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Identification of Dysregulated microRNAs in Glioma Using RNA sequencing

Current Medical Science 2021年第2期41卷 356-367页

作者： Chang LIU Ying-ying GE Xiao-xun XIE Bin LUO Ning SHEN xing-sheng LIAO Shui-qing BI Tao XU Shao-wen XIAO Qing-mei ZHANG Department of Neurosurgery the First Affiliated HospitalGuangxi Medical UniversityNanning 530021China School of Pre-clinical Medicine Guangxi Medical UniversiryNanning 530021China Department of Stomatology the People's Hospital of Guangxi Zhuang Atutonomous RegionNanning 530021China

Glioma is the most common malignant brain tumor in central nervous *** advances in the treatment of glioma such as surgery and chemoradiotherapy,most patients are easy to relapse,resulting in adverse clinical ***,effective molecular=targeting treatment may be one of attractive strategies for glioma *** dysregulated microRNAs(miRNAs),one of the candidates of therapeutic targets,are believed to play an important role in the progression of *** this study,we aimed to examine the expression profile of miRNAs in glioma and provide a reference for glioma ***,expression profile of miRNAs in 5 normal brain tissues,5 low-grade glioma(LGG)tissues and 5 glioblastoma(GBM)tissues was detected by RNA sequencing(RNA-seq).Next,the target genes of differentially expressed miRNAs(DEmiRNAs)were predicted and then GO enrichment and KEGG pathway analysis performed by ***,10 miRNAs which were significantly up-or down-regulated both in GBM and LGG were validated by real-time quantitative PCR(qRT-PCR).RNA-seq results indicated a number of DEmiRNAs in *** were 64 up-regulated miRNAs and 17 down-regulated miRNAs n LGG,and 181 up-regulated miRNAs and 124 down-regulated miRNAs in GBM,*** analysis showed that the target genes of these DEmiRNAs were enriched in various biological processes and signaling pathways such as cell metabolic and developmental *** DEmiRNAs were further confirmed by ***-10b-5p,miRNA-92b-3p and miRNA-455-5p were significantly up-regulated in both GBM and LGG;while miRNA-542-3p was significantly up-regulated in LGG;miRNA-184 and miRNA-206 were significantly down-regulated in both GBM and LGG;miRNA-766-5p and miRNA-1-3p were significantly down-regulated in *** subject of our study demonstrated several dysregulated miRNAs may serve as a potential therapeutic target for gl ioma.

关键词： glioma microRNA RNA-sequencing

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多目标协同正弦优化算法求解分布式流水车间调度问题

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控制理论与应用 2024年第6期41卷 1029-1037页

作者：郎峻顾幸生华东理工大学能源化工过程智能制造教育部重点实验室上海200237

针对最小化最大完工时间(makespan)、总拖期以及平均空闲时间的多目标序列相关准备时间分布式流水车间调度问题,本文提出一种多目标协同正弦优化算法(MCSOA).算法主要包括4个核心阶段:在多邻域搜索阶段,提出了基于关键工厂的搜索策略,... 详细信息

针对最小化最大完工时间(makespan)、总拖期以及平均空闲时间的多目标序列相关准备时间分布式流水车间调度问题,本文提出一种多目标协同正弦优化算法(MCSOA).算法主要包括4个核心阶段:在多邻域搜索阶段,提出了基于关键工厂的搜索策略,并通过正弦优化算法控制搜索范围;在破坏重构阶段,设计了一种迭代搜索策略引导个体的进化方向,同时使用正弦优化算法平衡全局开发与局部搜索;在选择阶段,使用非支配排序与参考点的方法筛选优质解,外部档案集用于存储所有非支配解;在协同阶段,设计种群间共享与竞争机制,平衡3个目标的优化.本文通过多目标优化的均匀性、反世代距离和覆盖率3项性能指标验证算法的有效性,并使用非参数检验证明所提出的算法具有显著性优势.

关键词：多目标优化分布式流水车间调度序列相关准备时间正弦优化算法协同优化

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数据协调中测量数据方差-协方差估计及过失误差序列补偿算法

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控制理论与应用 2008年第4期25卷 717-722页

作者：吴胜昔赵霞顾幸生华东理工大学自动化系上海200237 上海交通大学自动化系上海200240

数据协调测量误差的方差-协方差矩阵(也称Q矩阵)通常是由操作人员根据仪表的精度事先给定的,由于没有考虑仪表精度的变化,很可能会造成数据的不一致或不准确.基于空间冗余的约束残差,本文提出了一种测量方差-协方差Q矩阵的估计方法,有... 详细信息

数据协调测量误差的方差-协方差矩阵(也称Q矩阵)通常是由操作人员根据仪表的精度事先给定的,由于没有考虑仪表精度的变化,很可能会造成数据的不一致或不准确.基于空间冗余的约束残差,本文提出了一种测量方差-协方差Q矩阵的估计方法,有效地减少了对Q矩阵先验知识的依赖.针对常见非线性或双线性问题,提出了估计方法的应用方案,并给出了侦破过失误差的序列补偿法.最后,某焦化厂的应用示例表明,该方法对于获得Q矩阵的最初估计和侦破过失误差是有效的.

关键词：数据协调方差-协方差 Q矩阵空间冗余过失误差

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空间框架结构非线性分析的简化数值方法

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工程力学 2005年第6期22卷 21-27页

作者：吴胜兴康庆河海大学土木工程学院南京210098

钢筋混凝土框架结构正常使用期间是带裂缝工作的,合理的分析方法应考虑因开裂引起的非线性。在杆系结构有限元基础上,根据构件截面广义应力-应变关系,提出了空间框架结构非线性分析的简化数值方法——网格-等效截面法。该方法能考虑材... 详细信息

钢筋混凝土框架结构正常使用期间是带裂缝工作的,合理的分析方法应考虑因开裂引起的非线性。在杆系结构有限元基础上,根据构件截面广义应力-应变关系,提出了空间框架结构非线性分析的简化数值方法——网格-等效截面法。该方法能考虑材料非线性,混凝土开裂导致构件有效刚度降低,混凝土徐变和加载历程等影响因素。给出了相应的实施步骤,并采用通用有限元软件ANSYS部分功能,自编主体计算程序的混合编程方法编制了程序。通过考题,程序编制方法正确,计算精度满足工程要求。最后,采用程序对荷载和温度作用下某超长框架结构进行了计算。

关键词：钢筋混凝土空间框架结构非线性分析网格-等效截面法混合编程

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分布参数系统传感器位置优化策略的小波算法

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华东理工大学学报（自然科学版） 2008年第4期34卷 594-597页

作者：高桂革顾幸生华东理工大学自动化研究所上海200237

传感器位置配置是分布参数系统实现最优控制的关键问题之一,不仅和边界条件有关,还和输入信号、系统噪声、测量噪声、过程的动态特性等因素有关,各个因素对最佳测量位置的影响各不相同。分布参数系统状态在空间具有无穷维自由度,而测量... 详细信息

传感器位置配置是分布参数系统实现最优控制的关键问题之一,不仅和边界条件有关,还和输入信号、系统噪声、测量噪声、过程的动态特性等因素有关,各个因素对最佳测量位置的影响各不相同。分布参数系统状态在空间具有无穷维自由度,而测量通常只是在空间离散的有限个点上进行,并且受到噪声的污染,因此,选择分布参数系统测量位置具有重要的意义。本文基于正交函数逼近理论,用小波作为分析工具对分布参数系统的传感器测量点的位置优化问题进行研究。仿真结果表明:该方法对于分布参数系统的传感器位置的优化选择具有重要意义。

关键词：分布参数系统传感器位置优化策略小波算法

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Expression,Purification and Structural Characterization of Mouse Talin-1 Head Δ139-168

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Journal of Northeast Agricultural University(English Edition) 2020年第2期27卷 108-115页

作者： Sun xing-sheng Du Jia-yang Liu Jia-fu College of Veterinary Medicine Northeast Agricultural UniversityHarbin 150030China College of Life Sciences Northeast Agricultural UniversityHarbin 150030China

Talin-1 head(hereinafter referred to as TH)is the head structure of talin protein,which contains a four-point-one-protein/ezrin/radixin/moesin(FERM)*** F1 domain contains an unstructured loop of 30 amino acids(139-168),which does not interact with other *** TH doesn’t get the crystal structure and whether the unstructured loop has obvious influence on the TH secondary structure,therefore,the truncated talin-1 headΔ139-168(hereinafter referred to as THΔ)was constructed and its structure and the impact of stability after truncation were *** biology and structural biology methods were used to construct prokaryotic expression vectors of TH and THΔ,explore and optimize the expression conditions of recombinants,and they were purified by affinity chromatography and FPLC gel filtration ***,a large number of stable,high-purity protein samples were prepared *** physicochemical properties and structural stability of the proteins were investigated by dynamic light scattering and circular *** results showed that the THΔsecondary structure of the truncated body did not change significantly,the structural stability was enhanced and the resistance to guanidine hydrochloride and high temperature was stronger.

关键词： talin-1 head talin-1 headΔ139-168 circular dichroism(CD) secondary structure stability

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Contemporary therapy of atrial fibrillation

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World Journal of Cardiovascular Diseases 2012年第3期2卷 111-117页

作者： xing sheng Yang Jing Ping Sun Cheuk Man Yu Division of Cardiology Prince of Wales Hospital The Chinese University of Hong Kong Hong Kong China

Atrial fibrillation (AF) is estimated that by 2010, approximately 2.6 million people will be affected in USA;by 2050, that number may increase to 10 million patients. Generally, rate control alone is reasonable in some AF patients, especially asymptomatic patients. Restoration and maintenance of sinus rhythm (SR) may be achieved by means of cardioversion, drugs or/ and catheter ablation. Pharmacological therapy can be useful to maintain SR and prevent tachycardia-induced cardiomyopathy. All patients with AF regardless of whether a rhythm or rate control strategy recommend anticoagulant, antiplatelet or both combined therapy for prevention of thromboembolism, except those with lone AF or contraindications. Drug selection should be based upon the absolute risk of stroke, bleeding, the relative risk and benefit for a given patient. Biventricular pacing may overcome many of the adverse hemodynamic effects associated with RV pacing alone. A target individual ectopic foci ablation within the pulmonary vein (PV) has evolved to circumferential electrical isolation of the entire PV musculature. Cavotricuspid isthmus should be considered as first-line therapy for patients with typical atrial flutter. Completely non-fluoroscopic ablation guided by Real-Time Magnetic Resonance Imaging (RTMRI) using a steerable and non-ferromagnetic catheter is a promising novel technology in interventional electrophysiology.

关键词： Atrial Fibrillation Antiarrhythmic Drug Anticoagulant Therapy Antiplatelet Therapy Cardioversion Catheter Ablation

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Involvement of X-chromosome Reactivation in Augmenting Cancer Testis Antigens Expression:A Hypothesis

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Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences) 2018年第1期38卷 19-25页

作者： Chang LIU Bin LUO Xiao-xun XIE xing-sheng LIAO Jun FU Ying-ying GE Xi-sheng LI Gao-shui GUO Ning SHEN Shao-wen XIAO Qing-mei ZHANG Department of Neurosurgery the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical UniversityNanning 530021China Department of Histology and Embryology Guangxi Medical UniversityNanning 530021China Central Laboratory School of Pre-Clinical MedicineGuangxi Medical UniversityNanning 530021China Department of Oral and Maxillofacial Surgery The People's Hospital of Guangxi Zhuang Autonomous RegionNanning 530021China

Cancer testis antigens(CTAs)are attractive targets for tumor immunotherapy because of their tumor-specific *** more than half of confirmed CTAs are located on the X-chromosome,we asked whether there is a link between CTA expression and *** reports have shown that reactivation of the inactive X-chromosome,known as X-chromosome reactivation(XCR),a unique phenomenon that exists in many high-risk tumors in women,can transform the expression of many X-linked genes from monoallelic to *** this review,we discuss the link between CTA and XCR with the hopes of providing some novel insights into tumor biology.

关键词： cancer testis antigen X-chromosome reactivation tumor immunotherapy

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基于小波变换的二阶线性分布参数系统预测控制

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控制理论与应用 2005年第6期22卷 849-854页

作者：丁斗章顾幸生上海电机学院电气工程系上海200240 华东理工大学自动化研究所上海200237

分布参数系统由于其复杂性,控制系统设计一直是控制理论的难点.寻求解决分布参数系统控制的新思路,本文提出了基于正交小波变换的线性离散时间分布参数系统预测控制概念,应用正交小波变换将二阶线性分布参数系统预测控制命题变换为集总... 详细信息

分布参数系统由于其复杂性,控制系统设计一直是控制理论的难点.寻求解决分布参数系统控制的新思路,本文提出了基于正交小波变换的线性离散时间分布参数系统预测控制概念,应用正交小波变换将二阶线性分布参数系统预测控制命题变换为集总参数系统预测控制问题,并设计预测控制器,将控制律进行反演获得原系统的具有分布特性的控制律.仿真研究表明,本文提出的分布参数系统预测控制算法取得了理想的控制效果,对系统模型失配和扰动具有较好的鲁棒性,验证了算法的有效性.

关键词：预测控制分布参数系统正交小波变换仿真研究

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基于信度分配的并行集成CMAC及其在建模中的应用

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控制理论与应用 2010年第2期27卷 211-215页

作者：潘晔顾幸生卢胜利华东理工大学自动化研究所上海200237 天津工程师范学院自动化工程系天津300222

Albus CMAC(cerebella model articulation controller)神经网络是一种模拟人类小脑学习结构的小脑模型关节控制器,它具有很强的记忆与输出泛化能力,但对于在线学习来说,Albus CMAC仍难满足快速性的要求.本文在常规CMAC神经网络的基础上... 详细信息

Albus CMAC(cerebella model articulation controller)神经网络是一种模拟人类小脑学习结构的小脑模型关节控制器,它具有很强的记忆与输出泛化能力,但对于在线学习来说,Albus CMAC仍难满足快速性的要求.本文在常规CMAC神经网络的基础上,针对其在学习精度与存储容量之间的矛盾,引入信度分配概念,提出了一种基于信度分配的并行集成CMAC.它将大规模网络切割为多个子网络分别训练后再组合,大大地提高了计算效率.通过对复杂非线性函数建模的仿真研究表明,该方案提高了系统建模的泛化能力和算法的收敛速度.文章最后讨论了学习常数和泛化参数对该神经网络在线学习效果的影响.

关键词：小脑模型关节控制器(CMAC) 信度分配并行神经网络集成建模

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