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Population-based incremental learning for the prediction of Homo sapiens’ protein secondary structure

International Journal of Biomathematics 2019年第3期12卷 1-21页

作者： Ye Chen Xiaoping Yuan xiaohui cang School of Information and Control Engineering China University of Mining and Technology Xuzhou Jiangsu 221008 P. R. China Institute of Genetics Zhejiang University School of Medicine Hangzhou Zhejiang 310058 P. R. China

prediction of the protein secondary structure of Homo sapiens is one of the more important domains. Many methods have been used to feed forward neural networks or SVMs combined with a sliding window. This method’s mechanisms are too complex to be able to extract clear and straightforward physical meanings from it. This paper explores population-based incremental learning (PBIL), which is a method that combines the mechanisms of a generational genetic algorithm with simple competitive learning. The result shows that its accuracies are particularly associated with the Homo species. This new perspective reveals a number of different possibilities for the purposes of performance improvements.

关键词： Population-based incremental learning Homo sapiens prediction of protein secondary structure

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不同氮肥处理对污染红壤中铜有效性的影响

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土壤学报 2009年第6期46卷 1033-1039页

作者：孙磊郝秀珍范晓晖仓龙周东美土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所) 南京210008 中国科学院研究生院北京100049

通过室内培养试验，发现不同氮肥处理对污染红壤中铜有效性有显著影响。在培养前期（0～15d），施用尿素显著降低了红壤水溶态铜和有效态铜含量，而施用硫酸铵和硝酸钙则显著提高了水溶态铜含量，且硝酸钙的作用显著大于硫酸铵，但这两... 详细信息

通过室内培养试验，发现不同氮肥处理对污染红壤中铜有效性有显著影响。在培养前期（0～15d），施用尿素显著降低了红壤水溶态铜和有效态铜含量，而施用硫酸铵和硝酸钙则显著提高了水溶态铜含量，且硝酸钙的作用显著大于硫酸铵，但这两种氮肥对红壤有效态铜含量影响较小；培养60d后，尿素对该红壤两种形态铜的抑制效应逐渐转为正效应，且硫酸铵的促进作用更为显著；硝酸钙对红壤两种形态铜的促进作用不如尿素。氮肥的施用量对两种形态铜也具有显著影响。同一施氮水平下，水溶态铜含量和有效态铜含量在不同氮肥处理问均达显著差异（硫酸铵〉尿素〉硝酸钙）。不同氮肥影响红壤铜有效性的主要机制是土壤pH的变化，红壤水溶态铜和有效态铜含量均与pH呈极显著负相关。

关键词：铜氮肥土壤水溶态铜有效态铜

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PH结构域且富含亮氨酸重复基序的丝/苏氨酸蛋白磷酸酶1对乳腺癌恶性细胞行为的影响及其机制

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中华实验外科杂志 2021年第5期38卷 835-838页

作者：罗执芬崔勇霞仓顺东庞晓辉寇振朱庆尧河南省人民医院肿瘤中心郑州450003

目的探讨PH结构域且富含亮氨酸重复基序的丝/苏氨酸蛋白磷酸酶1(PHLPP1)对乳腺癌恶性细胞行为的影响及其机制。方法采用蛋白质免疫印迹法(Western blot)检测河南省人民医院2017年6月到2019年6月手术切除的59对乳腺癌组织和配对癌旁组织... 详细信息

目的探讨PH结构域且富含亮氨酸重复基序的丝/苏氨酸蛋白磷酸酶1(PHLPP1)对乳腺癌恶性细胞行为的影响及其机制。方法采用蛋白质免疫印迹法(Western blot)检测河南省人民医院2017年6月到2019年6月手术切除的59对乳腺癌组织和配对癌旁组织的PHLPP1蛋白表达水平。采用慢病毒在MDA-MB-231乳腺癌细胞系构建对照和PHLPP1过表达稳定细胞系,分别命名为对照组和实验组。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)测定两组细胞增殖能力;采用凋亡试剂盒检测两组细胞凋亡水平;采用Transwell分析两组细胞侵袭能力;采用异体移植瘤实验分析细胞在体内生长和转移能力;采用Western blot分析两组基质金属蛋白酶3(MMP-3)和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(Caspase)-3蛋白表达水平。两组间比较行独立样本的t检验。结果癌旁组织中PHLPP1蛋白相对表达水平(1.54±0.23)明显高于乳腺癌组织 (0.74±0.15),差异有统计学意义(t=3.749,P<0.05)。对照组细胞吸光度(A)值(1.98±0.22)明显高于观察组细胞A值(1.06±0.16),差异有统计学意义(t=4.082,P<0.05)。对照组细胞体内生长30 d后肿瘤体积[(1 209.43±289.69) mm3]明显高于观察组细胞[(920.43±100.54) mm3],差异有统计学意义(t=6.943,P<0.05)。对照组细胞凋亡比例[(4.19±4.90)%]明显低于观察组细胞凋亡比例[(27.33±4.98)%],差异有统计学意义(t=3.431,P<0.05)。对照组细胞迁移数量[(91.49±7.23)个]明显高于观察组细胞迁移数量[(57.18±6.20)个],差异有统计学意义(t=5.298,P<0.05)。对照组细胞体内生长30 d后淋巴结转移数量[(19.48±3.99)个]明显高于观察组细胞[(7.19±1.54)个],差异有统计学意义(t=6.943,P<0.05)。对照组细胞Caspase-3蛋白相对表达水平(0.86±0.18)明显低于观察组细胞(1.59±0.25),差异有统计学意义(t=3.002,P<0.05)。对照组细胞MMP-3蛋白相对表达水平(1.32±0.20)明显高于观察组细胞(0.73±0.17),差异有统计学意义(t=3.691,P<0.05)。结论 PHLPP1在乳腺癌组织中呈低表达,上调PHLPP1表达水平促进细胞凋亡,抑制细胞生长、侵袭和转移。

关键词：乳腺癌增殖侵袭凋亡

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基于阿克曼理论的四轮转向汽车转向梯形优化设计

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北京汽车 2021年第3期 16-20页

作者：李萍杨晓辉房启飞陈仓李兵王阳阳上海汽车集团股份有限公司商用车技术中心上海200438 联创汽车电子有限公司上海200120 同济大学汽车学院上海200092

以汽车转向系统中的阿克曼理论作为研究出发点,研究四轮转向汽车中满足阿克曼理论的转向梯形设计。提出一种基于MATLAB计算的设计观点和设计方法。在确定四轮转向汽车前后轮转向策略的基础上,根据四轮转向车辆的理想阿克曼转角关系,求... 详细信息

以汽车转向系统中的阿克曼理论作为研究出发点,研究四轮转向汽车中满足阿克曼理论的转向梯形设计。提出一种基于MATLAB计算的设计观点和设计方法。在确定四轮转向汽车前后轮转向策略的基础上,根据四轮转向车辆的理想阿克曼转角关系,求得在不同车速和不同内轮转角下对应的理想前后外轮转角,并将实际外轮转角与理想外轮转角的差值作为函数优化目标,最终在几何结构允许的范围内实现四轮转向的阿克曼最优。

关键词：四轮转向阿克曼理论转向梯形寻优算法

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