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Full-length transcriptome sequencing analysis reveals differential skin color regulation in snakeheads fish Channa argus

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Aquaculture and Fisheries 2024年第4期9卷 590-596页

作者： Leigang Mao Yongan zhu Jiaren Yan Longgang Zhang shuren zhu Li An Qinglei Meng Zhishan Zhang Xirong Wang College of Fisheries and Life Science Shanghai Ocean UniversityShanghai201306China Shandong Freshwater Fisheries Research Institute Jinan250017China

Albinism is a genetic disorder caused by a series of genetic abnormalities that result in a decrease in *** yellow snakehead fish(GCAS)has been discovered while the Channa argus(CAS)breeding,but the genetic mechanism that causes its albinism is not *** sequencing and comparison of CAS and GCAS skin using Oxford Nanopore Technologies(ONT)technology to elucidate the molecular mechanisms of snakehead albinism.27.1 G clean reads and 26,198 full-length non-redundant sequences were generated via ONT ***,8079 new transcripts and 7231 genes were identified by comparing and analyzing redundant removed transcripts and known reference genome *** results of DEGs analysis showed that a total of 59 transcripts were differentially expressed in the two groups,including 22 up-regulated transcripts and 37 down-regulated *** causative genes associated with albinism have been identified,including TYR(Tyrosinase)and SOX10(SRY-box transcription factor 10)(tyrosinase synthesis and metabolism),S-100(S100 calcium binding protein A1)(melanin production),NLRC3(NLR family CARD domain containing 3)(disease immunity)are significantly down-regulated in GCAS,while RhoGEFs expression(melanin synthesis)is *** interaction analysis revealed that GAPDH(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)is the top hub gene in the regulation of skin color in *** addition,the skin of snakehead fish is regulated by metabolic(GAPDH),immune[Tumor protein p53(TP53),C-X-C motif chemokine ligand 8(CXCL8),SRC proto-oncogene,non-receptor tyrosine kinase(SRC),CD274]and neural[Notch receptor 1(NOTCH1),C-X-C motif chemokine ligand 12(CXCL12)]related genes to achieve differences in skin *** findings in understanding the process by which albinism in fish develops.

关键词： Albinism Channa argus Nanopore-based RNA sequencing Melanin

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An Authentication Method of Distinguishing Proxy's Secure Accident Responsibility

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Wuhan University Journal of Natural Sciences 2007年第1期12卷 109-112页

作者： zhu shuren School of Information Science Guangdong University ofBusiness Studies Guangzhou 510320 Guangdong China

The publish/subscribe （pub/sub） paradigm has asynchronous, loosely-coupled and many-to-many communication properties and is widely used in the application of large-scale distributed computing environment. There is the problem that is mutual trustable between network proxies in terms of pub/sub systems and the problem which is hardly to distinguish accident responsibility while the accident happens in Kerberos based on symmetrical encryption algorithm. A proxy identity authentication algorithm based on RSA encryption is proposed to solve the problem of mutual trust between proxies, and the security of the messages is guaranteed through certificate delegation. The algorithm can distinguish accident responsibility. The feasibility analysis, security analysis and efficiency analysis of the algorithm are carried out.

关键词： publish/subscribe identity authentication kerberos secure accident responsibility

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Establishment of the Secure Channel between Broker Nodes in Pub/Sub System

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Wuhan University Journal of Natural Sciences 2006年第6期11卷 1441-1444页

作者： zhu shuren Information Science School Guangdong University of Business Studies Guangzhou 510320 Guangdong China

The paper mainly discusses the integrity of the forwarded subscription message guaranteed by secure channel which encrypted in data communication by using data encryption standard （DES） algorithm and chaos code algorithm between broker nodes in the routing process of the contentbased publish/subscribe system. It analyzes the security of the secure channel encrypted with data communication by DES algorithm and chaos code algorithm, and finds out the secure channel can be easily attacked by known plain text. Therefore, the paper proposes the improved algorithm of message encryption and authentication, combining encryption and the generation of the message authentication code together to finish scanning at one time, which enhances both the secure degree and running efficiency. This secure channel system has a certain reference value to the pub/sub system requiring highly communication security.

关键词： publish/subscribe routing algorithm subscription message secure channel data encryption standard (DES)

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Investigation of Phylogenetic Relationship among Three Species of Channa Based on ITS Sequence Analysis

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Agricultural Biotechnology 2016年第1期5卷 50-53页

作者： shuren zhu Qinglei MENG Yongan zhu Xirong WANG Shandong Provincial Key Laboratory of Freshwater Genetics and Breeding Fresh Water Fishery Research Institute of Shandong Province Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources Ministry of Agriculture Shanghai Ocean University Department of Biology East China Normal University

[ Objective ] This study aimed to analyze genetic variation of ribosomal ITS region sequences in Channa argus, C moculata and C. asiatica, and to in- vestigate the phylogenetic relationship among Charma species based on ITS sequences. [ Method] ITS sequences of three Channa species were amplified by PCR, cloned and assembled to obtain the full length of ITS sequences. [ Result] The full length of ITS sequences of C. argus, C. maculata and C. asiatica was 902, 927, and 902/903 bp, respectively. ITS sequences of C. argus, C. maculata and C. asiatica exhibited higher G ＋ C （72%） than A ＋ T. Interspecific nucleotide differences were significantly greater than intraspecific differences of these three Channa species. Thus, these remarkably differential ITS fragments could be used to identify C. argus, C. maculata and C. asiatica. Phylogenetic tree constructed by Neighbor-joining and Maximum Likehood methods showed that C. argus shared the lowest genetic distance with C. maculata and the highest genetic distance with C. asiatica. [ Conclusion] This study provided reference for classification, i- dentification, phylogenetic analysis and interspecific hybridization of Channa species.

关键词： Channa argus C. maculata C. asiatica ITS sequences Phylogenetic relationship

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Acute Toxicity of Four Drugs to Larvae of Channa argus

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Agricultural Biotechnology 2016年第6期5卷 31-34页

作者： Zhenhai YU Yongan zhu Qinglei MENG shuren zhu Xirong WANG Shandong Freshwater Fisheries Research Institute/Shandong Provincial Key Laboratory of Freshwater Genetics and Breeding Jinan 250013China

The acute toxicity of 4 drugs, dipterex, potassium permanganate, copper sulfate and formaldehyde to larvae of black-spot hybrid snakehead was tested with the semi hydrostatic test method under water temperature of （28.3± 1.5）℃, pH of（8.01 ±0.12） and dissolved oxygen of （4.6 ±0.5） mg/L. The results showed that 96 h median-lethal concentration （LCso） of copper sulphate was the lowest, 1. 586 mg/L, while 96 h LC50 of formaldehyde was the highest, 115. 159 mg/L. The toxicity of the 4 drugs ranked in the order of copper sulphate, dipterex, potassium permanganate and formaldehyde from high to low. The safe concentrations（SCs） of the 4 drugs were in order of formaldehyde （35. 529 mg/L）, potassium permanganate （ 1. 277 mg/L）, dipterex （ 1. 450 mg/L） and copper sulphate （0.882 mg/L）. According to the rosults,the SCs of dipterex, formaldehyde and copper sulphate were higher than the conventional dosage, they were safe to be used for control of corresponding diseases of Channa argus by the conventional dosage. The SC of potassium permanganate was in the conventional dosage range, so it could be used for control of diseases in accordance with the SC of C. argus to the drug in production.

关键词： Channa argus Acute toxicity Median-lethal concentration Safe concentration (SC)

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基于粒度原理的蚁群聚类算法

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计算机工程 2005年第23期31卷 162-163,166页

作者：朱树人匡芳君王艳华长沙理工大学计算机与通信工程学院长沙410076

在过去10多年中,蚁群算法(AC)的研究和应用取得了很大的进展,大量结果证明了算法的有效性和在某些领域的优势。文章从信息粒度的角度出发,解决了传统聚类算法中对样本“抱团”性质的客观描述和分类算法中分类专家主观先验知识之间的不... 详细信息

在过去10多年中,蚁群算法(AC)的研究和应用取得了很大的进展,大量结果证明了算法的有效性和在某些领域的优势。文章从信息粒度的角度出发,解决了传统聚类算法中对样本“抱团”性质的客观描述和分类算法中分类专家主观先验知识之间的不协调性。并将蚁群系统模型引入聚类模型中,提出了一种基于粒度原理的蚁群聚类新方法。仿真结果表明上述方法是可行和有效的。

关键词：信息粒度聚类蚁群算法

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异步事件驱动的物联网服务模型

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铁道科学与工程学报 2013年第5期10卷 93-98页

作者：朱树人谢勇广东财经大学信息学院广东广州510320

随着物联网应用的迅速发展,网络服务面对高并发请求,物联网服务和拥有大量在线用户的交通管理与信息网络服务器随时面临巨大访问量冲击,对网络服务质量形成威胁。本文提出了一种高性能网络服务模型。该模型基于EPCIS,用"阶段"划分网络服... 详细信息

随着物联网应用的迅速发展,网络服务面对高并发请求,物联网服务和拥有大量在线用户的交通管理与信息网络服务器随时面临巨大访问量冲击,对网络服务质量形成威胁。本文提出了一种高性能网络服务模型。该模型基于EPCIS,用"阶段"划分网络服务,对象化的队列为主要构件,底层采用异步I/O技术,组件内部和组件间的通信采用事件驱动模型构建。设计和实现了一个基于事件驱动模型的异步Socket通信适配子层,用以屏蔽底层OS异步I/O细节。实验证明该模型对高并发请求服务具有较好的可伸缩性,对网络服务的业务流程变化具有较好的的敏捷性和适应性。

关键词：异步通信事件驱动网络服务物联网

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集成化UML建模环境研究

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计算机工程 2000年第12期26卷 66-68页

作者：朱树人长沙电力学院长沙410077

提出了集成化UML建模环境的思想，讨论了其基本组成，并在结构化图形编辑生成工具SGEG等的基础上研究了UML集成建模环境的实现。

关键词： UML 面向对象建模软件开发

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PDM应用环境探讨

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系统工程与电子技术 2000年第7期22卷 86-89页

作者：朱树人李伟琴长沙电力学院 410077 北京航空航天大学 100083

产品数据管理 (ProductDataManagement,PDM)是当前国际上的热门技术 ,全面实施应用PDM技术已成为当前企业获取竞争优势的最佳途径。分析了PDM技术的基本功能、主要特点和作用、应用环境以及与其它应用技术 (CAD、MRP、CIMS和CE等 )的关... 详细信息

产品数据管理 (ProductDataManagement,PDM)是当前国际上的热门技术 ,全面实施应用PDM技术已成为当前企业获取竞争优势的最佳途径。分析了PDM技术的基本功能、主要特点和作用、应用环境以及与其它应用技术 (CAD、MRP、CIMS和CE等 )的关系 ,提出了企业成功实施应用PDM技术应采取的主要对策。

关键词：计算机辅助设计软件产品数据管理

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含S、P、Mo有机化合物润滑性能的研究

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润滑与密封 1998年第3期23卷 28-29页

作者：文庆珍张宝真姚树人朱金华海军工程学院化学教研室武汉430033

用新方法合成了含S、P、Mo的黄绿色有机化全物(简称SMPI),并用四球机评价了SMPI的润滑性能。试验结果表明:添加1.0Wt％～4.0Wt％的SMPI到基础油中,即显示优良的极压抗磨作用。SMPI在油中,在空气中均较稳定。

关键词：润滑极压抗磨添加剂 SMPI 润滑剂

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