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Decoding the fish genome opens a new era in important trait research and molecular breeding in China

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Science China(Life Sciences) 2024年第10期67卷 2064-2083页

作者： Qian Zhou Jialin Wang Jiongtang Li Zhangfan Chen Na Wang Ming Li Lei Wang Yufeng Si sheng Lu Zhongkai Cui Xuhui Liu Songlin Chen State Key Laboratory of Mariculture Biobreeding and Sustainable Goods Yellow Sea Fisheries Research InstituteChinese Academy of Fishery SciencesQingdaoShandong 266071China Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes Qingdao Marine Science and Technology CenterQingdaoShandong 266237China Key Laboratory of Aquatic Genomics Ministry of Agriculture and Rural AffairsBeijing Key Laboratory of Fishery BiotechnologyChinese Academy of Fishery SciencesBeijing 100041China

Aquaculture represents the fastest-growing global food production sector,as it has become an essential component of the global food *** has the world's largest aquaculture industry in terms of production ***,the sustainable development of fish culture is hindered by several concerns,including germplasm degradation and disease *** practice of genomic breeding,which relies heavily on genome information and genotypephenotype relationships,has significant potential for increasing the efficiency of aquaculture *** 2014,the completion of the genome sequencing and annotation of the Chinese tongue sole signified the beginning of the fish genomics era in *** then,domestic researchers have made dramatic progress in functional genomic *** date,the genomes of more than 60 species of fish in China have been assembled and *** on these reference genomes,evolutionary,comparative,and functional genomic studies have revolutionized our understanding of a wide range of biologically and economically important traits of fishes,including growth and development,sex determination,disease resistance,metamorphosis,and ***,genomic tools and breeding techniques such as SNP arrays,genomic selection,and genome editing have greatly accelerated genetic improvement through the incorporation of functional genomic information into breeding *** review aims to summarize the current status,advances,and perspectives of the genome resources,genomic study of important traits,and genomic breeding techniques of fish in *** review will provide aquaculture researchers,fish breeders,and farmers with updated information concerning fish genomic research and breeding *** summary will help to promote the genetic improvement of production traits and thus will support the sustainable development of fish aquaculture.

关键词： fish genomics economic traits genomic selection genome editing genomic breeding

Long-term glacier variations and the response to climate fluctuation in Qilian Mountains,China

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Journal of Geographical Sciences 2024年第10期34卷 1904-1924页

作者： WANG sheng WANG Jianwen ZHU Meilin YAO Tandong PU Jianchen WANG jinfeng College of Geography Science Shanxi Normal UniversityTaiyuan 030000China Center for the Pan-Third Pole Environment Lanzhou UniversityLanzhou 730000China Key Laboratory of Tibetan Environment Changes and Land Surface Processes Institute of Tibetan Plateau ResearchCASBeijing 100101China State Key Laboratory of Cryospheric Sciences Northwest Institute of Eco-environment and ResourcesCASLanzhou 730000China

Glaciers are considered to be‘climate-sensitive indicators'and‘solid reservoirs',and their changes significantly impact regional water *** mass balance(MB)from 2011 to 2020 of the Qiyi Glacier in the northeast Tibetan Plateau is presented based on field *** glacier showed a persistent negative balance over 9 years of in-situ observations,with a mean MB of-0.51 m ***^(-1).The distributed energy-mass balance model was used for glacier MB reconstruction from 1980 to *** daily meteorological data used in the model were from HAR v2 reanalysis data,with automatic weather stations located in the middle and upper parts of the glacier used for deviation *** average MB over the past 40 years of the Qiyi Glacier was -0.36 m ***^(-1)with the mass losses since the beginning of the 21st century,being greater than those in the *** glacier runoff shows a significant increasing trend,contributing~81% of the downstream river *** albedo disparity indicates that the net shortwave radiation is much higher in the ablation zone than in the accumulation zone,accelerating ablation-area expansion and glacier mass *** MB of the Qiyi Glacier is more sensitive to temperature and incoming shortwave radiation variation than *** MB presented a non-linear reaction to the temperature and incoming shortwave *** future climate warming,the Qiyi Glacier will be increasingly likely to deviate from the equilibrium state,thereby exacerbating regional water balance *** is found that the mass losses of eastern glaciers are higher than those of western glaciers,indicating significant spatial heterogeneity that may be attributable to the lower altitude and smaller area distribution of the eastern glaciers.

关键词： glacier mass balance energy-mass balance model hydrology Qilian Mountains

县级医院独立开展体外膜肺氧合辅助心肺复苏治疗成人心脏骤停可行性分析

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中华急诊医学杂志 2024年第6期33卷 814-818页

作者：王超怡裘晟金琦鲍柳倩庞利挺天台县人民医院天台317200

目的总结县级医院独立开展体外膜肺氧合辅助心肺复苏(extracorporeal cardiopulmonary resuscitation,ECPR)治疗成人心脏骤停(cardiac arrest,CA)患者的经验和效果。方法回顾天台县人民医院从2020年1月至2023年10月23例成人CA-ECPR治疗的临床资料,收集心脏骤停患者初始心律、ECMO启动时间、CA-Pump On时间(即心脏骤停至ECMO开始转流的时间)、ECMO启动-Pump On时间(即ECMO启动至ECMO开始转流的时间)、ECMO置管-Pump On时间(即ECMO穿刺置管至ECMO开始转流的时间)、并发症、神经功能预后、病死率、存活率等数据,进行分析比较。并收集分析2020年1月至2023年10月期间33例具有ECPR指征但仅接受传统心肺复苏(conventional cardiopulmonary resuscitation,CCPR)的成人CA患者的病死率、存活率,与CA-ECPR进行比较。结果23例CA-ECPR患者,自主心律恢复16例,死亡15例,好转出院8例,其中6例神经功能预后良好。与CA-CCPR相比,CA-ECPR患者病死率明显下降(65.21%vs.90.91%,P=0.017),存活率明显提升(34.78%vs.9.09%,P=0.017)。在ECPR流程逐渐优化后,2022-2023年组与2020-2021年组相比,存活率显著提升(46%vs.20%),ECMO启动-Pump On时间[41(IQR 36.5~44.5)minvs.43(IQR 32.75~58.5)min,P=0.709]、ECMO置管-Pump On时间[30(IQR 24.0~37.0)minvs.33(IQR 27.25~55.00)min,P=0.575],均有下降,但两组差异无统计学意义。存活组与死亡组比较,初始可电击心律比例明显高于死亡组(75%vs.20%),CA-Pump On时间[61(IQR 49.25~69.25)minvs.69(IQR 58.0~89.0)min,P=0.287]、ECMO启动-Pump On时间[39(IQR 29.25~51.75)minvs.43(IQR 34.0~52.0)min,P=0.539]均低于死亡组,但两组差异无统计学意义。结论县级基层医院独立开展ECPR治疗成人心脏骤停,有利于提高县域内心脏骤停患者的抢救成功率,改善患者预后,在县级医院推广心脏骤停ECPR抢救技术,可使更多的心脏骤停患者获益,具有重要意义及较高的可行性。

关键词：体外膜肺氧合辅助心肺复苏县级医院心脏骤停

Coupling N-doping and confined Co_(3)O_(4) on carbon nanotubes by polydopamine coating strategy for pleiotropic water purification

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Rare Metals 2024年第7期43卷 3146-3160页

作者： Wen-Long Tu Gang Wang Yue Zhang Hong-Yang Zhu Rong-Rong Du Hong-Yao Zhao sheng Tang Zeng-jing Guo Jun Yang Fu Yang Cheng-Zhang Zhu School of Environmental and Chemical Engineering Jiangsu University of Science and TechnologyZhenjiang 212003China School of Chemistry and Chemical Engineering Liaocheng UniversityLiaocheng 252000China School of Material Science and Engineering Jiangsu University of Science and TechnologyZhenjiang 212003China School of Environmental Science and Engineering Nanjing Tech UniversityNanjing 211816China

The development of effective and sustainable solutions for pleiotropic water purification becomes urgent and *** Fenton-like catalysts for activation of peroxymonosulfate(PMS)to purify organic wastewater show great *** this work,by tuning metal loading with an in-situ polydopamine coating strategy,oxygen vacancy-enriched Co_(3)O_(4) loading on N-doped carbon nanotubes(CNTs)were constructed to enhance PMS activation efficiency for pollutants ***,the obtained modified CNTs afford a well-developed N-containing network structure,which is further endowed with abundant Co(Ⅱ)/Co(Ⅲ)redox cycles and significant metal-carbon *** particular,the surface N doping in CNTs might induce the oriented enrichment of pollutants around the catalyst,which reduces the migration distance and correspondingly improves the utilization of reactive oxidative *** electron transfer efficiency of the catalyst can be further improved by incorporating oxygen vacancy-enriched Co_(3)O_(4).The performance results show that the optimal NC/Co-1 could mineralize 20×10^(-6)of bisphenol A(BPA)by almost 98%in 8 min.A low reaction activation energy(26.05 kJ·mol^(-1))in BPA degradation was demonstrated by the NC/*** importantly,NC/Co-1 can inherit excellent degradation performance towards oxytetracycline,2,4-dichlorophenol,and tetracycline,showing wide practical *** addition,by virtue of the photothermal conversion property,NC/Co-1 achieves an additive function for interfacial solar water evaporation(1.84 kg·m^(-2)·h^(-1),112.51%),showing impressive potential for clean water recovery under complicated environmental pollution conditions.

关键词： Carbon nanotube Advanced oxidation process Co_(3)O_(4) Photothermal conversion Solar water evaporation

海岸带三重双向嵌套三维环流数值模型及其应用

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中国水利水电科学研究院学报 2006年第2期4卷 111-118页

作者：汤立群申锦瑜中国水利水电科学研究院泥沙研究所北京100044 Dalhouse大学哈利法克斯

在极坐标条件下,考虑流体等密度面的斜压性,建立了具有4阶精度的三重双向嵌套海洋环流三维原始方程数值模型,模型垂直方向采用z坐标不均匀分层,具有完全非线性和计算效率高的特性。嵌套系统由大模型(19km)、中模型(6km)和小模型(2km)嵌... 详细信息

在极坐标条件下,考虑流体等密度面的斜压性,建立了具有4阶精度的三重双向嵌套海洋环流三维原始方程数值模型,模型垂直方向采用z坐标不均匀分层,具有完全非线性和计算效率高的特性。嵌套系统由大模型(19km)、中模型(6km)和小模型(2km)嵌套而成,上一级模型为下一级模型提供动力和边界条件,且下一级模型将自己的动力要素反馈给上一级模型,各模型间相互作用相互交换资料。在具体实施时,每一个模型占用一个CPU,实行同步计算,三模型间每天交换信息一次。模型用体积输送流函数、不同水深处实测海温过程等资料进行验证,在此基础上,应用模型计算了西加勒比海及海岸带浅水区的水流分布特征、温度和盐度分布。计算结果表明,加勒比西海岸带的海流具有明显的季节性变化过程。

关键词：海岸带嵌套海洋环流数值模型

林农复合对沙地樟子松人工林土壤团聚体、有机碳及微生物生物量碳分配的影响

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生态学杂志 2017年第11期36卷 3036-3042页

作者：郭鑫炜李志远秦胜金周永斌魏亚伟沈阳农业大学林学院沈阳110161 辽宁辽河平原森林生态系统定位研究站辽宁昌图112500

为探究林农复合对土壤团聚体、土壤有机碳、土壤微生物生物量碳的影响,在辽西地区选取樟子松-花生、樟子松-谷子、樟子松纯林(对照)为研究对象,对其土壤团聚体、团聚体有机碳、土壤微生物生物量碳以及土壤有机碳含量及其分布特征进行研... 详细信息

为探究林农复合对土壤团聚体、土壤有机碳、土壤微生物生物量碳的影响,在辽西地区选取樟子松-花生、樟子松-谷子、樟子松纯林(对照)为研究对象,对其土壤团聚体、团聚体有机碳、土壤微生物生物量碳以及土壤有机碳含量及其分布特征进行研究。结果表明:(1)研究区土壤团聚体以0.053~0.25 mm粒级为主,占团聚体总量的37%~45%,其中樟子松-谷子的大团聚体(>0.25 mm粒级)含量最高。(2)两种林农复合各粒级团聚体有机碳含量变化显著不同(P樟子松纯林>樟子松-花生。(4)试验区土壤有机碳的积累主要受0.053~0.25 mm和>2 mm粒级团聚体含量的影响;另外,0~50 cm土壤剖面微生物生物量碳和有机碳相关分析表明,樟子松-谷子土壤微生物生物量碳与有机碳具显著相关性,而在樟子松-花生复合林地内无显著相关性;这说明不同营林措施对土壤有机碳和微生物的影响存在差异。综上,辽西地区樟子松-谷子复合措施有利于改善土壤结构,促进大团聚体的形成,对提高土壤保水、供肥能力,实现对土壤的保护和可持续利用具有较为明显的作用。

关键词：林农复合土壤团聚体微生物生物量碳土壤有机碳

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我国草种业的成就、挑战与展望

草业学报 2022年第6期31卷 1-10页

作者：南志标王彦荣贺金生胡小文刘志鹏李春杰聂斌夏超草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院甘肃兰州730020

本研究从种质资源收集、品种选育、种子生产和质量管理等方面总结了我国草种业发展取得的成就,分析了面临的挑战,提出了建设草种强国的建议。我国已初步建立了完整的草种业体系,已成为世界草种质资源保存大国,自1987年实施品种审定制度... 详细信息

本研究从种质资源收集、品种选育、种子生产和质量管理等方面总结了我国草种业发展取得的成就,分析了面临的挑战,提出了建设草种强国的建议。我国已初步建立了完整的草种业体系,已成为世界草种质资源保存大国,自1987年实施品种审定制度以来,已审定通过了651个草类植物新品种,在利用乡土植物优异基因和内生真菌创制新种质等方面,取得了突出成果。所育成品种基本可满足一般生产需求。种子田常年保有面积10万hm;左右,年产种子约10万t。已在全国建立了5个部级检验中心,并在品种审定、特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,种子立法等方面建成了较为完整的质量管理体系。面临的挑战是种质资源收集不及我国现有饲草种质资源数的50%,对已有种质资源评价、鉴定工作不足,缺少用于生态修复的草种和草坪草品种。根据国家生态修复规划,每年需草种7万t,目前缺口巨大,每年进口草种5万t左右,主要是高质量商品草和草坪草用种。质量管理体系中缺少种子认证。建议进一步加强种质资源收集、评价与利用;加强乡土草、草坪草及放牧型牧草选育;建立大规模草种生产基地及成果转化渠道;完善种子质量管理体系及提高对草的认识,从科技创新、人才培养、发展政策等方面予以支持。

关键词：草种业种质资源品种选育种子生产质量管理

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火焰原子吸收法测定蒙古奶茶中的钙、镁、锌

现代化工 2012年第2期32卷 94-96页

作者：张金生林静李丽华杨宏娟赵文涛辽宁石油化工大学化学与材料科学学院辽宁抚顺113001 辽宁石油化工大学石油化工学院辽宁抚顺113001

用火焰原子吸收光谱法(FAAS)测定蒙古奶茶中的微量元素钙、镁、锌。对测定条件、干扰因素、准确度和精密度进行了考察。用灰化法处理蒙古奶茶。对3种元素进行测定,结果表明,吸光度与浓度之间呈良好线性关系,钙、镁、锌回归方程分别为:A=... 详细信息

用火焰原子吸收光谱法(FAAS)测定蒙古奶茶中的微量元素钙、镁、锌。对测定条件、干扰因素、准确度和精密度进行了考察。用灰化法处理蒙古奶茶。对3种元素进行测定,结果表明,吸光度与浓度之间呈良好线性关系,钙、镁、锌回归方程分别为:A=0.1334C+0.0025(R2=0.9993),A=0.4838C+0.0311(R2=0.9998),A=0.2149C+0.0224(R2=0.9997)。3种不同的蒙古奶茶中的钙、镁、锌测定结果的RSD值均小于1.25%,回收率在95.0%～105.0%。

关键词：蒙古奶茶空心阴极灯钙镁锌

吉兰-巴雷综合征相关空肠弯曲菌cstⅡ基因序列对比研究

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中华微生物学和免疫学杂志 2011年第6期31卷 554-559页

作者：孙世超白欣立陈娟王莹邢丛丛付金生李震中河北医科大学第二医院神经内科石家庄050000

目的研究华北地区3株吉兰-巴雷综合征（Guillain-Barre syndrome，GBS）相关空肠弯曲菌（Campylobacter jejuni，***）的cstⅡ基因序列并寻找GBS相关及GBS无关的两类空肠弯曲菌菌株间可能与GBS致病性相关的基因突变位点和蛋白高级结构... 详细信息

目的研究华北地区3株吉兰-巴雷综合征（Guillain-Barre syndrome，GBS）相关空肠弯曲菌（Campylobacter jejuni，***）的cstⅡ基因序列并寻找GBS相关及GBS无关的两类空肠弯曲菌菌株间可能与GBS致病性相关的基因突变位点和蛋白高级结构变化，分析菌株间遗传进化关系。方法选取分离自GBS患者粪便并经动物模型证实为致GBS的3株空肠弯曲菌菌株进行培养并提取基因组DNA测序，与GenBank中GBS无关空肠弯曲菌基因序列进行配对对比，寻找两类菌株间可能导致空肠弯曲菌致病能力差异的cstⅡ基因碱基突变位点及蛋白高级结构改变，观察这种变化是否为GBS相关菌株的共性，并构建遗传进化树。结果与GBS无关菌株相比，3株致GBS菌株cstⅡ基因的氨基酸序列二级结构的第7个0L螺旋的165—180区段均被打开形成了折叠或转角，该变化在其他GBS相关菌株的二级结构变化中同样得到体现。实验中75％的GBS相关菌株cstⅡ基因为双功能，25％GBS相关菌株及所有GBS无关菌株cstⅡ基因为单功能。LL株与实验中涉及的GBS相关菌株在进化上高度类聚。结论双功能cstⅡ可能与空肠弯曲菌的致GBS特性相关。LL株cstⅡ基因在一定程度上反映了亚洲地区的GBS相关菌株cstⅡ基因的序列特征，为进一步探索GBS发病的地域性特点并对GBS菌株进行监测提供了资料。

关键词：吉兰-巴雷综合征空肠弯曲菌 cstⅡ基因序列分析二级结构