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Expansion and improvement of ChinaMu by MuT-seq and chromosome-level assembly of the Mu-starter genome

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Journal of Integrative Plant Biology 2024年第4期66卷 645-659页

作者： Lei Liang Yuancong Wang Yanbin Han Yicong Chen Mengfei Li yibo wu Zeyang Ma Han Zhao Rentao Song State Key Laboratory of Maize Bio-breeding Frontiers Science Center for Molecular Design BreedingJoint International Research Laboratory of Crop Molecular BreedingNational Maize Improvement CenterCollege of Agronomy and BiotechnologyChina Agricultural UniversityBeijing 100091China Institute of Crop Germplasm and Biotechnology Jiangsu Provincial Key Laboratory of AgrobiologyJiangsu Academy of Agricultural SciencesNanjing 210014China Sanya Institute of China Agricultural University Sanya 572025China Hainan Yazhou Bay Seed Laboratory Sanya 572025China

ChinaMu is the largest sequence-indexed Mutator(Mu)transposon insertional library in maize(Zea mays).In this study,we made significant improvements to the size and quality of the ChinaMu *** developed a new Mu-tag isolation method Mu-Tn5-seq(MuT-seq).Compared to the previous method used by ChinaMu,MuT-seq recovered 1/3 more germinal insertions,while requiring only about 1/14 of the sequencing volume and 1/5 of the experimental *** MuT-seq,we identified 113,879 germinal insertions from 3,168 Mu-active F1 *** also assembled a high-quality genome for the Mu-active line Mu-starter,which harbors the initial active MuDR element and was used as the pollen donor for the mutation *** the Mu-starter genome,we recovered 33,662(15.6%)additional germinal insertions in 3,244(7.4%)genes in the Mu-starter *** Mu-starter genome also improved the assignment of 117,689(54.5%)germinal *** newly upgraded ChinaMu dataset currently contains 215,889 high-quality germinal *** insertions cover 32,224 pan-genes in the Mu-starter and B73Ref5 genomes,including 23,006(80.4%)core genes shared by the two *** a test model,we investigated Mu insertions in the pentatricopeptide repeat(PPR)superfamily,discovering insertions for 92%(449/487)of PPR genes in ChinaMu,demonstrating the usefulness of ChinaMu as a functional genomics resource for maize.

关键词： ChinaMu Mutator MuT-seq PPR gene Zea mays

GRACE、CADILLC及TIMI评分对STEMI患者PCI术后主要心脏不良事件的预测价值比较

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中国基层医药 2024年第5期31卷 747-752页

作者：吴益波饶志高张奇军宁波大学附属人民医院全科医学科宁波315100

目的比较全球急性冠状动脉事件注册(GRACE)评分、改良阿昔单抗与支架植入降低血管成形术后并发症的对照研究评分(改良CADILLAC评分)和心肌梗死溶栓治疗临床试验(TIMI评分)对急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者经皮冠状动脉介入(PCI)术... 详细信息

目的比较全球急性冠状动脉事件注册(GRACE)评分、改良阿昔单抗与支架植入降低血管成形术后并发症的对照研究评分(改良CADILLAC评分)和心肌梗死溶栓治疗临床试验(TIMI评分)对急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者经皮冠状动脉介入(PCI)术后主要心脏不良事件(MACEs)的预测价值。方法回顾性收集2018年1月至2022年1月宁波大学附属人民医院诊断STEMI患者80例为研究对象,患者均采用PCI治疗,术后常规随访1~15个月,中位时间7.5个月。记录MACEs,主要包括靶血管重建、再发心梗、新发心衰、恶性心律失常和心源性死亡。结果PCI术后80例中,18例患者发生MACEs(22.5%,18/80)。单因素分析发现,MACEs组患者年龄增大、多支血管病变增多、支架植入长度较长、肌钙蛋白I(cTnI)峰值和持续时间增加及总缺血时间>6 h等与无MACES组比较,差异均有统计学意义(均P6 h,GRACE评分-高危、CADILLAC评分-高危和TIMI评分-高危均是STEMI患者PCI术后1年内发生MACEs的独立危险因素(HR值分别为1.079,2.037,3.562、3.421、3.236)。受试者工作特征曲线(ROC曲线)显示,GRACE评分-高危、CADILLAC评分-高危和TIMI评分-高危预测MACEs的曲线下面积(AUC)分别为0.816、0.823和0.803,三者差异无统计学意义(P>0.05)。结论GRACE、改良CADILLAC评分和TIMI评分对STEMI患者PCI术后MACEs均具有预测价值,且3种评分对预测1年内发生MACEs的风险均具有较好的准确性。

关键词： ST段抬高型心肌梗死经皮冠状动脉介入治疗机械溶栓心力衰竭肌钙蛋白

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基于双流卷积神经网络的稻米缺陷分割

计算机科学 2024年第S1期51卷 341-348页

作者：吴一博郝应光王洪玉大连理工大学信息与通信工程学院辽宁大连116024

目前水稻质量精细化评估因为没有水稻缺陷精细化检测相关工作而无法实现,传统的水稻质量评估都是基于粗略的缺陷有无分类而实现的。针对水稻缺陷像素级分类问题,提出了一种基于深度学习的水稻缺陷分割模型,该模型使用了一个改进的Double... 详细信息

目前水稻质量精细化评估因为没有水稻缺陷精细化检测相关工作而无法实现,传统的水稻质量评估都是基于粗略的缺陷有无分类而实现的。针对水稻缺陷像素级分类问题,提出了一种基于深度学习的水稻缺陷分割模型,该模型使用了一个改进的DoubleU-Net网络作为主要架构,分为NETWORK1和NETWORK2两部分,其中NETWORK1是基于VGG-19修改的U型网络结构,而NETWORK2是基于Swin Transformer修改的U型网络结构,将这两部分串联起来,同时融合CNN局部信息提取和Transformer全局信息提取的优势,可以更好地捕捉图像的上下文信息。同时,使用了多重损失函数,包括加权的二元交叉熵损失、加权的交并比损失和一个无需训练的智能损失网络,在提高模型训练稳定性的同时进一步提高了模型分割的精度。在制作的密集水稻缺陷数据集上进行训练测试,该模型均取得了较其他方法更好的分割性能,具有鲁棒性和较好的泛化能力。

关键词：稻米质量评估语义分割深度学习卷积神经网络 Transformer

Tb3+掺杂PVDF/PLLA多功能压电纤维的制备及性能

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材料导报 2024年第8期38卷 250-255页

作者：何诗峰薛蕊贺永晴黄妍伍一波师奇松北京石油化工学院新材料与化工学院特种弹性体复合材料北京市重点实验室

采用静电纺丝方法，将聚偏氟乙烯（PVDF）与少量结晶聚合物(聚-L-乳酸（PLLA）)共混，并将共混体系掺入稀土荧光配合物(Tb（TTA）3-（TPPO）2)中制备出兼具黄绿色荧光和压电功能的复合纳米纤维。通过扫描电子显微镜（SEM）、傅里叶变换... 详细信息

采用静电纺丝方法，将聚偏氟乙烯（PVDF）与少量结晶聚合物(聚-L-乳酸（PLLA）)共混，并将共混体系掺入稀土荧光配合物(Tb（TTA）3-（TPPO）2)中制备出兼具黄绿色荧光和压电功能的复合纳米纤维。通过扫描电子显微镜（SEM）、傅里叶变换红外光谱（FTIR）、原子力显微镜（AFM）、X射线衍射（XRD）光谱、差示扫描量热（DSC）仪、荧光光谱（FL）仪、灵敏度测试等表征手段研究了共混体系和稀土荧光配合物对PVDF复合纳米纤维形貌、结晶结构、灵敏度、荧光性能等的影响。结果表明，添加5%（质量分数）的荧光配合物可以使复合纳米纤维的β相含量达到95%,在0～1 kPa的压力下，由复合纳米纤维制成的传感器表现出优异的灵敏度(0.42 kPa-1)。同时，传感器的压电输出也具有良好的表现，输出电压和输出电流分别为2.5 V和800 nA。这种兼具黄绿色荧光及压电功能的复合纳米纤维有望应用于压电传感器、运动监测系统和生物电子皮肤等领域。

关键词：静电纺丝荧光压电共混

2型糖尿病患者的用药依从性与生存质量的关系及自我效能的调节作用

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中华疾病控制杂志 2024年第2期28卷 228-232,240页

作者：于业波黄镇吴一波孙昕霙北京大学公共卫生学院社会医学与健康教育系北京100191

目的探究2型糖尿病患者用药依从性与生存质量的关联及自我效能在两者关系中的调节作用。方法选取符合条件的2型糖尿病患者728人,采用8条目Morisky用药依从性量表、糖尿病特异性生存质量量表和自编糖尿病自我效能量表收集数据。利用多元... 详细信息

目的探究2型糖尿病患者用药依从性与生存质量的关联及自我效能在两者关系中的调节作用。方法选取符合条件的2型糖尿病患者728人,采用8条目Morisky用药依从性量表、糖尿病特异性生存质量量表和自编糖尿病自我效能量表收集数据。利用多元线性回归分析模型分析药物依从性与生活质量之间的关系,并进一步探讨自我效能感的调节作用。结果用药依从性好的患者仅125人(占17.2%)。与基线相比,随访9个月后生存质量的社会维度得分显著上升(t=-3.668,P=0.001)。基线用药依从性与基线生存质量总分(β=-0.161,P<0.001)和第9个月生存质量总分(β=-0.148,P=0.002)负向相关。较高的自我效能会增强用药依从性与第9个月治疗维度生存质量(β=0.150,P=0.010)和总生存质量(β=0.110,P=0.044)间的关系。结论2型糖尿病患者的用药依从性与未来短期生存质量有显著关联;提高自我效能能够增强用药依从性对生存质量的正向影响,尤其是疾病治疗维度的生存质量。

关键词：用药依从性生存质量自我效能 2型糖尿病

Building up a general selection strategy and catalytic performance prediction expressions of heteronuclear double-atom catalysts for N_(2)reduction

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Journal of Energy Chemistry 2023年第7期82卷 375-386,I0009页

作者： yibo wu Cheng He Wenxue Zhang State Key Laboratory for Mechanical Behavior of Materials School of Materials Science and EngineeringXi'an Jiaotong UniversityXi'an 710049ShannxiChina School of Materials Science and Engineering Chang'an UniversityXi'an 710064ShannxiChina

The severe environmental problems and the demand for energy urgently require electrocatalysis to replace Haber-Bosch for the nitrogen reduction reaction(NRR).The descriptors and important properties of single-atom and homonuclear double-atom catalysts have been preliminarily explored,but the relationship between the inherent properties and catalytic activity of heteronuclear double-atom catalysts with better performance remains ***,it is very significant to explore the prediction expressions of catalytic activity of heteronuclear double-atom catalysts based on their inherent properties and find the rule for selecting catalytic ***,by summarizing the free energy for the key steps of NRR on 55 catalysts calculated through the first-principle,the expressions of predicting the free energy and the corresponding descriptors are deduced by the machine learning,and the strategy for selecting the appropriate catalytic center is *** selection strategy for the central atom of heteronuclear double-atom catalysts is that the atomic number of central B atom should be between group VB and VIIIB,and the electron difference between central A atom and B atom should be large enough,and the selectivity of NRR or hydrogen evolution reaction(HER)could be calculated through the prediction ***,five catalysts are screened to have low limiting potential and excellent selectivity,and are further analyzed by electron *** work explores the relationship between the inherent properties of heteronuclear double-atom catalysts and the catalytic activity,and puts forward the rules for selecting the heteronuclear double-atom catalytic center,which has guiding significance for the experiment.

关键词： Heteronuclear double-atom catalyst Nitrogen reduction reaction Density functional theory Prediction expression Selection strategy

Design of novel transition-metal-doped C_(4)N_(4) as highly effective electrocatalysts for nitrogen fixation with a new intrinsic descriptor

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Journal of Energy Chemistry 2023年第9期84卷 131-139页

作者： Cheng He Jianglong Ma yibo wu Wenxue Zhang State Key Laboratory for Mechanical Behavior of Materials School of Materials Science and EngineeringXi’an Jiaotong UniversityXi’an 710049ShaanxiChina School of Materials Science and Engineering Chang’an UniversityXi’an 710064ShaanxiChina

Electrocatalytic nitrogen reduction reaction(NRR) is an efficient and green way to produce ammonia,which offers an alternative option to the conventional Haber-Bosch ***,the large-scale industrial application of NRR processes is still hindered by poor Faraday efficiency and high overpotential,which need to be overcome ***,combined with density functional theory and particle swarm optimization algorithm for the nitrogen carbide monolayer structural search(C_mN_(8-m),m=1-7),the surprising discovery is that single transition metal-atom-doped C_(4)N_(4) monolayers(TM@C_(4)N_(4)) could effectively accelerate nitrogen reduction ***@C_(4)N_(4)(TM=29 transition metals) as single-atom catalysts are evaluated via traditional multi-step screening method,and their structures,NRR activity,selectivity and solvation effect are investigated to evaluate their NRR performance,Through the screening steps,W@C_(4)N_(4) possesses the highest activity for NRR with a very low limiting potential of-0.29 ***,an intrinsic descriptor φ is proposed with machine learning,which shortens the screening process and provides a new idea for finding efficient *** work not only offers promising catalysts W@C_(4)N_(4) for NRR process but also offers a new intrinsic and universal descriptor φ.

关键词： SACs Nitrogen reduction reaction C_(4)N_(4) Intrinsic descriptor Machine learning

中国居民心理与行为调查研究:理念、实践与展望

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中国全科医学 2024年第25期27卷 3069-3075页

作者：吴一波范思园刘迪玥孙昕霙北京大学公共卫生学院北京市100191 首都医科大学燕京医学院北京市101300 海南医学院公共卫生与全健康国际学院海南省海口市571199

为使研究者全面了解中国居民心理与行为调查研究(PBICR),本文从四个方面介绍其背景和特色。在设计理念上,PBICR聚焦中国人群的心理健康与健康行为的诸多方面,充分考虑时效性与高效性,秉承数据开放与数据共享初衷,以大样本、多中心、重... 详细信息

为使研究者全面了解中国居民心理与行为调查研究(PBICR),本文从四个方面介绍其背景和特色。在设计理念上,PBICR聚焦中国人群的心理健康与健康行为的诸多方面,充分考虑时效性与高效性,秉承数据开放与数据共享初衷,以大样本、多中心、重复性、全国性横断面设计搭建高质量数据库,促进数据挖掘与交流合作;在调查实施上,PBICR采用人口规模成比例、多阶段抽样与配额抽样相结合的抽样方法,以面对面实地调查获取数据并严格质量控制,保证样本代表性与可靠性;在成果产出上,因PBICR研究内容涵盖丰富、更新接轨国际热点,可满足多样化变量数据研究需求,既往研究结果在公共卫生、管理学、传播学、心理学等多个领域具有较高影响力;展望未来,PBICR将逐步完成从总库到分库的数据库建设,关注特殊人群与全球广泛地区,增添追踪性调查与生物医学数据研究视角,拥有更大研究潜力,通过总体布局多层面驱动中国居民心理与行为健康研究。

关键词：精神卫生健康行为数据库横断面研究中国居民

基于BN-AHP的装甲车辆动力系统故障状态评估

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兵器装备工程学报 2024年第3期45卷 86-93页

作者：王文顺崔俊杰刘勇张江夏添武一博中北大学机电工程学院太原030051 中北大学能源与动力工程学院太原030051

装甲车辆复杂传统部件的损伤能否及时被发现,这关系到整车战备或作战能力,系统的故障状态评估是至关重要的。将贝叶斯网络模型结合云模型理论,建立云贝叶斯网络模型,针对4个不同工况的装甲车辆进行故障状态评估。在获取贝叶斯网络初始... 详细信息

装甲车辆复杂传统部件的损伤能否及时被发现,这关系到整车战备或作战能力,系统的故障状态评估是至关重要的。将贝叶斯网络模型结合云模型理论,建立云贝叶斯网络模型,针对4个不同工况的装甲车辆进行故障状态评估。在获取贝叶斯网络初始节点时更多是依靠专家经验,往往会带来很大的误差,导致条件概率偏差过大,采用证据理论/层次分析法来优化专家经验,确定各个节点的条件概率;将层次分析法转化所得的条件概率值代入到云贝叶斯网络模型中,经过计算可以得到不同损毁等级的概率。将云贝叶斯网络模型计算结果与其他状态评估方法结果进行对比分析,结果表明,所采用的计算方法较其他方法在可靠性和准确性方面有所提高。

关键词：贝叶斯网络层次分析法云模型转换故障状态评估证据理论专家经验