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中国Ⅲ型弓形虫潜伏性感染前后宿主脑转录组差异分析

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中国病原生物学杂志 2023年第12期18卷 1393-1400页

作者：代莉莎谢环环解晓曼朱文菊孙航张俊梅王琦董宏杰周贝贝赵桂华徐超尹昆山东省寄生虫病防治研究所山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东济宁272033

目的分析中国III型弓形虫虫株感染小鼠脑组织前后转录组表达差异,鉴定与小鼠行为变化相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。方法取感染和未感染中国III型弓形虫LHG株的小鼠脑组织,镜下观察脑包囊;提取总RNA,构建... 详细信息

目的分析中国III型弓形虫虫株感染小鼠脑组织前后转录组表达差异,鉴定与小鼠行为变化相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。方法取感染和未感染中国III型弓形虫LHG株的小鼠脑组织,镜下观察脑包囊;提取总RNA,构建转录组文库,采用Oxford Nanopore Technologies单分子实时测序平台对感染组和对照组文库进行第三代纳米孔高通量测序,以Fold Change≥1.5且P<0.05作为筛选标准,从测序结果中筛选DEGs并对其进行Gene Ontology(GO)富集分析,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析和Protein-Protein interaction network(PPI network)蛋白互作网络分析。结果共检测到722个DEGs,其中708个表达上调,14个表达下调。GO功能注释表明DEGs主要富集在宿主的突触刺激应答和免疫应答过程,同时也与行为调控、成瘾、化学突触传递等生物学过程有关。KEGG富集分析表明,多数DEGs富集在寄生虫和病毒感染相关通路。将基因表达差异幅度大、GO注释和KEGG富集排名均靠前的DEGs取交集,共筛选到10个关键上调基因(Cd74、Ccl5及H2家族的H2-Aa、H2-Ab1、H2-Eb1、H2-D1、H2-Q7、H2-K1、H2-DMb1、H2-Qa基因)和5个关键下调基因(Gng4、Frzb、Hes5、Mfge8、Cartpt基因)。对关键DEGs进行PPI互作分析,H2蛋白家族及CD74的蛋白互作连接度大,节点多。结论MHC类分子可能是弓形虫LHG株感染小鼠过程中宿主抵抗其感染的主要因子,弱毒弓形虫株可能通过干扰宿主的神经元干细胞功能和兴奋性神经递质代谢通路导致宿主出现精神行为异常。

关键词：刚地弓形虫中国III型转录组脑包囊纳米孔三代测序

IGF-1联合ICT对BV2小胶质细胞炎症反应影响

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青岛大学学报（医学版） 2022年第3期58卷 353-356页

作者：解晓曼胡子凡杨妍卿陈文芳青岛大学基础医学院生理学与病理生理学系山东青岛266071

目的探讨胰岛素样生长因子-1(IGF-1)与淫羊藿素(ICT)合用对脂多糖(LPS)诱导的BV2小胶质细胞炎症反应的影响。方法常规培养BV2小胶质细胞,将细胞分为对照组、LPS组、IGF-1+LPS组、ICT+LPS组和IGF-1+ICT+LPS组。其中LPS组细胞加入LPS(1 mg... 详细信息

目的探讨胰岛素样生长因子-1(IGF-1)与淫羊藿素(ICT)合用对脂多糖(LPS)诱导的BV2小胶质细胞炎症反应的影响。方法常规培养BV2小胶质细胞,将细胞分为对照组、LPS组、IGF-1+LPS组、ICT+LPS组和IGF-1+ICT+LPS组。其中LPS组细胞加入LPS(1 mg/L)作用6 h;后3组细胞先加入IGF-1(12.5μg/L)或(和)ICT(10μmol/L)预保护1 h,再加入LPS(1 mg/L)共同作用6 h。应用实时荧光定量PCR检测各组细胞环氧合酶-2(COX-2)和诱导型一氧化氮合酶(iNOS)mRNA的表达。结果与对照组比较,LPS组COX-2和iNOS mRNA表达明显上调(F=20.77、39.85,P<0.05);IGF-1和ICT预处理均可显著下调LPS诱导的BV2小胶质细胞COX-2和iNOS mRNA的表达,且IGF-1和ICT联合用药的下调作用比单独应用两种药物更显著(F=54.84~241.68,P<0.05)。结论IGF-1和ICT均能明显抑制LPS诱导的BV2小胶质细胞炎症反应,且二者联合应用较单独应用更有效。

关键词：胰岛素样生长因子Ⅰ 淫羊藿苷小神经胶质细胞炎症环氧化酶2 一氧化氮合酶Ⅱ型

中国国家级农业智库能力体系构成及其制度保障

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农业展望 2017年第9期13卷 80-86页

作者：梁丽李晓曼梁晓贺谢能付张学福中国农业科学院农业信息研究所北京100081 沈阳农业大学经济管理学院辽宁沈阳110866

农业智库建设是中国政府加快农业决策科学化的一项国家战略。从智库工作流程视角,利用情报分析理论、系统工程理论和制度结构理论,分析了中国国家级农业智库的能力体系构成及其制度保障。研究发现,从工作流程角度来讲,中国国家级农业智... 详细信息

农业智库建设是中国政府加快农业决策科学化的一项国家战略。从智库工作流程视角,利用情报分析理论、系统工程理论和制度结构理论,分析了中国国家级农业智库的能力体系构成及其制度保障。研究发现,从工作流程角度来讲,中国国家级农业智库的能力体系包括政府需求分析能力、项目选题能力、项目研究能力、政策咨询能力、成果宣传能力,需要围绕自身资源构建能力体系,实现竞争优势;中国国家级农业智库能力建设所需要的制度保障包括组织管理制度、科研管理制度、资金管理制度、人才管理制度、合作交流制度和宣传推广制度。

关键词：智库农业智库能力体系制度保障

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不同种源文冠果种子的表型变异

经济林研究 2021年第4期39卷 97-105页

作者：刘莉王磊吴丹赵永军庄振杰王震鲁仪增刘立江陆璐解孝满山东师范大学山东济南250014 山东省林草种质资源中心山东济南250102 山东林昱宏文冠果有限公司山东淄博255400

【目的】揭示文冠果种子变异规律,为文冠果优树选择、引种利用及其种质资源保护提供参考。【方法】利用主成分分析、巢式方差分析、相关分析和聚类分析等方法对10个种源文冠果种子的10个表型性状进行分析比较。【结果】文冠果种子表型... 详细信息

【目的】揭示文冠果种子变异规律,为文冠果优树选择、引种利用及其种质资源保护提供参考。【方法】利用主成分分析、巢式方差分析、相关分析和聚类分析等方法对10个种源文冠果种子的10个表型性状进行分析比较。【结果】文冠果种子表型性状在不同个体间均存在变异,其中百粒质量的变异范围最大,72.275%的表型变异来自种源间。文冠果种子的发育明显受环境因子的调控,百粒质量与日照时长呈显著正相关,百粒质量和出仁率均与降水量呈显著负相关,种仁出油率和百粒出仁量均与相对湿度显著相关。在所研究的10个种源地中,越往北、西北方向,空气湿度相对越低,降水量越少,阳光充足,文冠果质量性状较好,其种子经济指标(种仁含油率和百粒出仁量)越好。将10个文冠果种源划分为4大类,地理位置上相近的种源基本聚在一起,而且自西北至东南方向,其亲缘关系逐渐变远。【结论】文冠果种子表型性状在种源间和种源内均存在变异,种子发育受基因型及环境影响,种仁饱满度、种壳厚度等不同,进而导致文冠果种子的百粒质量在不同种源之间均存在显著差异。文冠果种子的表型性状与环境因子具有显著相关关系,降雨量越小,文冠果种子的经济指标越好。

关键词：文冠果种源种子表型变异

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Variation and Dynamics of Soil Nematode Communities in Greenhouses with Different Continuous Cropping Periods

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Horticultural Plant Journal 2020年第5期6卷 301-312页

作者： Xueliang Tian xiaoman Zhao Zhenchuan Mao Bingyan xie College of Resources and Environment Henan Institute of Science and TechnologyXinxiangHenan 453003China Institute of Vegetable and Flowers Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

Continuous cropping in greenhouses can result in root-knot nematode outbreaks resulting from imbalances in the soil nematode ***,the changes in soil nematode communities in greenhouses with continuous crop production are *** compared soil nematode communities in greenhouses after 2 years(2-yr)and 10 years(10-yr)of continuous crop production by 18S rDNA high-throughput *** with the 2-yr greenhouse,soil in the 10-yr greenhouse showed acidification,nutrient accumulation and ***-feeding nematodes(BF)were dominant in the 2-yr greenhouse over the whole growing season,but plant-parasitic nematodes(PP)were the dominant group in the 10-yr greenhouse during the late growing *** gradually became the dominant group and had a relative abundance of 70.9%(maximum)in the 10-yr ***,with relative abundance ranging from 99.8%to 26.8%,was the predominant group in the 2-year ***β-diversity,hierarchical clustering analysis,unweighted UniFrac principal component analysis(PCA)and principal co-ordinates analysis(PCoA)all revealed that soil nematode communities in the two types of greenhouses were significantly *** analysis(RDA)showed that soil nematode communities in the 10-yr greenhouse were related to high soil organic material,total nitrogen,electrical conductivity and disease index of root-knot ***’s exact test and Pearson’s correlation coefficients revealed that Meloidogyne contributed to themain differences in soil nematode communities between the two types of *** dynamics of Meloidogyne were divided into dormant phase,low-level increasing phase and exponential phase during the whole *** soil nematode communities within the 2-yr and 10-yr greenhouses had significant variation and different *** work contributes to a deeper understanding of changes in the soil nematode community in greenhouses with different continuous cro

关键词： meloidogyne greenhouse soil nematode community continuous cropping high-throughput sequencing

Antifungal properties and mechanisms of three volatile aldehydes(octanal,nonanal and decanal)on Aspergillus flavus

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Grain & Oil Science and Technology 2021年第3期4卷 131-140页

作者： Qian Li xiaoman Zhu Yanli xie Jingmeng Liang Henan Key Laboratory of Cereal and Oil Food Safety Inspection and Control College of Food Science and EngineeringHenan University of TechnologyZhengzhou 450001China

The harmof Aspergillus flavus(***)and aflatoxin is a severe food safety problemworldwide,which causes huge economic losses every ***,it is urgent to control the growth of *** and the biosynthesis of ***-derived natural compounds are superior to synthetic fungicide in inhibiting the growth of *** benefiting from their high safety to the environment,humans and stock,and low *** study aimed to evaluate the antifungal effects and potential antifungal mechanisms of three plant-derived compounds(octanal,nonanal and decanal)against *** determined the minimum inhibitory concentrations(MICs)and action mechanism of the three volatile aldehydes on *** and also performed calcofluor white(CW)staining for visualizing the distribution of *** respiration metabolism and the pathogenicity on maize kernels were also carried out to evaluate the efficacy of the three volatile aldehydes on the growth of *** results showed that the three volatile aldehydes could inhibit the germination of spores and mycelial growth of ***,the MICs on spores and mycelia were:octanal(1.0 and 0.5μL/mL),nonanal(0.5 and 2.0μL/mL),and decanal(1 and 5μL/mL).The three volatile aldehydes could strongly damage the integrity of both the cell wall and the cell membrane of ***,they could decrease the content of total lipid and inhibit respiration metabolism of *** *** of in vitro antifungal test showed that all the three volatile aldehydes could effectively prevent the growth of *** on maize *** study revealed that octanal,nonanal and decanal could effectively inhibit the growth of *** both in culture medium and on maize kernels to different *** results confirmed that the plant-derived compounds could be developed into promising antifungal agents applied in the preservation of *** study provides a theoretical basis for the research and application of potential antifungal agents.

关键词： Aspergillus flavus Octanal Nonanal Decanal Antifungal mechanism

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野生软枣猕猴桃种子表型变异分析

种子 2022年第5期41卷 104-108页

作者：董昕韩彪解孝满咸洋乔婕徐慧张继良赵立军崔程程王宁山东省林草种质资源中心暖温带林草种质资源保存与利用国家林业和草原局重点实验室济南250102

为了揭示软枣猕猴桃遗传变异程度和变异规律,分别采用描述性统计、方差分析、多重比较、相关分析和聚类分析方法,对8个野生软枣猕猴桃群体的种子表型多样性进行研究。结果表明,软枣猕猴桃种内变异丰富,种子表型变异系数为7.77%~23.15%,... 详细信息

为了揭示软枣猕猴桃遗传变异程度和变异规律,分别采用描述性统计、方差分析、多重比较、相关分析和聚类分析方法,对8个野生软枣猕猴桃群体的种子表型多样性进行研究。结果表明,软枣猕猴桃种内变异丰富,种子表型变异系数为7.77%~23.15%,平均值为13.51%;各性状在群体间的差异均达到极显著水平,且种子大小和重量基本遵循东北地区群体>华东地区群体>西北地区群体的渐变趋势,中温带的软枣猕猴桃种子比暖温带的大且重;软枣猕猴桃种子重量与种子大小呈显著或极显著的正相关关系;8个软枣猕猴桃群体被聚为两类,其中,辽宁地区4个亲缘关系较近的群体被聚为一类。

关键词：软枣猕猴桃表型变异

野生玫瑰基因组DNA提取及CDDP引物筛选

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山东农业科学 2016年第11期48卷 13-17页

作者：姜丽媛臧德奎李文清解孝满仝伯强山东农业大学林学院山东泰安271018 山东省林木种质资源中心山东济南250102

野生玫瑰中多糖多酚含量较高,DNA提取较为困难,本试验在植物基因组DNA CTAB提取法的基础上,通过延长水浴时间、调整氯仿-异戊醇（24∶1）抽提次数为2~3次等一系列方法提高野生玫瑰基因组DNA的提取纯度。以2×Es Taq Master Mix（含染料... 详细信息

野生玫瑰中多糖多酚含量较高,DNA提取较为困难,本试验在植物基因组DNA CTAB提取法的基础上,通过延长水浴时间、调整氯仿-异戊醇（24∶1）抽提次数为2~3次等一系列方法提高野生玫瑰基因组DNA的提取纯度。以2×Es Taq Master Mix（含染料）10μL,40 ng/μL DNA模板1μL,10 pmol/μL引物1μL,dd H2O 8μL为CDDP-PCR反应体系,对21条CDDP引物进行多态性筛选。结果表明,用改良的CTAB法提取的野生玫瑰基因组DNA纯度较高;21条CDDP引物中有16条对野生玫瑰品种的鉴别能力较高。本研究为野生玫瑰CDDP分子标记及后续各种分子生物学研究奠定基础。

关键词：野生玫瑰改良CTAB法 DNA提取 CDDP分子标记

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盐胁迫对柳树无性系幼苗生理生态特性的影响

山东林业科技 2013年第3期43卷 9-12页

作者：韩彪解孝满董昕王磊咸洋田莎莎吴丹山东省林木种质资源中心山东济南250014

利用穴盘扦插育苗,研究了5种质量分数的盐(NaCl)胁迫处理对8个柳树无性系幼苗(SH13,SH16,SH19,SH23,SH24,SH30,172,2460)形态特性的影响,测定了叶片SOD活性、POD活性、MDA含量的变化情况。结果表明:柳树扦插苗成活率与生物量之间中度正... 详细信息

利用穴盘扦插育苗,研究了5种质量分数的盐(NaCl)胁迫处理对8个柳树无性系幼苗(SH13,SH16,SH19,SH23,SH24,SH30,172,2460)形态特性的影响,测定了叶片SOD活性、POD活性、MDA含量的变化情况。结果表明:柳树扦插苗成活率与生物量之间中度正相关(相关系数r=0.55),显示二者之间存在不紧密的关联。MDA含量与SOD活性、POD活性显著正相关(相关系数分别为rSOD=0.745,rPOD=0.794),说明抗氧化酶活性与叶片MDA含量紧密关联。柳树扦插苗对盐胁迫的耐受点在0.4%～0.6%之间,0.8%的NaCl胁迫对柳树幼苗造成不可逆伤害。SH30、SH19扦插扩繁相对容易,生长迅速,抗盐碱能力理论上较强,值得进一步研究。

关键词：柳树无性系盐胁迫抗氧化酶