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基于RNA-Seq的子宫内膜癌灶与癌旁组织差异表达基因分析

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石河子大学学报（自然科学版） 2022年第2期40卷 259-264页

作者：杨冰琪王竞州庞槐袁成钢张君王翠喆石河子大学医学院/新疆地方病与民族高发病教育部重点实验室新疆石河子832000

目的利用转录组测序(RNA sequencing, RNA-Seq)技术分析肥胖相关子宫内膜癌(Endometrial Cancer, EC)癌灶及癌旁组织中的差异表达基因,寻找肥胖相关EC发生、发展的相关危险因素。方法对4例超重/肥胖伴EC患者的癌灶和癌旁组织进行转录... 详细信息

目的利用转录组测序(RNA sequencing, RNA-Seq)技术分析肥胖相关子宫内膜癌(Endometrial Cancer, EC)癌灶及癌旁组织中的差异表达基因,寻找肥胖相关EC发生、发展的相关危险因素。方法对4例超重/肥胖伴EC患者的癌灶和癌旁组织进行转录组测序,筛选差异表达基因,并运用生物信息学技术对差异基因进行功能和通路富集分析。结果在EC癌灶及癌旁组织中共筛选出2 451个差异表达基因,包含1 697个上调基因,754个下调基因。GO功能富集分析表明:肥胖相关EC的发生发展与细胞间粘附调节、有丝分裂进程和错误蛋白折叠结合等一系列生物学进程密切相关。KEGG功能富集分析表明:肥胖相关EC的发生发展与病毒致癌、细胞周期、Hippo信号通路、细胞凋亡和p53信号通路等密切相关。结论 Hippo信号通路、p53信号通路和NETs信号通路可能在肥胖相关EC发生发展过程中发挥重要作用。

关键词：子宫内膜癌 RNA-Seq 差异表达基因通路功能富集

灵芝航天诱变菌株的活性成分含量与体外抗氧化活性评价

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食品科技 2023年第12期48卷 1-8页

作者：薛建邦莫转林莫美华华南农业大学食品学院广东广州510642 华南农业大学基础实验与实践训练中心广东广州510642

为培育灵芝优良新品种,对其进行太空诱变育种,筛选出15株诱变菌株。对它们的活性成分含量进行测定,结果显示,诱变菌株T6、T12、T15的多糖含量和T10、T15、T19的三萜及甾醇含量均显著高于出发菌株T0,T35的多酚含量显著高于出发菌株T0。... 详细信息

为培育灵芝优良新品种,对其进行太空诱变育种,筛选出15株诱变菌株。对它们的活性成分含量进行测定,结果显示,诱变菌株T6、T12、T15的多糖含量和T10、T15、T19的三萜及甾醇含量均显著高于出发菌株T0,T35的多酚含量显著高于出发菌株T0。体外抗氧化活性评价结果显示,诱变菌株T10、T19、T35醇提物的总还原力显著高于出发菌株T0,但是参试菌株水提物的总还原力与出发菌株T0没有显著差异;诱变菌株T15水提物的DPPH自由基清除率和醇提物的超氧阴离子自由基清除率以及T10、T19、T35的醇提物的DPPH自由基清除率和水提物的超氧阴离子自由基清除率均显著高于出发菌株。这些结果表明航天诱变育种能够改变药用真菌的活性成分含量和抗氧化能力,通过试验筛选可以获得活性成分含量高和抗氧化作用强的优良菌株,是优良新品种培育的有效途径之一。该试验结果可为微生物航天诱变育种研究提供参考,也有望为灵芝工业化生产提供更优良的菌种。

关键词：灵芝太空诱变育种活性成分抗氧化能力

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天然胡杨和灰杨群体遗传多样性研究

天然胡杨和灰杨群体遗传多样性研究

作者：陈向向塔里木大学

学位级别：硕士

胡杨(Populus euphratica Oliv.)和灰杨(Populus pruinosa Schrenk)是杨柳科杨属胡杨组的两个姊妹种,世界61%的胡杨分布在中国的新疆、甘肃、内蒙古、青海和宁夏,而中国91.1%的天然胡杨林分布于新疆,它不仅是维系极端干旱区生态平衡和... 详细信息

胡杨(Populus euphratica Oliv.)和灰杨(Populus pruinosa Schrenk)是杨柳科杨属胡杨组的两个姊妹种,世界61%的胡杨分布在中国的新疆、甘肃、内蒙古、青海和宁夏,而中国91.1%的天然胡杨林分布于新疆,它不仅是维系极端干旱区生态平衡和沙漠“绿色走廊”生存的主体,而且是优异、抗逆的林木基因库,这对中国西北干旱区生态安全和社会经济的可持续发展具有不可替代的重要作用,因此本文利用多元统计分析和分子信息学技术对中国西北地区天然胡杨和灰杨群体进行研究,从表型水平和分子水平上来揭示不同群体的遗传多样性,对进一步挖掘和选育优良抗旱的基因资源具有重要的指导意义。主要研究结果如下:(1)利用多重比较、方差分析、主成分分析和相关性分析等多元统计分析方法,对天然胡杨和灰杨群体叶片、果实和种子的表型性状分别进行遗传多样性分析。结果表明,胡杨和灰杨群体叶片表型性状的形态变异均大于果实和种子的变异;多重比较分析表明不同种源地胡杨和灰杨群体叶片、果实和种子表型性状存在显著差异;方差分析表明胡杨和灰杨叶片、果实和种子的表型变异在群体间和群体内均存在显著差异,且群体间的变异均大于群体内的差异;主成分分析表明叶片宽、脉左宽、叶面积、叶周长是引起胡杨和灰杨群体叶片表型性状变异的主要因素,蒴果长、蒴果周长是胡杨果实表型性状变异的主要因素,而蒴果宽、蒴果面积是灰杨果实表型性状变异的主要因素,种子长、种子面积和种子周长是胡杨和灰杨种子表型性状变异的主要因素;相关性分析表明叶片长、叶片宽、叶面积、脉左宽和叶周长是胡杨群体叶片、果实和种子密切关联的性状,而种子长、种子周长、种形指数、叶片长、叶片面积和蒴果宽是灰杨群体叶片、果实和种子密切关联的性状;胡杨群体中,地理因子经度、纬度和海拔比年均平均温度和年均最低气温等气候因子对胡杨叶片、果实和种子的表型形态变化显著性影响更大,而在灰杨群体中,地理因子纬度和海拔及环境因子年均降水量和年均蒸发量对叶片、果实和种子的表型性状影响最为显著,表明在长期的演化过程中,干旱区灰杨群体的表型形态变异对潮湿环境更为敏感。(2)利用胡杨响应抗旱的转录组数据和拟南芥抗旱基因同源比对到胡杨、灰杨的抗旱基因上,合并这两个基因的来源和设计引物,最终获得与抗旱基因关联的候选10对ESR-SSR共显性引物,然后利用这些标记对胡杨和灰杨群体进行遗传多样性研究。结果表明,胡杨和灰杨群体遗传多样性水平丰富,且南疆胡杨、灰杨群体遗传多样性平均水平均高于其他分布区群体;胡杨群体的平均观察杂合度水平大于期望杂合度,表明整体水平上,其群体内的杂合子高于达到平衡所需要的比例,即杂合子过剩,不同胡杨群体间的亲缘关系较远。而灰杨群体的平均期望杂合度水平大于观测杂合度,表明灰杨群体中杂合子缺失,纯合子过剩,灰杨群体间的近亲群体较多。分子方差分析表明胡杨和灰杨群体内的变异均大于群体间的变异;聚类分析表明天然胡杨、灰杨群体主要分为以南疆和北疆为代表的2大类群体,群体结构和主坐标轴分析支持47个胡杨群体以南疆喀什地区和巴州、北疆塔城地区和昌吉州群体为代表的共4个支系;支持17个灰杨群体以南疆地区尉犁县、且末县、墨玉县、北疆地区尼勒克县群体为代表的共4个支系。

关键词：胡杨灰杨天然群体遗传多样性 EST-SSR标记

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嫁接用苗力定位气囊把持手设计与试验

农机化研究 2023年第5期45卷 191-195页

作者：周泽坤谢忠坚初麒杨艳丽欧杨辜松华南农业大学工程学院广州510642 广州实凯机电科技有限公司广州510642

针对嫁接用苗个体差异大、把持定位难、把持易损伤等问题,提出了一种力定位气囊把持手的设计方案,以实现嫁接用苗的柔性把持。气囊把持手以硅胶为材料,通过进气后气室的膨胀变形推动夹持翅绕中心旋转,与持苗圆弧一起实现嫁接用苗的夹持... 详细信息

针对嫁接用苗个体差异大、把持定位难、把持易损伤等问题,提出了一种力定位气囊把持手的设计方案,以实现嫁接用苗的柔性把持。气囊把持手以硅胶为材料,通过进气后气室的膨胀变形推动夹持翅绕中心旋转,与持苗圆弧一起实现嫁接用苗的夹持。在对气囊把持手完成初步设计的基础上,通过仿真分析确定合适的气室距离和进气压力。为了检验气囊把持手对嫁接用苗的夹持效果,以水平拔出力和垂直拔出力为目标函数,对气囊把持手进行性能试验。试验研究结果表明:当力定位气囊把持手作业压力为0.2MPa时,针对苗径为1.5~3.5mm的嫁接用苗,气囊把持手的垂直拔出力可达到1.0~2.5N,水平拔出力可达到1.0~2.0N。试验结果可为进一步研究上苗定位夹持机构提供参考。

关键词：嫁接用苗上苗定位气囊把持手

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植物工厂种植板物流输送系统设计与试验

农机化研究 2023年第5期45卷 78-82页

作者：季涵涵谢忠坚辜美章初麒杨艳丽刘厚诚辜松华南农业大学工程学院广州510642 华南农业大学园艺学院广州510642 广州实凯机电科技有限公司广州510642

植物工厂作为目前最高水平的设施农业生产方式,成为近年来研究的重点。多层式立体栽培种植模式最为常见,主要输送方式为人工搬运种植板输送,由于人工搬运效率低、成本高,存在高空作业安全隐患,严重制约了植物工厂作业效率的提高。为此,... 详细信息

植物工厂作为目前最高水平的设施农业生产方式,成为近年来研究的重点。多层式立体栽培种植模式最为常见,主要输送方式为人工搬运种植板输送,由于人工搬运效率低、成本高,存在高空作业安全隐患,严重制约了植物工厂作业效率的提高。为此,研发了一种种植板物流输送系统,以立体栽培种植模式为基础,包含地面输送系统、提升车系统及栽培架内无线引导车系统。同时,运用Flexsim软件对该种植板物流输送模式进行仿真,并进行性能试验,结果表明:系统能够实现植物工厂立体栽培模式下种植板的自动化运输作业,作业效率达到500穴盘/h,达到国内领先水平,可为相关植物工厂立体物流输送模式的设计提供理论依据和技术支撑。

关键词：植物工厂立体栽培种植板垂直运输物流设备

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新疆伊犁地区发酵驼乳中酵母菌多样性分析

中国食品学报 2020年第7期20卷 188-198页

作者：李王强樊哲新刘月李宝坤李开雄石河子大学食品学院新疆石河子056400

从新疆伊犁地区采集到12份发酵驼乳样品,用传统分离培养方法从中分离出35株酵母菌。通过生化鉴定结合形态观察,结果显示:8株为马克斯克鲁维酵母;15株属于单胞酿酒酵母菌;9株林德纳克勒克酵母;2株酿酒酵母;1株白地霉,其中单胞酿酒酵母菌... 详细信息

从新疆伊犁地区采集到12份发酵驼乳样品,用传统分离培养方法从中分离出35株酵母菌。通过生化鉴定结合形态观察,结果显示:8株为马克斯克鲁维酵母;15株属于单胞酿酒酵母菌;9株林德纳克勒克酵母;2株酿酒酵母;1株白地霉,其中单胞酿酒酵母菌是优势菌属。通过样品酵母菌26S r DNA基因D1区DGGE图谱的优势条带有12条;样品间酵母菌种群结构相似性系数范围21.9%~73.9%;Shannon-Wiener指数在1.92~3.41之间,丰度S值在10~34;在40%水平上样品聚为4类。酵母群落组成主要包括马克斯克鲁维酵母、酿酒酵母、单胞酿酒酵母菌、解脂耶氏酵母和白地霉等。

关键词：发酵驼乳酵母菌多样性聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳

机采棉等行距密植模式下棉花脱叶催熟效果研究

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西北农业学报 2019年第10期28卷 1594-1601页

作者：陈兵张国蕾王静刘景德李少昆余渝王方永韩焕勇新疆农垦科学院棉花研究所新疆石河子832003 石河子大学农学院新疆石河子832000 新疆石河子职业技术学院水建分院新疆石河子832003

探讨机采棉等行距密植模式下棉花脱叶催熟规律及其效果,为机采棉提质增效新模式下的脱叶催熟技术提供理论依据。以‘新陆早53号’为供试材料,设置不同用量脱叶剂和不同喷洒时间共15个处理,研究机采棉等行距密植模式下棉花的脱叶和吐絮... 详细信息

探讨机采棉等行距密植模式下棉花脱叶催熟规律及其效果,为机采棉提质增效新模式下的脱叶催熟技术提供理论依据。以‘新陆早53号’为供试材料,设置不同用量脱叶剂和不同喷洒时间共15个处理,研究机采棉等行距密植模式下棉花的脱叶和吐絮变化规律,对产量和纤维品质的影响及成本效益特征。结果表明:(1)等行距密植模式下的脱叶率处理7和12最高(98.85%,98.57%),处理5和13最低(30.28%,41.30%),其他处理均达到75%以上;吐絮率处理2和11最高(77.25%,81.80%),处理5和13最低(45.79%,66.42%),其他处理均达到57%以上。(2)每个处理都对产量造成减产,减产2~67 kg/667m^2,减产率1%~23%,其中处理6和14减产最少,1%以内,处理7和9减产最多,23%以上,脱吐隆处理对温度不敏感,可在2个时期施用,瑞脱龙处理对温度敏感,宜早期施用。(3)各药剂处理使得棉花绒长、比强度、成熟系数略有增减,整齐度略微减小,均未达显著差异,对马克隆值影响较大,处理6、11、14与对照达显著性差异。(4)处理6、10、14的效益较好,效益减少20元/667m^2,处理7和15的效益最差,效益减少了377元/667m^2。不同时期不同脱叶剂处理均能促进棉花脱叶和吐絮,造成不同幅度的减产,对马克隆值以外的品质参数影响较小,处理6(瑞脱龙15 g/667m^2+助剂15 g/667m^2+乙烯利100 g/667m^2,9月1日)和处理14(瑞脱龙15 g/667m^2+助剂15 g/667m^2+乙烯利100 g/667m^2,9月9日)综合经济效益最好,可在北疆早熟棉地区大面积推广。

关键词：棉花等行距密植脱叶剂产量效益

基于MiSeq高通量测序技术奶疙瘩细菌群落结构研究

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中国乳品工业 2020年第12期48卷 16-19页

作者：倪慧葛东颖杨甜甜单春会佘雅倩肖石高郭壮湖北文理学院湖北省食品配料工程技术研究中心湖北襄阳441053 石河子大学食品学院新疆石河子832003 湖北澳利龙食品股份有限公司湖北宜昌443000

本研究采用Illumina MiSeq高通量测序技术解析伊犁哈萨克自治州奶疙瘩中细菌的群落结构,进而为新疆地区传统发酵乳制品的微生物解析提供数据支持。结果发现优势细菌门为Firmicutes(厚壁菌门),平均相对含量为99.26%、优势细菌属为Lactoba... 详细信息

本研究采用Illumina MiSeq高通量测序技术解析伊犁哈萨克自治州奶疙瘩中细菌的群落结构,进而为新疆地区传统发酵乳制品的微生物解析提供数据支持。结果发现优势细菌门为Firmicutes(厚壁菌门),平均相对含量为99.26%、优势细菌属为Lactobacillus(乳杆菌属)和Streptococcus(链球菌属),平均相对含量分别为87.59%和9.48%;有18个操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)存在于所有样品中,包含序列占总序列数的85.15%,其中OTU3705(属于Lactobacillus)、OTU4026(属于Lactobacillus)和OTU1780(属于Streptococcus)的平均相对含量分别为56.60%、18.76%和7.56%;通过PICRUSt分析发现,奶疙瘩中细菌代谢碳水化合物和氨基酸的功能较强。由此可见,奶疙瘩中具有大量代谢碳水化合物和氨基酸的细菌菌群,且以Lactobacillus和Streptococcus为优势细菌属。

关键词：奶疙瘩高通量测序细菌多样性乳酸菌基因功能

发酵桑叶对肥育猪生长性能以及血浆、尿液代谢物的影响

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动物营养学报 2022年第9期34卷 5620-5629页

作者：崔艺燕彭苏李贞明宋敏余苗邓盾田志梅容庭刘志昌马现永广东省农业科学院动物科学研究所畜禽育种国家重点实验室农业农村部华南动物营养与饲料重点实验室广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广东畜禽肉品质量安全控制与评定工程技术研究中心广州510640 岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心茂名525000

本试验旨在研究饲粮中添加发酵桑叶对肥育猪生长性能以及血浆、尿液代谢物的影响。选取18头体重(78.19±2.05)kg的杜×长×大阉公猪,随机分为2组,每组9个重复,每个重复1头猪。对照组饲喂基础饲粮,发酵桑叶组在基础饲粮中添加10%发酵桑... 详细信息

本试验旨在研究饲粮中添加发酵桑叶对肥育猪生长性能以及血浆、尿液代谢物的影响。选取18头体重(78.19±2.05)kg的杜×长×大阉公猪,随机分为2组,每组9个重复,每个重复1头猪。对照组饲喂基础饲粮,发酵桑叶组在基础饲粮中添加10%发酵桑叶。试验期69 d。结果表明:1)与对照组相比,饲粮中添加发酵桑叶对肥育猪生长性能无显著影响(P>0.05)。2)与对照组相比,发酵桑叶组血浆肌酐、尿酸、甘油三酯含量和乳酸脱氢酶活性显著降低(P<0.05),血浆谷草转氨酶活性有降低趋势(P=0.079)。3)与对照组相比,发酵桑叶组尿液肌酐含量显著提高(P<0.05),尿液尿酸含量和乳酸脱氢酶活性显著降低(P<0.05)。4)与对照组相比,发酵桑叶组血浆谷胱甘肽含量显著提高(P<0.05)。5)与对照组相比,发酵桑叶组血浆白细胞介素(IL)-2、IL-6、IL-8、IL-22、肿瘤坏死因子-α、干扰素-γ、免疫球蛋白(Ig)A含量显著提高(P<0.05),血浆IgG和IgM含量有提高趋势(P=0.084和P=0.068)。由此可见,饲粮中添加10%发酵桑叶对肥育猪生长性能无负面影响,改善了血浆和尿液代谢物含量,提高了机体抗氧化能力和免疫功能。

关键词：发酵桑叶猪血浆尿液代谢物