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Dear-DIA^(XMBD): Deep Autoencoder Enables Deconvolution of Data-Independent Acquisition Proteomics

Research 2024年第1期6卷 707-720页

作者： Qingzu He Chuan-Qi Zhong Xiang Li Huan Guo Yiming Li Mingxuan Gao rongshan yu Xianming Liu Fangfei Zhang Donghui Guo Fangfu Ye Tiannan Guo Jianwei Shuai Jiahuai Han Department of Physics and Fujian Provincial Key Laboratory for Soft Functional Materials ResearchXiamen UniversityXiamen 361005China Oujiang Laboratory(Zhejiang Lab for Regenerative Medicine Vision and Brain Health)and Wenzhou InstituteUniversity of Chinese Academy of SciencesWenzhouZhejiang 325001China School of Life Sciences Xiamen UniversityXiamen 361102China State Key Laboratory of Cellular Stress Biology Innovation Center for Cell Signaling NetworkXiamen 361102China Department of Computer Science Xiamen UniversityXiamen 361005China National Institute for Data Science in Health and Medicine School of MedicineXiamen UniversityXiamen 361102China Bruker(Beijing)Scientific Technology Co.Ltd. BeijingChina Westlake Laboratory of Life Sciences and Biomedicine Key Laboratory of Structural Biology of Zhejiang ProvinceSchool of Life SciencesWestlake University18 Shilongshan RoadHangzhou 310024China Institute of Basic Medical Sciences Westlake Institute for Advanced Study18 Shilongshan RoadHangzhou 310024China Westlake Omics Ltd. Yunmeng Road 1HangzhouChina Department of Electronic Engineering Xiamen UniversityXiamen 361005China

Data-independent acquisition(DIA)technology for protein identification from mass spectrometry and related algorithms is developing *** spectrum-centric analysis of DIA data without the use of spectra library from data-dependent acquisition data represents a promising *** this paper,we proposed an untargeted analysis method,Dear-DIA^(XMBD),for direct analysis of DIA ***-DIA^(XMBD) first integrates the deep variational autoencoder and triplet loss to learn the representations of the extracted fragment ion chromatograms,then uses the k-means clustering algorithm to aggregate fragments with similar representations into the same classes,and finally establishes the inverted index tables to determine the precursors of fragment clusters between precursors and peptides and between fragments and *** show that Dear-DIA^(XMBD) performs superiorly with the highly complicated DIA data of different species obtained by different instrument platforms.

关键词： Deep Auto Independent

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电厂集控运行汽轮机运行优化措施探讨

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现代工业经济和信息化 2020年第8期10卷 55-56页

作者：俞溶山内蒙古大唐国际托克托发电有限责任公司内蒙古呼和浩特010206

阐述了电厂汽轮机的概念,分析了电厂汽轮机运行能耗问题,研究了电厂汽轮机运行优化措施,以期保障电力企业的长远发展。

关键词：电厂集控系统汽轮机优化措施

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Multiplexed imaging mass cytometry reveals distinct tumor-immune microenvironments linked to immunotherapy responses in melanoma

Multiplexed imaging mass cytometry reveals distinct tumor-im...

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2022CCTB中国肿瘤标志物学术大会暨中国整合肿瘤学大会暨第十六届肿瘤标志物青年科学家论坛暨中国肿瘤标志物产业创新大会

作者： Xu Xiao Qian Guo Chuanliang Cui Yating Lin Lei Zhang Xin Ding Qiyuan Li Minshu Wang Wenxian Yang Yan Kong rongshan yu Xiamen University Peking University Cancer Hospital and Research Institute Zhongshan Hospital Xiamen University

Background:Single-cell technologies have enabled extensive analysis of complex immune composition,phenotype and interactions within tumor,which is crucial in understanding the mechanisms behind cancer progression and treatment ***,the knowledge on cell phenotypes and their spatial interactions at present has only limited utilization in guiding pathological stratification on patients based on their immune microenvironments for better clinical ***:Here we used imaging mass cytometry to simultaneously quantify 35 proteins in a spatially resolved manner on tumor tissues from 26 melanoma patients(14 responders and 12nonresponders) receiving anti-programmed cell death-1(anti-PD-1) ***:Combined single-cell and spatial analysis reveals highly dynamic tumor microenvironments(TMEs) that are characterized with variable tumor and immune cell phenotypes and their spatial organizations in melanomas,and many of these multicellular features are associated with response to anti-PD-1 *** further identify six distinct TME archetypes based on their multicellular compositions,and find that patients with different TME archetypes responded differently to anti-PD-1 ***,we find that classifying patients based on the gene expression signature derived from TME archetypes predicts anti-PD-1 therapy response across multiple validation ***:Our results demonstrate the utility of multiplex proteomic imaging technologies in studying complex molecular events in a spatially resolved manner for the development of new strategies for patient stratification and treatment outcome prediction.

关键词：

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地震扰动下四川省九寨沟县生态质量的时空变化及影响因素

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应用生态学报 2024年第8期35卷 2035-2043页

作者：万荣山于慧王瀚婕金秋雨马艳霞刘梦君中国科学院、水利部成都山地灾害与环境研究所成都610299 中国科学院大学北京101408 西南国土空间生态保护修复与综合整治工程技术创新中心成都610072 中国科学院成都生物研究所成都610299 中国科学院生态环境研究中心北京100085 四川省国土空间生态修复与地质灾害防治研究院成都610084

准确监测和评估地震扰动下生态环境质量变化,对区域生态环境恢复和保护具有重要意义。本研究针对九寨沟县2017年“8·8”地震,利用高精度遥感影像分析地震对区域植被破坏情况,基于GEE平台测算地震前、后及3年恢复期的遥感生态指数(RSEI)... 详细信息

准确监测和评估地震扰动下生态环境质量变化,对区域生态环境恢复和保护具有重要意义。本研究针对九寨沟县2017年“8·8”地震,利用高精度遥感影像分析地震对区域植被破坏情况,基于GEE平台测算地震前、后及3年恢复期的遥感生态指数(RSEI),分析地震扰动下四川省九寨沟县生态环境时空变化特征,并采用地理探测器揭示生态质量恢复时空差异的影响因素。结果表明:九寨沟县植被覆盖度由震前的0.71减少到震后的0.69,高覆盖区面积减少310.78km^(2),其余区域面积增加。RESI均值由震前0.50下降为震后0.42,3年恢复期后上升到0.45;震前、震后、恢复期的生态环境质量均以良和中等为主,主要分布在中部南部山脉和东部河谷地区。年降雨量、高程、湿度、绿度是九寨沟县生态质量恢复分异的主控因子,各因子间交互增强会影响区域生态环境质量恢复的空间分异。

关键词：生态环境质量遥感生态指数地理探测器地震九寨沟县

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基于SEIR-LSTM混合模型的新型冠状病毒肺炎传播趋势分析与预测

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厦门大学学报（自然科学版） 2020年第6期59卷 1034-1040页

作者：洪彬陈锦秀王连生俞容山厦门大学信息学院福建厦门361005

为了对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)传播趋势实现更精准的分析与预测,基于传统的传染病动力学模型SEIR(susceptible-exposed-infectious-recovered)和长短期记忆(long short-term memory,LSTM)深度学习网络构建了一种混合模型SEIR-LSTM,结合全国和湖北省的疫情数据进行分析与预测.从实验结果来看,相较于传统的机器学习、多项式拟合、普通的SEIR模型和单一的LSTM,所提出的混合模型能取得更高的疫情预测精度.最后给出了对疫情发展的预测,对疫情防控具有一定的应用价值和社会价值.

关键词：新型冠状病毒肺炎 SEIR模型长短期记忆混合模型

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Modulating CsPbl_(3)crystallization by using diammonium agent for efficient solar cells

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SusMat 2023年第6期3卷 894-908页

作者： Junming Qiu Qisen Zhou Mei yu Jianhua Liu rongshan Zhuang Yong Hua Liming Ding Xiaoliang Zhang School of Materials Science and Engineering Beihang UniversityBeijingChina yunnan Key Laboratory for Micro/Nano Materials&Technology School of Materials and EnergyYunnan UniversityKunmingChina National Center for Nanoscience and Technology BeijingChina

Cesium lead triiodide(CsPbI_(3))perovskite receives tremendous attention for photovoltaic applications,owing to its remarkable thermal stability and optoelectronic ***,realizing the CsPbI_(3)perovskite with high black-phase stability and optoelectronic properties remains a significant challenge,which largely affects the photovoltaic performance of perovskite solar cells(PSCs).Herein,aromatic ammonium agents are used to modulate the crystallization of the CsPbI_(3)perovskite to improve its black-phase stability and optoelectronic properties for efficient *** experimental studies and comprehensively theoretical calculations are performed,which reveal that histammonium dihydrochloride(HACl_(2))could strongly couple with the perovskite during its crystallization,leading to faster nucleation and slower perovskite growth,and thus modulating the crystallization dynamics of the ***,the residual diammonium cations(HA^(2+))distributed at the grain boundaries and on the surface of the perovskites can effectively passivate defects through electrostatic interactions,substantially suppressing trap-assisted nonradiative recombination,and prompting more matched perovskite surface ***,the photovoltaic performance of CsPbI_(3)PSCs is largely improved because of a combination of enhanced crystallinity and optoelectronic properties of the *** work offers a new avenue to prepare inorganic perovskites with high optoelectronic properties for photovoltaics.

关键词： crystallization modulation CsPbI_(3) diammonium salt optoelectronic property perovskite solar cells

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高钾血症管理规范——多科室合作全流程管理模式

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中华肾脏病杂志 2024年第3期40卷 245-254页

作者：叶智明蔡建芳陈崴程虹何强李荣山李湘民廖新学毛志国毛慧娟谭宁徐钢詹红张浩张健余学清广东省人民医院肾内科广州510030 中国医学科学院、北京协和医学院、国家心血管病中心、阜外医院肾内科北京100037 中山大学附属第一医院肾内科广州510080 首都医科大学附属北京安贞医院肾内科北京100011 浙江省人民医院肾内科杭州310014 山西省人民医院肾内科太原030000 中南大学湘雅医院急诊科长沙410013 中山大学附属第一医院心内科广州510080 海军军医大学第二附属医院肾内科上海200003 江苏省人民医院肾内科南京210029 广东省人民医院心内科广州510030 华中科技大学同济医学院附属同济医院肾内科武汉430030 中山大学附属第一医院急诊科广州510080 中南大学湘雅三医院肾内科长沙410013 北京协和医学院、中国医学科学院阜外医院、国家心血管病中心、心力衰竭中心、心衰重症监护病区北京100037

高钾血症是临床常见的离子代谢紊乱之一,国内外指南将血钾高于5.0 mmol/L定义为高钾血症。急性重度高钾血症可引起弛缓性麻痹、致死性心律失常,甚至心脏停搏等严重后果。肾素-血管紧张素-醛固酮系统抑制剂、β受体阻滞剂、保钾利尿剂的... 详细信息

高钾血症是临床常见的离子代谢紊乱之一,国内外指南将血钾高于5.0 mmol/L定义为高钾血症。急性重度高钾血症可引起弛缓性麻痹、致死性心律失常,甚至心脏停搏等严重后果。肾素-血管紧张素-醛固酮系统抑制剂、β受体阻滞剂、保钾利尿剂的应用,低钠高钾饮食以及相关合并症的存在均增加了高钾血症的发生。临床各科室均存在高钾血症风险人群,但缺乏医院多科室合作管理模式。为此,国内多位肾内科、心内科等领域专家讨论高钾血症医院多科室防治模式,制定了院内评估、预警、诊疗及管理规范流程,从而促进各科室更有效地参与院内高钾血症的诊疗以及慢性高钾血症的长期管理,提高全院高钾血症管理质量。

关键词：高钾血症跨部门合作组织和管理管理信息系统多科室合作全流程管理

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AVS无损音频编码标准——熵编码简介

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电声技术 2010年第12期34卷 69-71页

作者：黄海滨舒海燕俞容山陈帝佑 Rahardja Susanto 新加坡科研局资讯通信研究院新加坡138632

AVS无损音频编码标准,简称AVS-LS,是AVS工作组制定的用于无损压缩音频数据的新标准。AVS-LS采用线性预测和熵编码来对音频数据进行压缩,其中熵编码器用于对线性预测产生的残差信号进行归一化处理及算术编码。介绍了AVS-LS熵编码器的结... 详细信息

AVS无损音频编码标准,简称AVS-LS,是AVS工作组制定的用于无损压缩音频数据的新标准。AVS-LS采用线性预测和熵编码来对音频数据进行压缩,其中熵编码器用于对线性预测产生的残差信号进行归一化处理及算术编码。介绍了AVS-LS熵编码器的结构及原理,并对AVS-LS的编码效率进行了测试。测试结果表明:AVS-LS的编码效率略低于MPEG-4 ALS,但高于MPEG-4 SLS和FLAC。

关键词： AVS 无损压缩线性预测熵编码算术编码

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复杂工况下深水大跨度桥梁承台钢板桩围堰设计和施工控制

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价值工程 2024年第21期43卷 61-64页

作者：吴煜四川公路工程咨询监理有限公司成都610000

搞好大型河流上复杂工况下大跨度桥梁承台钢板桩围堰设计和施工,难度较大。为了安全、环保地完成大桥施工,以泸州市榕山长江大桥为典型工程案例,开展研究。阐述了泸州市榕山长江大桥的工程概况以及地形地貌条件、地质条件,分析了设计和... 详细信息

搞好大型河流上复杂工况下大跨度桥梁承台钢板桩围堰设计和施工,难度较大。为了安全、环保地完成大桥施工,以泸州市榕山长江大桥为典型工程案例,开展研究。阐述了泸州市榕山长江大桥的工程概况以及地形地貌条件、地质条件,分析了设计和施工的难点,研究了2#承台钢板桩围堰的设计和施工控制。本论文阐述了钢板桩围堰施工的措施、具体要求,完成了钢板桩围堰施工创新的阐述及其效果分析,提出了“套管旋挖钻引孔、钢板桩嵌岩、砂泥浆混合料填充止水”的成套施工技术;施工效果良好,研究成果有助于搞好深水大跨桥梁承台钢板桩围堰的设计、施工,还可以为类似工程提供借鉴和可靠的技术支撑。

关键词：大桥承台围堰设计施工

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麸曲酱香型白酒的酿制研究

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中国酿造 2010年第1期29卷 138-140页

作者：马荣山于影沈阳农业大学食品学院辽宁沈阳110161

采用麸曲法生产酱香型白酒,主要研究发酵过程中各成分变化规律,从而掌握麸曲酱香型白酒的酿制特点。结果表明:水分、酒度随发酵时间逐渐增加,酸度先增加后变缓慢,淀粉浓度前期下降较快,后期变化平稳。气相色谱分析,酒质成分丰富,酱香味... 详细信息

采用麸曲法生产酱香型白酒,主要研究发酵过程中各成分变化规律,从而掌握麸曲酱香型白酒的酿制特点。结果表明:水分、酒度随发酵时间逐渐增加,酸度先增加后变缓慢,淀粉浓度前期下降较快,后期变化平稳。气相色谱分析,酒质成分丰富,酱香味突出。

关键词：麸曲酱香型酒酿造分析

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