检索结果-南通市图书馆

3D U-Net Segmentation Improves Root System Reconstruction from 3D MRI Images in Automated and Manual Virtual Reality Work Flows

引用

Plant Phenomics 2023年第3期5卷 598-611页

作者： Tobias Selzner Jannis Horn Magdalena Landl Andreas Pohlmeier Dirk Helmrich Katrin Huber Jan Vanderborght Harry Vereecken sven behnke Andrea Schnepf Forschungszentrum Juelich GmbH Agrosphere(IBG-3)JuelichGermany Autonomous Intelligence Systems Group University of BonnBonnGermany Forschungszentrum Juelich GmbH Juelich Supercomputing CenterJuelichGermany

Magnetic resonance imaging(MRI)is used to image root systems grown in opaque ***,reconstruction of root system architecture(RSA)from 3-dimensional(3D)MRI images is *** resolution and poor contrast-to-noise ratios(CNRs)hinder automated ***,manual reconstruction is still widely ***,we evaluate a novel 2-step work flow for automated RSA *** the first step,a 3D U-Net segments MRI images into root and soil in *** the second step,an automated tracing algorithm reconstructs the root systems from the segmented *** evaluated the merits of both steps for an MRI dataset of 8 lupine root systems,by comparing the automated reconstructions to manual reconstructions of unaltered and segmented MRI images derived with a novel virtual reality *** found that the U-Net segmentation offers profound benefits in manual reconstruction:reconstruction speed was doubled(+97%)for images with low CNR and increased by 27%for images with high *** root lengths were increased by 20%and 3%,***,we propose to use U-Net segmentation as a principal image preprocessing step in manual work *** root length derived by the tracing algorithm was lower than in both manual reconstruction methods,but segmentation allowed automated processing of otherwise not readily usable MRI ***,model-based functional root traits revealed similar hydraulic behavior of automated and manual *** studies will aim to establish a hybrid work flow that utilizes automated reconstructions as scaffolds that can be manually corrected.

关键词： Root utilize otherwise

来源：

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：