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美国黄瓜生产、育种和加工概况

中国蔬菜 2008年第1期 6-8页

作者：张圣平顾兴芳 todd c．wehner 中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京市100081 美国北卡罗来那州立大学园艺系

15世纪末,黄瓜被引种到美国,直到今天,在美国仍能找到100年前从国外引进的一些品种。美国加工黄瓜栽培面积是鲜食黄瓜的2.02倍,因此,在育种目标上更倾向于雌型品种,以利于机械化集中收获。

关键词：育种目标黄瓜美国加工生产栽培面积机械化品种

黄瓜成熟瓜网纹基因H遗传定位及候选基因分析

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中国农业科学 2014年第8期47卷 1550-1557页

作者：王敏顾兴芳苗晗刘书林王烨 todd c.wehner 张圣平中国农业科学院蔬菜花卉研究所 Department of Horticulture Science North Carolina State University

【目的】有无网纹是黄瓜果实生理成熟后的重要表型性状之一,对其控制基因进行遗传定位和候选基因分析,为黄瓜果实性状改良提供理论依据和技术支撑,同时也可为网纹基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】利用成熟瓜无网纹黄瓜自交系PI20... 详细信息

【目的】有无网纹是黄瓜果实生理成熟后的重要表型性状之一,对其控制基因进行遗传定位和候选基因分析,为黄瓜果实性状改良提供理论依据和技术支撑,同时也可为网纹基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】利用成熟瓜无网纹黄瓜自交系PI205996(P1)和成熟瓜有网纹自交系PI263079(P2)为亲本构建不同遗传群体,进行网纹性状遗传分析。以包含230个单株的F2分离群体为试材,应用分离群体分组分析(BSA)法和2 112对SSR引物进行SSR分析,采用JoinMap 4.0作图软件和MapInspect软件构建成熟瓜网纹基因的SSR连锁群,并完成其染色体的初步定位。结合9 930黄瓜全基因组序列信息和115份核心种质重测序结果,利用Primer6.0软件开发设计新标记,对初步定位区域进行标记加密,利用生物信息学的相关信息对定位区域进行候选基因分析。【结果】研究表明,黄瓜成熟瓜有网纹自交系PI263079的有网纹性状是由显性单基因(H)控制的,有网纹对无网纹为显性。从2 112对SSR引物中筛选出255对在亲本间表现出多态性的引物,多态率为12.1%。利用亲本间具有多态性的引物对有网纹和无网纹各7个单株DNA进行分析,筛选获得了9对与H基因连锁的SSR标记,将H初步定位在黄瓜5号染色体(chr.5)上,侧翼标记分别为SSR13006和cSWcT-17,遗传距离分别为3.6 cM和8.2cM。根据初步定位区域的序列信息,设计合成了97对新的SSR引物,其中4对引物在亲本间表现出多态,多态率为4.1%。利用这4对新的多态性SSR引物对亲本和F2群体的DNA进行分析,最终构建了一张包含13个SSR标记的H分子标记连锁群,获得了与H最近的侧翼标记SSR13006和SSRH-90,遗传距离分别为3.6 cM和1.7 cM。利用黄瓜全基因组测序提供的基因预测和注释结果,发现基因H所在区段的物理距离为297.7 kb,存在29个候选基因。根据前人研究结果,推测csa5G591790是与成熟瓜网纹形成相关性较大的候选基因。【结论】黄瓜自交系PI263079的成熟瓜有网纹性状由显性单基因H控制,该基因位于黄瓜第5号染色体长臂的297.7 kb区段内,侧翼标记分别为SSR13006和SSRH-90,遗传距离分别为3.6 cM和1.7 cM。本研究为H基因的精细定位和克隆奠定了良好基础,也为黄瓜成熟瓜网纹性状的分子标记辅助选择育种提供了理论参考。

关键词：黄瓜成熟瓜网纹 SSR标记基因定位候选基因

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黄瓜黑色果刺基因染色体定位及候选基因分析

中国农业科学 2014年第1期47卷 122-132页

作者：刘书林顾兴芳苗晗王烨 Yiqun Weng todd c wehner 张圣平中国农业科学院蔬菜花卉研究所 Department of Horticulture Science North Carolina State University USDA-ARS Vegetable crops Research Unit Horticulture Department University of Wisconsin

【目的】黄瓜作为重要的果菜类蔬菜,果实品质一直是黄瓜育种研究的重点。果实品质包括内在品质和外观品质,其中外观品质对黄瓜的商品性具有重要影响。果刺颜色作为黄瓜重要的品质性状之一,对其进行遗传分析和基因定位将有助于了解果刺... 详细信息

【目的】黄瓜作为重要的果菜类蔬菜,果实品质一直是黄瓜育种研究的重点。果实品质包括内在品质和外观品质,其中外观品质对黄瓜的商品性具有重要影响。果刺颜色作为黄瓜重要的品质性状之一,对其进行遗传分析和基因定位将有助于了解果刺颜色遗传的分子机理,为黄瓜果实性状改良提供理论依据和技术支撑,同时也可为刺色基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】研究利用黄瓜白色果刺自交系GY14(P1)和黑色果刺自交系Nc76(P2)为亲本构建遗传群体,进行黄瓜果刺颜色的遗传分析。以F2分离群体为试材,应用分离群体分组分析法(BSA)和2 112对SSR引物进行SSR分析,结合9 930黄瓜全基因组序列信息和100份核心种质重测序结果开发新标记,对初定位区域进行标记加密。采用JoinMap 4.0作图软件和MapInspect软件构建连锁群并完成连锁群与染色体的对应,实现黄瓜黑色果刺性状的基因定位。运用生物信息学,在定位区域进行候选基因分析。利用包含156个株系的重组自交系(RILs)群体,对黑色果刺基因紧密连锁的两侧翼分子标记进行验证,确定标记用于分子标记辅助选择(MAS)育种的准确性。【结果】研究表明,黄瓜自交系Nc76的黑色果刺符合质量性状遗传特点,由显性单基因B控制,黑色对白色为显性。初步定位筛选获得了与B基因连锁的8对SSR引物,将B定位于黄瓜4号染色体(chr.4)上,最近的连锁标记为SSR22231,遗传距离为10.8 cM;根据初定位区域的序列信息,设计合成了新的SSR引物212对和Indel引物25对,利用这些引物对双亲和F2群体DNA进行分析,最终构建了一个包含14个SSR标记和1个InDel标记的分子标记连锁群,获得与B连锁的两侧翼标记SSRB-181和SSRB-130,遗传距离分别为2.0 cM和1.6 cM,该区段物理距离为422.1 kb,有60个预测候选基因,推测csa4G003095和csa4G001690是与黑色果刺形成相关性较大的候选基因。与B紧密连锁的两侧翼标记用于MAS育种的准确率分别为96.8%和96.2%,其中SSRB-181对黑色果刺植株鉴定的准确率达到100%,将在MAS育种发挥重要作用。【结论】黄瓜自交系Nc76的黑色果刺性状由显性单基因控制,该基因位于chr.4上422.1 kb范围内,两侧翼标记为SSRB-181和SSRB-130,遗传距离为3.6 cM。本研究结果为黑色果刺基因的精细定位和克隆及MAS育种奠定了良好基础。

关键词：黄瓜黑色果刺染色体定位 SSR标记候选基因

成熟黄瓜果皮红色性状的遗传分析及其基因定位

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园艺学报 2014年第2期41卷 259-267页

作者：刘书林顾兴芳苗晗王敏王烨 todd c. wehner 张圣平中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081 Department of Horticulture Science North Carolina State UniversityRaleigh NC27695-7609 USA

以黄瓜(cucumis sativus L.)成熟瓜红色果皮自交系‘NcG127’(P1)和成熟瓜黄色果皮自交系‘9930’(P2)为试验材料构建F2遗传群体,对成熟瓜红色果皮R基因进行遗传分析和基因定位研究。结果表明,黄瓜成熟瓜红色果皮性状由显性单基因控制,... 详细信息

以黄瓜(cucumis sativus L.)成熟瓜红色果皮自交系‘NcG127’(P1)和成熟瓜黄色果皮自交系‘9930’(P2)为试验材料构建F2遗传群体,对成熟瓜红色果皮R基因进行遗传分析和基因定位研究。结果表明,黄瓜成熟瓜红色果皮性状由显性单基因控制,红色对黄色为显性。以256株F2分离群体为试材,应用群体分离分析(BSA)法筛选得到与R基因连锁的20个多态性SSR标记,构建了R基因的分子标记连锁图谱,将R基因定位到黄瓜4号染色体上,物理距离为213.4 kb的区段内,两侧翼标记为UW019319和UW019203,与R遗传距离分别为0.8 cM和0.7 cM。生物信息学分析表明,该区段存在30个预测候选基因。

关键词：黄瓜红色果皮遗传分析 SSR标记基因定位

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西瓜基因目录(2007)

中国瓜菜 2013年第1期26卷 45-50页

作者：肖光辉 todd c.wehner 湖南省西瓜甜瓜研究所长沙410125 Department of Horticultural Science North Carolina State University

3 西瓜同工酶和分子标记基因西瓜同工酶和分子标记基因包括顺乌头酸酶2个、乙醇脱氢酶5个、酸性磷酸酶3个、酯酶11个、谷氨酸脱氢酶2个、谷草转氨酶11个、苹果酸脱氢酶5个、苹果酸酶4个、6-葡萄糖磷酸脱氢酶8个、葡萄糖磷酸异构酶9个... 详细信息

3 西瓜同工酶和分子标记基因西瓜同工酶和分子标记基因包括顺乌头酸酶2个、乙醇脱氢酶5个、酸性磷酸酶3个、酯酶11个、谷氨酸脱氢酶2个、谷草转氨酶11个、苹果酸脱氢酶5个、苹果酸酶4个、6-葡萄糖磷酸脱氢酶8个、葡萄糖磷酸异构酶9个、葡萄糖磷酸变位酶8个、过氧化物酶9个、莽草酸脱氢酶7个、超氧化物歧化酶7个、种子蛋白5个、丙糖磷酸异构酶7个,还有心肌黄酶、果糖1,6二磷酸酶、铁氧还蛋白氧化还原酶、热激蛋白70、异柠檬酸脱氢酶、亮氨酸氨肽酶、乙酰丝氨酸转移酶、尿素酶等各1个,共111个同工酶和分子标记基因.

关键词：西瓜瓜菜水果小西葫芦黄花叶病毒果肉颜色栽培品种种子繁殖器官肖光辉基因目录检索工具

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黄瓜无毛基因gl-2的遗传分析和定位

园艺学报 2011年第9期38卷 1685-1692页

作者：杨双娟苗晗张圣平程周超周健董邵云 todd c.wehner 顾兴芳中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081 美国北卡罗来纳州立大学园艺系

以黄瓜(cucumis sativus L.)有毛类型‘9110Gt’(P1)和无毛突变体‘NcG-042’(P2)为试材,对无毛基因gl-2进行遗传分析和基因定位研究。结果表明,黄瓜的有毛、无毛性状由一对核基因控制,有毛对无毛为显性。结合分离群体分组混合分析法(bu... 详细信息

以黄瓜(cucumis sativus L.)有毛类型‘9110Gt’(P1)和无毛突变体‘NcG-042’(P2)为试材,对无毛基因gl-2进行遗传分析和基因定位研究。结果表明,黄瓜的有毛、无毛性状由一对核基因控制,有毛对无毛为显性。结合分离群体分组混合分析法(bulked segregant analysis,BSA),以F2为作图群体,筛选得到18对与黄瓜无毛基因gl-2相关的SSR引物,构建了gl-2基因的SSR连锁群,并将该基因定位在黄瓜第2染色体上,两侧最近的连锁标记为SSR10522和SSR13275,遗传距离分别为0.6cM和3.8cM。经过回交群体验证,SSR10522和SSR13275的正确率分别为94.4%和91.6%。

关键词：黄瓜无毛基因gl-2 遗传分析基因定位 SSR

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黄瓜种瓜红色果皮遗传分析及基因定位

黄瓜种瓜红色果皮遗传分析及基因定位

中国园艺学会2013年学术年会

作者：刘书林顾兴芳苗晗王敏王烨 todd c.wehner 张圣平中国农业科学院蔬菜花卉研究所 Department of Horticulture Science North Carolina State UniversityRaleighNC 27695-7609USA

目前对于黄瓜(cucumis sativus L.)果实性状的研究多集中在嫩果性状方面,在种瓜性状方面研究较少。本研究旨在探究黄瓜种瓜果皮颜色的遗传规律,筛选与黄瓜种瓜红色果皮基因R紧密连锁的SSR分子标记,实现其在染色体上的定位。该研究将为R... 详细信息

目前对于黄瓜(cucumis sativus L.)果实性状的研究多集中在嫩果性状方面,在种瓜性状方面研究较少。本研究旨在探究黄瓜种瓜果皮颜色的遗传规律,筛选与黄瓜种瓜红色果皮基因R紧密连锁的SSR分子标记,实现其在染色体上的定位。该研究将为R基因的精细定位和分子克隆奠定基础,对于分子标记辅助选择育种(MAS)也具有重要意义。试验所用母本为美国加工类型黄瓜NcG127(种瓜果皮红色),父本为黄瓜全基因组测序材料,华北保护地类型黄瓜9930(种瓜果皮黄色),利用两亲本进行杂交、自交获得F、F’及F群体。在果实生理成熟期(授粉后35～45 d)调查亲本、F及F群体种瓜果皮颜色,分析红色果皮基因R的遗传规律。提取亲本及F群体基因组DNA,用2 112对基因组SSR引物进行筛选,再结合BSA

关键词：黄瓜红色果皮遗传分析 SSR标记基因定位

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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西瓜基因目录(2007)

中国瓜菜 2012年第6期25卷 45-48页

作者：肖光辉 todd c.wehner 湖南省西瓜甜瓜研究所长沙410125 Department of Horticultural Science North Carolina State UniversityRaleighNC 27695-7609

2007年的国际葫芦科遗传协会年报(cGc Report)第30期发表了最新的西瓜基因目录,对以前的西瓜基因目录进行了修改和补充,纠正了某些基因描述等方面的错误,新增加了8个基因,特别是增加了部分基因的照片。这个西瓜基因目录包括60个基因和11... 详细信息

2007年的国际葫芦科遗传协会年报(cGc Report)第30期发表了最新的西瓜基因目录,对以前的西瓜基因目录进行了修改和补充,纠正了某些基因描述等方面的错误,新增加了8个基因,特别是增加了部分基因的照片。这个西瓜基因目录包括60个基因和111个分子标记共171个基因,对从事西瓜研究特别是西瓜育种的科研人员很有用,特译出供参考。

关键词：基因目录西瓜分子标记科研人员葫芦科

Analysis of the combined effect of rs699 and rs5051 on angiotensinogen expression and hypertension

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chronic Diseases and Translational Medicine 2024年第2期10卷 102-117页

作者： Nicholas R.Powell Tyler Shugg Jacob Leighty Matthew Martin Rolf P.Kreutz Michael T.Eadon Dongbing Lai Tao Lu todd c.Skaar Division of clinical Pharmacology Department of MedicineSchool of MedicineIndiana UniversityIndianapolisIndianaUSA Department of Pharmacology and Toxicology School of MedicineIndiana UniversityIndianapolisIndianaUSA Department of cardiology School of MedicineKrannert Institute of CardiologyIndiana UniversityIndianapolisIndianaUSA Division of Nephrology Department of MedicineSchool of MedicineIndiana UniversityIndianapolisIndianaUSA Department of Medical and Molecular Genetics School of MedicineIndiana UniversityIndianapolisIndianaUSA

Background Hypertension(HTN)involves genetic variability in the renin-angiotensin system and influences antihypertensive *** previously reported that angiotensinogen(AGT)messenger RNA(mRNA)is endogenously bound by miR-122-5p and rs699 A>G decreases reporter mRNA in the microRNA functional-assay *** AGT promoter variant rs5051 c>T is in linkage disequilibrium(LD)with rs699 A>G and increases AGT *** independent effect of these variants is understudied due to their LD therefore we aimed to test the hypothesis that increased AGT by rs5051 c>T counterbalances AGT decreased by rs699 A>G,and when these variants occur independently,it translates to HTN-related *** We used in silico,in vitro,in vivo,and retrospective models to test this *** In silico,rs699 A>G is predicted to increase miR-122-5p binding affinity by 3%.Mir-ecLIP results show rs699 is 40–45 nucleotides from the strongest microRNA-binding site in the AGT ***,rs699 A>G increases AGT mRNA in an AGT-plasmid-cDNA HepG2 expression ***-Tissue Expression(GTEx)and UK Biobank analyses demonstrate liver AGT expression and HTN phenotypes are not different when rs699 A>G occurs independently from rs5051 c>***,GTEx and the in vitro experiments suggest rs699 A>G confers cell-type-specific effects on AGT mRNA abundance,and suggest paracrine renal renin-angiotensin-system perturbations could mediate the rs699 A>G associations with *** We found that rs5051 c>T and rs699 A>G significantly associate with systolic blood pressure in Black participants in the UK Biobank,demonstrating a fourfold larger effect than in White *** studies are warranted to determine if altered antihypertensive response in Black individuals might be due to rs5051 c>T or rs699 A>*** like this will help clinicians move beyond the use of race as a surrogate for genotype.

关键词： angiotensinogen genetic and genomic medicine hypertension rs699