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Patient-derived xenograft platform of OSCC： a renewable human bio-bank for preclinical cancer research and a new co-clinical model for treatment optimization

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Frontiers of Medicine 2016年第1期10卷 104-110页

作者： shuyang sun Zhiyuan Zhang Department of Oral and Maxillofacial-Head Neck Oncology Ninth People's Hospital Shanghai Jiao Tong University School of Medicine'Shanghai Key Laboratory of Stomatology Shanghai 200011 China

Advances in next-generation sequencing and bioinformatics have begun to reveal the complex genetic landscape in human cancer genomes, including oral squamous cell carcinoma （OSCC）. Sophisticated preclinical models that fully represent intra- and inter-tumoral heterogeneity are required to understand the molecular diversity of cancer and achieve the goal of personalized therapies. Patient-derived xenograft （PDX） models generated from human tumor samples that can retain the histological and genetic features of their donor tumors have been shown to be the preferred preclinical tool in translational cancer research compared with other conventional preclinical models. Specifically, genetically well-defined PDX models can be applied to accelerate targeted antitumor drug development and biomarker discovery. Recently, we have successfully established and characterized an OSCC PDX panel as part of our tumor bio-bank for translational cancer research. In this paper, we discuss the establishment, characterization, and preclinical applications of the PDX models. In particular, we focus on the classification and applications of the PDX models based on validated annotations, including clinicopathological features, genomic profiles, and pharmacological testing information. We also explore the translational value of this well-annotated PDX panel in the development of co-clinical trials for patient stratification and treatment optimization in the near future. Although various limitations still exist, this preclinical approach should be further tested and improved.

关键词： patient-derived xenograft models personalized medicine co-clinical trial patient stratification oral squamous cellcarcinoma

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Clinical utility of PDX cohorts to reveal biomarkers of intrinsic resistance and clonal architecture changes underlying acquired resistance to cetuximab in HNSCC

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2022年第4期7卷 1202-1218页

作者： Yanli Yao Yujue Wang Lan Chen Zhen Tian Guizhu Yang Rui Wang Chong Wang Qi Wu Yaping Wu Jiamin Gao Xindan Kang Shengzhong Duan Zhiyuan Zhang shuyang sun Department of Oral and Maxillofacial-Head Neck Oncology Shanghai Ninth People’s HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghaiChina College of Stomatology Shanghai Jiao Tong UniversityNational Center for StomatologyNational Clinical Research Center for Oral DiseasesShanghai Key Laboratory of StomatologyShanghaiChina Department of Oral Pathology Shanghai Ninth People’s HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghaiChina Laboratory of Oral Microbiota and Systemic Diseases Shanghai Ninth People’s HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghaiChina

Cetuximab is a widely used drug for treating head and neck squamous cell carcinomas(HNSCCs);however,it provides restricted clinical benefits,and its response duration is limited by drug ***,we conducted randomized“Phase II-like clinical trials”of 49 HNSCC PDX models and reveal multiple informative biomarkers for intrinsic resistance to cetuximab(e.g.,amplification of ANKH,up-regulation of PARP3).After validating these intrinsic resistance biomarkers in another HNSCC PDX cohort(61 PDX models),we generated acquired cetuximab resistance PDX models and analyzed them to uncover resistance *** exome sequencing and transcriptome sequencing revealed diverse patterns of clonal selection in acquired resistant PDXs,including the emergence of subclones with strongly activated RAS/*** these insights,we show that a combination of a RAC1/RAC3 dual-target inhibitor and cetuximab could overcome acquired cetuximab resistance in vitro and in *** revealing intrinsic resistance biomarkers,our PDX-based study shows how clonal architecture changes underlying acquired resistance can be targeted to expand the therapeutic utility of this important drug to more HNSCC patients.

关键词： resistance PDX intrinsic

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A biomimetic nanoplatform for customized photothermal therapy of HNSCC evaluated on patient-derived xenograft models

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International Journal of Oral Science 2023年第1期15卷 87-98页

作者： Qi Wu Lan Chen Xiaojuan Huang Jiayi Lin Jiamin Gao Guizhu Yang Yaping Wu Chong Wang Xindan Kang Yanli Yao Yujue Wang Mengzhu Xue Xin Luan Xin Chen Zhiyuan Zhang shuyang sun Department of Oral and Maxillofacial-Head&Neck Oncology Shanghai Ninth People’s HospitalShanghai Jiao Tong University School of Medicine/College of StomatologyShanghai Jiao Tong University/National Center for Stomatology/National Clinical Research Center for Oral Diseases/Shanghai Key Laboratory of Stomatology/Shanghai Research Institute of StomatologyShanghaiChina Shanghai Frontiers Science Center for Chinese Medicine Chemical Biology Institute of Interdisciplinary Integrative Medicine ResearchShanghai University of Traditional Chinese MedicineShanghaiChina School of Chemical Engineering and Technology Shaanxi Key Laboratory of Energy Chemical Process IntensificationInstitute of Polymer Science in Chemical EngineeringXi’an Jiao Tong UniversityXi’anChina

Cancer cell membrane(CCM)derived nanotechnology functionalizes nanoparticles(NPs)to recognize homologous cells,exhibiting translational potential in accurate tumor ***,these nanoplatforms are majorly generated from fixed cell lines and are typically evaluated in cell line-derived subcutaneous-xenografts(CDX),ignoring the tumor heterogeneity and differentiation from inter-and intra-individuals and microenvironments between heterotopic-and orthotopic-tumors,limiting the therapeutic efficiency of such ***,various biomimetic nanoplatforms(CCM-modified gold@Carbon,i.e.,Au@C-CCM)were fabricated by coating CCMs of head and neck squamous cell carcinoma(HNSCC)cell lines and patient-derived cells on the surface of Au@C *** generated Au@C-CCMs were evaluated on corresponding CDX,tongue orthotopic xenograft(TOX),immunecompetent primary and distant tumor models,and patient-derived xenograft(PDX)*** Au@C-CCM generates a photothermal conversion efficiency up to 44.2% for primary HNSCC therapy and induced immunotherapy to inhibit metastasis via photothermal therapy-induced immunogenic cell *** homologous CCM endowed the nanoplatforms with optimal targeting properties for the highest therapeutic efficiency,far above those with mismatched CCMs,resulting in distinct tumor ablation and tumor growth inhibition in all four *** work reinforces the feasibility of biomimetic NPs combining modular designed CMs and functional cores for customized treatment of HNSCC,can be further extended to other malignant tumors therapy.

关键词： xenograft patient custom

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Developing a Comprehensive Regime for Personal Information Protection in Networked Chinese Public Sectors

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Management Studies 2015年第1期3卷 13-20页

作者： Xiaomi An shuyang sun Wenlin Bai Bin Zhang Xiaoyu Huang Hepu Deng Renmin University of China Beijing China

With the increasing sharing and reuse of personal information resources for better public services, the effective protection and management of personal information as organizational and individual assets as well as social resources are becoming more and more important in networked Chinese public sectors. Existing studies of personal information protection in China is mainly conducted from the legal perspective with a focus on the development of appropriate legislation and policies at the national level. There is little research on how specific legislation and polices can actually be implemented in an effective manner and what impacts such legislation and policies have on individuals, organizations, and the society. To adequately address this issue, this study investigates the legal requirements for personal information protection based on the relevant laws, regulations, and standards in China. It proposes a comprehensive regime for personal information protection in the networked public sectors in China. Such a regime takes the advantages of existing discipline-based approaches, legal requirements, and control mechanisms for personal information protection. It can be used to facilitate the provision of public services in the networked Chinese public sectors through the adequate protection of personal information and the effective management of personal information.

关键词： information resources management personal information personal information protection public sector networked environment China

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转化医学视角下头颈癌人源性肿瘤异种移植瘤模型队列的研究愿景

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华西口腔医学杂志 2021年第6期39卷 617-623页

作者：张志愿孙树洋上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔颌面-头颈肿瘤科上海交通大学口腔医学院国家口腔医学中心国家口腔疾病临床医学研究中心上海市口腔医学重点实验室上海200011

头颈癌位居全球第七大恶性肿瘤,现存多种治疗策略无法满足大部分患者的临床获益需求。同时,缺乏分子分型指导的头颈癌治疗策略也严重阻碍个性化疗法的发展。近年来,以临床前模型为纽带,加快临床问题与基础成果双向转化的新思路逐渐成为... 详细信息

头颈癌位居全球第七大恶性肿瘤,现存多种治疗策略无法满足大部分患者的临床获益需求。同时,缺乏分子分型指导的头颈癌治疗策略也严重阻碍个性化疗法的发展。近年来,以临床前模型为纽带,加快临床问题与基础成果双向转化的新思路逐渐成为业界共识。PDX模型作为肿瘤基础研究和临床转化的桥梁,能够精准复制肿瘤遗传特征和肿瘤进化,在阐析肿瘤发生发展机制中显示出强大的生命力。借助PDX模型组成的治疗队列,彰显出小鼠为患者进行药物筛选和生物标志物分析的独特优势,这种理想的临床前模型能够在符合伦理范畴内最大可能的为患者寻找潜在的治疗策略。

关键词：人源性肿瘤异种移植瘤模型头颈癌异质性药物筛选

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统计关系学习研究进展

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计算机研究与发展 2008年第12期45卷 2110-2119页

作者：刘大有于鹏高滢齐红孙舒杨吉林大学计算机科学与技术学院长春130012 吉林大学符号计算与知识工程教育部重点实验室长春130012

统计关系学习是人工智能领域的一个新研究热点,它将关系表示、似然性理论和机器学习相结合,能更好地解决现实世界中复杂的关系数据问题,在生物信息学、Web导航、社会网、地理信息系统和自然语言理解等领域有着重要的应用.首先对统计关... 详细信息

统计关系学习是人工智能领域的一个新研究热点,它将关系表示、似然性理论和机器学习相结合,能更好地解决现实世界中复杂的关系数据问题,在生物信息学、Web导航、社会网、地理信息系统和自然语言理解等领域有着重要的应用.首先对统计关系学习的研究内容以及研究任务进行了介绍和总结,然后根据概率表示和推理机制的不同,对当前的统计关系学习方法进行了分类,并对各类方法进行了详细介绍,最后讨论了当前统计关系学习存在的问题,并指出了今后研究和发展的方向.

关键词：统计关系学习似然逻辑学习多关系数据挖掘统计学习关系学习

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成釉细胞瘤临床研究前模型构建及精准治疗研究前景

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中华口腔医学杂志 2023年第8期58卷 844-851页

作者：康馨丹孙露露张志愿孙树洋上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔颌面-头颈肿瘤科、上海交通大学口腔医学院、国家口腔医学中心、国家口腔疾病临床医学研究中心、上海市口腔医学重点实验室、上海市口腔医学研究所、中国医学科学院口腔颌面再生医学创新单元上海200011

成釉细胞瘤(ameloblastoma,AM)是病因不明,易复发、可恶变的良性牙源性肿瘤,刮治术后复发率高,颌骨部分切除术影响患者口腔颌面部结构功能。全基因组测序结果显示BRAF基因突变和SMO基因突变较常见,且二者发生倾向于互斥。个别病例报告表... 详细信息

成釉细胞瘤(ameloblastoma,AM)是病因不明,易复发、可恶变的良性牙源性肿瘤,刮治术后复发率高,颌骨部分切除术影响患者口腔颌面部结构功能。全基因组测序结果显示BRAF基因突变和SMO基因突变较常见,且二者发生倾向于互斥。个别病例报告表明BRAF抑制剂对携带BRAFV600E的患者有效,而开展大规模临床研究有困难,因此亟需可靠的临床研究前模型来探索AM靶向药物治疗。体外细胞模型及小鼠体内移植瘤模型是常见的临床研究前模型。二维培养良性肿瘤增殖能力有限,永生化处理后很可能影响细胞表型;此外,AM在裸鼠皮下移植瘤成功率较低,人源化小鼠异种移植瘤模型待更多探索。而目前三维类器官有希望实现AM干性上皮细胞亚群培养,进而模拟体内肿瘤、用于精准治疗药物研发。本文对AM临床研究前模型、遗传变异特征的研究进展展开综述,提出可进行药物筛选等研究的AM类器官模型构建的研究前景,从而为更多患者提供个性化治疗可能。

关键词：成釉细胞瘤临床研究前模型类器官基因突变个性化治疗

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基于肿瘤临床前模型建立头颈癌新型药物基因组学的必要性及展望

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山东大学学报(医学版) 2021年第9期59卷 57-63页

作者：孙树洋张志愿上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔颌面-头颈肿瘤科上海交通大学口腔医学院国家口腔医学中心国家口腔疾病临床医学研究中心上海市口腔医学重点实验室

头颈癌是全球第七大恶性肿瘤类型,超过60%患者初次确诊即为中晚期。靶向治疗和免疫治疗的发展已经显著推动了头颈癌治疗策略的转型,但是临床获益有待进一步提升。肿瘤临床前模型保留了患者肿瘤的基因和表型的异质性,已广泛应用于临床前... 详细信息

头颈癌是全球第七大恶性肿瘤类型,超过60%患者初次确诊即为中晚期。靶向治疗和免疫治疗的发展已经显著推动了头颈癌治疗策略的转型,但是临床获益有待进一步提升。肿瘤临床前模型保留了患者肿瘤的基因和表型的异质性,已广泛应用于临床前药物筛选和验证体系。药物基因组学通过将基因组学和药物响应进行匹配,能够基于肿瘤异质性基础进行患者分层,优化治疗策略并挖掘新治疗靶点。本文概述药物基因组学的发展史,从头颈癌治疗现状和异质性特征出发,探讨借助临床前模型开展新型药物基因组学的必要性和可行性。

关键词：药物基因组学人源性肿瘤异种移植瘤人源肿瘤来源的原代肿瘤细胞肿瘤异质性头颈癌

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水文飞地:深圳非供水水库的适应性管理

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景观设计学（中英文） 2023年第5期11卷 82-91页

作者：孙曙阳香港大学建筑学院园境建筑学部中国香港999077

本文重点关注深圳的城市水域,尤其是自2019年跨城区集中化供水工程启动以来正在经历快速转变的小型水库。该供水工程的任务包括提升深圳市的跨流域调水能力(西江引水)、建设两个储水量超过1亿立方米的大型水库,以及推动废弃小型水库的... 详细信息

本文重点关注深圳的城市水域,尤其是自2019年跨城区集中化供水工程启动以来正在经历快速转变的小型水库。该供水工程的任务包括提升深圳市的跨流域调水能力(西江引水)、建设两个储水量超过1亿立方米的大型水库,以及推动废弃小型水库的退役。水库的退役过程是指将无法支持供水管理系统集中高效运作的小型水库从饮用水源供水水库改造为非饮用水源供水水库,随之降级的水源保护政策使小型水库极易受到城市发展的威胁,进而引发一系列生态和社会经济问题。“水文飞地”一词揭示了深圳即将退役的小型水库背后三个相互关联的现实:首先,这些水库被高密度城市环境所包围,形成了独特的形态;其次,它们的存在长期不为公众知晓与关注;第三,它们与所属的更大尺度的景观系统之间存在复杂的水文社会关系,暗示了潜在的景观干预空间。本项目建议将这类小型水库作为分散的离网供水系统水源,以期提高当地的供水韧性。与此同时,从并网水基础设施向离网水基础设施的转变需要借助新的分流域管理方案来确保水源的储量与质量。本文呈现了一个迭代的设计–研究过程,重点关注位于深圳市塘朗山西北山脚的一系列小型水库。在探究场地复杂生态水文关系及景观所蕴含机遇与挑战的同时,也对银湖山郊野公园将这些非饮用水源供水水库排除在管理边界之外的现状提出了质疑。项目提出的水利基础设施同时可发挥必要的教育功能,通过策划的视觉和触觉体验向人们展示景观性能及其与水安全之间的重要联系。

关键词：水安全供水水库非供水水库水利基础设施教育设施深圳

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电子文件管理的国际进展、发展趋势与未来方向

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档案学研究 2012年第3期 82-86页

作者：安小米张维孙舒扬数据工程与知识工程教育部重点实验室(中国人民大学) 北京100872 中国人民大学信息资源管理学院北京100872

近年来电子文件管理研究的文献数量逐年增多,但多局限于单一国家或少数国家的电子文件管理经验,并大多关注电子政务背景下的电子文件管理系统建设问题,视角多基于信息技术或文件档案管理。本文采用文献调查和典型案例研究方法,对2008年... 详细信息

近年来电子文件管理研究的文献数量逐年增多,但多局限于单一国家或少数国家的电子文件管理经验,并大多关注电子政务背景下的电子文件管理系统建设问题,视角多基于信息技术或文件档案管理。本文采用文献调查和典型案例研究方法,对2008年以来的代表性英文期刊文献和澳大利亚、加拿大、新西兰、英国和美国的代表性电子文件管理法规、政策、标准及最佳实践指南进行了分析,旨在发现国际领域电子文件管理综合解决方案的国际进展、发展趋势和未来方向。研究揭示,越来越多的国家认识到电子文件管理的问题与挑战并将其列入电子政务建设的议程;采用多学科合作方法将文件作为信息资源和业务资产进行管理是电子文件管理的国际化发展趋势;制定综合集成管理方案整合、优化和创新组织和国家层次的电子文件管理和电子政务建设方案是电子文件管理的未来发展方向。

关键词：电子文件管理国际进展发展趋势未来方向电子政务

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