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Co and postseismic fault slip models of the 2022 M_(W)6.7 Menyuan earthquake reveal conjugated faulting tectonics at the central section of the Lenglongling fault

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Earthquake Science 2024年第4期37卷 277-303页

作者： zilong he Wenbin Xu Zhiwei Li Lei Xie Guangcai Feng Nan Fang Xiaoge Liu Kai Sun Zhidan Chen Zhihui Zhu School of Geosciences and Info-Physics Central South UniversityChangsha 410083China Key Laboratory of Metallogenic Prediction of Nonferrous Metals and Geological Environment Monitoring Central South UniversityChangsha 410083China School of Civil Engineering Central South UniversityChangsha 410083China

The 2022 M_(W)6.7 Menyuan earthquake ruptured the western end of the Tianzhu seismic gap,providing an opportunity to study the regional seismogenic characteristics and seismic *** we use interferometric synthetic aperture radar(InSAR)and seismic data to study the mainshock rupture,early afterslip and the second largest aftershock of the 2022 Menyuan earthquake *** modeling results show that the mainshock ruptured the Lenglongling fault and the Tuolaishan fault with a maximum slip of~3 *** postseismic transient deformation occurred at the center of the Lenglongling *** afterslip modeling reveals that the majority of afterslip occurred in the deeper part of the Lenglongling fault.A high-angle conjugated faulting event is found at the middle section of the Lenglongling *** use the stress inversion to investigate the possible triggering mechanism of the conjugated rupture *** results indicate the maximum principal stress direction is in~222°,forming a~22°angle between the conjugated fault of second largest aftershock and the *** calculated normal stress changes indicate the region is within a pull-apart stress field,which favors such a conjugated rupturing *** study will help understand the rupture behavior of such kind of conjugated fault in other regions.

关键词： coseismic displacement and slip postseismic deformation and afterslip conjugate rupture coulomb stress change stress inversion

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中国产业循环的演变特征与动力机制

河南社会科学 2024年第9期32卷 1-11页

作者：李善同蒋雪梅何子龙国务院发展研究中心北京100010 首都经济贸易大学经济学院北京100070

加快构建以国内大循环为主体、国内国际双循环相互促进的新发展格局,是关系中国发展全局的重大战略任务,也是推动高质量发展的重大举措。基于中国多区域投入产出表,利用增加值分解的方法测度了1987-2017年中国不同产业的循环结构和演变... 详细信息

加快构建以国内大循环为主体、国内国际双循环相互促进的新发展格局,是关系中国发展全局的重大战略任务,也是推动高质量发展的重大举措。基于中国多区域投入产出表,利用增加值分解的方法测度了1987-2017年中国不同产业的循环结构和演变趋势,并揭示了产业经济循环结构变化的影响及其背后的动力机制。研究发现:第一,1987-2017年中国一直以国内大循环为主体,绝大多数产业的国内循环占比超过50%,尤其是农业、建筑业和公共服务业。第二,随着市场化改革的深入和基础设施的完善,省际循环占比呈现快速上升趋势,中间品制造业趋势表现更加显著。第三,国外循环的支撑产业正逐渐从纺织业、服装皮革业等劳动密集型产业转为电子信息制造业等技术密集型产业,产业结构升级也正在成为经济发展质量提升的新动能。第四,交互循环占比提升,表明国内循环与国际循环的互联互通性正在加强。深入分析中国产业循环结构的演变,能够为新发展格局下经济政策的制定提供参考。

关键词：新发展格局全国统一大市场投入产出分析产业循环测度

基于多尺度残差融合图卷积网络的脑疾病诊断研究

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数据采集与处理 2024年第4期39卷 827-842页

作者：郝小可何子龙卢欣楚马明明刘时宇河北工业大学人工智能与数据科学学院天津300401

近年来,功能性脑网络已被用于自闭症谱系障碍(Autism spectrum disorder,ASD)等脑部疾病的诊断。现有研究表明,将静息态功能磁共振成像(Resting-state functional magnetic resonance imaging,rs-fMRI)数据以及非影像信息结合起来构成... 详细信息

近年来,功能性脑网络已被用于自闭症谱系障碍(Autism spectrum disorder,ASD)等脑部疾病的诊断。现有研究表明,将静息态功能磁共振成像(Resting-state functional magnetic resonance imaging,rs-fMRI)数据以及非影像信息结合起来构成人口图,然后采用图神经网络(Graph neural network,GNN)进行学习和分类的方法对ASD的诊断十分有效。然而,大多数研究仍然面临两个挑战:一是仅使用皮尔森相关系数等方法构建功能连接矩阵无法有效地识别和分析与疾病相关的局部脑区和生物标志物;二是无法在GNN上有效地学习人口图中节点特征的多尺度信息。为解决这些问题,提出了一种基于注意力机制的多尺度残差融合图卷积网络(Multi-scaleresidualfusiongraph convolutional networks,MSRF-GCN)。该算法通过设计一个功能连接生成器来提取具有远程依赖关系的时间相关特征,从而有效地定位和识别对诊断有益的脑区。同时,通过设计多尺度残差融合算法,学习人口图中的多尺度信息。此外,还引入了Edge Sparse策略,通过随机丢弃初始人口图中的边,以增加节点连接的稀疏性,进而减少训练期间过拟合的风险。通过在自闭症脑影像数据交换项目(Autism brain imaging data exchange,ABIDE)上进行实验的结果证明了MSRF-GCN在ASD诊断方面的有效性。

关键词：自闭症谱系障碍功能连接注意力机制人口图图神经网络

基于双模态乳腺影像特征的heR2表达状态多分类机器学习预测模型构建及可解释性分析研究

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临床放射学杂志 2024年第8期43卷 1310-1316页

作者：舒予静何子龙曾伟雄刘家玲郭丫丫陈卫国南方医科大学南方医院放射科广州510515 广东医科大学附属东莞第一医院放射影像中心东莞523710

目的基于乳腺X线及超声双模态影像特征构建多分类机器学习模型,术前预测乳腺癌患者的人类表皮生长因子受体2(heR2)表达状态。方法搜集符合纳排标准的632例女性乳腺癌患者,其中heR2不表达141例、低表达311例、高表达180例。提取研究对象... 详细信息

目的基于乳腺X线及超声双模态影像特征构建多分类机器学习模型,术前预测乳腺癌患者的人类表皮生长因子受体2(heR2)表达状态。方法搜集符合纳排标准的632例女性乳腺癌患者,其中heR2不表达141例、低表达311例、高表达180例。提取研究对象全视野数字化乳腺X线摄影(FFDM)、数字乳腺断层摄影(DBT)以及乳腺超声(US)图像上乳腺癌病灶的影像学征象。在完成数据预处理后,基于五种机器学习算法构建乳腺癌heR2表达状态的三分类预测模型。采用五折交叉验证训练机器学习模型,计算三分类模型的总体准确率、精确率、查全率、F1⁃score、受试者工作特征曲线(ROC)曲线下面积(AUC)值。通过Bootstrap法比较模型间AUC值,筛选出分类性能最优的三分类模型。采用SHAP方法评估每个特征对模型预测heR2表达状态的重要性。结果在测试集上,随机森林(RF)模型对heR2表达状态的三分类性能最优,宏平均AUC为0.723,微平均AUC为0.783,总体准确率为57.4%,宏平均召回率为53.0%。SHAP分析结果表明,影响RF模型输出最重要的五个全局特征依次为X线观察到的钙化、舒张压、细线样或线样分支状钙化、US测量的病灶最大径、CA153。结论基于乳腺X线及超声双模态影像特征的机器学习多分类模型可以实现乳腺癌患者heR2表达状态的术前预测,结合SHAP方法可以提高机器学习模型的可解释性。

关键词：乳腺癌 heR2 表达状态乳腺X 线摄影超声机器学习

白术对慢传输型便秘小鼠短链脂肪酸和肠道屏障的影响

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中国实验方剂学杂志 2024年第6期30卷 66-74页

作者：尹康陈科力刘焱文刘松林贺子龙杨立朝陈新詹志来湖北中医药大学中药资源与中药化学湖北省重点实验室武汉430065 北京航空航天大学医学科学与工程学院北京100191 厦门大学医学院福建厦门361005 中国中医科学院中药资源中心道地药材品质保障与资源持续利用全国重点实验室北京100700

目的:通过观察生白术对慢传输型便秘(STC)小鼠的短链脂肪酸和肠道屏障的影响,探究其治疗STC的作用机制。方法:将48只雄性KM小鼠随机分为空白组、模型组、生白术低、中、高剂量组(2.5、5、10g·kg^(-1))及莫沙必利组(2.5 mg·kg^(-1))。... 详细信息

目的:通过观察生白术对慢传输型便秘(STC)小鼠的短链脂肪酸和肠道屏障的影响,探究其治疗STC的作用机制。方法:将48只雄性KM小鼠随机分为空白组、模型组、生白术低、中、高剂量组(2.5、5、10g·kg^(-1))及莫沙必利组(2.5 mg·kg^(-1))。除空白组外,其余各组均灌胃洛哌丁胺混悬液(5 mg·kg^(-1)),2次/d,连续灌胃14 d,构建STC小鼠模型。同时各给药组给予相应的药物灌胃治疗,连续14 d,空白组和模型组灌胃等体积蒸馏水。观察生白术治疗对小鼠体质量、排便频率、粪便含水率、肠道推进率的影响;苏木素-伊红(he)和过碘酸-雪夫(PAS)染色观察小鼠结肠的病理变化;酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测小鼠血清中胃泌素(GAS)和胃动素(MTL)的含量;气相色谱质谱联用法(GC-MS)检测小鼠粪便中短链脂肪酸(SCFAs)的含量;实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)和蛋白免疫印迹法(Western blot)检测小鼠结肠中闭锁小带蛋白-1(ZO-1)、咬合蛋白(Occludin)和闭合蛋白-1(Claudin-1)的mRNA和蛋白表达水平。结果:与空白组比较,模型组小鼠的体质量、排便频率、粪便含水率、肠道推进率均明显下降(P<0.05,P<0.01);结肠组织排列紊乱,杯状细胞数量减少;血清中GAS、MTL的含量均显著下降(P<0.01);粪便中SCFAs的含量均有下降趋势,其中乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸、戊酸的含量明显下降(P<0.05,P<0.01);结肠组织中ZO-1、Occludin和Claudin-1的mRNA和蛋白表达水平均显著降低(P<0.01)。与模型组比较,生白术低、中、高剂量组小鼠体质量、排便频率、粪便含水率、肠道推进率均明显上升(P<0.05,P<0.01);结肠组织黏膜层结构完整,无明显损伤,杯状细胞的数量增多;血清中GAS、MTL的含量均显著上升(P<0.01);粪便中短链脂肪酸的含量均有上升趋势,其中乙酸、丙酸、丁酸、异丁酸的含量明显上升(P<0.05,P<0.01);结肠组织中ZO-1、Occludin、Claudin-1的mRNA和蛋白表达水平均明显上升(P<0.05,P<0.01)。结论:生白术能够改善STC小鼠的便秘症状,其作用机制可能与提高肠道中SCFAs含量及促进结肠中ZO-1、Occludin和Claudin-1的mRNA及蛋白水平表达有关。

关键词：白术慢传输型便秘短链脂肪酸肠道屏障洛哌丁胺紧密连接气相色谱质谱联用法(GC-MS)

基于网络药理学与代谢组学和分子对接的整合药理学策略研究温胆汤治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制

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中国药学杂志 2024年第11期59卷 998-1010页

作者：牛旭东何溢琨何梓龙陈爱灵高文浩任腾飞朱珍珍汪芳任睿楠林松王天阳齐齐哈尔医学院基础医学院黑龙江齐齐哈尔161006 齐齐哈尔医学院药学院黑龙江齐齐哈尔161006 齐齐哈尔医学院基础医学院基础医学科研中心黑龙江齐齐哈尔161006 黑龙江省药食同源资源与代谢性疾病防治重点实验室黑龙江齐齐哈尔161006

目的探讨温胆汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的作用机制。方法首先,基于网络药理学方法,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Swiss Target Prediction和Metascape等数据库,揭示温胆汤治... 详细信息

目的探讨温胆汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的作用机制。方法首先,基于网络药理学方法,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Swiss Target Prediction和Metascape等数据库,揭示温胆汤治疗COPD的潜在机制;其次,采用代谢组学方法,研究温胆汤对COPD诱发内源性代谢物紊乱的干预作用;最后,借助MetScape算法,整合网络药理学与代谢组学研究结果,并采用分子模拟对接和分子生物学方法,深入研究温胆汤治疗COPD的作用机制。结果网络药理学结果揭示温胆汤的102个潜在活性成分及其治疗COPD的98个潜在靶点。进一步分析显示温胆汤的11个潜在药效物质,包括3-叔丁基己二酸、6-甲基姜辣二醇双乙酸酯和甘草异黄烷酮等可能通过调节脂质与动脉粥样硬化、环磷腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphoinositide 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)信号通路和白介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路等发挥疗效。另一方面代谢组学研究显示,丙二醇、N-乙酰神经氨酸、苏氨酸、原胆酸、2-氧异戊酸酯、乙酰磷酸、柠檬酸盐和异丁酸等9种内源性物质,可能是温胆汤治疗COPD的关键代谢物。最后整合分析显示,脂质代谢与氨基酸代谢可能是温胆汤治疗COPD的关键过程,黄嘌呤脱氢酶(xanthine dehydrogenase,XDH)、激酶插入区受体(kinase insert domain receptor,KDR)、磷酸二酯酶5A(phosphodiesterase 5A,PDE5A)、细胞色素P450家族2亚家族C成员9(cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9,CYP2C9)和成员19(cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19,CYP2C19)等同氧化和炎症相关的基因可能是温胆汤发挥治疗作用的关键靶点;并且结果显示温胆汤可有效改善COPD大鼠肺部充血、水肿和炎性细胞浸润等多种病理状态,显著降低COPD大鼠肺组织中白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)含量和丙二醛(malonaldehyde,MDA)活性,提高超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性;而且分子对接结果也揭示了潜在药效物质与核心靶点基因之间的关联性。结论基于代谢组学、网络药理学和分子对接的整合药理学研究表明温胆汤可能通过调控炎症反应、氧化应激、脂质代谢和氨基酸代谢等途径实现治疗COPD的作用。

关键词：温胆汤慢性阻塞性肺疾病网络药理学代谢组学分子对接炎症因子

影像组学及影像基因组学预测乳腺癌分子分型的研究进展

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国际医学放射学杂志 2024年第3期47卷 306-309页

作者：耿天吴泽琪秦耿耿何子龙(审校) 南方医科大学南方医院医学影像科广州510515

影像组学可从医学图像中高通量地提取大量影像特征,影像基因组学则侧重于挖掘影像数据与基因组之间的相关性。基于动态对比增强MRI(DCE-MRI)、乳腺X线摄影、乳腺超声等成像技术,影像组学及影像基因组学能够评估乳腺癌的肿瘤异质性及生... 详细信息

影像组学可从医学图像中高通量地提取大量影像特征,影像基因组学则侧重于挖掘影像数据与基因组之间的相关性。基于动态对比增强MRI(DCE-MRI)、乳腺X线摄影、乳腺超声等成像技术,影像组学及影像基因组学能够评估乳腺癌的肿瘤异质性及生物学行为,为乳腺癌诊断、疗效评估及预后预测等方面的研究提供了新途径和新思路,尤其在术前无创性地预测乳腺癌分子分型方面显示出极大的潜能。就影像组学及影像基因组学预测乳腺癌分子亚型方面的研究进展予以综述。

关键词：乳腺癌分子分型影像组学影像基因组学乳腺X线摄影体层摄影术,X线计算机磁共振成像超声

维普期刊数据库博看期刊

Selection for Cheaper Amino Acids Drives Nucleotide Usage at the Start of Translation in Eukaryotic Genes

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2021年第6期19卷 949-957页

作者： Na L.Gao zilong he Qianhui Zhu Puzi Jiang Songnian Hu Wei-Hua Chen Key Laboratory of Molecular Biophysics of the Ministry of Education Hubei Key Laboratory of Bioinformatics and Molecular-imagingDepartment of Bioinformatics and Systems BiologyCollege of Life Science and TechnologyHuazhong University of Science and TechnologyWuhan 430074China Institute for Computer Science and Cluster of Excellence on Plant Sciences Heinrich Heine UniversityD-40225 DuesseldorfGermany CAS Key Laboratory of Genome Sciences and Information Beijing Institute of GenomicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China State Key Laboratory of Microbial Resources Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Beijing Advanced Innovation Center for Big Data-Based Precision Medicine Interdisciplinary Innovation Institute of Medicine and EngineeringBeihang UniversityBeijing 100191China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China

Coding regions have complex interactions among multiple selective forces,which are manifested as biases in nucleotide *** studies have revealed a decreasing GC gradient from the 5′-end to 3′-end of coding regions in various *** confirmed that this gradient is universal in eukaryotic genes,but the decrease only starts from the~25th *** trend is mostly found in nonsynonymous(ns)sites at which the GC gradient is universal across the eukaryotic *** GC contents at ns sites result in cheaper amino acids,indicating a universal selection for energy efficiency toward the N-termini of encoded *** a genome,the decreasing GC gradient is intensified from lowly to highly expressed genes(more and more protein products),further supporting this *** reveals a conserved selective constraint for cheaper amino acids at the translation start that drives the increased GC contents at ns *** GC contents can facilitate transcription but result in a more stable local secondary structure around the start codon and subsequently impede translation ***,the GC gradients at four-fold and two-fold synonymous sites vary across *** could decrease or increase,suggesting different constraints acting at the GC contents of different codon sites in different *** study reveals that the overall GC contents at the translation start are consequences of complex interactions among several major biological processes that shape the nucleotide sequences,especially efficient energy usage.

关键词： Macroevolution Prioritization of selective forces Energy efficiency Transcription Translation initiation

血栓性非硬化门脉高压症的遗传易感性研究进展

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国际检验医学杂志 2024年第19期45卷 2305-2310页

作者：马文霞贺子龙丁惠国吕翎娜首都医科大学附属北京佑安医院肝病消化中心/首都医科大学基础临床联合实验室北京100069 北京航空航天大学医学科学与工程学院北京100191

肝外型非硬化门脉高压症(NH-PH)是以肝外非硬化门静脉血栓形成和Budd-Chiari综合征(布加综合征)为代表的门脉高压疾病,二者的病因都归于内脏静脉血栓,具有多种共同的遗传易感因素。该文综述了血栓性NH-PH的遗传易感性研究进展,并对已报... 详细信息

肝外型非硬化门脉高压症(NH-PH)是以肝外非硬化门静脉血栓形成和Budd-Chiari综合征(布加综合征)为代表的门脉高压疾病,二者的病因都归于内脏静脉血栓,具有多种共同的遗传易感因素。该文综述了血栓性NH-PH的遗传易感性研究进展,并对已报道的遗传易感基因及其突变位点进行整理分析,同时提示其他潜在的遗传易感基因靶点,以期为后续临床大样本验证提供筛选靶标,为NH-PH的早期诊断和发病机制研究提供新思路。

关键词：非硬化门脉高压症血栓布加综合征遗传易感性

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