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两阶段问答范式的生物医学事件触发词检测

计算机工程与应用 2024年第10期60卷 121-131页

作者：行帅熊玉洁苏前敏黄继汉上海工程技术大学电子电气工程学院上海201620 上海中医药大学药物临床研究中心上海201203

现有的生物医学事件触发词检测存在以下缺陷:保留了与触发词无关的冗余信息;忽略了实体与事件之间的潜在关联性;传统方法容易受到数据稀缺性的影响。针对上述问题,提出了一种两阶段问答范式的生物医学事件触发词检测方法。在事件类型识... 详细信息

现有的生物医学事件触发词检测存在以下缺陷:保留了与触发词无关的冗余信息;忽略了实体与事件之间的潜在关联性;传统方法容易受到数据稀缺性的影响。针对上述问题,提出了一种两阶段问答范式的生物医学事件触发词检测方法。在事件类型识别阶段,采用基于句法距离的注意力捕获更有意义的上下文特征,排除无关信息的干扰;为了有效利用实体中的潜在特征,采用全局统计的单词-实体-事件共现特征,指导事件类型感知注意力挖掘词与事件之间的强关联性。在触发词定位阶段,根据识别出的事件类型,制定问题回答该事件对应的触发词索引,从而利用丰富的问答数据库实现数据增强。在MLEE语料库上的结果表明,两阶段问答范式、句法距离和事件类型感知注意力都有效地提升了模型性能,所提出的模型取得了81.39%的F1分数,并在多个事件类型上的详细结果均优于其他基线模型。

关键词：生物医学事件触发词检测句法距离单词-实体-事件共现特征两阶段问答范式

极区电离层N_(m)F_(2)观测与国际参考电离层对比研究

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极地研究 2024年第1期36卷 26-36页

作者：徐盛李培豪廖小倩刘瑞源陈相材郑州轻工业大学计算机与通信工程学院河南郑州450000 自然资源部极地科学重点实验室中国极地研究中心(中国极地研究所)上海200136

利用南北极极隙区与极光带纬度3个台站对电离层F2层峰值电子密度(N_(m)F_(2))长达1个太阳活动周的观测数据,对国际参考电离层IRI-2016模型在极区的适用性进行系统的定量研究。结果表明,在极光带纬度的北极Tromsø站,IRI预测与观测符合最... 详细信息

利用南北极极隙区与极光带纬度3个台站对电离层F2层峰值电子密度(N_(m)F_(2))长达1个太阳活动周的观测数据,对国际参考电离层IRI-2016模型在极区的适用性进行系统的定量研究。结果表明,在极光带纬度的北极Tromsø站,IRI预测与观测符合最好,大部分季节相对误差在40%以内,在太阳活动高年略好于太阳活动低年。在极隙区纬度的南极中山站和Longyearbyen站,IRI预测精度在太阳活动低年高于太阳活动高年。在中山站和北极Longyearbyen站仅个别月份相对误差在20%以内,大部分月份相对误差超过40%,冬季相对误差接近100%,特别是Longyearbyen站,在太阳活动高年冬季相对误差超过100%。从季节上看,3个台站都是冬季符合最差,夏季符合最好。IRI-2016模型对极区电离层进行预测时,难以如实反映极区等离子体对流和能量粒子沉降等极区特有的物理过程对极区电离层N_(m)F_(2)的影响。

关键词：极区电离层国际参考电离层 IRI-2016模型 F2层峰值电子密度(N_(m)F_(2))

成人DICER1基因突变甲状腺肿瘤临床病理特征分析

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中华医学杂志 2024年第18期104卷 1623-1627页

作者：唐娟黄敬敬罗彦丽张立坤王倩倩陈杰刘志艳上海交通大学医学院附属第六人民医院病理科上海山东省临沂市中医医院病理科临沂

筛选病理形态特征提示DICER1基因突变的甲状腺肿瘤37例行Sanger测序检测DICER1基因及BRAF基因。共10例患者表现为DICER1基因体系突变(27.0%), 均为女性, 年龄[M(Q1, Q3)]为38.0(30.5, 47.5)岁, BRAFV600E基因均为野生型。DICER1基因突... 详细信息

筛选病理形态特征提示DICER1基因突变的甲状腺肿瘤37例行Sanger测序检测DICER1基因及BRAF基因。共10例患者表现为DICER1基因体系突变(27.0%), 均为女性, 年龄[M(Q1, Q3)]为38.0(30.5, 47.5)岁, BRAFV600E基因均为野生型。DICER1基因突变肿瘤超声示高-低回声结节, 界限清, 肿瘤周边及内部血流信号丰富。肿瘤局限于甲状腺内, 直径(3.68±1.31)cm。病理特征为:肿瘤绝大多数具有纤维结缔组织包膜, 以大滤泡结构为主、富含胶质, 部分为小滤泡及微滤泡结构、细胞核圆形深染或略淡染, 小至中等大小, 偶见核沟, 缺乏核内假包涵体。免疫组化染色显示Ki67增殖指数2%～10%。所有病例随访11～18个月, 均无复发和远处转移。本研究证实DICER1基因突变与BRAFV600E基因突变互斥。DICER1基因突变甲状腺肿瘤体积偏大, 好发于年轻女性, 预后好。DICER1基因野生型病例可表现为相似形态学特征, 推荐行分子检测。如明确DICER1基因体系突变, 患者应行胚系突变检测确诊除外DICER1综合征以明确是否需要遗传咨询。

关键词：甲状腺肿瘤 DICER1基因突变临床病理特征

KRT6A调控胰腺导管腺癌细胞生物学行为的作用及作为诊断与预后判断靶标的研究

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中国肿瘤生物治疗杂志 2024年第5期31卷 462-468页

作者：王浩泽杨轩陈昕苑顾炎海军军医大学基础医学院免疫学教研室暨免疫与炎症全国重点实验室上海200433

目的:通过生物信息学分析以及细胞生物学实验研究角蛋白6A(KRT6A)对胰腺导管腺癌(PDAC)诊断、预后判断、免疫微环境以及PDAC细胞PANC1增殖、凋亡等生物学行为的影响。方法:通过GEPIA平台整合TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库与GTEx(... 详细信息

目的:通过生物信息学分析以及细胞生物学实验研究角蛋白6A(KRT6A)对胰腺导管腺癌(PDAC)诊断、预后判断、免疫微环境以及PDAC细胞PANC1增殖、凋亡等生物学行为的影响。方法:通过GEPIA平台整合TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库与GTEx(Genotype-Tissue)数据库中的数据,分析KTRT6A在PDAC组织中的表达情况,并通过CIBERSORT工具分析KRT6A表达与PDAC组织中免疫细胞浸润的关系,然后通过GSEA方法研究与KRT6A基因表达相关的肿瘤信号通路。选取长海医院病理科保存的60例PDAC组织与癌旁组织标本进行免疫组化分析,验证KRT6A在肿瘤组织中表达情况;通过干扰RNA敲减PANC1细胞中KRT6A的表达,采用CCK-8实验以及流式细胞术检测敲减KRT6A对细胞的增殖、凋亡的影响。结果:利用TCGA与GTEx数据库数据分析发现,KRT6A在人PDAC组织中呈高表达,且与患者较差的生存期存在关联(P=0.015)。利用CIBERSORT软件以及GSEA分析发现,KRT6A高表达的PDAC组织中M2型巨噬细胞浸润性升高(P=0.034),且与Wnt通路(NES:1.7359272,P<0.05)、磷酸戊糖途径(PPP)(NES:1.5613053,P<0.05)等信号通路上调有关联(P<0.05或P<0.01);免疫组化结果进一步验证了KRT6A在PDAC组织中呈高表达(P<0.001)。增殖和凋亡实验发现,干扰KRT6A能够显著抑制PANC1细胞的增殖(P<0.05)以及凋亡(P<0.001)。结论:KRT6A在人PDAC组织中呈高表达,敲减其表达能够抑制PANC1细胞的增殖和凋亡,具有作为PDAC诊断与预后判断新靶标的潜力。

关键词：胰腺导管腺癌 KRT6A基因 PANC1细胞增殖凋亡诊断预后

AISL:一个基于LAMMPS的XFEL辐照损伤自动化模拟程序

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核技术 2024年第4期47卷 97-106页

作者：周悦海雪任翠兰殷亚茹商琨琳雷蕾怀平上海科技大学上海201210 中国科学院上海应用物理研究所上海201800 中国科学院大学北京100049 中国科学院上海高等研究院上海201210

在高强度X射线辐照下,X射线自由电子激光(X-ray Free-electron Laser,XFEL)装置的光学元件薄膜产生的大量辐照缺陷会导致材料结构损伤,引起宏观性能退化,从而影响其服役寿命,进而影响到XFEL装置的可靠性和稳定性。为了研究材料辐照缺陷... 详细信息

在高强度X射线辐照下,X射线自由电子激光(X-ray Free-electron Laser,XFEL)装置的光学元件薄膜产生的大量辐照缺陷会导致材料结构损伤,引起宏观性能退化,从而影响其服役寿命,进而影响到XFEL装置的可靠性和稳定性。为了研究材料辐照缺陷过程以及方便耐辐照材料的数据积累,提供了一种基于Python语言的自动化辐照模拟程序AISL(Automatic Irradiation Simulation based on LAMMPS),以支持采用分子动力学方法模拟XFEL对材料的辐照损伤进行微观研究。AISL实现了模拟任务的自动化工作流管道,包括高通量计算任务的管理和执行,计算数据的高可靠存储和热力学信息的后处理。基于AISL在XFEL光学元件金属薄膜辐照损伤模拟的应用实例研究,表明了AISL是一种便捷开展高通量自动化的辐照模拟研究的有效方法,能够显著提高基于LAMMPS的材料辐照损伤模拟计算效率。

关键词： XFEL 辐照损伤 LAMMPS 工作流数据库

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道路基础设施管养标准图谱体系

同济大学学报（自然科学版） 2024年第1期52卷 95-103页

作者：蔡文渊刘成龙吴荻非高紫月杜豫川同济大学道路与交通工程教育部重点实验室上海201804 上海城市基础设施更新工程技术研究中心上海200032

为提升道路基础设施管养标准体系的一致性和完整性,探究了对道路基础设施管养影响较大的重要标准并分析了标准体系的时间、地域特色。建立道路基础设施管养标准规范的引用网络,使用度中心性、半局部中心性、PageRank算法估复杂网络中关... 详细信息

为提升道路基础设施管养标准体系的一致性和完整性,探究了对道路基础设施管养影响较大的重要标准并分析了标准体系的时间、地域特色。建立道路基础设施管养标准规范的引用网络,使用度中心性、半局部中心性、PageRank算法估复杂网络中关键节点的重要性,并引入逼近理想解排序(TOPSIS)法进行综合评估,从标准引用网络中挖掘出具有重要性、代表性、权威性的标准规范。此外,使用基于词云的词频统计方法分析了不同时间段内标准和3个不同地理分区地方标准的主题热点,得到养护技术、养护对象的特点。通过道路管养标准图谱梳理了道路基础设施管养标准的关联与脉络,为完善标准体系提供了重要参考。

关键词：交通工程道路基础设施管养标准图谱复杂网络分析重要节点

等离子电弧双丝增材制造Ti-48Al合金组织特征

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焊接学报 2024年第2期45卷 1-6,I0003页

作者：王林华学明沈忱张跃龙李芳周雯露丁煜瀚上海交通大学上海市激光制造与材料改性重点实验室上海200240

采用等离子电弧双丝增材制造技术成功制备了Ti-48Al合金(at.%),并对其沉积态和热处理后的组织特征进行了系统地研究.结果表明,沉积态Ti-48Al合金主要由α2相和γ相组成,沿着沉积方向,沉积态组织呈现由树枝晶区和片层晶团区交替分布的不... 详细信息

采用等离子电弧双丝增材制造技术成功制备了Ti-48Al合金(at.%),并对其沉积态和热处理后的组织特征进行了系统地研究.结果表明,沉积态Ti-48Al合金主要由α2相和γ相组成,沿着沉积方向,沉积态组织呈现由树枝晶区和片层晶团区交替分布的不均匀性特征,并且在树枝晶区存在严重的枝晶间Al元素偏析现象.在1 340℃/10 h/炉冷热处理后,不均匀的沉积态组织转变为晶粒尺寸细小的双态组织,Ti-48Al合金的微观组织的不均匀性获得明显改善,并且α2相含量显著增加,组织的择优取向减弱.

关键词：电弧增材制造 TiAl合金微观组织热处理

银粉对硅异质结太阳电池用低温银浆的影响综述

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太阳能学报 2024年第2期45卷 489-498页

作者：王光远韩安军刘文柱赵文婕王栋良敖毅伟冈本珍范孟凡英刘正新中国科学院上海微系统与信息技术研究所新能源技术中心上海200050 常州聚和新材料股份有限公司常州213000

银浆是硅异质结太阳电池的重要材料,更低的体积电阻率和接触电阻、良好的附着力、优良的细线印刷性能及组件栅线抗腐蚀老化是其不断改进的方向。作为导电相,银粉的性能和含量对银浆有着至关重要的影响。该文基于低温固化银浆导电机理以... 详细信息

银浆是硅异质结太阳电池的重要材料,更低的体积电阻率和接触电阻、良好的附着力、优良的细线印刷性能及组件栅线抗腐蚀老化是其不断改进的方向。作为导电相,银粉的性能和含量对银浆有着至关重要的影响。该文基于低温固化银浆导电机理以及SHJ电池对银浆性能的追求,综述了银粉的振实密度、形貌、粒径、表面处理剂及其与有机物的适配。进一步探讨了纳米银粉和银包铜粉在SHJ太阳电池用低温银浆中的应用。

关键词：硅异质结太阳电池低温银浆银粉表面处理振实密度银包铜

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基于数字孪生与元宇宙的能源互联网认知系统论(二):面向复杂系统涌现现象的虚拟仿真推演框架

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中国电机工程学报 2024年第11期44卷 4311-4322,I0011页

作者：贺兴潘美琪唐跃中郝然艾芊电力传输与功率变换控制教育部重点实验室(上海交通大学) 上海市闵行区200240 上海交通大学国家电投智慧能源创新学院上海市闵行区200240 国网上海市电力公司上海市浦东新区200122 国家电力调度与控制中心北京市西城区100032

复杂性是能源互联网的重要特征与演进趋势,复杂性及其所伴随的涌现现象往往使得基于机理模型(白箱子)的仿真、分析、推演方法不再适用于复杂系统。得益于数据科学、仿真技术、孪生技术的共同发展,虚拟孪生技术成为应对复杂系统的利器。... 详细信息

复杂性是能源互联网的重要特征与演进趋势,复杂性及其所伴随的涌现现象往往使得基于机理模型(白箱子)的仿真、分析、推演方法不再适用于复杂系统。得益于数据科学、仿真技术、孪生技术的共同发展,虚拟孪生技术成为应对复杂系统的利器。面向复杂性,该文对虚拟孪生技术及其应用前景进行探究,并重点讨论虚拟孪生系统的基本特性、支撑理论、技术体系、建设流程及其案例分析等,进一步提出基于虚拟仿真推演技术的涌现现象认知框架。该工作一方面为在能源系统中开展虚拟孪生工作提供参考借鉴,另一方面也有益于虚拟孪生技术的推进。

关键词：复杂性认知涌现虚拟仿真能源互联网(EIoT)

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