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A Push–Pull Mechanism Helps Design Highly competent G-Quadruplex-DNA catalysts

ccS chemistry 2021年第8期3卷 2183-2193页

作者： Jielin chen Jiawei Wang stephanie c.cvan der lubbe Mingpan cheng Dehui Qiu David Monchaud Jean-Louis Mergny célia Fonseca Guerra Huangxian Ju Jun Zhou State Key Laboratory of Analytical chemistry for Life Science School of Chemistry and Chemical EngineeringNanjing UniversityNanjing 210023 Theoretical chemistry Department of Chemistry and Pharmaceutical SciencesAIMMSVrije Universiteit AmsterdamAmsterdam 1081 HV Institut de chimie Moléculaire(IcMUB) CNRSUniversitéde Bourgogne Franche-ComtéDijon 21078 Leiden Institute of chemistry Gorlaeus LaboratoriesLeiden UniversityLeiden 2333 CD

Massive efforts are currently being invested to improve the performance,versatility,and scope of applications of nucleic acid catalysts.G-quadruplex(G4)/hemin DNAzymes are of particular interest owing to their structural programmability and chemical ***,optimized catalytic efficiency is still bottleneck and the activation mechanism is ***,we have designed a series of parallel G4s with different proximal cytosine(dc)derivatives to fine-tune the hemin-binding pocket for G4-DNAzymes.

关键词： DNAzyme electron density G-quadruplex hemin push–pull mechanism

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Modeling the effects of salt concentration on aqueous and organic electrolytes

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npj computational Materials 2023年第1期9卷 546-552页

作者： stephanie c.c.van der lubbe Pieremanuele canepa Department of Materials Science and Engineering National University of Singapore9 Engineering Drive 1117575 SingaporeSingapore Department of chemical and Biomolecular Engineering National University of Singapore4 Engineering Drive 4117585 SingaporeSingapore Department of Electrical and computer Engineering and Texas center for Superconductivity University of HoustonHoustonTX 77204USA

Understanding the thermodynamic properties of electrolyte solutions is of vital importance for a myriad of physiological and technological *** mean activity coefficientγ±is associated with the deviation of an electrolyte solution from its ideal behavior and may be obtained by combining the Debye-Hückel(DH)and Born(B)***,the DH and B equations depend on the concentration and temperature-dependent static permittivity of the solutionεr(c,T)and the size of the solvated ions ri,whose experimental data is often not ***,we use a combination of molecular dynamics and density functional theory to predictεr(c,T)and ri,which enables us to apply the DH and B equations to any technologically relevant aqueous and nonaqueous electrolyte at any concentration and temperature of interest.

关键词： equations electrolyte apply

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