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绵羊肺炎支原体GH3-3株全基因组测序及生物信息学分析

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生物技术通报 2024年第7期40卷 323-334页

作者：田彤彤葛家振高鹏程李学瑞宋国栋郑福英储岳峰中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室兰州730000 新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

【目的】全面了解绵羊肺炎支原体GH3-3株的基因序列,研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制。【方法】采用体外培养,利用细菌基因组DNA提取试剂盒提取绵羊肺炎支原体GH3-3株基因组DNA,进行全基因组测序。【结果】绵... 详细信息

【目的】全面了解绵羊肺炎支原体GH3-3株的基因序列,研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制。【方法】采用体外培养,利用细菌基因组DNA提取试剂盒提取绵羊肺炎支原体GH3-3株基因组DNA,进行全基因组测序。【结果】绵羊肺炎支原体GH3-3株基因组大小为1060772 bp,GC含量为29.66%,基因组组分分析后发现,GH3-3株的基因组含有730个编码基因,总长度为914379 bp,平均长度为1252.57 bp,占基因组全长的86.2%。串联重复序列共149个,总长为20926 bp,占基因组全长的1.97%。微卫星DNA序列102个,tRNA 30个,rRNA 3个。在NR、SwissProt、GOG、KEGG、GO、CARD、CAZy、PHI、TCDB、RMS数据库中,分别有719、459、473、394、449、33、5、180、113、59个基因被注释;在VFDB数据库中,共注释到了76个毒力因子相关的基因。将基因组序列提交至NCBI网站,获得登录号为:PRJNA1051969。【结论】获得了绵羊肺炎支原体GH3-3株完整的基因组信息,预测和注释了其基因的功能,明确了GH3-3株以及与国内外其他绵羊肺炎支原体菌株之间的遗传进化关系。

关键词：绵羊肺炎支原体 GH3-3株全基因组测序毒力因子耐药基因

2022年四川泸定 M_(s)6.8地震强震动特性研究

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世界地震工程 2024年第1期40卷 13-24页

作者：张聪周宝峰任叶飞王晓敏余桦张亚军吴华灯中国地震局工程力学研究所地震工程与工程振动重点实验室黑龙江哈尔滨150080 中国地震局工程力学研究所地震灾害防治应急管理部重点实验室黑龙江哈尔滨150080 四川省地震局四川成都610200 宁夏交通建设股份有限公司宁夏银川750004 广东省地震局广东广州510070

北京时间2022年9月5日12时52分,四川省甘孜州泸定县发生M_(s)6.8级地震。国家强震动台网获得了133组三分量加速度记录,在对记录进行初步筛选和滤波后,研究了PGA和PGV衰减关系、竖向地震动特点、地震动速度脉冲,对比分析了反应谱和设计谱... 详细信息

北京时间2022年9月5日12时52分,四川省甘孜州泸定县发生M_(s)6.8级地震。国家强震动台网获得了133组三分量加速度记录,在对记录进行初步筛选和滤波后,研究了PGA和PGV衰减关系、竖向地震动特点、地震动速度脉冲,对比分析了反应谱和设计谱,着重对石棉挖角台站附近震害与地震动的相关性进行了分析,结论如下:1)三种台站强震动记录的PGA和PGV拟合曲线都比较相近,PGA、PGV拟合曲线与霍俊荣的预测模型较为接近;2)竖向地震动偏大,约38.2%的强震动记录V/H大于2/3,可能是屋顶塌落、柱子扭转和天花板坠落等震害现象出现的主要原因;3)识别出具有速度脉冲特性的记录11条,该类记录对长周期结构影响较大;4)所选记录反应谱大多超过了罕遇地震设计谱水平段,具有速度脉冲特性的051SMW台站周围房屋破坏较严重,人员伤亡较重。

关键词：泸定M_(s)6.8地震地震动衰减竖向地震动速度脉冲加速度反应谱

太原盆地2016年以来中小地震震源机制研究

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太原理工大学学报 2024年

作者：李嘉丽李斌靳一丹赵晓云李自红太原理工大学地球科学与工程系太原理工大学地震与地质灾害防治研究所山西省地震局

本文基于山西测震台网数字波形资料，利用P波初动和CAP方法确定了2016年5月至2023年12月间发生在太原盆地的68个2.5级及以上地震的震源机制解。结果显示，近期发生在太原盆地的中小地震震源机制主要以正断类型为主，兼有一定的正断-走... 详细信息

本文基于山西测震台网数字波形资料，利用P波初动和CAP方法确定了2016年5月至2023年12月间发生在太原盆地的68个2.5级及以上地震的震源机制解。结果显示，近期发生在太原盆地的中小地震震源机制主要以正断类型为主，兼有一定的正断-走滑及走滑类型，逆断性质类型较少；震源机制P轴方位主要集中在NEE-NE-NEN范围内，区域变化特征明显；T轴方位则集中在NW-NWN，具有较好一致性。基于震源机制解反演的区域构造应力场结果显示，主压应力轴σ1走向45°、倾角79°，主张应力轴σ3走向149°、倾角3°，表明太原盆地整体受控于NW向近水平主张应力及NE向近垂直主压应力，且主压应力轴在平面内呈现出一定的变化特征；上述结果亦表明，近期该区域构造应力场整体未发生显著变化，继承性特征明显。

关键词：震源机制解 P波初动 CAP方法区域构造应力太原盆地

应用KMB17细胞培养柯萨奇病毒B族1、2、3型的研究

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中国病原生物学杂志 2024年第1期19卷 10-14页

作者：邓自君靳玮华李艳艳张伟杨凤梅张名陈丽雄徐鸿界李明学刘权唐洁段素琴孙文亭李咏洁马绍辉赵远杨明和占龙杨净思中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南昆明650018

目的采用人胚肺二倍体细胞(human embryonic lung diploid cell)KMB17株对柯萨奇病毒B族(Coxsackievirus B,CVB)1、2、3型进行适应性培养,探索应用KMB17细胞培养CVB1-3型病毒的相关参数,为基于KMB17细胞研发CVB多价疫苗提供参考。方法 ... 详细信息

目的采用人胚肺二倍体细胞(human embryonic lung diploid cell)KMB17株对柯萨奇病毒B族(Coxsackievirus B,CVB)1、2、3型进行适应性培养,探索应用KMB17细胞培养CVB1-3型病毒的相关参数,为基于KMB17细胞研发CVB多价疫苗提供参考。方法将CVB 1-3型分别设置8个不同的感染复数(mulitiplicity of infection, MOI)梯度(0.05、0.1、0.15、0.2、0.25、0.3、0.35、0.4),在KMB17细胞上进行培养观察,对病毒培养结果进行统计分析。结果 CVB 1-3型病毒均能KMB17细胞中复制,并使细胞产生明显的细胞病变(cytopathic effect, CPE)。其中CVB 1型在KMB17细胞上适宜的种毒MOI值为0.25~0.3,病毒收获液的平均滴度为7.25 lgCCID50/mL,适宜MOI范围内病毒培养时间的95%置信区间为96.1~97.6 h;CVB 2型在KMB17细胞上适宜的种毒MOI值为0.20~0.25,病毒收获液平均滴度为7.375 lgCCID50/mL,适宜MOI范围内病毒培养时间的95%置信区间为74.8~76.8 h。CVB 3型在KMB17细胞上适宜的种毒MOI值为0.30~0.35,病毒收获液的平均滴度为7.25 lgCCID50/mL,适宜MOI范围内病毒培养时间的95%置信区间为82.7~84.7 h。结论 KMB17为一株理想的用于CVB1、2、3型培养的基质细胞,可为基于KMB17细胞研发CVB多价疫苗提供参考。

关键词： KMB17细胞柯萨奇病毒B 1、2、3型病毒培养

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黑龙江省大豆延迟型冷害指标构建及检验

中国农业气象 2024年第6期45卷 619-628页

作者：闫平季生太姜丽霞王冬妮王晾晾初征王春华陈宛彤于瑛楠田宝星中国气象局沈阳大气环境研究所沈阳110166 中国气象局东北地区生态气象创新开放实验室哈尔滨150030 黑龙江省气象科学研究所哈尔滨150030 黑龙江省气候中心哈尔滨150030 大连市旅顺口区气象局大连116000

黑龙江省大豆生长季冷害发生频次高、影响重,构建黑龙江省大豆延迟型冷害指标,对大豆防灾减灾、保障大豆安全生产具有重要意义。利用1961-2020年黑龙江省73县(市、区)大豆产量资料及气象站逐日温度资料,以5-9月各月月平均温度之和的距... 详细信息

黑龙江省大豆生长季冷害发生频次高、影响重,构建黑龙江省大豆延迟型冷害指标,对大豆防灾减灾、保障大豆安全生产具有重要意义。利用1961-2020年黑龙江省73县(市、区)大豆产量资料及气象站逐日温度资料,以5-9月各月月平均温度之和的距平值为致灾因子,利用致灾因子和减产率的线性关系确定冷害阈值,构建黑龙江省大豆延迟型冷害指标并验证。结果表明:研究区大豆在5个种植区轻度冷害阈值分别为-1.8℃、-1.9℃、-1.9℃、-2.0℃、-2.0℃,中度冷害阈值分别为-2.0℃、-2.2℃、-2.3℃、-2.4℃、-2.6℃,重度冷害阈值分别为-2.2℃、-2.5℃、-2.7℃、-2.9℃、-3.1℃。经检验,大豆延迟型冷害指标对冷害发生趋势判识平均准确率83%,对冷害发生等级判识平均准确率62%,典型冷害年判识冷害平均准确率93%。综上所述,大豆延迟型冷害指标界定及评价黑龙江省大豆生长季延迟型冷害准确率较高,指标获取容易且实用性强。

关键词：大豆延迟型冷害指标黑龙江省

未来气候情景下高寒区水稻延迟型冷害演变特征研究

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灾害学 2024年

作者：韩俊杰石红艳初征翟墨那荣波季生太何锋庞云超姜丽霞黑龙江省气象科学研究所双鸭山市气象局黑龙江省生态气象中心

利用中国区域气候模式BCC-CSM 1.0模拟的日平均气温数据，结合国家标准中5—9月温度和的距平（ΔT）指标，判识RCP4.5情景下2024—2060年水稻延迟型冷害的演变特征。结果表明：该模型数据对研究水稻冷害较为可靠；2024—2060年，研究区... 详细信息

利用中国区域气候模式BCC-CSM 1.0模拟的日平均气温数据，结合国家标准中5—9月温度和的距平（ΔT）指标，判识RCP4.5情景下2024—2060年水稻延迟型冷害的演变特征。结果表明：该模型数据对研究水稻冷害较为可靠；2024—2060年，研究区水稻延迟型冷害识别年数为5～ 12 a，随时间呈减少趋势，其中2024—2030年、2030s为冷害高发期，2040s为低发期，2050s未发生冷害，与基准时段（1969—2005年）相比，冷害总年数大幅减少；空间分布上，水稻延迟型冷害发生频率总体呈北少南多，冷害发生频率在13.5%～ 32.3%，高值区位于哈尔滨东部、鸡西南部和牡丹江，而齐齐哈尔、大庆区域为低值中心，与基准时段相比，冷害高频区向南收缩并东移。研究区冷害发生范围在不同年份存在差异，IOC值呈“弹跳式”波动变化，2024、2026、2028、2029、2030、2031、2033、2035、2036、2046、2049年冷害发生范围较大，IOC高于0.42，与基准时段相比，IOC为0的年数增加，IOC高于0.50的年数减少。

关键词：水稻延迟型冷害冷害演变特征高寒区 BCC-CSM 1.0模拟

基于熵权模糊物元法的广东省海洋牧场生态效益评价

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南方水产科学 2024年第5期20卷 14-23页

作者：柳睿杰袁华荣冯雪陈丕茂中国农业科学院研究生院北京100081 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部海洋牧场重点实验室/农业农村部南海渔业资源环境科学观测实验站广东广州510300

海洋牧场是广东省海洋渔业资源养护和环境修复的重要手段之一。为系统评估广东省海洋牧场的生态效益,采用熵权法(Entropy Weight Method)和模糊物元法(Fuzzy Matter Element Method)构建综合评价模型,根据2019—2021年广东省10个海域养... 详细信息

海洋牧场是广东省海洋渔业资源养护和环境修复的重要手段之一。为系统评估广东省海洋牧场的生态效益,采用熵权法(Entropy Weight Method)和模糊物元法(Fuzzy Matter Element Method)构建综合评价模型,根据2019—2021年广东省10个海域养护型海洋牧场的生物资源和环境因子调查数据,筛选出透明度、溶解氧、叶绿素、初级生产力、浮游生物多样性等26个关键指标,并制定三类标准作为参照。结果显示,2019—2021年广东省海洋牧场生态效益的综合得分分别为0.588113、0.609307和0.521257,均高于一类标准的评价值(0.462171),表明广东省海洋牧场保持了较高的生态质量,并有效改善了海域的生态环境;初级生产力在生态效益评价中具有较高的重要性,其2021年的得分略有下降,主要受到无机氮含量上升和浮游生物、底栖生物多样性指数降低的影响。研究建议,应进一步完善评价指标体系和加强对外部环境因素影响的研究,以更科学地评估海洋牧场的生态效益。

关键词：海洋牧场生态效益熵权法模糊物元法

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海洋牧场建设效益评价研究进展与展望

南方水产科学 2024年第5期20卷 1-13页

作者：袁华荣章守宇陈丕茂上海海洋大学海洋科学与生态环境学院上海201306 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部海洋牧场重点实验室广州510300

建设海洋牧场是中国海洋渔业转型升级的关键策略,旨在通过人工干预的方式促进海洋渔业资源增殖和生态环境修复。人工鱼礁和增殖放流是海洋牧场建设的重要手段,人工鱼礁通过改善海域生态环境为鱼类提供适宜的栖息地,增殖放流则直接补充... 详细信息

建设海洋牧场是中国海洋渔业转型升级的关键策略,旨在通过人工干预的方式促进海洋渔业资源增殖和生态环境修复。人工鱼礁和增殖放流是海洋牧场建设的重要手段,人工鱼礁通过改善海域生态环境为鱼类提供适宜的栖息地,增殖放流则直接补充特定的海洋生物种群。文章综述了海洋牧场的发展历程、建设现状及效益评价方法,分析了人工鱼礁的水下物理状态、流场效应、规模效应及其渔业增殖效应,强调了科学布设的重要性;总结了增殖放流标记回捕、统计量分析和模型分析等效应评估方法。尽管中国在这些领域已经取得了显著进展,但仍面临人工鱼礁建设规模与生态效益的关系不明确、增殖放流效果评价的准确度有待提升以及缺乏成熟的定量评估模型等挑战。此外,还提出了未来的研究方向及建议,包括完善评价指标体系、强化技术创新、构建定量评估模型以及加强政策和管理指导等,以期推动海洋牧场科研和实践的发展,实现海洋渔业资源的可持续利用和海洋生态平衡。

关键词：海洋牧场人工鱼礁增殖放流效果评估生态动态平衡可持续发展

低共熔溶剂提取虾壳中虾青素工艺优化及机理初探

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南方水产科学 2024年第3期20卷 164-172页

作者：刘宇航相欢黄卉魏涯岑剑伟潘创李春生赵永强郝淑贤上海海洋大学食品学院上海201306 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部水产品加工重点实验室/国家水产品加工技术研发中心广东广州510300

虾壳中虾青素的高效安全提取技术是促进虾类加工副产物变废为宝的途径之一。利用乳酸-氯化胆碱构成的低共熔溶剂提取虾壳中的虾青素,在单因素实验基础上,采用响应面实验优化提取工艺;通过低共熔溶剂的物化性质分析探究其对虾青素的提取... 详细信息

虾壳中虾青素的高效安全提取技术是促进虾类加工副产物变废为宝的途径之一。利用乳酸-氯化胆碱构成的低共熔溶剂提取虾壳中的虾青素,在单因素实验基础上,采用响应面实验优化提取工艺;通过低共熔溶剂的物化性质分析探究其对虾青素的提取机理。优化后的工艺条件为乳酸-氯化胆碱摩尔比为2.5∶1,含水量(w)为9.5%,超声时间为30.5 min,实际得率为24.41μg·g-1。傅里叶变换红外光谱分析表明低共熔溶剂合成时官能团并未发生改变,二者融合产生的氢键可能是促进虾青素高效提取的主要原因,黏度会在一定程度上影响产品的提取过程。

关键词：虾青素低共熔溶剂乳酸氯化胆碱

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