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Identification of Key Genes for the Ultrahigh Yield of Rice Using Dynamic Cross-tissue Network Analysis

Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2020年第3期18卷 256-270页

作者： Jihong Hu Tao Zeng Qiongmei Xia Liyu Huang Yesheng Zhang Chuanchao Zhang Yan Zeng Hui Liu Shilai Zhang Guangfu Huang wenting wan Yi Ding Fengyi Hu Congdang Yang Luonan Chen Wen wang State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution Kunming Institute of ZoologyChinese Academy of SciencesKunming 650223China State Key Laboratory of Hybrid Rice College of Life SciencesWuhan UniversityWuhan 430072China CAS Key Laboratory of Systems Biology Center for Excellence in Molecular Cell ScienceInstitute of Biochemistry and Cell BiologyShanghai Institutes for Biological SciencesChinese Academy of SciencesShanghai 200031China Institute of Brain-Intelligence Technology Zhangjiang LaboratoryShanghai 201210China Institute of Food Crop of Yunnan Academy of Agricultural Sciences Kunming 650205China School of Agriculture Yunnan UniversityKunming 650500China BGI-Baoshan Baoshan 678004China Center for Ecological and Environmental Sciences Northwestern Polytechnical UniversityXi’an 710072China School of Life Science and Technology ShanghaiTech UniversityShanghai 201210China

Significantly increasing crop yield is a major and worldwide challenge for food supply and *** is well-known that rice cultivated at Taoyuan in Yunnan of China can produce the highest yield ***,the gene regulatory mechanism underpinning this ultrahigh yield has been a ***,we systematically collected the transcriptome data for seven key tissues at different developmental stages using rice cultivated both at Taoyuan as the case group and at another regular rice planting place Jinghong as the control *** identified the top 24 candidate high-yield genes with their network modules from these well-designed datasets by developing a novel computational systems biology method,i.e.,dynamic cross-tissue(DCT)network *** used one of the candidate genes,Os SPL4,whose function was previously unknown,for gene editing experimental validation of the high yield,and confirmed that Os SPL4 significantly affects panicle branching and increases the rice *** study,which included extensive field phenotyping,cross-tissue systems biology analyses,and functional validation,uncovered the key genes and gene regulatory networks underpinning the ultrahigh yield of *** DCT method could be applied to other plant or animal systems if different phenotypes under various environments with the common genome sequences of the examined *** can be downloaded from https://***/ztpub/DCT.

关键词： Dynamic cross-tissue(DCT) Systems biology RNA-seq Ultrahigh yield Rice

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Marein Modulates the Methylglyoxal-induced Oxidative Stress Response Via the AMPK/GLUT4 Signaling Pathway in PC12 Cells

Marein Modulates the Methylglyoxal-induced Oxidative Stress ...

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第十四届全国中药和天然药物学术研讨会

作者： Baoping Jiang Lijia Xu Liang Le wenting wan Keping Hu Peigen Xiao Chinese Academy of Medical Science and Peking Union Medical College

＜正＞Diabetic encephalopathy is an emerging diabetic complication,and diabetes-associated cognitive decline is the core component of this *** studies have suggested that methylglyoxal（MG）,a highly reactive metabolite in hyperglycemia,plays an important role in diabetic *** is a chalcone compound from Coreopsis tinctoria,but little

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一类复矩阵线性组合的幂等性

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科技通报 2014年第11期30卷 1-4,8页

作者：万文婷荆楚理工学院数理学院湖北荆门448000

讨论了关于复矩阵的一类特殊线性组合的幂等性问题。当组合系数为复数时,给出了矩阵线性组合是幂等的两个充要条件。并在所得结论的基础上,考虑组合系数为实数,研究了矩阵线性组合是幂等阵时,复矩阵及其特征值所具备的特性。

关键词：幂等矩阵特征值 Hermite矩阵正规矩阵

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弹簧质点系统的一类振动反问题

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贵州大学学报（自然科学版） 2016年第3期33卷 4-7页

作者：万文婷荆楚理工学院数理学院湖北荆门448000

本文讨论了系统惯性能量约束下的接地弹簧质点系统的构造问题。通过求解一类广义逆特征值问题,得到问题有解的一个充分必要条件,并给出解的计算表达式、数值算法及算例。

关键词：接地弹簧质点系统广义逆特征值问题 Jacobi矩阵特征对

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知识生产转型视域下应用型大学的产教融合:理路与走向

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现代教育科学 2024年第1期 106-113,135页

作者：刘欣万文婷广州应用科技学院广东广州511370 荆楚理工学院湖北荆门448000

产教融合是应用型大学深度转型的制度性命题。基于知识生产制度演变与模式转型的双重逻辑,观照应用型大学产教融合的生成理路,可引申出两个关键问题:一是如何适应知识社会转型的外部环境,实现产教融合制度的外融合;二是如何适应知识生... 详细信息

产教融合是应用型大学深度转型的制度性命题。基于知识生产制度演变与模式转型的双重逻辑,观照应用型大学产教融合的生成理路,可引申出两个关键问题:一是如何适应知识社会转型的外部环境,实现产教融合制度的外融合;二是如何适应知识生产转型的内在逻辑,实现产教融合模式的内融合。为此,应聚焦产教“内外融合”的关键要素,形成制度与模式双向协同分析框架,进而审视产教融合的实践路向:应用型大学的产教融合应聚焦制度情境和模式内涵的系统性重构,逐步实现多主体、多平台、多文化、多功能、多路径等“多重融合”的范式变革,最终形塑产教系统性变革的新型大学。

关键词：应用型大学知识生产模式产教融合模式转型制度建设

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Genome and Comparative Transcriptomics of African Wild Rice Oryza Iongistaminata Provide Insights into Molecular Mechanism of Rhizomatousness and Self-Incompatibility

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Molecular Plant 2015年第11期8卷 1683-1686页

作者： Yesheng Zhang Shilai Zhang Hui Liu Binying Fu Lijuan Li Min Xie Yue Song Xin Li Jing Cai wenting wan Ling Kui Hui Huang Jun Lyu Yang Dong Wensheng wang Liyu Fluang Jing Zhang Qinzhong Yang Qinfi Shan Qiong Li wangqi Huang Dayun Tao Muhua wang Mingsheng Chen Yeisoo Yu Rod A. Wing Wen wang Fengyi Hu State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution Kunming Institute of Zoology Chinese Academy of Sciences Kunming 650223 China Food Crops Research Institute Yunnan Academy of Agricultural Sciences Kunming 650205 China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100039 China Institute of Crop Sciences/National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement Chinese Academy of Agricultural Sciences Beijing 100081 China BGI-Shenzhen Shenzhen 518083 China Laboratory of Applied Genomics and Synthetic Biology College of LifeScience Kunming University of Science and Technology Kunming 650093 P. R. China Plant Germplasm and Genomics Center Germplasm Bank of Wild Species inSouthwest China Kunming Institute of Botany Chinese Academy of Sciences Kunming 650201 China Arizona Genomics of Institute School of Plant Sciences University of Arizona Tucson AZ 85721 USA State Key Laboratory of Plant Genomics Institute of Genetics and Developmental Biology Chinese Academy of Sciences Beijing 100101 China

Dear Editor, Oryza Iongistaminata is an African wild rice species with AA genome type possessing special traits that are highly valued for improving cultivated rice, such as strong resistance to biotic and abiotic stresses （Song et al., 1995） for improving resistance of cultivars, rhizomatousness for perennial breeding （Glover et al., 2010）, and self-incompatibility （SI） for new ways to produce hybrid seeds （Ghesquiere, 1986）. Deciphering the genome of O. Iongistaminata will be the key to uncovering the mechanism of these hallmark traits and improving cultivated rice.

关键词：繁殖基因组内皮缩血管肽类稻属血气分析胰岛素种子铍

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治疗II型糖尿病的传统药物发明专利专题分析

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世界科学技术-中医药现代化 2014年第6期16卷 1240-1245页

作者：万文婷马运运许利嘉孙志一刘海波中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 北京东方灵盾科技有限公司北京100080 国家中医药管理局传统药物专利信息资源重点研究室北京100080

本文检索2014年之前治疗II型糖尿病的传统药物发明专利,得到共1 229件专利族信息。从专利的授权情况、发展趋势、地域分布、竞争国家、竞争机构、技术重点、药材偏好等方面对其进行了整体层面的统计和分析,结果显示,中国在专利申请数量... 详细信息

本文检索2014年之前治疗II型糖尿病的传统药物发明专利,得到共1 229件专利族信息。从专利的授权情况、发展趋势、地域分布、竞争国家、竞争机构、技术重点、药材偏好等方面对其进行了整体层面的统计和分析,结果显示,中国在专利申请数量上处于领先地位,高等院校、科研院所和药企是申请主体。虽然治疗糖尿病的学说和流派众多,在申请专利保护的中药复方上,多以益气养阴清热为主,使用频次前20位的药物多为补虚药和清热药。本研究展现了传统药物治疗糖尿病的发展历史和临床使用的整体思路,由此分析治疗糖尿病传统药物的研究、开发、应用导向,可帮助研究者了解治疗糖尿病中药的研发成果和专利格局,指导未来研究方向。

关键词：非胰岛素依赖型糖尿病传统药物专利文献数据库

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2016—2020年温州市学生餐微生物污染状况监测分析

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中国食品卫生杂志 2023年第2期35卷 212-217页

作者：万文婷蔡圆圆高四海洪程基王黎荔李毅林丹单毓娟温州医科大学公共卫生与管理学院浙江温州325035 温州市疾病预防控制中心浙江温州325000 浙江安防职业技术学院应急技术学院浙江温州325016

目的了解近5年温州市幼儿园及中小学食堂自制的学生餐微生物污染状况,为进一步保障学生餐安全提供依据。方法对2016—2020年温州市各县(市、区)采集的学生餐样品中的卫生指标菌(菌落总数及大肠埃希菌)和常见食源性致病菌(金黄色葡萄球... 详细信息

目的了解近5年温州市幼儿园及中小学食堂自制的学生餐微生物污染状况,为进一步保障学生餐安全提供依据。方法对2016—2020年温州市各县(市、区)采集的学生餐样品中的卫生指标菌(菌落总数及大肠埃希菌)和常见食源性致病菌(金黄色葡萄球菌、蜡样芽孢杆菌、沙门菌、单核细胞增生李斯特菌)进行检测,并用SPSS 18.0对测定结果进行统计学分析。结果2016年学生餐微生物污染状况较为严重,样品不合格率达23.58%,此后4年学生餐样品不合格率依次为6.27%、6.80%、9.06%、3.82%,5年来温州市学生餐样品不合格率总体呈逐年下降趋势(χ2=60.852,P0.05)。在调整了监测学校类型、采样季度和监测地点等影响因素后,相对于2016年,2017—2020年学生餐微生物污染均显著降低(P<0.01)。结论2016年温州市幼儿园及中小学学生餐微生物污染状况最为严重,此后4年学生餐卫生状况有所改善,但仍存在不同程度的微生物污染。相关监管部门应根据监测结果进一步加强食品监管力度,防止学校食源性疾病的发生。

关键词：学生餐食品微生物食品污染卫生指示菌食源性致病菌

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喷施1-甲基环丙烯对水培油菜品质和生理变化的影响

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食品科技 2023年第9期48卷 30-37页

作者：张鹏李明阳万文婷吴迪薛友林贾晓昱李江阔天津市农业科学院农产品保鲜与加工技术研究所天津300384 国家农产品保鲜工程技术研究中心(天津) 农业农村部农产品贮藏保鲜重点实验室天津市农产品采后生理与贮藏保鲜重点实验室天津300384 沈阳农业大学食品学院辽宁沈阳110866 辽宁大学轻型产业学院辽宁沈阳110036 浙江大学农业与生物技术学院浙江杭州310058 浙江大学中原研究院河南郑州450000

为研究喷施1-甲基环丙烯(1-Methylcyclopropene,1-MCP)处理对物流运输后水培油菜货架品质和生理变化的影响,对物流运输后水培油菜常温货架和冷藏5 d后常温货架期的感官指标、营养指标、生理指标、衰老指标进行测定。设置喷施4μL/L 1-MC... 详细信息

为研究喷施1-甲基环丙烯(1-Methylcyclopropene,1-MCP)处理对物流运输后水培油菜货架品质和生理变化的影响,对物流运输后水培油菜常温货架和冷藏5 d后常温货架期的感官指标、营养指标、生理指标、衰老指标进行测定。设置喷施4μL/L 1-MCP为1-MCP处理组,喷施蒸馏水为CK组。对于常温货架期贮藏方式,相较于CK组,1-MCP处理水培油菜后,其失重率降低、色差更小,同时延缓了维生素C、还原糖、可溶性蛋白含量以及色素(叶绿素a、叶绿素b和类胡萝卜素)含量的下降,降低呼吸速率和乙烯生成速率,延缓相对电导率、丙二醛的上升。而对于冷藏5 d后常温货架贮藏方式,1-MCP处理后除了对失重率及呼吸速率无明显影响外,其他指标的变化趋势与常温货架贮藏组相同。另外通过对比2种不同贮藏方式发现,在贮藏后期冷藏处理与常温货架相比除了丙二醛含量更高外,其余指标的含量都更低。同时,对比2种贮藏环境下1-MCP处理组发现,冷藏后维生素C、还原糖、可溶性蛋白含量、呼吸强度以及乙烯生成速率更低,失重率更高。综上所述,1-MCP可以延缓黄化及软化,维持各营养物质含量,同时还能抑制呼吸强度,减少乙烯释放量,并有效抑制相对电导率和丙二醛的升高,延长货架期。

关键词： 1-甲基环丙烯水培油菜货架品质生理变化

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实时三维超声心动图检测左室质量指数评价主动脉瓣置换术后左心室重构的改善情况

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实用医学杂志 2019年第13期35卷 2161-2165页

作者：童仙君曹慧熊文峰程遵华金露万文婷孙辉上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院超声科上海200437 上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院心内科上海200437 同济大学医学院附属第十人民医院心血管内科上海200072

目的探索实时三维超声心动图(RT-3DE)计算左室质量指数(LVMI)评估主动脉瓣置换(AVR)前后主动脉瓣病变患者左室重构(LVH)的改善情况。方法选择行AVR 的主动脉瓣疾病患者并定义为病例组(n=68),其中主动脉瓣狭窄(AS)33例,主动脉瓣关闭不全(... 详细信息

目的探索实时三维超声心动图(RT-3DE)计算左室质量指数(LVMI)评估主动脉瓣置换(AVR)前后主动脉瓣病变患者左室重构(LVH)的改善情况。方法选择行AVR 的主动脉瓣疾病患者并定义为病例组(n=68),其中主动脉瓣狭窄(AS)33例,主动脉瓣关闭不全(AI)35例。同期选择健康体检人群作为对照组(n=70)。分别于AVR 前,治疗后1 周、1 个月和6 个月进行超声心动图检查并计算2D-LVMI 和3D-LVMI。所有检查均由2 名超声医师采用单盲独立测量。采用重复测量方差分析比较AS和AI患者2D-LVMI和3D-LVMI的变化差异。采用Bland-Altman 分析和组内相关系数(ICC)对2D-LVMI和3D-LVMI进行重复性检验。结果AS与AI患者的3D-LVMI和2D-LVMI在整个AVR治疗周期中均呈下降趋势,在不同时间段的变化差异有统计学意义(P<0.001)。组间比较发现,AS患者2D-LVMI大于3D-LVMI,差异有统计学意义(P=0.043)。AI与AS患者在AVR术后1周时3D-LVMI低于2D-LVMI,差异有统计学意义(P<0.05)。3D-LVMI在观察者之间ICC结果为0.966;2D-LVMI的ICC结果为0.757,低于3D-LVMI的一致性。结论RT-3DE能够通过LVMI精确评估主动脉瓣病变患者AVR前后LVH的改善情况。

关键词：实时三维超声心动图主动脉瓣置换左室质量指数左室重构

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