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SARS-CoV-2 ORF10 hijacking ubiquitination machinery reveals potential unique drug targeting sites

Acta Pharmaceutica Sinica B 2024年第9期14卷 4164-4173页

作者： Kaixiang Zhu Lili Song Linyue Wang Lei Hua Ziyu Luo Tongyun Wang Bo Qin Shuofeng Yuan Xiaopan Gao wenyi mi Sheng Cui NHC Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens National Institute of Pathogen BiologyChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijing 100730China Key Laboratory of Pathogen Infection Prevention and Control(Peking Union Medical College) Ministry of EducationBeijing 100730China The Province and ministry Co-Sponsored Collaborative Innovation Center for Medical Epigenetics Key Laboratory of Immune Microenvironment and Disease(Ministry of Education)Tianjin Medical University General HospitalDepartment of ImmunologyTianjin Medical UniversityTianjin 300070China Medical School Yan’an UniversityShaanxi ProvinceYan’an 716000China State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases Li Ka Shing Faculty of Medicinethe University of Hong KongPokfulamHong Kong SARChina Department of microbiology Li Ka ShingFaculty of Medicinethe University of Hong KongPokfulamHong Kong SARChina

Viruses often manipulate ubiquitination pathways to facilitate their replication and ***2ZYG11B known as the substrate receptor of cullin-2 RING E3 ligase,is bound by SARS-CoV-2 ORF10 to increase its E3 ligase activity,leading to degradation of IFT46,a protein component of the intraflagellar transport(IFT)complex *** results in dysfunctional cilia,which explains certain symptoms that are specific to ***,the precise molecular mechanism of how ORF10 recognizes CUL2ZYG11B remains ***,we determined the crystal structure of CUL2ZYG11B complexed with the N-terminal extension(NTE)of SARS-CoV-2 ORF10(2.9 A°).The structure reveals that the ORF10 N-terminal heptapeptide(NTH)mimics the Gly/N-degron to bind *** studies identified key residues within ORF10 that are key players in its interaction with CUL2ZYG11B both in ITC assay and in vivo *** addition,we prove that enhancement of CUL2ZYG11B activity for IFT46 degradation by which ORF10-mediated correlates with the binding affinity between ORF10 and ***,we used a Global Protein Stability system to show that the NTH of ORF10 mimics the Gly/N-degron motif,thereby binding competitively to CUL2ZYG11B and inhibiting the degradation of target substrates bearing the Gly/N-degron ***,this study sheds light on how SARS-CoV-2 ORF10 exploits the ubiquitination machinery for proteasomal degradation,and offers valuable insights for optimizing PROTAC-based drug design based on NTH CUL2ZYG11B interaction,while pinpointing a promising target for the development of treatments for COVID-19.

关键词： SARS-CoV-2 ORF10 Crystal structure cullin-2 RING E3 ligase Drug design

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大学生旅游定制化平台优势与策略分析

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科技创业月刊 2019年第5期32卷 54-56页

作者：李国英李晨希米文艺西安石油大学经济管理学院

大学生是旅游业最具发展潜力的群体,传统旅游业已然满足不了大学生的个性化需求,随之出现的定制化旅游不仅可以更完美地体验旅游带来的乐趣,也可以提高大学生精神文明素养。因此,根据大学生定制化旅游的优势对其进行对策分析。

关键词：大学生定制化旅游消费潜力

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岩溶山区耕地非粮化空间格局演变及其影响因素分析——以威宁彝族回族苗族自治县为例

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云南师范大学学报（自然科学版） 2024年第4期44卷 64-70页

作者：耿秘刘艳吴冉覃文艺郑朋飞贵州师范大学地理与环境科学学院贵州贵阳550025

研究选取岩溶山区威宁彝族回族苗族自治县作为研究区,分析其2017年、2019年和2021年三个时间段的耕地非粮化情况.通过全局莫兰指数和冷热点分析,揭示了耕地非粮化空间格局的演化,并利用地理加权回归模型研究了影响因素.结果显示,1)威宁... 详细信息

研究选取岩溶山区威宁彝族回族苗族自治县作为研究区,分析其2017年、2019年和2021年三个时间段的耕地非粮化情况.通过全局莫兰指数和冷热点分析,揭示了耕地非粮化空间格局的演化,并利用地理加权回归模型研究了影响因素.结果显示,1)威宁彝族回族苗族自治县耕地非粮化整体呈增强趋势,但最大非粮化率下降了4.71%,空间上表现为西北—中部—西南的聚集特征;2)威宁彝族回族苗族自治县耕地非粮化空间格局的局部聚集差异明显.研究期间全局变化稳定,局部变化显著,热点逐年减少,冷点先减后增;3)地理加权回归模型分析表明,经济作物种植面积与非粮化正相关,而人口密度、肉类总产量、人均粮食产量与非粮化率负相关.

关键词：岩溶山区耕地非粮化影响因素乡村振兴

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The role of ubiquitination in tumorigenesis and targeted drug discovery

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2020年第1期5卷 2294-2321页

作者： Lu Deng Tong Meng Lei Chen wenyi Wei Ping Wang College of Animal Science and Technology Northwest A&F UniversityYangling Shaanxi 712100China Division of Spine Department of OrthopedicsTongji Hospital Affiliated to Tongji University School of Medicine389 Xincun RoadShanghaiChina Division of Laboratory Safety and Services Northwest A&F UniversityYangling Shaanxi 712100China Department of Pathology Beth Israel Deaconess Medical CenterHarvard Medical SchoolBostonMA 02215USA Tongji University Cancer Center Shanghai Tenth People’s Hospital of Tongji UniversitySchool of MedicineTongji UniversityShanghai 200092China

Ubiquitination,an important type of protein posttranslational modification(PTM),plays a crucial role in controlling substrate degradation and subsequently mediates the“quantity”and“quality”of various proteins,serving to ensure cell homeostasis and guarantee life *** regulation of ubiquitination is multifaceted and works not only at the transcriptional and posttranslational levels(phosphorylation,acetylation,methylation,etc.)but also at the protein level(activators or repressors).When regulatory mechanisms are aberrant,the altered biological processes may subsequently induce serious human diseases,especially various types of *** tumorigenesis,the altered biological processes involve tumor metabolism,the immunological tumor microenvironment(TME),cancer stem cell(CSC)stemness and so *** regard to tumor metabolism,the ubiquitination of some key proteins such as RagA,mTOR,PTEN,AKT,c-Myc and P53 significantly regulates the activity of the mTORC1,AMPK and PTEN-AKT signaling *** addition,ubiquitination in the TLR,RLR and STING-dependent signaling pathways also modulates the ***,the ubiquitination of core stem cell regulator triplets(Nanog,Oct4 and Sox2)and members of the Wnt and Hippo-YAP signaling pathways participates in the maintenance of CSC *** on the altered components,including the proteasome,E3 ligases,E1,E2 and deubiquitinases(DUBs),many molecular targeted drugs have been developed to combat *** them,small molecule inhibitors targeting the proteasome,such as bortezomib,carfilzomib,oprozomib and ixazomib,have achieved tangible *** addition,MLN7243 and MLN4924(targeting the E1 enzyme),Leucettamol A and CC0651(targeting the E2 enzyme),nutlin and mi‐219(targeting the E3 enzyme),and compounds G5 and F6(targeting DUB activity)have also shown potential in preclinical cancer *** this review,we summarize the latest progress in understanding the substrates for ubiquitination and their special functions

关键词： metabolism ubiquitin targeted

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叶面真菌群落对白粉病发病的分子生态响应机制

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激光生物学报 2024年第1期33卷 73-79页

作者：黄海涛刘文仪杨文武张建铎米其利李菁菁陈义强李浩斌尹华群高茜云南中烟工业有限责任公司技术中心云南省烟草化学重点实验室昆明650231 湖南农业大学环境与生态学院长沙410128 福建中烟技术中心厦门361022 红塔集团玉溪卷烟厂玉溪653100 中南大学资源加工与生物工程学院长沙410083

叶面微生物群落组成与植物叶部病害发生密切相关,但植物真菌性叶部病害的发病程度与叶面真菌群落组成及多样性的关联机制仍然未知。本研究利用真核生物内源转录间隔区(ITS)扩增子高通量测序技术,在茄科作物白粉病不同发病程度下,研究了... 详细信息

叶面微生物群落组成与植物叶部病害发生密切相关,但植物真菌性叶部病害的发病程度与叶面真菌群落组成及多样性的关联机制仍然未知。本研究利用真核生物内源转录间隔区(ITS)扩增子高通量测序技术,在茄科作物白粉病不同发病程度下,研究了叶面真菌群落的组成和多样性差异,解析了叶面真菌分子生态网络拓扑性质的变化规律,并探明了叶面真菌群落系统发育装配的生态过程。多样性分析表明,随着白粉病病情程度加重,叶面真菌群落丰富度及多样性逐渐下降;网络分析表明,相较于中度和重度感病植株,轻微发病植株叶面真菌网络的节点和连接数更多,网络密度、聚集系数和平均连通度更高。在不同发病程度的植株中,叶面真菌群落的系统发育装配的生态过程均由随机性主导,但随着发病程度加重,叶面真菌群落趋向于系统发育扩散。综上所述,病原菌入侵改变了叶面真菌群落结构,扰动了真菌群落之间的相互作用和群落系统发育的生态装配过程,这些结果为深入认识白粉病病害与叶面真菌群落关联机制和生产上防控该病具有重要意义。

关键词：白粉病叶面微生物真菌群落生态网络群落装配

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Signaling pathways in the regulation of cytokine release syndrome in human diseases and intervention therapy

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2021年第11期6卷 3230-3245页

作者： Xia Li mi Shao Xiangjun Zeng Pengxu Qian He Huang Bone Marrow Transplantation Center The First Affiliated HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhouPeople’s Republic of China Liangzhu Laboratory Zhejiang University Medical Center1369 West Wenyi RoadHangzhou311121People’s Republic of China Institute of Hematology Zhejiang UniversityHangzhouZhejiangPeople’s Republic of China Zhejiang Province Engineering Laboratory for Stem Cell and Immunity Therapy HangzhouZhejiangPeople’s Republic of China Center of Stem Cell and Regenerative Medicine Zhejiang University School of MedicineHangzhouPeople’s Republic of China

Cytokine release syndrome(CRS)embodies a mixture of clinical manifestations,including elevated circulating cytokine levels,acute systemic inflammatory symptoms and secondary organ dysfunction,which was first described in the context of acute graft-versus-host disease after allogeneic hematopoietic stem-cell transplantation and was later observed in pandemics of influenza,SARS-CoV and COVID-19,immunotherapy of tumor,after chimeric antigen receptor T(CAR-T)therapy,and in monogenic disorders and autoimmune ***,severe CRS is a very significant and life-threatening complication,which is clinically characterized by persistent high fever,hyperinflammation,and severe organ ***,CRS is a double-edged sword,which may be both helpful in controlling tumors/viruses/infections and harmful to the *** a high incidence and high levels of cytokines are features of CRS,the detailed kinetics and specific mechanisms of CRS in human diseases and intervention therapy remain *** the present review,we have summarized the most recent advances related to the clinical features and management of CRS as well as cutting-edge technologies to elucidate the mechanisms of *** that CRS is the major adverse event in human diseases and intervention therapy,our review delineates the characteristics,kinetics,signaling pathways,and potential mechanisms of CRS,which shows its clinical relevance for achieving both favorable efficacy and low toxicity.

关键词： cytokine release kinetics

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面向视觉数据处理与分析的解耦表示学习综述

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中国图象图形学报 2023年第4期28卷 903-934页

作者：李雅婷肖晶廖良王正陈文益王密武汉大学计算机学院国家多媒体软件工程技术研究中心武汉430072 日本国立信息学研究所数字内容和媒体科学研究部东京101-8430日本武汉大学测绘遥感信息工程国家重点实验室武汉430079

表示学习是机器学习研究的核心问题之一。机器学习算法的输入表征从过去主流的手工特征过渡到现在面向多媒体数据的潜在表示,使算法性能获得了巨大提升。然而,视觉数据的表示通常是高度耦合的,即输入数据的所有信息成分被编码进同一个... 详细信息

表示学习是机器学习研究的核心问题之一。机器学习算法的输入表征从过去主流的手工特征过渡到现在面向多媒体数据的潜在表示,使算法性能获得了巨大提升。然而,视觉数据的表示通常是高度耦合的,即输入数据的所有信息成分被编码进同一个特征空间,从而互相影响且难以区分,使得表示的可解释性不高。解耦表示学习旨在学习一种低维的可解释性抽象表示,可以识别并分离出隐藏在高维观测数据中的不同潜在变化因素。通过解耦表示学习,可以捕获到单个变化因素信息并通过相对应的潜在子空间进行控制,因此解耦表示更具有可解释性。解耦表征可用于提高样本效率和对无关干扰因素的容忍度,为数据中的复杂变化提供一种鲁棒性表示,提取的语义信息对识别分类、域适应等人工智能下游任务具有重要意义。本文首先介绍并分析解耦表示的研究现状及其因果机制,总结解耦表示的3个重要性质。然后,将解耦表示学习算法分为4类,并从数学描述、类型特点及适用范围3个方面进行归纳及对比。随后,分类总结了现有解耦表示工作中常用的损失函数、数据集及客观评估指标。最后,总结了解耦表示学习在实际问题中的各类应用,并对其未来发展进行了探讨。

关键词：解耦表示学习视觉数据潜在表征变化因素潜空间

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中职教师在职攻读硕士学位招生制度研究

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职业技术教育 2006年第28期27卷 25-27页

作者：米运卿闫文艺西安交通大学职业技术教育学院陕西西安710048

对区域中职教师攻读硕士学位有关环节的调查显示,有关报名条件、考试科目、录取标准等内容需要进一步改进。建议:建立独立的培养体系与招生制度,放宽报考条件、改革考试内容,利用推荐、保送、择优降分、本科应届毕业生保送不直读、同等... 详细信息

对区域中职教师攻读硕士学位有关环节的调查显示,有关报名条件、考试科目、录取标准等内容需要进一步改进。建议:建立独立的培养体系与招生制度,放宽报考条件、改革考试内容,利用推荐、保送、择优降分、本科应届毕业生保送不直读、同等学力申请等形式,多渠道选拔优秀人才,弥补现行招生制度的不足。同时国家应建立"中职硕士"奖学金,并在考试时间、专业设置等方面考虑中职学校教师的现实需求。

关键词：中职教师中职硕士招生制度

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网络时代农业技术类期刊的办刊思路

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中国科技期刊研究 2010年第5期21卷 696-698页

作者：翁维义赵进春胡成志郝红梅米文广中国果树编辑部

我国农业技术类网络版期刊的读者主要集中在农业教学、科研人员中,而印刷版期刊的读者主要集中在基层农业技术推广人员和农民中。为实现印刷版和网络版期刊双赢,农业技术类期刊应坚持贴近生产实际的办刊宗旨;注重论文信息的创新性;增强... 详细信息

我国农业技术类网络版期刊的读者主要集中在农业教学、科研人员中,而印刷版期刊的读者主要集中在基层农业技术推广人员和农民中。为实现印刷版和网络版期刊双赢,农业技术类期刊应坚持贴近生产实际的办刊宗旨;注重论文信息的创新性;增强可读性;加强广告经营工作;保持印刷版期刊价格的相对稳定。

关键词：农业技术类期刊印刷版期刊网络版期刊

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超导磁梯度张量探头结构优化方法研究

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低温与超导 2023年第10期51卷 13-18页

作者：张樱子秦肖雅王晨刘改改米旺刘文怡中北大学省部共建动态测试技术国家重点实验室太原030051 北京美尔斯通科技有限公司北京100080

针对传统超导磁梯度张量探头中多个磁梯度计间的噪声互扰会降低系统灵敏度的问题,本文提出了一种基于二维傅里叶变换的磁梯度张量探头结构优化方法。通过二维傅里叶变换及逆变换将磁场矢量Z分量沿着Z轴方向的二阶空间导数Bzzz转换为磁... 详细信息

针对传统超导磁梯度张量探头中多个磁梯度计间的噪声互扰会降低系统灵敏度的问题,本文提出了一种基于二维傅里叶变换的磁梯度张量探头结构优化方法。通过二维傅里叶变换及逆变换将磁场矢量Z分量沿着Z轴方向的二阶空间导数Bzzz转换为磁场矢量的3个分量以及一阶磁梯度张量的5个独立元素,把通常至少需要6个SQUID一阶平面磁梯度计的探头结构简化为只需要1个二阶SQUID磁梯度计的探头结构,消除了磁梯度计之间的噪声干扰,系统灵敏度提高了1个数量级。实验结果表明该探头具有良好的探测能力,证明了这种优化方法的可行性。

关键词：磁梯度张量超导量子干涉器二维傅里叶变换二阶磁梯度计

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