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Pig pangenome graph reveals functional features of non‑reference sequences

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2024年第3期15卷 956-970页

作者： Jian Miao Xingyu Wei Caiyun Cao Jiabao Sun Yuejin Xu Zhe zhang qishan Wang Yuchun Pan Zhen Wang College of Animal Sciences Zhejiang UniversityHangzhou 310058ZhejiangChina Yazhou Bay Science and Technology City Hainan Institute of Zhejiang UniversityYazhou DistrictBuilding 11Yongyou Industrial ParkSanya 572025HainanChina

Background The reliance on a solitary linear reference genome has imposed a significant constraint on our compre-hensive understanding of genetic variation in *** constraint is particularly pronounced for non-reference sequences(NRSs),which have not been extensively *** In this study,we constructed a pig pangenome graph using 21 pig assemblies and identified 23,831 NRSs with a total length of 105 *** findings revealed that NRSs were more prevalent in breeds exhibiting greater genetic divergence from the reference ***,we observed that NRSs were rarely found within coding sequences,while NRS insertions were enriched in immune-related Gene Ontology ***,our investigation also unveiled a close association between novel genes and the immune capacity of *** observed substantial differences in terms of frequencies of NRSs between Eastern and Western pigs,and the heat-resistant pigs exhibited a substantial number of NRS insertions in an 11.6 Mb interval on chromosome ***,we discovered a 665 bp insertion in the fourth intron of the TNFRSF19 gene that may be associated with the ability of heat tolerance in South-ern Chinese *** Our findings demonstrate the potential of a graph genome approach to reveal important functional features of NRSs in pig populations.

关键词： Heat tolerance Immune ability Non-reference sequences Pig pangenome

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软件GPS接收机架构与捕获算法实现

北京航空航天大学学报 2006年第1期32卷 53-56页

作者：赵昀张其善北京航空航天大学电子信息工程学院北京100083

为了将软件无线电技术应用于全球定位系统GPS(Global Positioning System)接收机,提出了一种符合目前硬件技术水平的软件GPS接收机设计架构;分析了软件GPS接收机信号捕获方法的要求;采用循环相关算法作为软件GPS接收机的信号捕获算法,在... 详细信息

为了将软件无线电技术应用于全球定位系统GPS(Global Positioning System)接收机,提出了一种符合目前硬件技术水平的软件GPS接收机设计架构;分析了软件GPS接收机信号捕获方法的要求;采用循环相关算法作为软件GPS接收机的信号捕获算法,在Matlab仿真环境下实现了相应的捕获程序,并使用GPS卫星C/A码信号采集数据进行了初步验证;初步验证结果表明这种捕获算法能够为软件GPS接收机提供快速捕获能力,同时不损失信号搜索的灵敏度,是一种适用而高效的软件GPS接收机捕获方法.

关键词：全球定位系统软件接收机捕获算法循环相关 Matlab

GPS SATELLITE SIMULATOR SIGNAL ESTIMATION BASED ON ANN

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Journal of Electronics(China) 2005年第5期22卷 458-464页

作者： Kou Yanhong Yang Dongkai zhang qishan School of Electronic and Information Engineering Beihang University Belting 100083 China

Multi-channel Global Positioning System (GPS) satellite signal simulator is used to provide realistic test signals for GPS receivers and navigation systems. In this paper, signals arriving the antenna of GPS receiver are analyzed from the viewpoint of simulator design. The estimation methods are focused of which several signal parameters are difficult to determine directly according to existing experiential models due to various error factors. Based on the theory of Artificial Neural Network (ANN), an approach is proposed to simulate signal propagation delay,carrier phase, power, and other parameters using ANN. The architecture of the hardware-in-the-loop test system is given. The ANN training and validation process is described. Experimental results demonstrate that the ANN designed can statistically simulate sample data in high *** the computation of signal state based on this ANN can meet the design requirement,and can be directly applied to the development of multi-channel GPS satellite signal simulator.

关键词： Artificial Neural Network (ANN) Global Positioning System (GPS) Simulator Signal estimation Pseudorange error

WAVELET KERNEL SUPPORT VECTOR MACHINES FOR SPARSE APPROXIMATION

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Journal of Electronics(China) 2006年第4期23卷 539-542页

作者： Tong Yubing Yang Dongkai zhang qishan Dept of Electronic Information Engineering Beijing University of Aeronautics and astronautics Beijing 100083 China

Wavelet, a powerful tool for signal processing, can be used to approximate the target func-tion. For enhancing the sparse property of wavelet approximation, a new algorithm was proposed by using wavelet kernel Support Vector Machines (SVM), which can converge to minimum error with bet-ter sparsity. Here, wavelet functions would be firstly used to construct the admitted kernel for SVM according to Mercy theory; then new SVM with this kernel can be used to approximate the target fun-citon with better sparsity than wavelet approxiamtion itself. The results obtained by our simulation ex-periment show the feasibility and validity of wavelet kernel support vector machines.

关键词： Wavelet kernel function Support Vector Machines (SVM) Sparse approximation Quadratic Programming (QP)

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基于多最小支持度的加权关联规则挖掘算法

北京航空航天大学学报 2007年第5期33卷 590-593页

作者：邹力鹍张其善北京航空航天大学电子信息工程学院北京100083

针对交易数据库中数据项重要性不同的现象,提出了新的加权关联规则模型,并基于该模型设计了一个基于多最小支持度的加权关联规则挖掘新算法,允许用户设定多个最小支持度,为数据项设置不同的权重,从而解决数据项的重要性各不相同且出现... 详细信息

针对交易数据库中数据项重要性不同的现象,提出了新的加权关联规则模型,并基于该模型设计了一个基于多最小支持度的加权关联规则挖掘新算法,允许用户设定多个最小支持度,为数据项设置不同的权重,从而解决数据项的重要性各不相同且出现频率不均匀的问题,发现更多有趣的规则.理论证明了相关性质,并实验验证了算法的有效性.

关键词：数据挖掘加权关联规则多支持度

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法律体系的建构:从完美无缺到不完备

东岳论丛 2010年第4期31卷 173-177页

作者：张其山山东大学威海分校法学院山东威海264209

继传统司法三段论试图建构一个完美无缺的法律体系的努力失败之后,类型化的思维方式对完备法律体系的追求亦宣告失败。这迫使人们不得不承认法律体系的不完备性,并将其理解成一个开放的、不断发展的体系。相应的,法律体系的作用也由原... 详细信息

继传统司法三段论试图建构一个完美无缺的法律体系的努力失败之后,类型化的思维方式对完备法律体系的追求亦宣告失败。这迫使人们不得不承认法律体系的不完备性,并将其理解成一个开放的、不断发展的体系。相应的,法律体系的作用也由原来的为裁判提供裁判依据转变为作为法官裁判前见和评价的知识谱系。

关键词：法律体系司法三段论不完备性

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两种智能卡芯片的ECDSA实现

计算机工程 2005年第15期31卷 16-18页

作者：袁晓宇张其善北京航空航天大学电子信息工程学院北京100083

探讨了有限域GF(2n)上椭圆曲线密码算法基本理论、快速实现和ECDSA算法(椭圆曲线数字签名算法)实现的相关理论;然后采用INFINEON公司的携带域上求模运算的加速协处理模块(DDES-EC2)的智能卡芯片SLE66CL160S和SLE66CX320P,实现了基于有限... 详细信息

探讨了有限域GF(2n)上椭圆曲线密码算法基本理论、快速实现和ECDSA算法(椭圆曲线数字签名算法)实现的相关理论;然后采用INFINEON公司的携带域上求模运算的加速协处理模块(DDES-EC2)的智能卡芯片SLE66CL160S和SLE66CX320P,实现了基于有限域GF(2n)上密钥长度为163bits的椭圆曲线数字签名算法,并对这两种实现进行了对比分析;最后对实现进行测试,证明是成功高效的。

关键词：椭圆曲线密码体制 ECDSA 智能卡

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一种适用于实时应用的快速运动估计算法

计算机工程 2006年第2期32卷 223-225页

作者：董海燕张其善北京航空航天大学电子信息工程学院北京100083

提出了一种适用于实时应用的快速运动估计搜索算法,该算法按照一定的顺序依次搜索候选运动矢量,并且尽可能多地采用小菱形搜索模式,同时采用了高效的提前截止准则。实验结果表明,在保持图像质量基本不变的前提下,该文算法的搜索速度是MP... 详细信息

提出了一种适用于实时应用的快速运动估计搜索算法,该算法按照一定的顺序依次搜索候选运动矢量,并且尽可能多地采用小菱形搜索模式,同时采用了高效的提前截止准则。实验结果表明,在保持图像质量基本不变的前提下,该文算法的搜索速度是MPEG-4标准中的快速运动估计算法的两倍左右,该文提出的算法在搜索速度和搜索效果两方面具有很大的优势,更适合实时应用。

关键词：视频压缩运动估计块匹配菱形搜索

低复杂度的H.264帧间宏块编码模式选择算法

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计算机工程 2006年第12期32卷 221-222,240页

作者：董海燕张其善北京航空航天大学电子信息工程学院北京100083

为了减少H.264/AVC帧间编码模式选择的计算复杂度,利用不同编码模式在实际视频序列中的利用率信息及空时域相邻块之间的相关性,提出了一个低复杂度的快速帧间编码模式选择算法。模拟结果表明,该算法在保持率失真性能的前提下可以大幅度... 详细信息

为了减少H.264/AVC帧间编码模式选择的计算复杂度,利用不同编码模式在实际视频序列中的利用率信息及空时域相邻块之间的相关性,提出了一个低复杂度的快速帧间编码模式选择算法。模拟结果表明,该算法在保持率失真性能的前提下可以大幅度减少模式选择的计算复杂度,有利于H.264的实时应用。

关键词： H.264 运动估计运动补偿模式选择运动搜索视频编码