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From germline genome to highly fragmented somatic genome:genome-wide DNA rearrangement during the sexual process in ciliated protists

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Marine Life Science & Technology 2024年第1期6卷 31-49页

作者： Liping Lyu Xue Zhang yunyi gao Tengteng Zhang Jinyu Fu Naomi A.Stover Feng gao Key Laboratory of Evolution&Marine Biodiversity(Ministry of Education) and Institute of Evolution&Marine BiodiversityOcean University of ChinaQingdao 266003China Department of Biology Bradley UniversityPeoriaIL 61625USA Laoshan Laboratory Qingdao 266237China

Genomes are incredibly dynamic within diverse eukaryotes and programmed genome rearrangements(PGR)play important roles in generating genomic diversity.However,genomes and chromosomes in metazoans are usually large in size which prevents our understanding of the origin and evolution of PGR.To expand our knowledge of genomic diversity and the evolutionary origin of complex genome rearrangements,we focus on ciliated protists(ciliates).Ciliates are single-celled eukaryotes with highly fragmented somatic chromosomes and massively scrambled germline genomes.PGR in ciliates occurs extensively by removing massive amounts of repetitive and selfish DNA elements found in the silent germline genome dur-ing development of the somatic genome.We report the partial germline genomes of two spirotrich ciliate species,namely Strombidium cf.sulcatum and Halteria grandinella,along with the most compact and highly fragmented somatic genome for S.cf.sulcatum.We provide the first insights into the genome rearrangements of these two species and compare these features with those of other ciliates.Our analyses reveal:(1)DNA sequence loss through evolution and during PGR in S.cf.sulcatum has combined to produce the most compact and efficient nanochromosomes observed to date;(2)the compact,transcriptome-like somatic genome in both species results from extensive removal of a relatively large number of shorter germline-specific DNA sequences;(3)long chromosome breakage site motifs are duplicated and retained in the somatic genome,revealing a complex model of chromosome fragmentation in spirotrichs;(4)gene scrambling and alternative pro-cessing are found throughout the core spirotrichs,offering unique opportunities to increase genetic diversity and regulation in this group.

关键词： Alternative processing Ciliates Gene scrambling Genome rearrangement Germline genome Somatic genome

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Dynamic changes of wound-related miRNAs after application of autologous platelet-rich gel in diabetic wounds

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Chinese Medical Journal 2022年第21期135卷 2644-2646页

作者： Yan Li Yujie Liang yunyi gao Dawei Chen Xingwu Ran Department of Endocrinology and Metabolism Innovation Center for Wound RepairDiabetic Foot Care CenterWest China HospitalSichuan UniversityChengduSichuan 610041China

To the Editor:Diabetic chronic cutaneous ulcers(DCUs)are among the most common and serious complications of diabetes mellitus.Diabetic foot ulcers are the most common type of DCU and are now considered a global epidemic.[1]The clinical prevention and treatment of DCUs are critical and have remained challenging for clinicians.With the exploration of topical treatment methods,autologous platelet-rich gel(APG)is regarded as an adjuvant therapy to promote wound healing,and it has been widely used for wound repair.[2]Some microRNAs that play a critical role in the whole wound healing process have been found in wound tissues,which we call wound-related miRNAs(wr-miRNAs).However,few studies have explored the dynamic changes of wr-miRNAs during APG treatment.Our study aimed to evaluate the efficacy of APG in treating diabetic wounds and explore the dynamic changes of wr-miRNAs during wound healing.

关键词： prevention treatment miRNAs

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小南山遗址与东北地区史前玉器的相关问题

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考古与文物 2024年第1期 93-100页

作者：段天璟高云逸吉林大学考古学院

本文将小南山遗址出土遗存划分为小南山文化和新开流文化两种文化遗存,对二者的年代作了初步探讨。通过对查海遗址的分析,建立起兴隆洼文化及该文化玉器发展的年代标尺,为相关考古学文化年代的判定树立了参照系。继而讨论了塔布敖包遗... 详细信息

本文将小南山遗址出土遗存划分为小南山文化和新开流文化两种文化遗存,对二者的年代作了初步探讨。通过对查海遗址的分析,建立起兴隆洼文化及该文化玉器发展的年代标尺,为相关考古学文化年代的判定树立了参照系。继而讨论了塔布敖包遗址、哈克遗址第一期遗存及北山洞遗址第三期遗存的年代,明确了三者的年代晚于小南山文化,而与兴隆洼文化共时。梳理了公元前5000年以前东北地区相关考古学文化之间的联系,探讨了这一时期东北地区玉文化发展的基本格局。

关键词：小南山遗址年代兴隆洼文化东北地区史前玉器

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东北地区新民夏季雨滴谱特征

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应用气象学报 2024年第3期35卷 337-349页

作者：周任然王改利高云义中国气象科学研究院灾害天气国家重点实验室北京100081 中国科学院大学北京100049

以辽宁省新民气候基准站的降水现象仪观测数据为基础,研究我国东北地区新民夏季不同雨强及不同降雨类型的雨滴谱特征,并与其他地区进行对比。结果表明:新民雨强越大谱宽越宽,雨强大于20 mm·h^(-1)的雨滴谱谱宽接近8 mm,降雨以小雨滴为... 详细信息

以辽宁省新民气候基准站的降水现象仪观测数据为基础,研究我国东北地区新民夏季不同雨强及不同降雨类型的雨滴谱特征,并与其他地区进行对比。结果表明:新民雨强越大谱宽越宽,雨强大于20 mm·h^(-1)的雨滴谱谱宽接近8 mm,降雨以小雨滴为主,但中等雨滴对雨量的贡献最大。对流云降雨为典型的大陆型对流,以雨滴的直径较大而数浓度较低为特点,质量加权平均直径Dm的平均值为2.14 mm,标准化截距lgN_(w)的平均值为3.40。拟合的μ-Λ关系与其他地区采用PARSIVEL雨滴谱仪数据拟合的μ-Λ经验关系接近,而与采用二维视频雨滴谱仪(2DVD)数据拟合的μ-Λ关系差异较大。与华东、华北地区相比,东北地区新民D_(m)(lgN_(w))的平均值更大(小),拟合的对流云降雨Z-R关系的指数更大。

关键词：东北地区雨滴谱分布大陆型对流经验公式微物理特征

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2-Iodomelatonin上调NRF2表达对缺血性脑损伤神经保护作用

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青岛大学学报（医学版） 2024年第2期60卷 159-163页

作者：高云奕罗倩万芪青岛大学神经再生与康复研究院山东青岛266071

目的探讨褪黑激素受体1(MT1)激动剂2-Iodomelatonin通过上调核因子E2相关因子2(NRF2)对大脑中动脉栓塞小鼠的神经保护作用。方法采用大脑中动脉栓塞(MCAO)法制备小鼠缺血性脑损伤体内模型,给予2-Iodomelatonin及NRF2抑制剂(Nrf2-IN-1)... 详细信息

目的探讨褪黑激素受体1(MT1)激动剂2-Iodomelatonin通过上调核因子E2相关因子2(NRF2)对大脑中动脉栓塞小鼠的神经保护作用。方法采用大脑中动脉栓塞(MCAO)法制备小鼠缺血性脑损伤体内模型,给予2-Iodomelatonin及NRF2抑制剂(Nrf2-IN-1)干预。采用三苯基氯化四氮唑(TTC)染色法检测小鼠大脑的梗死体积,Western Blot法检测缺血损伤后大脑皮质半暗带NRF2表达水平,改良神经功能缺损程度评分(mNSS)评估2-Iodomelatonin和Nrf2-IN-1干预对小鼠缺血性脑损伤亚急性期运动功能的影响。结果TTC染色结果显示,2-Iodomelatonin干预可以显著降低缺血性脑损伤小鼠的大脑梗死体积(F=7.79,q=5.06,P<0.05)。Western Blot结果显示,2-Iodomelatonin干预可上调小鼠皮质梗死半暗带NRF2的表达水平(F=10.56,q=3.99,P<0.05)。mNSS评分结果显示,2-Iodomelatonin干预可以显著改善缺血性脑损伤第14天的运动功能损伤(F=6.12,q=4.79,P<0.05),该效应可被Nrf2-IN-1逆转(q=3.60,P<0.05)。结论2-Iodomelatonin干预可以通过上调NRF2降低缺血性脑损伤小鼠的大脑梗死体积并改善14 d时的运动功能损伤。

关键词：缺血性卒中神经保护褪黑素受体,褪黑激素,MT1 2-Iodomelatonin

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养阴解毒法治疗肺癌的临床研究进展

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中国医学创新 2024年第18期21卷 180-184页

作者：翟韵怡高静东南京中医药大学附属苏州市中医医院肿瘤科江苏苏州215000

在肺癌患者治疗过程中积极联用养阴解毒等中西医结合方式进行治疗,在发挥药物增效减毒作用、提升临床治疗效果、降低肿瘤标志物、提高免疫功能、减轻放化疗药物毒副反应、延长患者生存期及提高生活质量方面均存在显著的价值,能进一步为... 详细信息

在肺癌患者治疗过程中积极联用养阴解毒等中西医结合方式进行治疗,在发挥药物增效减毒作用、提升临床治疗效果、降低肿瘤标志物、提高免疫功能、减轻放化疗药物毒副反应、延长患者生存期及提高生活质量方面均存在显著的价值,能进一步为临床治疗肺癌患者提供新的思路和技术。基于此,文章将从肺癌病因病机及养阴解毒法治疗依据等方面进行综述。

关键词：肺癌养阴解毒法阴虚内热证气阴两虚证

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基于“玄府-络脉”新视角阐析糖尿病认知功能障碍

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世界中医药 2024年第7期19卷 991-993,999页

作者：潘欣渝高云逸方泽阳魏军平中国中医科学院广安门医院北京100053

糖尿病认知功能障碍属于“消渴呆病”范畴,其病机本虚标实,以脏腑亏虚为本,痰瘀糖毒阻络为标。玄府、络脉是人体普遍存在的一种微观结构,具有维系周身气血津液运行的功能,玄府闭塞、络脉阻滞是多种疾病发生的病理基础。基于“玄府-络脉... 详细信息

糖尿病认知功能障碍属于“消渴呆病”范畴,其病机本虚标实,以脏腑亏虚为本,痰瘀糖毒阻络为标。玄府、络脉是人体普遍存在的一种微观结构,具有维系周身气血津液运行的功能,玄府闭塞、络脉阻滞是多种疾病发生的病理基础。基于“玄府-络脉”的新视角,分析其与糖尿病认知功能障碍发病的关联性。玄府闭塞,脑络不通,神机失用是糖尿病认知功能障碍的病机,治宜以通为用,临证组方借虫类风药开玄通络,共增药效,为糖尿病认知功能障碍的临床治疗提供思路。

关键词：玄府络脉糖尿病认知功能障碍风药虫类药中药理论

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中国南北方多囊卵巢综合征不孕患者临床基线特征分布与疗效分析

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中华中医药杂志 2024年第4期39卷 2077-2080页

作者：马红丽朱韵怡高敬书王宇沈文娟吴效科黑龙江中医药大学附属第一医院哈尔滨150040 黑龙江中医药大学哈尔滨150040 黑龙江省医院哈尔滨150036

目的:分析我国南北方多囊卵巢综合征(PCOS)不孕患者临床基线特征及疗效的差异,从而为不同地域女性预防与治疗PCOS提供指导。方法:以秦岭-淮河线将644例PCOS患者按就诊医院分为北方和南方,随机给予小檗碱、来曲唑或小檗碱联合来曲唑治疗... 详细信息

目的:分析我国南北方多囊卵巢综合征(PCOS)不孕患者临床基线特征及疗效的差异,从而为不同地域女性预防与治疗PCOS提供指导。方法:以秦岭-淮河线将644例PCOS患者按就诊医院分为北方和南方,随机给予小檗碱、来曲唑或小檗碱联合来曲唑治疗,配合超声监测排卵,疗程共6个月。观察南北方PCOS受试者临床基线特征及疗效的差异。结果:南方P C O S受试者年龄,身高,体质量,腰围,臀围,身体质量指数,左、右卵巢体积,孕酮,促黄体生成素/促卵泡生成素,游离睾酮指数,胰岛素浓度等显著低于北方PCOS受试者(P<0.01);左、右侧窦卵泡数,促卵泡生成素,性激素结合球蛋白水平,抗苗勒管激素显著高于北方PCOS受试者(P<0.05,P<0.01);南北方PCOS受试者的排卵率、受孕率、妊娠率、流产率及活产率差异均无统计学意义。结论:北方受试者的PCOS病情重于南方受试者,地域差异及病情严重程度对促排卵药物疗效及生殖结局没有明显影响。

关键词：多囊卵巢综合征基线特征临床表型特征不同地域身体质量指数

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桥本甲状腺炎伴甲状腺肿患者的肠道菌群特征研究

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河北医药 2024年第9期46卷 1324-1329页

作者：孟淑华肖瑶高云逸魏军平北京市西城区广外医院(北京市西城区广外老年医院) 100053 中国中医科学院广安门医院北京中医药大学

目的探讨桥本甲状腺炎伴甲状腺肿与肠道菌群物种分布及丰度是否相关。方法收集31例临床粪便样本,其中健康受试者10例(A组),桥本甲状腺炎伴甲状腺肿组9例(B组),桥本甲状腺炎不伴甲状腺肿组12例(C组),进行16S rRNA基因测序检测,描述3组肠... 详细信息

目的探讨桥本甲状腺炎伴甲状腺肿与肠道菌群物种分布及丰度是否相关。方法收集31例临床粪便样本,其中健康受试者10例(A组),桥本甲状腺炎伴甲状腺肿组9例(B组),桥本甲状腺炎不伴甲状腺肿组12例(C组),进行16S rRNA基因测序检测,描述3组肠道菌群的特征。结果3组共聚类16941个操作分类单元(OTU),其中A组肠道菌群样本OUT组成分布相对集中,B组及C组的菌群多样性下降,但3组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。在科水平上,B组的拟杆菌科(Bacteroidaceae)丰度显著低于A组和C组,而普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、韦荣氏球菌科(Veillonellaceae)丰度显著高于A组和C组,差异均有统计学意义(P<0.05);在属水平上,B组患者的拟杆菌属(Bacteroides)显著低于A组和C组,而普氏菌属(Prevotella)显著高于A组和C组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论桥本甲状腺炎伴甲状腺肿患者物种分布和丰度发生改变,存在肠道菌群失调,其中拟杆菌科及菌属、普雷沃氏菌科、韦荣氏球菌科、普氏菌属可能是区别桥本甲状腺炎伴甲状腺肿的生物标志物。

关键词：桥本甲状腺炎肠道菌群甲状腺肿

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基于机器视觉的胶体金试剂盒质量检测方法

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自动化应用 2024年第4期65卷 180-182页

作者：王传龙李云逸高瑞琪中国船舶集团有限公司第七一一研究所上海201108

抗原检测试剂盒(胶体金法)是一种新型冠状病毒核酸检测的补充检测方法,具有操作便捷、检测速度快的优点,因此,实现胶体金试剂盒批量自动化生产对于有效的疫情防控具有重要意义。切条检测算法、装条检测算法和压盖检测算法是实现自动化... 详细信息

抗原检测试剂盒(胶体金法)是一种新型冠状病毒核酸检测的补充检测方法,具有操作便捷、检测速度快的优点,因此,实现胶体金试剂盒批量自动化生产对于有效的疫情防控具有重要意义。切条检测算法、装条检测算法和压盖检测算法是实现自动化生产的关键一环。所提出的视觉检测方法已在实际项目中得到应用和验证,并可在确保产品质量的前提下,有效提高生产效率,大幅降低人力成本。

关键词：新型冠状病毒胶体金试剂盒抗原检测视觉算法

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