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Phosphorylated protein chip combined with artificial intelligence tools for precise drug screening

Journal of Biomedical Research 2024年第3期38卷 195-205页

作者： Katsuhisa Horimoto Yuki Suyama Tadamasa Sasaki Kazuhiko Fukui Lili Feng Meiling Sun yamin tang Yixuan Zhang Dongyin Chen Feng Han SOCIUM Inc. Tokyo 1350064Japan International Medical Center Saitama Medical UniversitySaitama 350-1298Japan Artificial Intelligence Research Center National Institute of Advanced Industrial Science and TechnologyTokyo 1350064Japan Department of Informatics and Data Science Sanyo-Onoda City UniversityYamaguchi 7560884Japan International Joint Laboratory for Drug Target of Critical Illnesses School of PharmacyNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China Department of Physiology School of Basic Medical SciencesNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China Gusu School Nanjing Medical UniversitySuzhouJiangsu 215001China National Vaccine Innovation Platform Nanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China

We have developed a protein array system,named"Phospho-Totum",which reproduces the phosphorylation state of a sample on the *** protein array contains 1471 proteins from 273 known signaling *** to the activation degrees of tyrosine kinases in the sample,the corresponding groups of substrate proteins on the array are phosphorylated under the same *** addition to measuring the phosphorylation levels of the 1471 substrates,we have developed and performed the artificial intelligence-assisted tools to further characterize the phosphorylation state and estimate pathway activation,tyrosine kinase activation,and a list of kinase inhibitors that produce phosphorylation states similar to that of the *** Phospho-Totum system,which seamlessly links and interrogates the measurements and analyses,has the potential to not only elucidate pathophysiological mechanisms in diseases by reproducing the phosphorylation state of samples,but also be useful for drug discovery,particularly for screening targeted kinases for potential drug kinase inhibitors.

关键词： Phospho-Totum protein array signal transduction pathways artificial intelligence tools drug screening

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Cyclopeptide moroidin inhibits vasculogenic mimicry formed by glioblastoma cells via regulating β-catenin activation and EMT pathways

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Journal of Biomedical Research 2024年第4期38卷 322-333页

作者： Pengxiang Min Yingying Li Cuirong Wang Junting Fan Shangming Liu Xiang Chen yamin tang Feng Han Aixia Zhang Lili Feng Key Laboratory of Cardiovascular&Cerebrovascular Medicine International Joint Laboratory for Drug Target of Critical IllnessesSchool of PharmacyNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China Department of Pharmaceutical Analysis School of PharmacyNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 210029China Department of Analysis and Testing Center School of Basic Medical SciencesNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China Institute of Brain Science the Affiliated Brain Hospital of Nanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China Department of Clinical Pharmacology School of PharmacyNanjing Medical UniversityNanjingJiangsu 211166China

Glioblastoma(GBM)is a highly vascularized malignant brain tumor with poor clinical *** mimicry(VM)formed by aggressive GBM cells is an alternative approach for tumor blood supply and contributes to the failure of anti-angiogenic *** date,there is still a lack of effective drugs that target VM formation in *** the present study,we evaluated the effects of the plant cyclopeptide moroidin on VM formed by GBM cells and investigated its underlying molecular *** significantly suppressed cell migration,tube formation,and the expression levels ofα-smooth muscle actin and matrix metalloproteinase-9 in human GBM cell lines at sublethal *** RNA sequencing data suggested the involvement of the epithelialmesenchymal transition(EMT)pathway in the mechanism of *** to moroidin led to a concentration-dependent decrease in the expression levels of the EMT markers N-cadherin and vimentin in GBM ***,moroidin significantly reduced the level of phosphorylated extracellular signal-regulated protein kinase(p-ERK)and inhibited the activation of β-***,we demonstrated that the plant cyclopeptide moroidin inhibited VM formation by GBM cells through inhibiting the ERK/β-catenin-mediated ***,our study indicates a potential application of moroidin as an anti-VM agent in the treatment of GBM.

关键词： moroidin vasculogenic mimicry glioblastoma EMT β-catenin

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轻量化结构设计的新颖度评价及安全评估方法

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船舶 2024年第1期35卷 118-129页

作者：吴嘉蒙汤雅敏朱文博蔡诗剑韩涛朱俊侠王元上海市船舶工程重点实验室上海200011 中国船舶及海洋工程设计研究院上海200011

轻量化技术是未来船舶发展的重要趋势。轻量化的船体结构设计,可能出现突破现有规范的新颖设计,包括新型结构或新材料。在现有船舶结构安全评估体系综述的基础上,该文重点阐述了轻量化结构设计的安全评估流程和方法,包括替代设计流程、... 详细信息

轻量化技术是未来船舶发展的重要趋势。轻量化的船体结构设计,可能出现突破现有规范的新颖设计,包括新型结构或新材料。在现有船舶结构安全评估体系综述的基础上,该文重点阐述了轻量化结构设计的安全评估流程和方法,包括替代设计流程、新颖度评价指标及方法、基于极限状态的结构安全评估准则确定方法等。在此基础上应用文章所提出的轻量化结构设计新颖度评价及安全评估方法,针对国内公开文献发表的油船、散货船和集装箱船轻量化结构设计的典型案例进行应用性分析。文中轻量化结构设计的新颖度评价及安全评估方法可为相应的新颖或替代设计的结构安全性评估提供途径和方法。

关键词：轻量化结构优化新颖度安全评估等效替代

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Total gaseous mercury emissions from mercury-enriched soil in Guizhou, China

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Chinese Journal Of Geochemistry 2006年第B8期25卷 243-244页

作者： Xinbin FENG Shaofeng WANG Guangle QIU yamin HOU Shunlin tang State Key Laboratory of Environmental Geochemistry Institute of Geochemistry Chinese Academy of Sciences Guiyang 550002 China

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综合老年评估指数作为老年B细胞淋巴瘤患者独立预后因素的研究进展

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肿瘤 2024年第1期44卷 13-19页

作者：施展徐雅敏沈倩雯唐曦复旦大学附属华东医院肿瘤内科上海200040 复旦大学附属华东医院护理部上海200040 复旦大学附属华东医院放疗科上海200040

中国是一个人口大国,且人口老龄化进程加快。老年患者群体普遍存在着的躯体功能、心理以及社会等众多方面的医疗需求,因此急需对老年群体的健康状况进行全面的了解,从而为这类特殊人群制定个体化的诊疗方案。综合老年评估(comprehensive... 详细信息

中国是一个人口大国,且人口老龄化进程加快。老年患者群体普遍存在着的躯体功能、心理以及社会等众多方面的医疗需求,因此急需对老年群体的健康状况进行全面的了解,从而为这类特殊人群制定个体化的诊疗方案。综合老年评估(comprehensive geriatric assessment,CGA)主要内容包括全面的医疗评估、躯体功能评估、认知和情感评估以及社会及环境因素评估等4个方面,是中国老年医学的核心技能。中外多项研究已经证实CGA评分可作为接受免疫化疗的老年B细胞淋巴瘤患者的独立预后因素,用于预测老年B细胞淋巴瘤患者的生存结局。建议在中国老年B细胞淋巴瘤患者接受免化疗前进行推广和实行CGA,以利于为中国60岁以上B细胞淋巴瘤患者制定精准治疗策略和个体化干预手段。

关键词： B细胞淋巴瘤人口老龄化综合老年评估指数预后因素生存

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豪华邮轮大型剧场内支柱布局优化设计

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船舶工程 2022年第3期44卷 48-54页

作者：朱俊侠吴嘉蒙汤雅敏陈碧昊徐莹中国船舶及海洋工程设计研究院上海200011 上海市船舶工程重点实验室上海200011

豪华邮轮大型剧场内通常要求设置尽量少的支柱形成尽可能大的支撑空间,存在优化需求。目前的支柱布局多依赖工程师的设计经验实现,缺少数学优化方法的支撑。对此,建立一套基于变密度拓扑优化法的支柱布局优化方法,利用单元相对密度确定... 详细信息

豪华邮轮大型剧场内通常要求设置尽量少的支柱形成尽可能大的支撑空间,存在优化需求。目前的支柱布局多依赖工程师的设计经验实现,缺少数学优化方法的支撑。对此,建立一套基于变密度拓扑优化法的支柱布局优化方法,利用单元相对密度确定设计域内各支柱的“重要性”,通过简化算例验证该方法的可行性。针对目标邮轮大型剧场,采用建立的支柱布局优化方法获得初步的支柱优化方案。经结构动响应校核和二次设计修正,获得工程化的支柱布局优化设计方案。通过对比新、旧方案的多项响应发现,优化设计效果较好,表明该方法在实船优化设计中有效且可靠,可供豪华邮轮大型剧场内的支柱布局优化设计参考。

关键词：豪华邮轮布局优化支柱拓扑优化

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快速识别密度骨架的聚类算法

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计算机应用 2017年第12期37卷 3482-3486页

作者：邱保志唐雅敏郑州大学信息工程学院郑州450001

针对如何快速寻找密度骨架、提高高维数据聚类准确性的问题,提出一种快速识别高密度骨架的聚类(ECLUB)算法。首先,在定义了对象局部密度的基础上,根据互k近邻一致性及近邻点局部密度关系,快速识别出高密度骨架;然后,对未分配的低密度点... 详细信息

针对如何快速寻找密度骨架、提高高维数据聚类准确性的问题,提出一种快速识别高密度骨架的聚类(ECLUB)算法。首先,在定义了对象局部密度的基础上,根据互k近邻一致性及近邻点局部密度关系,快速识别出高密度骨架;然后,对未分配的低密度点依据邻近关系进行划分,得到最终聚类。人工合成数据集及真实数据集上的实验验证了所提算法的有效性,在Olivetti Face数据集上的聚类结果显示,ECLUB算法的调整兰德系数(ARI)和归一化互信息(NMI)分别为0.877 9和0.962 2。与经典的基于密度的聚类算法(DBSCAN)、密度中心聚类算法(CFDP)以及密度骨架聚类算法(CLUB)相比,所提ECLUB算法效率更高,且对于高维数据聚类准确率更高。

关键词：聚类算法高维数据 k近邻密度骨架局部密度

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基于不同爆炸风险水平的FPSO生活楼抗爆结构设计

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船舶 2023年第5期34卷 57-66页

作者：张延昌陈刚汤雅敏刘昆上海外高桥造船有限公司上海200137 中国船舶及海洋工程设计研究院上海200011 江苏科技大学船舶与海洋工程学院镇江212003

油气爆炸是海洋平台主要风险之一,基于爆炸风险的结构设计是设计技术发展趋势。该文梳理风险分析相关的技术法规、规范,总结了爆炸风险评估流程、结构抗爆性能评估方法及流程;以某浮式生产储卸油装置(floating production storage and o... 详细信息

油气爆炸是海洋平台主要风险之一,基于爆炸风险的结构设计是设计技术发展趋势。该文梳理风险分析相关的技术法规、规范,总结了爆炸风险评估流程、结构抗爆性能评估方法及流程;以某浮式生产储卸油装置(floating production storage and offloading unit,FPSO)海洋平台生活楼为依托对象,利用结构有限元分析软件,分别开展了筛选分析、强度水平分析和塑性水平分析,完成基于爆炸风险的生活楼结构性能评估;基于功能性、作业、生命安全这3个性能水平,开展不同爆炸风险水平的结构设计,得到满足各性能水平衡准的设计方案。

关键词：浮式生产储卸油装置生活楼结构爆炸风险设计性能设计水平抗爆性能

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轮压载荷下夹层板直升机平台结构响应特性

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船舶工程 2019年第4期41卷 23-30,103页

作者：汤雅敏张延昌中国船舶及海洋工程设计研究院上海200011 上海市船舶工程重点实验室上海200011

以直升机平台甲板为研究对象,基于数值仿真方法,考虑弹性工况和塑性工况,分别采用动态冲击、轮胎准静态压载、刚体准静态压载和均布压载4种处理方式模拟轮压载荷,分析夹层板上面板、夹芯层和下面板的响应特点,讨论载荷处理方式对轮压压... 详细信息

以直升机平台甲板为研究对象,基于数值仿真方法,考虑弹性工况和塑性工况,分别采用动态冲击、轮胎准静态压载、刚体准静态压载和均布压载4种处理方式模拟轮压载荷,分析夹层板上面板、夹芯层和下面板的响应特点,讨论载荷处理方式对轮压压力分布和结构响应的影响规律,并初步探讨4种载荷处理方式间的内在关系。研究结果表明:在轮压载荷作用下,板架产生高应力、高变形的局部结构响应,采用动态冲击、轮胎准静态压载和均布载荷3种处理方式均能较好地反映夹层板响应,这3种载荷处理方式之间存在联系,轮压载荷可通过等效处理达到一定程度的简化。

关键词：夹层板轮压载荷结构响应塑性载荷处理方式

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加快对企业核心竞争力的培育

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科技和产业 2005年第4期5卷 54-57页

作者：唐亚敏中共常州市委党校经济教研室江苏213016

人们在对企业的核心竞争力的理解上众说纷纭,并在企业核心竞争力的培育过程中走了不少弯路。为此,本文就如何拨开核心竞争力理解实施上的迷雾、努力加快企业核心竞争力培育进程问题作了些分析和探讨。

关键词：企业核心竞争力培育

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