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Genome-wide association with transcriptomics reveals a shade-tolerance gene network in soybean

The Crop Journal 2024年第1期12卷 232-243页

作者： Yanzhu Su Xiaoshuai Hao weiying zeng Zhenguang Lai Yongpeng Pan Can Wang Pengfei Guo Zhipeng Zhang Jianbo He Guangnan Xing Wubin Wang Jiaoping Zhang Zudong Sun Junyi Gai Soybean Research Institute/MARA National Center for Soybean Improvement MARA Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Soybean/State Key Laboratory for Crop Genetics and Germplasm Enhancement/State Innovation Platform for Integrated Production and Education in Soybean Bio-breeding/Jiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop Production Nanjing Agricultural UniversityNanjing 210095JiangsuChina Guangxi Academy of Agricultural Sciences Nanning 530007GuangxiChina

Shade tolerance is essential for soybeans in inter/relay cropping systems.A genome-wide association study(GWAS)integrated with transcriptome sequencing was performed to identify genes and construct a genetic network governing the trait in a set of recombinant inbred lines derived from two soybean parents with contrasting shade *** improved GWAS procedure,restricted two-stage multi-locus genome-wide association study based on gene/allele sequence markers(GASM-RTM-GWAS),identified 140 genes and their alleles associated with shade-tolerance index(STI),146 with relative pith cell length(RCL),and nine with *** of these genes by biological categories allowed the construction of a protein–protein interaction network by 187 genes,of which half were differentially expressed under shading and non-shading conditions as well as at different growth *** the identified genes,three ones jointly identified for both traits by both GWAS and transcriptome and two genes with maximum links were chosen as beginners for entrance into the ***,both STI and RCL gene systems worked for shade-tolerance with genes interacted each other,this confirmed that shadetolerance is regulated by more than single group of interacted genes,involving multiple biological functions as a gene network.

关键词： Soybean(Glycine max(L.)Merr.) Shade-tolerance Restricted two-stage multi-locus genomewide association study based on gene/allele sequence markers(GASM-RTM-GWAS) Shade-tolerance index(STI) Relative cell length(RCL) Transcriptome

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荫蔽对大豆叶片角度及光合特性的影响

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四川农业大学学报 2024年第4期42卷 744-751页

作者：谢雨霏曾维英雷怡吴哲孙祖东杨峰四川农业大学农学院/作物带状复合种植工程技术研究中心成都611130 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所南宁530007

【目的】叶片角度直接影响光能的利用,探究荫蔽对大豆叶片角度和光合特性的影响,为揭示荫蔽下叶片如何提高光截获能力、光合效率提供理论支撑。【方法】以耐荫性南夏豆25(ND25)和不耐荫性自贡冬豆(GD)这2个大豆品种为研究对象,设置正常... 详细信息

【目的】叶片角度直接影响光能的利用,探究荫蔽对大豆叶片角度和光合特性的影响,为揭示荫蔽下叶片如何提高光截获能力、光合效率提供理论支撑。【方法】以耐荫性南夏豆25(ND25)和不耐荫性自贡冬豆(GD)这2个大豆品种为研究对象,设置正常光[600μmol/(m^(2)·s),CK]处理和弱光[300μmol/(m^(2)·s),L] 2个处理,探究植株形态、叶倾角动态变化、叶枕结构以及光合荧光特征等对荫蔽的响应。【结果】与CK相比,L处理下ND25和GD的株高、叶柄长显著增加,日平均叶倾角分别降低337.26%和478.83%。ND25在CK处理与L处理下叶倾角极差分别为49.46°和56.96°;GD分别为33.16°和73.37°。耐荫性ND25在L处理下皮层占叶枕比例和屈肌细胞层数与CK相比分别增加1.12%和15.38%,不耐荫性GD不具有该显著性变化。与CK相比,L处理下ND25和GD的蒸腾速率、叶绿素a含量、叶绿素b含量增加,净光合速率、胞间CO_(2)浓度降低,类胡萝卜素含量分别增加481.25%和降低58.97%。L处理下ND25和GD的光化学猝灭系数与CK相比降低,最大光化学量子产量增加。ND25的PSⅡ有效光化学量子产量、非光化学猝灭系数降低,而GD增加。【结论】荫蔽环境下,大豆叶倾角变化范围增大,日平均叶倾角降低。耐荫性大豆皮层占叶枕比例及屈肌细胞层数的增加有利于叶枕调控叶片角度与入射光趋于垂直以增加光能截获。

关键词：荫蔽大豆叶片角度光合特性叶枕

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大黄芒硝外敷联合温针灸对腹腔镜阑尾切除术后康复的影响

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药品评价 2024年第1期21卷 108-111页

作者：刘攀秦忠萍吴少林曾为英郭晚元宜春职业技术学院江西宜春336000 宜春浙赣友好医院江西宜春336000

目的探讨大黄芒硝外敷联合温针灸对腹腔镜阑尾切除术后患者胃肠功能恢复、腹胀程度、胃动素(MTL)、胃泌素(GAS)的影响。方法回顾性分析宜春浙赣友好医院2021年12月至2023年1月腹腔镜阑尾切除术患者100例临床资料,术后给予常规治疗50例... 详细信息

目的探讨大黄芒硝外敷联合温针灸对腹腔镜阑尾切除术后患者胃肠功能恢复、腹胀程度、胃动素(MTL)、胃泌素(GAS)的影响。方法回顾性分析宜春浙赣友好医院2021年12月至2023年1月腹腔镜阑尾切除术患者100例临床资料,术后给予常规治疗50例作为对照组;在对照组基础上给予大黄芒硝外敷联合温针灸治疗的50例作为观察组。比较两组胃肠功能恢复指标、腹胀程度、MTL、GAS及并发症发生率。结果治疗后,观察组肠鸣音恢复时间、首次排气时间、首次排便时间均短于对照组;观察组腹胀程度轻于对照组;观察组血清MTL、GAS水平均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。观察组并发症总发生率(6.00%)低于对照组(20.00%),差异有统计学意义(P<0.05)。结论大黄芒硝外敷联合温针灸可有效地改善腹腔镜阑尾切除术后胃肠蠕动功能,促进胃肠功能恢复,减轻腹胀程度,降低并发症发生率。

关键词：大黄芒硝外敷温针灸阑尾炎胃动素胃泌素

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中小流量计量仪选用及漏失计量研究

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油气储运 2007年第12期26卷 47-49页

作者：曾维英西南油气田分公司重庆气矿

针对目前天然气中小型用户(特别是民用气)流量范围波动较大且含有一定粉尘或杂质的特点,从各种计量仪表中筛选出对现场气流环境和外界条件适应能力强的TDS仪表。对该仪表低谷时漏失计量问题做了对比试验研究,试验表明,对TDS计量仪漏失... 详细信息

针对目前天然气中小型用户(特别是民用气)流量范围波动较大且含有一定粉尘或杂质的特点,从各种计量仪表中筛选出对现场气流环境和外界条件适应能力强的TDS仪表。对该仪表低谷时漏失计量问题做了对比试验研究,试验表明,对TDS计量仪漏失计量问题能得到解决,并建议推广使用。

关键词：中小流量优选电磁阀起步流量漏失计量研究建议

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智能旋涡流量计在中小流量计量中的应用

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石油仪器 2007年第3期21卷 29-31页

作者：曾维英中国石油西南油气田公司重庆气矿

智能旋涡流量计在重庆气矿中小流量计量中运用广泛。针对该类型仪表存在的问题,从抗压力波动、起步流量、安装工艺流程及设计选型等方面进行了深入分析,总结出了相应的解决措施。并对该仪表小流量测量误差做了对比试验研究,提出了优选... 详细信息

智能旋涡流量计在重庆气矿中小流量计量中运用广泛。针对该类型仪表存在的问题,从抗压力波动、起步流量、安装工艺流程及设计选型等方面进行了深入分析,总结出了相应的解决措施。并对该仪表小流量测量误差做了对比试验研究,提出了优选建议。

关键词：智能旋涡流量计中小流量计量

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福成寨、石河站脱水装置运行存在问题对比及改进对策

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天然气与石油 2006年第4期24卷 47-50页

作者：曾维英重庆气矿渝北天然气运销部重庆401147

天然气脱水和增压工艺已经在重庆气矿广泛使用。对两座处理能力和压力等级相同,但上流工艺不同的脱水装置的脱水效果进行对比分析。主要从运行参数、工艺设备、脱水效果方面入手,列出了原料气入塔温度、含水量、干气露点等对比参数,对... 详细信息

天然气脱水和增压工艺已经在重庆气矿广泛使用。对两座处理能力和压力等级相同,但上流工艺不同的脱水装置的脱水效果进行对比分析。主要从运行参数、工艺设备、脱水效果方面入手,列出了原料气入塔温度、含水量、干气露点等对比参数,对脱水设计、运行中存在的问题进行探讨,并提出了相应的建议措施。重点对增压+脱水这一复合新工艺所出现的新设备———空冷器,在设计和运行中出现的问题进行了深入分析,提出了相应的改进建议。

关键词：脱水干气露点含水量脱水效果空冷器建议措施

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经肝段动脉栓塞治疗中晚期肝癌

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中国肿瘤临床 2000年第12期27卷 929-931页

作者：苏明涛陈裕明曾维英汕头市中心医院介入放射科广东省汕头市515031

目的：探讨105例不能手术切除的中晚期肝癌经肝段动脉栓塞治疗效果和治疗成功的关键步骤。方法：通过肝动脉造影，对105例不能手术切除的中晚期肝癌经肿瘤供血的肝段动脉进行化疗栓塞治疗。结果：肝段动脉栓塞术者的1，2，3，4和5年的... 详细信息

目的：探讨105例不能手术切除的中晚期肝癌经肝段动脉栓塞治疗效果和治疗成功的关键步骤。方法：通过肝动脉造影，对105例不能手术切除的中晚期肝癌经肿瘤供血的肝段动脉进行化疗栓塞治疗。结果：肝段动脉栓塞术者的1，2，3，4和5年的生存率分别为90．0％、70．0％、50．0％、40．0％和30．0％；肝动脉栓塞术后联合肝段动脉栓塞术者其1，2，3，4和5年生存率分别为74．5％、49．1％、40．0％、29．1％和20．0％。结论：肝段动脉栓塞术是最佳的治疗方式，肝动脉栓塞术联合肝段动脉栓塞术可显著提高不能手术切除的中晚期肝癌的生存率。

关键词：中晚期肝癌超选择性插管术肝段动脉栓塞

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大豆抗豆卷叶螟的转录组和蛋白质组关联分析

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中国农业科学 2018年第7期51卷 1244-1260页

作者：曾维英孙祖东赖振光蔡昭艳陈怀珠杨守臻唐向民广西农业科学院经济作物研究所/农业部西南玉米大豆间套作区农业科学观测实验站

【目的】通过对大豆受豆卷叶螟幼虫胁迫下的转录组和蛋白质组结果进行联合分析,筛选出一些与大豆抗豆卷叶螟相关的候选基因,为深入认识大豆抗豆卷叶螟的分子调控机制奠定基础。【方法】以高抗材料赶泰-2-2(HR)和高感材料皖82-178(HS)为... 详细信息

【目的】通过对大豆受豆卷叶螟幼虫胁迫下的转录组和蛋白质组结果进行联合分析,筛选出一些与大豆抗豆卷叶螟相关的候选基因,为深入认识大豆抗豆卷叶螟的分子调控机制奠定基础。【方法】以高抗材料赶泰-2-2(HR)和高感材料皖82-178(HS)为研究对象,运用RNA-Seq技术和i TRAQ技术鉴定出豆卷叶螟幼虫取食诱导0和48 h时样品间的差异表达基因(DEGs)和差异表达蛋白(DEPs),将在蛋白水平和转录水平关联到的所有可定量数据进行关联分析,计算蛋白水平和转录水平间的相关系数。【结果】蛋白质鉴定结果表明,HR48/HR0、HS48/HS0、HR0/HS0和HR48/HS48比较组中分别鉴定出236、250、213、211个DEPs;转录组鉴定结果表明,HR48/HR0、HS48/HS0、HR0/HS0和HR48/HS48比较组中分别鉴定出1 064、680、605、468个DEGs。定量关联分析结果表明,HR48/HR0、HS48/HS0、HR0/HS0和HR48/HS48比较组的相关系数r分别为0.156、0.2687、0.1149和0.035;HR48/HR0、HS48/HS0、HR0/HS0和HR48/HS48比较组中分别关联到11、9、3和4个DEPs/DEGs,其中蛋白和m RNA表达趋势相同的基因分别有11、9、2和3个,蛋白和m RNA表达趋势相反的基因分别有0、0、1和1个。生物信息学分析结果表明,这些差异蛋白功能涉及代谢途径、核糖体、类黄酮生物合成、亚油酸代谢、氨基糖-核苷酸代谢、氨酰生物合成、亚麻酸代谢、次生代谢产物的生物合成、苯基丙酸生物合成、RNA运转、谷胱甘肽代谢、抗坏血酸盐和aldarate代谢等。功能关联分析结果表明,HR48/HR0比较组中有27条Pathway通路共关联到101个DEPs和23个DEGs,HS48/HS0比较组中有15条Pathway通路共关联到147个DEPs和16个DEGs,HR0/HS0比较组中有18条Pathway通路共关联到82个DEPs和10个DEGs,HR48/HS48比较组中仅有1条Pathway通路关联到71个DEPs和2个DEGs。同时关联发现胰蛋白酶抑制剂A、K型胰蛋白酶抑制剂、查尔酮异构酶4、脂氧合酶9、α-加氧合酶1、9S-脂氧合酶、植物凝集素前体、POD12、应激蛋白SAM22和c APX1等可能是大豆抗豆卷叶螟潜在的靶标蛋白(基因)。q RT-PCR表达分析结果表明,5个DEPs/DEGs在HR48/HR0比较组的表达趋势与它们的RNA-Seq和i TRAQ结果基本一致。【结论】确定了一些与豆卷叶螟的抗性相关蛋白(基因)和代谢通路,这些差异蛋白可能直接或间接参与大豆对豆卷叶螟的抗虫反应。

关键词：大豆豆卷叶螟转录组蛋白质组关联分析

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规范化继续教育是医院持续发展的保障——中山市人民医院“九五”期间继续医学教育工作回顾

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现代医院 2002年第1期2卷 30-32页

作者：彭庆有曾伟英程敏婷中山市人民医院 528403

规范化的继续医学教育工作是医院持续发展的保障。做法:从建立和健全管理制度,建立有效的激励及考核评估机制、加强信息处理及建立个人继续医学教育档案、利用信息技术开展远程医学教育、与医学院校联合办学、抓紧住院医师规范化培训等... 详细信息

规范化的继续医学教育工作是医院持续发展的保障。做法:从建立和健全管理制度,建立有效的激励及考核评估机制、加强信息处理及建立个人继续医学教育档案、利用信息技术开展远程医学教育、与医学院校联合办学、抓紧住院医师规范化培训等方面规范实施。

关键词：继续医学教育医院持续发展中山市人民医院规范化培训住院医师远程医学教育医学院校继续教育联合办学档案

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东南亚大豆种质资源的鉴定评价及生育期划分

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大豆科学 2023年第4期42卷 506-512页

作者：谭玉荣唐娟胡昌赖振光杨守臻孙祖东曾维英广西壮族自治区农业科学院广西南宁530007 广西桂先种业有限公司广西南宁530007

为了丰富我国的大豆基础材料,引进东南亚国家大豆种质资源32份,在广西南宁夏季播种的生态条件下,对这些种质资源的主要农艺性状及品质性状进行鉴定评价,筛选出优异种质资源。结果表明:东南亚大豆种质资源的7个主要质量性状Simpson多样... 详细信息

为了丰富我国的大豆基础材料,引进东南亚国家大豆种质资源32份,在广西南宁夏季播种的生态条件下,对这些种质资源的主要农艺性状及品质性状进行鉴定评价,筛选出优异种质资源。结果表明:东南亚大豆种质资源的7个主要质量性状Simpson多样性指数范围为0.117~0.683,脐色、结荚习性、茸毛色、花色等性状的遗传多样性高,而种皮色、叶形和落叶性的遗传多样性较低;10个主要数量性状变异数范围为5.24%~43.98%,其中有效分枝数、单株荚数、单株粒重的变异系数大于30%;10个数量性状主成分分析的结果表明,前3个主成分的累计贡献率达80.166%,第1主成分、第2主成分和第3主成分分别为产量构成因子、品质构成因子和株型构成因子;生育期组覆盖MG II~MG X,87.5%为晚熟品种;同时,筛选出5份综合性状优异的种质资源Bilomi No.3(菲律宾)、Yezin-15(缅甸)、Sri Samrong(泰国)、Sumbing No.452(泰国)及A-66甲(泰国)。本研究为种质资源创新利用和培育适合低纬度地区种植大豆新品种提供材料基础。东南亚大豆种质资源的鉴定评价为培育出适合我国南方及东南亚国家种植的大豆新品种提供材料基础。

关键词：大豆种质资源引进鉴定评价

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