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刺参TRAF7基因克隆及其响应高温胁迫下的表达特征分析

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渔业科学进展 2024年

作者：赵岩峰廖梅杰葛建龙王锦锦王印庚荣小军李彬谭颜廷青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室上海海洋大学水产与生命学院中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室

肿瘤坏死因子受体相关因子7 (tumor necrosis factor receptor associated factor7， TRAF7)作为一种细胞内蛋白，参与信号转导，并介导宿主应激防御调控过程。为研究TRAF7在刺参(Apostichopus japonicus)高温胁迫中的作用，本研究利用c... 详细信息

肿瘤坏死因子受体相关因子7 (tumor necrosis factor receptor associated factor7， TRAF7)作为一种细胞内蛋白，参与信号转导，并介导宿主应激防御调控过程。为研究TRAF7在刺参(Apostichopus japonicus)高温胁迫中的作用，本研究利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)，克隆了刺参TRAF7 (AjTRAF7)全长cDNA序列，分析了其结构特征和在基因组中的分布，并检测了该基因在刺参不同组织和高温胁迫过程中体壁组织中的表达变化情况。结果显示，AjTRAF7全长2 576 bp，开放阅读框(ORF)长1 770 bp，5′UTR长345 bp，3′UTR长461 bp，编码589个氨基酸，预测蛋白分子量为65.6 kDa，理论等电点(pI)为7.52。蛋白序列包含1个RING finger结构域、1个Coiled coil结构域和6个WD40结构域，N端包含1个螺旋区域。该基因预测蛋白包含41个丝氨酸磷酸化位点、20个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点，蛋白N端具有3个天冬酰胺糖基化位点。刺参基因组中比对到2个AjTRAF7基因拷贝，位于同一条染色体上，第一个拷贝包含18个外显子和15个内含子，第二拷贝包含17个外显子和14个内含子。系统进化学分析表明，刺参TRAF7氨基酸序列与蝠海星(Patiria miniata)和紫色球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)相似性较高，分别为40.58%和38.37%，刺参与蝠海星和紫色球海胆聚在一支。qRT-PCR结果显示，AjTRAF7在健康刺参各组织中均有表达，其在雌性性腺中表达量最高，体腔细胞中表达量次之，在呼吸树、体壁、肠道、雄性性腺和纵肌中表达量依次降低，各组织间表达量差异显著(P科学依据。

关键词：刺参 TRAF7 高温胁迫基因克隆表达特征

牡蛎养殖对大鹏澳环境因子与浮游菌落扰动研究

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南方水产科学 2024年第5期20卷 32-41页

作者：佟飞冯雪袁华荣陈钰祥舒黎明刘雁陈丕茂中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部南海渔业资源环境科学观测实验站/农业农村部海洋牧场重点实验室广东广州510300 南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海) 广东珠海519000

为评估牡蛎养殖对典型半封闭海湾环境及其生态系统的影响,深入理解其在海洋环境治理和修复中的地位和作用,采用高通量测序技术,对位于典型城市半封闭海湾——大鹏澳的牡蛎养殖区4个季节的水体菌落结构和功能变化进行了分析,并对比了养... 详细信息

为评估牡蛎养殖对典型半封闭海湾环境及其生态系统的影响,深入理解其在海洋环境治理和修复中的地位和作用,采用高通量测序技术,对位于典型城市半封闭海湾——大鹏澳的牡蛎养殖区4个季节的水体菌落结构和功能变化进行了分析,并对比了养殖区与对照区在水体和沉积物环境因子的差异特征。结果表明,牡蛎养殖对大鹏澳水体营养盐等环境因子的扰动相对较小,但其生物沉积作用却增强了海区总有机碳(Total organic carbon,TOC)、硫化物(Sulfide,Sul)和部分重金属的富集。高通量测序结果显示,冬季牡蛎养殖区中的绿弯菌门、脱硫杆菌门和放线菌门等菌落的相对丰度显著高于对照区(p性变化和水文条件等综合因素的制约。同时,牡蛎养殖也促进了N和S的生物地球化学循环。

关键词：牡蛎养殖环境因子浮游菌落大鹏澳

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坛紫菜多糖对冻藏凡纳滨对虾品质维持的研究

食品与发酵工业 2024年

作者：吕金润戚勃杨贤庆李春生赵永强杨少玲刘书成潘创广东海洋大学食品科技学院三亚热带水产研究院海南省深远海渔业资源高效利用与加工重点实验室中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部水产品加工重点实验室国家水产品加工技术研发中心农业农村部水产品贮保鲜质量安全风险评估实验室

探究坛紫菜多糖（polysaccharides derived from Porphyra haitanensis，PHP）对冻藏凡纳滨对虾品质维持的影响。将去壳虾仁分别用1、5、10 mg/mL坛紫菜多糖，去离子水和5 mg/mL磷酸盐浸泡后沥干，-18 ℃冰箱冷冻贮藏30 d，每隔5 d测定... 详细信息

探究坛紫菜多糖（polysaccharides derived from Porphyra haitanensis，PHP）对冻藏凡纳滨对虾品质维持的影响。将去壳虾仁分别用1、5、10 mg/mL坛紫菜多糖，去离子水和5 mg/mL磷酸盐浸泡后沥干，-18 ℃冰箱冷冻贮藏30 d，每隔5 d测定1次指标。结果表明，与空白对照组相比，坛紫菜多糖处理可提高虾仁持水能力，降低解冻损失率与离心损失率；可防止蛋白质与脂质氧化，延缓总巯基含量下降、防止羰基含量和丙二醛含量上升；可维持理化性质稳定，减少pH值与颜色、质构特性等变化。HE染色与扫描电镜结果表明坛紫菜多糖处理通过抑制冰晶生长，可以维持微观结构稳定性与完整性。水分指标与品质指标的相关性表明水分变化是导致冻藏虾仁品质改变的重要因素，而坛紫菜多糖能与水分相互作用，抑制冰晶生长，因而具有更好的抗冻保水效果。该研究有望为坛紫菜多糖作为绿色抗冻保水剂应用到冷冻水产品中提供依据，为低甜、低热的抗冻剂开发和应用提供一定的理论基础与指导。

关键词：坛紫菜多糖冻藏凡纳滨对虾品质维持抗冻剂

基于改进灰色关联度聚类的海水质量状况评价方法研究:以大亚湾为例

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南方水产科学 2024年第1期20卷 141-150页

作者：赵连玲刘华雪饶义勇廖秀丽戴明黄洪辉中国水产科学研究院南海水产研究所/广东省渔业生态环境重点实验室广东广州510300 西安电子科技大学数学与统计学院陕西西安710071

海洋环境质量评价是开展海洋环境管理的依据,而海洋环境评价的精度取决于海洋环境的监测和评价水平。为建立科学有效的指标评价体系,准确分析目前大亚湾西部的海水质量状况,通过改进灰色关联度聚类,将其与层次聚类结合起来,在大亚湾核... 详细信息

海洋环境质量评价是开展海洋环境管理的依据,而海洋环境评价的精度取决于海洋环境的监测和评价水平。为建立科学有效的指标评价体系,准确分析目前大亚湾西部的海水质量状况,通过改进灰色关联度聚类,将其与层次聚类结合起来,在大亚湾核电海域开展了海水质量评价探索研究。结果表明,在海水质量状况相对评价中,一类站点占比20.83%,二类站点占比66.67%,三类站点占比12.5%,总体结果表现良好。将4个季节进行对比发现,平均绝对关联度为夏季(0.7479)>冬季(0.7345)>春季(0.7290)>秋季(0.7097),夏季海水质量状况相对较好,秋季表现较差。根据评价结果可将大亚湾24个站点分成3个区域,而这3个区域的划分与大亚湾周边实际生产生活状况及实地踏勘情况相符,体现了评价方法的可操作性。

关键词：大亚湾海水质量评价灰色关联度层次聚类

养殖密度对投喂模式下网箱养殖刺参生长、消化酶及肠道菌群的影响

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渔业科学进展 2024年第06期 199-211页

作者：宋一明葛建龙廖梅杰李彬荣小军王印庚王锦锦陈丽梅天津农学院中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业与可持续发展重点实验室

为评估养殖密度对投喂模式下浅海网箱养殖刺参(Apostichopusjaponicus)的影响，本研究在辽宁省大连刺参网箱养殖核心区开展了为期42 d的养殖实验，分析了不同养殖密度条件下(10、20、30kg/箱，标记为F10、F20和F30)刺参的生长、消化酶... 详细信息

为评估养殖密度对投喂模式下浅海网箱养殖刺参(Apostichopusjaponicus)的影响，本研究在辽宁省大连刺参网箱养殖核心区开展了为期42 d的养殖实验，分析了不同养殖密度条件下(10、20、30kg/箱，标记为F10、F20和F30)刺参的生长、消化酶及肠道菌群结构的差异。结果显示，F10、F20和F30组增重率(WGR)分别为(51.63±4.27)%、(33.21±8.58)%和(23.08±0.24)%。随着养殖密度的增大，刺参的WGR和特定生长率(SGR)显著降低，净产量增加，饵料系数(FCR)升高。F10组的FCR(0.76±0.06)显著低于F30组(1.72±0.03)(P性均呈下降的趋势，F30组的消化酶活性显著低于F10组和F20组(P性较高，其ACE、Chao1、Shannon和Simpson等多样性指数均显著高于F30组(P性分析显示，链球菌属、Muribaculaceae和UCG＿005属与消化酶活性呈显著正相关。效益估算显示，F20组与F30组养殖效益相差不大，较F10组有大幅提高。研究表明，养殖密度在20～30kg/箱时，可提高养殖净产量，但养殖密度达30 kg/箱时，刺参生长、肠道消化酶活性和微生物多样性显著降低，现有小网箱投喂模式下养殖密度宜提高至20kg/箱。研究结果可为刺参浅海网箱的科学养殖和提质增效提供参考。

关键词：海参网箱养殖养殖密度酶活菌群结构

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预防刺参腐皮综合征复方中药的筛选及体内药效评价

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水生生物学报 2024年第7期48卷 1130-1140页

作者：庞明海王春元王印庚李成华廖梅杰张正荣小军李彬刘妮宁波大学海洋学院宁波315211 中国水产科学研究院黄海水产研究所崂山实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室青岛266071

为开发防治刺参腐皮综合征的复方中药,从14种中药中筛选出对灿烂弧菌(Vibrio splendidus)有明显抑制作用的单味中药,并通过正交实验确定最佳抗菌复方FF-Z(诃子﹕五倍子﹕穿心莲﹕川芎=15 g﹕2 g﹕10 g﹕5 g)。在饲料中分别添加10、20、3... 详细信息

为开发防治刺参腐皮综合征的复方中药,从14种中药中筛选出对灿烂弧菌(Vibrio splendidus)有明显抑制作用的单味中药,并通过正交实验确定最佳抗菌复方FF-Z(诃子﹕五倍子﹕穿心莲﹕川芎=15 g﹕2 g﹕10 g﹕5 g)。在饲料中分别添加10、20、30和40 g/kg的复方FF-Z作为试验组,不含复方FF-Z的饲料为对照组,并以含恩诺沙星粉20 g/kg的饲料为药物对照组,连续投喂刺参10d,继而用终浓度为10^(7) CFU/mL的灿烂弧菌进行浸浴攻毒,以观察预防保护效果。结果显示,灿烂弧菌对复方FF-Z极敏感,抑菌圈直径可达(23.10±0.62)mm,最小抑菌浓度(MIC)和最小杀菌浓度(MBC)值分别为7.81和15.63 mg/mL;与阴性对照组相比,复方FF-Z各剂量组刺参的SOD、ACP和AKP活性显著提高,且优于药物对照组。在灿烂弧菌感染后,复方FF-Z各剂量组处理的刺参发病时间比阳性对照组推迟2d,其中复方FF-Z 20 g/kg组、FF-Z 30 g/kg组和FF-Z 40 g/kg组刺参的20d发病率分别为22.08%、22.14%和14.58%,显著低于阳性对照组的84.45%。组织病理学观察结果表明,添加30 g/kg复方FF-Z的饲料能够有效减轻灿烂弧菌入侵引起的刺参组织炎症反应,从而起到保护作用。研究证明,复方FF-Z能够显著提高刺参的免疫和抗病力,对灿烂弧菌引起的腐皮综合征具有良好的预防保护效果,能延缓该病的发病进程并降低发病率。

关键词：腐皮综合征灿烂弧菌中药复方恩诺沙星体外抑菌刺参

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中华鲎幼鲎生态养殖模式的初步研究

海洋湖沼通报 2024年第1期46卷 84-89页

作者：李银康鲍虞园钟金香陈晓海李俊伟颉晓勇中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室广东广州510300 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 广东省海洋发展规划研究中心广东广州510022

中华鲎被IUCN列入“濒危”名录,进行鲎的人工培育并增殖放流是恢复鲎资源的有效途径,然而目前国内外尚未有适宜的幼鲎批量化生产培育技术。为探索幼鲎人工培育新方法,利用方斑东风螺养殖系统开展了中华鲎幼鲎生态养殖试验。结果显示,中... 详细信息

中华鲎被IUCN列入“濒危”名录,进行鲎的人工培育并增殖放流是恢复鲎资源的有效途径,然而目前国内外尚未有适宜的幼鲎批量化生产培育技术。为探索幼鲎人工培育新方法,利用方斑东风螺养殖系统开展了中华鲎幼鲎生态养殖试验。结果显示,中华鲎幼鲎生态养殖模式显著提高了幼鲎成活率,并促进了幼鲎群体生长发育;经过9个月养殖,生态养殖池幼鲎90%以上个体达到3龄及以上,而单养池中幼鲎超过一半个体仍停滞在1龄;单养池和生态养殖池中螺的存活率和经济效益没有显著性差异。试验表明,中华鲎幼鲎生态养殖模式可有效促进幼鲎生长率并提高存活率,且不影响方斑东风螺养殖的经济效益。

关键词：中华鲎方斑东风螺生态养殖

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多组学视角下植物精油抑菌机理的研究进展

食品科学 2024年第17期45卷 348-356页

作者：王亚哲赵永强王迪陈胜军于刚冯阳王悦齐李春生中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部水产品加工重点实验室广东广州510300 上海海洋大学食品学院上海201306 三亚热带水产研究院海南省深远海渔业资源高效利用与加工重点实验室海南三亚572018

近年来,植物精油的抑菌活性被广泛报道,并在食品、药品和化妆品行业得到广泛开发应用。国内外学者对其抑菌作用机理进行了研究,植物精油可以通过破坏细菌细胞膜、干扰细胞代谢活动、影响细菌核酸和蛋白质的合成等多种方式抑制微生物的生... 详细信息

近年来,植物精油的抑菌活性被广泛报道,并在食品、药品和化妆品行业得到广泛开发应用。国内外学者对其抑菌作用机理进行了研究,植物精油可以通过破坏细菌细胞膜、干扰细胞代谢活动、影响细菌核酸和蛋白质的合成等多种方式抑制微生物的生长,且植物精油成分复杂,具有多作用靶点、广谱抗菌性的特点。随着研究的不断深入,利用组学技术多层面深入解析抑菌机理已成为可能,开辟了植物精油抑菌机理研究的新视角。本文在介绍植物精油种类及抑菌活性的基础上,分别从转录组学、蛋白质组学、代谢组学及多组学联用技术角度系统性总结了植物精油抑菌机理的研究进展,并进行展望,旨在为抑菌剂多靶点抑菌机理解析与植物精油进一步在食品领域应用提供理论依据。

关键词：转录组学蛋白质组学代谢组学植物精油抑菌机理

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稻田-沟渠协同净化池塘养殖尾水效果

淡水渔业 2024年第3期54卷 85-96页

作者：陈思媛陶玲彭亮代梨梨彭格格郝柳柳李谷张辉上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学研究院长江水产研究所武汉430223

为了实现养殖尾水达标排放和循环利用,本研究构建了稻田-农沟-强化沟协同净化系统,考察了各净化单元对池塘养殖尾水中TN、TP、COD_(Mn)和TSS的处理效果,并采用水质标识指数法评价其去除特征和效果,通过浓度沿程衰减的模型拟合分析了相... 详细信息

为了实现养殖尾水达标排放和循环利用,本研究构建了稻田-农沟-强化沟协同净化系统,考察了各净化单元对池塘养殖尾水中TN、TP、COD_(Mn)和TSS的处理效果,并采用水质标识指数法评价其去除特征和效果,通过浓度沿程衰减的模型拟合分析了相关水质指标沿流程变化规律。结果显示:净化系统出水中TN、TP、COD_(Mn)和TSS浓度平均值分别为1.33、0.19、6.61和12.00 mg/L,去除率分别为86.73%、89.26%、85.77%和93.68%。池塘养殖尾水经净化系统处理后综合水质得到明显改善,其中主要污染物TN得到了显著改善,相关水质达到《淡水池塘养殖水排放要求》(SC/T 9101—2007)一级排放要求;TN、TP和COD_(Mn)沿流程变化规律符合线性削减模型。结果表明稻田-沟渠系统可用于池塘养殖尾水的达标排放。

关键词：养殖尾水系统构建净化效果沿程削减模型

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