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Eco-evolutionary evidence for the global diversity pattern of Cycas(Cycadaceae)

Journal of Integrative Plant Biology 2024年第6期66卷 1170-1191页

作者： Jian Liu Anders JLindstrom yiqing gong Shanshan Dong Yusheng(Chris)Liu Shouzhou Zhang Xun gong CAS Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia Kunming Institute of BotanyChinese Academy of SciencesKunming 650201China Department of Economic Plants and Biotechnology Yunnan Key Laboratory for Wild Plant ResourcesKunming Institute of BotanyChinese Academy of SciencesKunming 650201China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Global Biodiversity Conservancy 144/124 Moo3Soi Bua ThongBangsalaeSattahipChonburi 20250Thailand Key Laboratory of Southern Subtropical Plant Diversity Fairy Lake Botanical GardenShenzhen&Chinese Academy of SciencesShenzhen 518004China Department of Earth and Environmental Sciences Indiana University-IndianapolisIndianapolisIN 46202USA

The evolution of the latitudinal diversity gradient(LDG),characterized by a peak in diversity toward the tropics,has captured significant attention in evolutionary biology and ***,the inverse LDG(i-LDG)mechanism,wherein species richness increases toward the poles,remains inadequately *** are among one of the oldest lineages of extant seed plants and have undergone extensive diversification in the ***,the extant cycad abundance exhibits an i-LDG pattern,and the underlying causes for this phenomenon remain largely ***,using 1,843 nuclear genes from a nearly complete sampling,we conducted comprehensive phylogenomic analyses to establish a robust species-level phylogeny for Cycas,the largest genus within *** then reconstructed the spatial-temporal dynamics and integrated global environmental data to evaluate the roles of species ages,diversification rates,contemporary environment,and conservatism to ancestral niches in shaping the i-LDG *** found Cycas experienced decreased diversification rates,coupled with the cooling temperature since its origin in the Eocene from continental *** regions have distinctively contributed to the formation of i-LDG for Cycas,with the northern hemisphere acting as evolutionary museums and the southern hemisphere serving as ***,water-related climate variables,specifically precipitation seasonality and potential evapotranspiration,were identified as paramount factors constraining Cycas species richness in the rainforest biome near the ***,the adherence to ancestral monsoonal climates emerges as a critical factor in sustaining the diversity *** study underscores the imperative of integrating both evolutionary and ecological approaches to comprehensively unravel the mechanisms underpinning global biodiversity patterns.

关键词： cycads latitudinal diversity gradient niche conservatism spatiotemporal diversification species richness

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Generation and characterization of expressed sequence tags(ESTs) from coralloid root cDNA library of Cycas debaoensis

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Plant Diversity 2018年第5期40卷 245-252页

作者： Yunhua Wang Nan Li Ting Chen yiqing gong Shenzhen Key Laboratory of Southern Subtropical Plant Diversity Fairylake Botanical GardenShenzhen & Chinese Academy of Sciences

A normalized full-length cDNA library was constructed from the coralloid roots of Cycas debaoensis by the DSN （duplex-specific nuclease） normalization method combined with the SMART （Switching Mechanism At 5＇ end of the RNA Transcript） technique. The titer of the original cDNA library was about 1.5 × 10^6 cfu·mL^-1 and the average insertion size was about 1 kb with a high recombination rate （97%）. The 5011 high-quality expressed sequence tags （ESTs） were obtained from 5393 randomly picked cDNA clones. Clustering and assembly of ESTs resulted in 2984 unique sequences, consisting of 618 contigs and 2366 singlets. EST sequence annotation revealed that 2333 and 1901 unigenes were functionally anno- tated in the NCBI non-redundant database and Swiss-Prot protein database, respectively. Functional analysis demonstrated that 1495 （50.1%） unigenes were associated with 4082 Gene Ontology （GO） terms. A total of 847 unigenes were grouped into 22 Cluster of Orthologous Groups （COG） functional categories. Based on the EST dataset, 22 ESTs that encoded putative receptor-like protein kinase （RLK） genes were screened. Furthermore, a total of 94 simple sequence repeats （SSRs） were discovered, of which 20 loci were successfully amplified in C debaoensis. This study is the first EST analysis for the coralloid roots of C debaoensis and provides a valuable genomic resource for novel gene discovery, gene expression and comparative genomics, conservation and management studies as well as applications in C debaoensis and related cycad species.

关键词： Cycas debaoensis Coralloid root cDNA library Expressed sequence tags Symbiosis and defense SSRs

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CsPbBr_(3) quantum dots photodetectors boosting carrier transport via molecular engineering strategy

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Nano Research 2021年第11期14卷 4038-4045页

作者： Wei Yan Jianhua Shen Yihua Zhu yiqing gong Jingrun Zhu Zheng Wen Chunzhong Li Shanghai Engineering Research Centre of Hierarchical Nanomaterials Key Laboratory for Ultrafine Materials of Ministry of EducationFrontiers Science Centre for Materiobiology and Dynamic ChemistrySchool of Materials Science and EngineeringEast China University of Science and TechnologyShanghai200237China Institute of Functional Nano and Soft Materials(FUNSOM) Jiangsu Key Laboratory for Carbon-Based Functional Materials and DevicesSoochow UniversitySuzhou215123China Shanghai Engineering Research Centre of Hierarchical Nanomaterials School of Chemical EngineeringEast China University of Science and TechnologyShanghai200237China

Perovskite quantum dots (PQDs) require ligands on their surfaces to passivate defects and prevent aggregation. However, the ligands construct the interface relationship between the PQDs, which may seriously hinder the carrier transport. Hence, we propose a molecular engineering strategy of using 3,4-ethylenedioxythiophene (EDOT) to perfectly solve this problem, benefiting from its high conjugation and passivation ability to CsPbBr_(3) PQDs. Furthermore, EDOT on the surface of PQDs can be in-situ polymerized under the photocurrent of the photodetector, thus interconnecting the PQDs which enhanced the performance of the photodetectors up to 178% of its initial performance. We have thoroughly investigated the electropolymerization process of EDOT and its passivation effect on PQDs. The simple lateral photodetector based on EDOT PQDs exhibits a high responsivity of 11.96 A/W, which is 104 times higher than that of oleic acid caped PQDs. Due to the protection of poly(3,4-ethylenedioxythiophene) (PEDOT), the photodetector prepared from EDOT PQDs exhibited very high stability, retaining 94% of its performance after six months in air. This strategy provides a solution for the application of PQDs in high performances and stable optoelectronic devices.

关键词： perovskite quantum dots molecular engineering photodetector interface 3,4-ethylenedioxythiophene

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The genome of Magnolia biondii Pamp. provides insights into the evolution of Magnoliales and biosynthesis of terpenoids

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Horticulture Research 2021年第1期8卷 552-564页

作者： Shanshan Dong Min Liu Yang Liu Fei Chen Ting Yang Lu Chen Xingtan Zhang Xing Guo Dongming Fang Linzhou Li Tian Deng Zhangxiu Yao Xiaoan Lang yiqing gong Ernest Wu Yaling Wang Yamei Shen Xun gong Huan Liu Shouzhou Zhang Laboratory of Southern Subtropical Plant Diversity Fairy Lake Botanical GardenShenzhen&Chinese Academy of SciencesShenzhen 518004China State Key Laboratory of Agricultural Genomics BGI-ShenzhenShenzhen 518083China Nanjing Forestry University Nanjing 210037China Fujian Agriculture and Forestry University Fuzhou 350000China University of British Columbia Vancouver BCCanada Xi’an Botanical Garden Xi’an 710061China Zhejiang Agriculture and Forestry University Hangzhou 311300China Kunming Botanical Garden Chinese Academy of SciencesKunming 650201China Department of Biology University of CopenhagenDK-2100 CopenhagenDenmark

Magnolia biondii Pamp.(Magnoliaceae,magnoliids)is a phylogenetically,economically,and medicinally important ornamental tree species widely grown and cultivated in the north-temperate regions of *** the genome sequence of *** would help resolve the phylogenetic uncertainty of magnoliids and improve the understanding of individual trait evolution within the Magnolia *** assembled a chromosome-level reference genome of *** using~67,~175,and~154Gb of raw DNA sequences generated via Pacific Biosciences single-molecule real-time sequencing,10X Genomics Chromium,and Hi-C scaffolding strategies,*** final genome assembly was~2.22Gb,with a contig N50 value of 269.11 kb and a BUSCO complete gene percentage of 91.90%.Approximately 89.17%of the genome was organized into 19 chromosomes,resulting in a scaffold N50 of *** genome contained 47,547 protein-coding genes,accounting for 23.47%of the genome length,whereas 66.48%of the genome length consisted of repetitive *** confirmed a WGD event that occurred very close to the time of the split between the Magnoliales and *** enrichment of the Magnolia-specific and expanded gene families highlighted genes involved in the biosynthesis of secondary metabolites,plant–pathogen interactions,and responses to stimuli,which may improve the ecological fitness and biological adaptability of the *** analyses revealed a sister relationship of magnoliids and Chloranthaceae,which are sister to a clade comprising monocots and *** genome sequence of *** could lead to trait improvement,germplasm conservation,and evolutionary studies on the rapid radiation of early angiosperms.

关键词： evolution sister resolve

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河道型水库干支流交汇段水力特性数值分析

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排灌机械工程学报 2019年第9期37卷 776-781,828页

作者：陆建宇毛劲乔龚轶青蔡海滨曹青戴会超闫杰国家电网公司华东分部上海200120 河海大学水利水电学院江苏南京210098 卡迪夫大学工程学院英国卡迪夫CF243AA 中国电力工程顾问集团西北电力设计院有限公司陕西西安710075

以典型河道型水库库区主流与支流交汇段几何尺寸与来流条件为参照,建立了三维概化数学模型并开展多情景数值分析,以揭示不同交汇角对干支流交汇段关键水力特性变化的影响.重点研究了交汇角α分别为30°,60°,90°,120°,150°的5种工况... 详细信息

以典型河道型水库库区主流与支流交汇段几何尺寸与来流条件为参照,建立了三维概化数学模型并开展多情景数值分析,以揭示不同交汇角对干支流交汇段关键水力特性变化的影响.重点研究了交汇角α分别为30°,60°,90°,120°,150°的5种工况,计算结果表明:在不同交汇角条件下均存在紊动能高值集中区域,且紊动能与交汇角大小存在正相关关系,即随着交汇角增大,紊动能峰值区域的面积及峰值大小显著增大;不同交汇角条件下床面切应力最大值均由交汇口向支流上游沿程递减,而当α<90°时断面流速变异系数沿程先增大后减小,当α≥90°时断面流速变异系数沿程减小;另外,当α<90°时,床面切应力和断面流速变异系数与交汇角大小存在负相关关系,而当α≥90°时,这2个特性指标随着交汇角增大而递增.

关键词：河道型水库干支流交汇交汇角紊动能床面切应力变异系数

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精密工程测量仪器及数据处理

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现代测绘 2009年第6期32卷 25-27页

作者：黄成辉龚忆清苏州高新区测绘事务所有限公司江苏苏州215129

从精密工程测量的定义出发,指出其测量的特点,对精密工程测量的仪器如:马达全站仪、激光跟踪测量系统、数字摄影测量系统、测量机人和高程测量系统的发展和应用进行介绍;引用了某大堤作为工程实例,指出了在数据处理中利用自由网拟稳平... 详细信息

从精密工程测量的定义出发,指出其测量的特点,对精密工程测量的仪器如:马达全站仪、激光跟踪测量系统、数字摄影测量系统、测量机人和高程测量系统的发展和应用进行介绍;引用了某大堤作为工程实例,指出了在数据处理中利用自由网拟稳平差的优点,以及对它的适用性和网形布局对它的影响程度做了讨论。

关键词：精密工程测量测量仪器测量理论拟稳平差

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促红细胞生成素对视网膜Müller细胞光损伤的作用及机制

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实用临床医药杂志 2021年第20期25卷 28-32页

作者：贡亦清孟娜娜江苏大学附属人民医院/镇江第一人民医院眼科江苏镇江212002

目的探讨促红细胞生成素(EPO)对视网膜Müller细胞紫外线光损伤的作用及机制。方法将培养的小鼠原代Müller细胞分为无紫外线组(对照组)和紫外线组,每组均用不同浓度药物进行处理,采用噻唑蓝(MTT)法检测EPO对小鼠原代Müller细胞抗紫外... 详细信息

目的探讨促红细胞生成素(EPO)对视网膜Müller细胞紫外线光损伤的作用及机制。方法将培养的小鼠原代Müller细胞分为无紫外线组(对照组)和紫外线组,每组均用不同浓度药物进行处理,采用噻唑蓝(MTT)法检测EPO对小鼠原代Müller细胞抗紫外线的保护作用。采用蛋白质免疫印迹法检测EPO活化Müller细胞中蛋白激酶B(Akt)水平;将Müller细胞分为二甲基亚砜(DMSO)对照组(DMSO组)和Akt抑制剂MK-2206组(MK-2206组)。以上细胞均以3种方式进行处理:①无紫外线组不处理;②紫外线组采用UV辐射(30 mJ/cm^(2))30 min;③紫外线+药物组,采用1μg/mL的EPO预处理30 min,再进行UV(30 mJ/cm^(2))辐射30 min细胞进一步按照指定时间培养,采用MTT检测细胞活性。将24只小鼠分为无注射组(小鼠右眼,n=6)、注射组(小鼠左眼,n=6)、光照组(无注射眼接受光照,n=6)、光照+注射组(注射眼接受光照,n=6)共4小组,对各组小鼠进行闪光视网膜电图检查,以评估视觉功能受损情况。结果紫外线组不同浓度EPO预处理后的细胞MTT检测的吸光度(OD)值与无紫外线组比较,差异有统计学意义(P<0.05);EPO(0.1、1、10μg/mL)预处理后的细胞MTT检测的OD值较未处理细胞大幅提高,差异有统计学意义(P<0.01);EPO诱导的Müller细胞保护作用也随EPO浓度的增高(0.1、1μg/mL)而增强,差异有统计学意义(P<0.05),而1、10μg/mL浓度处理的细胞保护作用比较,差异无统计学意义(P=0.114)。采用指定浓度的EPO(0、0.1、1、10μg/mL)处理Müller细胞1 h,Western blot检测结果表明,p-Akt(Ser-473)和Akt1蛋白表达水平增高,且在0.1、1μg/mL浓度范围存在浓度依赖性。无注射组和注射组振幅比较,差异无统计学意义(P=0.17);无注射组与光照组及光照+注射组振幅比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。光照+注射组和光照组振幅比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论EPO通过激活Müller细胞Akt信号通路减轻小鼠视网膜光损伤。

关键词：促红细胞生成素 Müller细胞光损伤信号通路

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长江口北岸土地利用空间结构分析

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现代测绘 2009年第6期32卷 33-35页

作者：李润生龚忆清苏州高新区测绘事务所有限公司江苏苏州215129

采用地统计学方法,进行长江口北岸土地利用样本点半变异函数拟合和结构性分析,研究表明:当样本点间距小于61 km时,土地利用样点间的距离越小,空间相关性越大;当样本点间距大于61 km时,区域化变量的空间相关性不存在。长江口北岸土地利... 详细信息

采用地统计学方法,进行长江口北岸土地利用样本点半变异函数拟合和结构性分析,研究表明:当样本点间距小于61 km时,土地利用样点间的距离越小,空间相关性越大;当样本点间距大于61 km时,区域化变量的空间相关性不存在。长江口北岸土地利用样本点半变异函数拟合的结构系数为0.7左右,表明长江口北岸土地利用样本间的变异更多是由随机因素引起的,土地利用样本间的空间依赖性较弱,但有增强的趋势。

关键词：土地利用/覆盖变化地理信息系统地统计分析长江口北岸

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姜黄素对视网膜Müller细胞光损伤的保护作用及机制研究

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齐齐哈尔医学院学报 2022年第7期43卷 606-609页

作者：贡亦清孟娜娜席昊澜江苏大学附属人民医院(镇江第一人民医院)眼科江苏镇江212002

目的研究姜黄素(curcumin)对小鼠视网膜Müller细胞抗紫外线光损伤的保护作用及机制。方法选择C57BL/6小鼠12只作为研究对象,Müller细胞按照加入姜黄素浓度(0、2.5、5、10、15、20μmol/L)是否用紫外线辐照分对照组和紫外线组两组,每组... 详细信息

目的研究姜黄素(curcumin)对小鼠视网膜Müller细胞抗紫外线光损伤的保护作用及机制。方法选择C57BL/6小鼠12只作为研究对象,Müller细胞按照加入姜黄素浓度(0、2.5、5、10、15、20μmol/L)是否用紫外线辐照分对照组和紫外线组两组,每组各6只。对照组正常培养;紫外线组在暗室中的无菌操作台中,用紫外线仪(UVB)进行照射。紫外线辐照检测计调控紫外线仪照射剂量354μW/cm^(2)。用MTT法检测姜黄素对小鼠Müller细胞抗紫外线的保护作用;用Western blot检测不同浓度姜黄素活化Müller细胞中Nrf2水平。另选择小鼠(6-8周)12只作为研究对象,小鼠是否行姜黄素200 mg/(kg d)灌胃分为对照组和药物组两组,每组各6只。通过视觉电生理检测其对视网膜光损伤的保护作用。结果姜黄素减轻紫外线对Müller细胞的损伤。姜黄素(2.5、5、10、15、20μmol/L)进行预处理后的细胞活性相对于对照组,大幅提高。姜黄素诱导的Müller细胞保护作用在一定浓度范围内(2.5、5、10μmol/L)随浓度而增加,紫外线组与对照组比较,差异有统计学意义(P0.05);姜黄素激活Nrf2信号通路发挥保护作用;小鼠姜黄素200 mg/(kg d)灌胃后,减少了光损伤对小鼠闪光视网膜B波的影响,药物组与对照组比较,差异有统计学意义(P0.05)。ERG结果表明姜黄素灌胃能够减轻小鼠视网膜光损伤。结论姜黄素通过激活Müller细胞Nrf2信号通路减轻小鼠视网膜光损伤。

关键词：姜黄素 Müller细胞光损伤信号通路

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深圳市梅林水库仙湖苏铁群落优势种群生态位研究

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中南林业科技大学学报 2019年第11期39卷 63-70页

作者：孙延军陈晓熹付奇峰龚奕青邝嘉慧李楠荣建伟廖文波深圳园林股份有限公司广东深圳518000 梅林水库管理处广东深圳518049 深圳市中国科学院仙湖植物园深圳市南亚热带植物多样性重点实验室广东深圳518004 有害生物控制与资源利用国家重点实验室广东省热带亚热带植物资源重点实验室中山大学生命科学学院广东广州510275

仙湖苏铁Cycas fairylakea ***是深圳市唯一被列入《国家重点保护野生植物(附录一)》的物种,具有重要的科学、生态和观赏价值。深圳市梅林水库的仙湖苏铁群落是该物种现存最大的野生种群,因此研究深圳市梅林水库仙湖苏铁群落的生态位特... 详细信息

仙湖苏铁Cycas fairylakea ***是深圳市唯一被列入《国家重点保护野生植物(附录一)》的物种,具有重要的科学、生态和观赏价值。深圳市梅林水库的仙湖苏铁群落是该物种现存最大的野生种群,因此研究深圳市梅林水库仙湖苏铁群落的生态位特征对制定仙湖苏铁野生种群的保护规划具有重要意义。在群落调查的基础上,应用Levins和Shannon生态位宽度、Levins生态位重叠以及生态响应速率计算公式对深圳市梅林水库仙湖苏铁群落主要种群的生态位进行测度。结果表明:1)Levins和Shannon生态位宽度指数计算结果基本一致,乔灌层中仙湖苏铁、假萍婆、银柴、九节在群落中的生态位宽度较大,草本层中九节、粗叶榕、仙湖苏铁、牛白藤的在群落中的生态位宽度较大,这些物种的资源利用能力和环境适应能力较强;2)仙湖苏铁群落优势种群生态位重叠现象较普遍,但总体上重叠程度偏低,种间竞争不激烈,群落结构处于稳定状态;3)仙湖苏铁在乔灌层和草本层中均呈发展趋势,优势地位可能会进一步提升。

关键词：仙湖苏铁梅林水库生态位宽度生态位重叠生态响应速率

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