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2022年山东省烟台市1起人间布鲁氏菌病聚集性疫情溯源分析

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中华地方病学杂志 2024年第5期43卷 345-349页

作者：于一帆李岩丁淑军寇增强史卫峰山东第一医科大学（山东省医学科学院）公共卫生与健康管理学院，济南250000 山东省疾病预防控制中心传染病防制所，济南250014

目的探讨山东省烟台市1起人间布鲁氏菌病(简称布病)聚集性疫情的潜在传染源。方法收集2022年山东省烟台市1起人间布病聚集性疫情病例信息,分离培养菌株并提取DNA,采用BCSP31-PCR进行种属鉴定,AMOS-PCR进行种型鉴定。采用多位点可变数目... 详细信息

目的探讨山东省烟台市1起人间布鲁氏菌病(简称布病)聚集性疫情的潜在传染源。方法收集2022年山东省烟台市1起人间布病聚集性疫情病例信息,分离培养菌株并提取DNA,采用BCSP31-PCR进行种属鉴定,AMOS-PCR进行种型鉴定。采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)-16进行聚类分析,并与公共数据库MLVAbank和2022年山东省布鲁氏菌监测数据进行比对分析。同时,采用全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)分型分析2022年山东省已完成全基因组测序的53株布鲁氏菌菌株,构建wgSNP系统发育树。结果经BCSP31-PCR和AMOS-PCR鉴定,2022年山东省烟台市布病聚集性疫情相关的3株菌株均为羊种布鲁氏菌生物型。MLVA-16分型结果显示,3株分离菌株的MLVA-16分型完全一致,16个串联重复序列位点为1-5-3-13-2-2-3-2-4-41-8-4-4-3-6-5,属于东地中海分支。与MLVAbank进行比对检索,有2株哈萨克斯坦分离菌株的MLVA-16分型与本次结果一致;与2022年山东省布鲁氏菌监测数据比对分析发现,有11株分离菌株的MLVA-16分型与本次结果一致,分别分离自枣庄、临沂、泰安、烟台、潍坊市。wgSNP分型结果显示,11株布鲁氏菌菌株与本次分离菌株的距离小于7个单核苷酸多态性,分别分离自泰安、淄博、临沂、滨州、济南、济宁、烟台和威海市。结论经2022年山东省烟台市1起人间布病聚集性疫情溯源,临沂、泰安、烟台市分离羊种布鲁氏菌菌株的亲缘关系较近,推测这些地区的羊只具有同源性。

关键词：布鲁氏菌病流行病学调查分子分型全基因组测序

山东省潍坊市农村居民耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌耐药基因特征及核心基因组特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 48-55页

作者：王安阁王爽刘璐孙高翔陈玉贞齐加新寇增强毕振旺山东第一医科大学(山东省医学科学院)附属省立医院医院感染管理办公室济南250021 山东省疾病预防控制中心传染病防制所济南250014

目的探究山东省潍坊市农村居民耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌(CR-ECL)耐药基因特征及核心基因组特征。方法收集2017年山东省潍坊市农村社区居民粪便标本,使用耐碳青霉烯类肠杆菌显色培养基筛选耐药菌株,通过激光解吸/电离飞行时间质谱仪(MALDI... 详细信息

目的探究山东省潍坊市农村居民耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌(CR-ECL)耐药基因特征及核心基因组特征。方法收集2017年山东省潍坊市农村社区居民粪便标本,使用耐碳青霉烯类肠杆菌显色培养基筛选耐药菌株,通过激光解吸/电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOFMS)分析获得CR-ECL阳性菌株,针对CR-ECL分离株,采用微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性试验获得CR-ECL耐药表型,开展全基因组测序(WGS)和分析、bla_(NDM)基因周围环境及菌株间系统进化分析。结果共获得并检测628份粪便标本,6份为CR-ECL阳性(检出率0.96%),均表现为多重耐药(MDR)表型。6株CR-ECL共有4个MLST分型(ST),均携带多种耐药基因(bla_(NDM-1)、bla_(NDM-5)等)和毒力基因(acrA、acrB、entB、fepC等),且bla_(NDM)基因周围遗传环境中均存在移动遗传元件ISAba125、TN3-IS3000、TN3及IS5。系统发育树显示,核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing,cgMLST)与单核苷酸多态性(SNPs)结果具有一致性,cgMLST结果显示菌株2BC0101B与2BC0251B,2BG0561B与2BI0221B之间等位基因差异分别为2和1,SNPs结果显示上述2对菌同样各自聚成一簇,并发现美国国立生物技术信息中心数据库(National Center for Biotechnology Information,NCBI)中鸡粪样本的菌株居于进化树中心,且本地序列均可追溯到美国人源序列。结论山东省潍坊市农村社区居民中已检出多重耐药碳青霉烯类阴沟肠杆菌。

关键词：基因组,细菌碳青霉烯类耐药阴沟肠杆菌

2009-2024年山东省甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第7期44卷 580-587页

作者：赵志红何玉洁吴巨龙宋绍霞孙林李忠王显军寇增强温红玲刘倜山东大学齐鲁医学院公共卫生学院微生物检验学系山东省"十四五"高等学校新发突发传染病防控与生物安全重点实验室济南250012 山东省疾病预防控制中心山东省预防医学研究院济南250014

目的描述并分析山东省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的多样性,探讨其遗传变异规律,为流感监测、疫情防控和疫苗株匹配度提供科学参考。方法从GISAID流感数据平台下载2009—2024年流感疫苗推荐株和各分支代表株... 详细信息

目的描述并分析山东省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的多样性,探讨其遗传变异规律,为流感监测、疫情防控和疫苗株匹配度提供科学参考。方法从GISAID流感数据平台下载2009—2024年流感疫苗推荐株和各分支代表株的HA基因序列,与山东省分离的298株甲型H1N1流感病毒株HA基因序列进行系统发育分析和氨基酸位点变异分析。利用IQ-TREE在线工具的最大似然法(maximum likelihood,ML)构建系统进化树,利用MegAlign软件查看氨基酸位点变异,同时采用NetNGlyc 1.0在线软件预测HA基因潜在的糖基化位点。结果298株山东省甲型H1N1流感病毒的HA基因同源性为91.2%~100.0%,序列进化分支随时间推移亲缘关系渐远,但进化方向与其他省份大致相同。HA基因氨基酸变异在各年度均有发生,抗原决定簇是其主要变异区域。结论山东省2009—2024年流感病毒分离株的HA基因仍处于不断进化过程,持续监测流感病毒流行趋势和进化方向对预警流感病毒大流行至关重要。

关键词：流感病毒A型,H1N1亚型血凝素基因遗传进化氨基酸变异

Epidemiological Characteristics of Human Rabies——Shandong Province,China,2010-2020

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China CDC weekly 2022年第35期4卷 793-797页

作者： Xiaomei Zhang Xueying Tian Bo Pang Zhiqiang Wang Wenji Zhai Xiaolin Jiang zengqiang kou Shujun Ding Xianjun Wang Shandong Provincial Key Laboratory of Communicable Disease Control and Prevention Department of Communicable Disease Control and PreventionShandong Center for Disease Control and PreventionJinanShandongChina

Introduction:Rabies is a viral zoonotic disease that causes progressive and fatal inflammation in the *** has caused more than 5,000 human deaths in Shandong Province since *** study aimed to analyze the epidemiological characteristics of human rabies in Shandong Province from 2010 to 2020 and to provide a scientific basis for policy ***:The data of reported human rabies cases from 2010 to 2020 were obtained from China’s National Notifiable Disease Reporting System,and data related to exposure and post-exposure prophylaxis(PEP)of the cases were acquired through case ***:A total of 414 human rabies cases were reported in Shandong Province from 2010 to *** of the 414 total cases,87.20%were primarily farmers;83.10%were over 40 years old.70.29%(265/377)belonged to categoryⅢexposure;and 96.67%(377/390)were exposed to the virus through infected *** vaccine inoculation rate of these cases after exposure was only 8.85%;1.03%(4/390)had been vaccinated with rabies immunoglobulin,developing the disease 11 to 13 days after categoryⅢ***:Dogs were still the primary animal *** rabies patients died due to no or inadequate post-exposure *** inoculation rates for dogs should reach the target of 70%as soon as *** departments should improve the accessibility and quality of PEP;and improve the health literacy of the elderly in rural areas.

关键词： Shandong category policy

A Nosocomial COVID-19 Outbreak Initiated by an Infected Dockworker at Qingdao City Port-Shandong Province, China, October, 2020

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China CDC weekly 2020年第43期2卷 838-840页

作者： Qun Yuan zengqiang kou Fachun Jiang Zhongjie Li Lijie Zhang Huihui Liu Xiang Zhao Dianmin Kang Ruqin Gao Jie Lei Shandong provincial Center for Disease Control and Prevention JinanShangdongChina Qingdao prefecture Center for Disease Control and Prevention QingdaoShangdongChina Chinese Center for Disease Control and Prevention BeijingChina National Institute for Viral Disease Control and Prevention China CDCBeijingChina

On October 10,2020,3 cases of coronavirus disease 2019(COVID-19)were detected via routine preadmission nucleic acid screening of inpatients and their visitors at Qingdao Central *** 3 cases were all related to the Qingdao Chest *** additional 9 cases were discovered and confirmed through tracing and testing contacts of the 3 initial *** isolates from all 12 cases were found to have high degrees of genetic homology with the viral isolate from a dockworker at Qingdao Port,referred to as Patient A in this report.A joint investigation team was formed to determine the source of infection and the scale of the outbreak,and to prevent further spread of the virus.

关键词： Qingdao Port worker

济南社区卫生服务中心流感疫苗接种人群特征分析

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国际病毒学杂志 2024年第4期31卷 342-346页

作者：董祯孙林宋绍霞李敏李伟何玉洁张淑孙文魁吴巨龙李忠王显军寇增强刘倜山东省疾病预防控制中心传染病防制所济南250013 济南市历城区疾病预防控制中心传染病防制科 250199 济南市槐荫区疾病预防控制中心传染病防制科 250022

目的了解济南市流感疫苗接种人群的基本特征,为疫苗接种策略提供参考。方法在社区卫生服务中心对接种人群开展问卷调查,使用χ2检验对接种人群基本特征进行分析,使用多元logistic回归分析对流感疫苗预防作用、疫苗推荐意愿和接种效果进... 详细信息

目的了解济南市流感疫苗接种人群的基本特征,为疫苗接种策略提供参考。方法在社区卫生服务中心对接种人群开展问卷调查,使用χ2检验对接种人群基本特征进行分析,使用多元logistic回归分析对流感疫苗预防作用、疫苗推荐意愿和接种效果进行分析。结果调查共获得1736份有效问卷,接种人群以中老年人为主,94.8%的接种者认为疫苗能有效预防流感,87.8%会向周围人群推荐流感疫苗。多因素分析显示,非常了解流感疫苗(OR=24.326,95%CI:10.128~58.426)和第2年接种疫苗者(OR=8.781,95%CI:3.693~20.877)更加认可疫苗的预防作用;农民(OR=4.906,95%CI:1.519~15.847)和接种疫苗5次以上者(OR=7.435,95%CI:2.187~25.276)更愿意向周围人推荐流感疫苗。结论本次调查人群基本了解并认可疫苗的保护作用,接种及推荐接种意愿较高,疫苗宣传需要提高针对性。

关键词：流感疫苗接种人群影响因素

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山东省狂犬病暴露人群监测研究

中华实验和临床病毒学杂志 2024年第4期38卷 378-382页

作者：张晓梅田雪莹段青逄博张玉薇寇增强翟文济丁淑军山东省疾病预防控制中心、山东省传染病预防控制重点实验室济南250014

目的分析2019-2023年山东省狂犬病暴露预防处置门诊暴露人群监测数据,探讨暴露风险因素,为进一步规范暴露后预防处置提供依据。方法基于山东省2019-2023年狂犬病暴露预防处置门诊预防接种信息系统监测信息、人口、空间行政区划等数据,采... 详细信息

目的分析2019-2023年山东省狂犬病暴露预防处置门诊暴露人群监测数据,探讨暴露风险因素,为进一步规范暴露后预防处置提供依据。方法基于山东省2019-2023年狂犬病暴露预防处置门诊预防接种信息系统监测信息、人口、空间行政区划等数据,采用SPSS 18.0进行描述性流行病学分析。结果2019-2023年山东省暴露预防处置门诊每年接受暴露后处置人数均在100万以上,并呈逐年上升的趋势。每年5~8月份就诊人数最多。女性就诊者有逐年上升的趋势。15岁以下年龄组就诊者占31.69%~36.86%,且占比逐年增高。Ⅲ级暴露者占53.40%,暴露部位在四肢的占89.81%,1.94%为多部位暴露。致伤动物以犬为主,其次为猫,猫占比逐年上升。就诊者自行处理伤口的比例由32.32%上升至45.46%,门诊处理伤口的占比由76.07%下降至66.24%。首次暴露后全程接种率63.79%,15~29岁年龄组全程接种率低于其他年龄组;Ⅲ级暴露者被动免疫制剂使用率在35.66%。2019-2023年报告8例狂犬病病例死亡,均未进行暴露后处置。结论山东省动物致伤后疑似狂犬病暴露人群的流行特点和暴露风险发生了变化,需关注女性群体、15岁至29岁全程接种率偏低群体、猫致伤群体等,持续开展暴露人群监测,适时调整防控策略。

关键词：狂犬病暴露监测暴露后预防处置

Two Confirmed Patients of Anthrax—Binzhou City,Shandong Province,China,August 2021

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China CDC weekly 2021年第38期3卷 808-810页

作者： Xiaolin Yu Lifang Zhang Ming Fang Hao Liang Qi Zhang Xiusheng Yin zengqiang kou Wenwu Yin Zhong Li Enmin Zhang Shujun Ding Shandong Center for Disease Control and Prevention JinanShandongChina Binzhou Center for Disease Control and Prevention BinzhouShandongChina Shandong University JinanShandongChina Chinese Center for Disease Control and Prevention BeijingChina.

As of August 15,2021,2 confirmed cases of anthrax were reported to Shandong CDC,one of which was a 14-year-old student(Patient A)and the other was a 35-year-old man(Patient B)engaging in the slaughter of *** A died on August 6,and Patient B has been transferred to an infectious disease hospital for isolation and *** Shandong CDC formed a joint investigation team to determine the source of infection and prevent any further spread.

关键词： treatment. Shandong fir

一株GⅡ.12[P16]型诺如病毒毒株的全基因组序列分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第2期38卷 144-149页

作者：李美佳王国强郭明鑫刘晓林刘倜孙文魁傅忠燕寇增强山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院济南250117 德州市疾病预防控制中心检验科德州253058 山东省疾病预防控制中心传染病防制所济南250014

目的对一株诺如病毒分离株SD20200267进行鉴定和全基因组序列分析,了解其结构特征。方法取患者标本进行病毒核酸的提取,对样本核酸进行扩增,将扩增产物进行测序,根据核苷酸序列进行基因分型。采用宏基因组测序技术进行全基因组测序,对... 详细信息

目的对一株诺如病毒分离株SD20200267进行鉴定和全基因组序列分析,了解其结构特征。方法取患者标本进行病毒核酸的提取,对样本核酸进行扩增,将扩增产物进行测序,根据核苷酸序列进行基因分型。采用宏基因组测序技术进行全基因组测序,对测序所得的核苷酸序列进行分析。结果获得SD20200267株病毒基因组全长,总长度为7465个核苷酸。SD20200267株在VP1区及RdRp区分别属于GⅡ.12和GⅡ.P16基因型。SD20200267株与其他GⅡ.12[P16]型毒株核苷酸一致性在96.0%~97.3%之间,有15个氨基酸位点变异。该毒株存在重组现象,重组位点位于ORF1与ORF2重叠区域。结论SD20200267株为GⅡ.12[P16]型毒株,ORF1与ORF2重叠区域存在重组现象。

关键词：诺如病毒基因组重组