP1表达升高（P＜0.01），Wt1、nephrin、podocin的mRNA表达恢复（P＜0.01），肾组织Nrf2-Keap1通路被活化（P＜0.01）。结论：加减补阳还五汤可能通过激活DKD小鼠肾脏细胞自噬，疏通自噬通路，促进Nrf2核转移，抑制氧化应激，保护足细胞，降低尿蛋白排泄，改善DKD肾脏损伤。

关键词：加减补阳还五汤糖尿病肾脏疾病自噬-溶酶体通路核因子E2相关因子2-Kelch样ECH关联蛋白1通路足细胞

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燕山绒山羊绒毛细度关键蛋白的筛选

中国畜牧杂志 2024年

作者：韩聪洪支林高思慧李雪茹吴香君张崇妍刘志红张玉新王建涛乔贤刘铮铸谢遇春巩元芳河北科技师范学院动物科技学院河北省特色动物种质资源挖掘与创新重点实验室内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室唐山市畜牧技术推广站

燕山绒山羊是河北省青龙地区一个重要的遗传资源，属绒肉兼用品种，由于其绒毛细度良莠不齐，严重影响了养殖经济效益。为了加快燕山绒山羊的选育，本研究通过无标记定量蛋白组学技术对燕山绒山羊与内蒙古绒山羊绒毛的差异蛋白表达谱进... 详细信息

燕山绒山羊是河北省青龙地区一个重要的遗传资源，属绒肉兼用品种，由于其绒毛细度良莠不齐，严重影响了养殖经济效益。为了加快燕山绒山羊的选育，本研究通过无标记定量蛋白组学技术对燕山绒山羊与内蒙古绒山羊绒毛的差异蛋白表达谱进行了分析，结果共鉴定到93个总蛋白，21个差异蛋白，进一步通过GO功能注释、KEGG通路富集、亚细胞定位和PPI蛋白网络互作分析，筛选出6个关键蛋白（ALB、KRT1、KRT17、DSG4、KRT10、KRT18）可能影响燕山绒山羊绒毛细度。研究结果为燕山绒山羊绒毛细度的改良提供了理论基础。

关键词：燕山绒山羊羊绒细度关键蛋白

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小窝蛋白1泛素化在不同疾病中的角色与意义

中国生物化学与分子生物学报 2024年

作者：胡凤丽王鹏飞谷国强河北医科大学第二医院心内科

小窝蛋白1（caveolin-1，Cav-1）是小窝的主要成分，可参与细胞膜内吞、脂质运输及信号转导等生理过程。近年来，大量研究发现，小窝蛋白1泛素化修饰既能影响自身水平，又能通过改变蛋白质结构造成相互作用分子的构象变化，进而在不同... 详细信息

小窝蛋白1（caveolin-1，Cav-1）是小窝的主要成分，可参与细胞膜内吞、脂质运输及信号转导等生理过程。近年来，大量研究发现，小窝蛋白1泛素化修饰既能影响自身水平，又能通过改变蛋白质结构造成相互作用分子的构象变化，进而在不同疾病中扮演不同的角色。Cav-1含12个赖氨酸残基，其中N端结构域6个赖氨酸残基（5/26/30/39/47/57）对于Cav-1的泛素化修饰必不可少。在不同疾病状态下，Cav-1的泛素化类型及位点各异，而且泛素化修饰后可通过泛素-蛋白酶体系统及溶酶体途径降解。本文通过综述Cav-1泛素化在呼吸、消化、神经、内分泌、乳腺生殖等系统疾病中的相关研究，发现Cav-1泛素化主要涉及肿瘤、炎症和代谢性疾病等病理过程。通过综述Cav-1泛素化修饰在不同疾病模型及细胞中扮演的角色，希望能加深理解Cav-1泛素化的生理和病理生理学意义，为未来可能相关干预提供方向。

关键词：小窝蛋白1 泛素化修饰小窝