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Discovery of active compounds and key targets of Thymus quinquecostatus Celak. based on gastrointestinal metabolism and Gut flora-Compound-Target-Pathway network with TOPSIS method

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Food Science and Human Wellness 2024年

作者： Xueyang Ren Jiamu Ma Ying Dong Yuan Zheng Rufeng Wang Chongjun Zhao Wei Liu Mingxia Li Mengyu Sun Feng Zhang Yingyu He Xianxian Li qingyue deng Gaimei She School of Chinese Materia Medica， Beijing University of Chinese Medicine School of Life Sciences， Beijing University of Chinese Medicine Beijing Key Laboratory for Quality Evaluation of Chinese Materia Medica

Thymus quinquecostatus Celak.， a traditional aromatic edible plant from Lamiaceae， is widely used as food additive， food condiment， spice， and herbal teas. Its polyphenol-rich fraction （PRF） has been proven to be effective protective effect for cerebral ischemia reperfusion injury （CIRI） in our previous study. In this study， we developed a novel “Gut flora-Compound-Target-Pathway” （GCTP） network based on network pharmacology coupled with gastrointestinal metabolism for screening bio-active components， key targets and gut floras through the classical technique for order preference by similarity to ideal solution （TOPSIS） method. This compensates for the lack of gut floras and gastrointestinal metabolism in network pharmacology. Firstly， four incubation models covering simulated gastric juice， simulated intestinal juice， gut floras of normal and transient middle cerebral artery occlusion （tMCAO） rat in vitro were applied to PRF. The 109 proto-components and 64 metabolites were elucidated by UPLC-QE-Orbitrap-MSn. Then， the key targets of MMP9， PTGS2， FYN， ESR1， APP， and EGFR， and gut floras of Enterococcus avium LY1 were selected. Moreover， the selected key proto-components were rosmarinic acid， daidzein， quercetin， luteolin， apigenin， methyl rosmarinate， kaempferol， luteoloside， and caffeic acid， and the key metabolites were isokaempferide， isorhamnetin， isoquercetin， and mangiferin. Binding of compounds to the key proteins was analyzed by molecular docking， and also verified though a AAPH induced oxidative stress zebrafish model and qRT-PCR assays. This study provides a new idea and a better understanding of PRF for its protective effects on CIRI and its underlying mechanisms.

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Fufang E’jiao Jiang’s effect on immunity,hematopoiesis,and angiogenesis via a systematic“compound-effect-target”analysis

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Food Science and Human Wellness 2024年第5期13卷 2813-2832页

作者： Xiang Li Xiao Xu Ying Dong Shusheng Fan Xueyang Ren Yuan Zheng Jiamu Ma Feng Zhang qingyue deng Xianxian Li Yingyu He Mengyu Sun Wei Liu Mengxia Li Qing Xia Yan Zhang Gaimei She School of Chinese Materia Medica Beijing University of Chinese MedicineBeijing 102488China Biology Institute Qilu University of Technology(Shandong Academy of Sciences)Jinan 250103China National Engineering Research Center for Gelatin-based Traditional Chinese Medicine Dong-E-E-Jiao Co.Ltd.Liaocheng 252201China

Fufang E’jiao Jiang(FEJ)as a healthy food consisting of medicine food homology materials approved by China’s Ministry of Health has been extensively applied to replenish qi and nourish blood,and it has a positive impact on women’s *** find out the material basis and mechanism of FEJ,a systematic“compoundeffect-target”analysis including chemical composition resolution,zebrafish,network pharmacology,molecular docking,transcriptome,and bibliometric analysis was adopted.124 chemical components including ginsenosides,and phenylethanoid glycosides in FEJ were discovered,and effects of FEJ on promoting the generation of immune cells,erythropoiesis and angiogenesis in zebrafish were *** on network pharmacology,molecular docking and in vivo activity assay,6 compounds including jionoside A1,isoacteoside,echinacoside,acteoside,lobetyolin,and rehmannioside D were identified as active components of *** data showed that several pathways such as complement and coagulation cascades,ECM-receptor interaction,and PI3K-Akt signaling pathway were associated with proangiogenic effect of FEJ.19 common targets were obtained through combined analysis of network pharmacology and transcriptomics,and 5 targets of them were verified by *** bibliometric analysis of these common targets revealed that FEJ was related to energy metabolism,pathway in cancer,etc.,which was consistent with the results of network pharmacology and *** studies suggested that FEJ could replenish qi and nourish blood through multi-compound and multi-targets.

关键词： Fufang E’jiao Jiang Zebrafish(Danio rerio) Network pharmacology Transcriptome Bibliometrics

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端板对Savonius风力机启动性能的影响

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排灌机械工程学报 2024年第5期42卷 463-469页

作者：李岩邓晴月杨胜兵佟国强冯放东北农业大学工程学院黑龙江哈尔滨150030 寒地农业可再生资源利用技术与装备黑龙江省重点实验室黑龙江哈尔滨150030 东北农业大学文理学院黑龙江哈尔滨150030

为探究端板对Savonius风力机启动性能的影响,利用数值模拟和风洞试验相结合的方法对比研究了端板对两叶片、三叶片Savonius风力机在不同风速下的静态启动性能,并对流场进行了分析.结果表明:对于两叶片Savonius风力机,有端板风力机较无... 详细信息

为探究端板对Savonius风力机启动性能的影响,利用数值模拟和风洞试验相结合的方法对比研究了端板对两叶片、三叶片Savonius风力机在不同风速下的静态启动性能,并对流场进行了分析.结果表明:对于两叶片Savonius风力机,有端板风力机较无端板风力机平均启动力矩提升了85.4%(u=8 m/s),且反向启动力矩小,但无端板风力机启动力矩波动范围较有端板风力机小;对于三叶片Savonius风力机,有端板风力机较无端板风力机平均启动力矩提升了17.9%(u=8 m/s),但有端板风力机存在反向力矩,无端板风力机较有端板风力机整体力矩波动范围小且无反向启动力矩;端板的存在改变了叶片端部的流动情况和压力分布,叶片个数不同影响规律也不同.研究结果可以为Savonius风力机的结构设计提供参考.

关键词： Savonius风力机端板风洞试验数值模拟启动性能

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基于HPLC-Q-Exactive Orbitrap MS和特征分子网络技术快速鉴定滇白珠水提物化学成分

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中草药 2024年第11期55卷 3620-3634页

作者：王宇郑媛任雪阳董英马嘉慕邓清月和映玉李仙仙王秀环折改梅北京中医药大学中药学院北京100029 北京大学回龙观临床医学院北京回龙观医院北京100096

目的采用高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(HPLC-Q-Exactive Orbitrap MS)结合特征分子网络(feature-based molecular networking,FBMN)技术,对滇白珠Gaultherialeucocarpa ***水提物化学成分进行快速分析。方法采用Agilent ZorbaxEclipse XDB-C_(18)色谱柱(250 mm×4.6 mm,5μm),以乙腈-0.1%甲酸水为流动相进行梯度洗脱,体积流量为0.8 mL/min,在正、负离子模式下,采集滇白珠水提物MS/MS数据,并在全球天然产物社会分子网络(Global Natural Products Social Molecular Networking,GNPS)网站(http://***)上创建FBMN。根据Compound Discoverer软件及GNPS数据库匹配结果,结合化合物的精确相对分子质量、特征碎片离子、色谱保留时间,参考对照品、文献及Pubchem、Massbank数据库,快速鉴定滇白珠水提物的化学成分。结果共从滇白珠水提物中鉴定出130个成分,并区分了同分异构体,包括黄酮类40个、苯丙素类22个、糖苷类19个、有机酸类10个、生物碱类10个、酚类7个、萜类6个、酯类5个、氨基酸类4个、糖类3个、核苷酸类2个、醛类2个,其中5-O-咖啡酰奎宁酸、4-熊酰奎宁酸、邻苯二甲酸二丙酯这3个成分为根据FBMN结果推测解析。结论FBMN弥补了传统分子网络在鉴定同分异构体方面的不足,HPLC-Q-Exactive Orbitrap MS结合FBMN能快速、准确、全面地鉴定滇白珠水提物化学成分,可为其进一步开发与应用提供依据。

关键词：滇白珠水提物高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱特征分子网络 5-O-咖啡酰奎宁酸 4-熊酰奎宁酸邻苯二甲酸二丙酯

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山乌桕质量标准及急性毒性研究

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中国现代应用药学 2024年第4期41卷 512-519页

作者：吕芳许啸吴晓鹏游燕单东杰任雪阳李仙仙邓清月和映玉折改梅北京中医药大学北京100029 中国热带农业科学院分析测试中心海口571101 桂林市中医医院广西桂林541002

目的建立山乌桕药材的质量标准并进行急性毒性研究。方法对10批山乌桕药材进行性状鉴别、粉末显微鉴别、薄层色谱(thin-layer chromatography,TLC)鉴别研究,并采用HPLC建立特征图谱;采用电感耦合等离子体质谱(inductively coupled plasm... 详细信息

目的建立山乌桕药材的质量标准并进行急性毒性研究。方法对10批山乌桕药材进行性状鉴别、粉末显微鉴别、薄层色谱(thin-layer chromatography,TLC)鉴别研究,并采用HPLC建立特征图谱;采用电感耦合等离子体质谱(inductively coupled plasma-mass spectrometry,ICP-MS)法测定镉(Cd)、铅(Pb)、砷(As)、铜(Cu)、汞(Hg)5种重金属元素含量;以最大给药量法进行急性毒性研究。结果山乌桕药材外皮深褐色,内表面浅黄棕色,纤维性强。其粉末呈棕黄色,晶鞘纤维常见,草酸钙簇晶排列成行。供试品TLC图中,在对照品(东莨菪内酯、异秦皮啶)相应的位置上显相同颜色的荧光斑点;特征图谱中共标定5个共有峰,指认出3个特征峰(东莨菪内酯、异秦皮啶、白蜡树素)。所测重金属元素含量低于国家限量标准,测定方法学考察其线性相关系数R2>0.999,精密度、稳定性、重复性RSD<10%,平均加样回收率为80%~120%,RSD<10%。急性毒性试验最大给药量为184.09 g·kg^(-1),14 d内体质量、进食量、脏体比,大鼠血清中丙氨酸转氨酶、天冬氨酸转氨酶、尿素氮、肌酐水平与正常对照组比较无显著差异,未见明显毒性。结论所建标准可为山乌桕药材的质量评价提供参考。10批药材重金属含量在安全范围内;急性毒性试验表明山乌桕药材口服无明显不良反应,安全剂量范围大,为山乌桕药材后续开发利用提供了参考。

关键词：山乌桕质量标准电感耦合等离子体质谱重金属急性毒性

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基于Apriori和MIE算法分析关节炎中药制剂用药规律及核心药对的潜在作用机制

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中草药 2024年第9期55卷 3027-3040页

作者：翟桐杜佳璐任雪阳孙梦豫黎明霞刘薇和映玉李仙仙邓清月折改梅北京中医药大学中药学院北京100029

目的基于Apriori和MIE算法分析并总结《中国药典》2020年版中关节炎成方和单味制剂的用药规律。方法检索《中国药典》2020年版一部中治疗关节炎的成方制剂和单味制剂的信息。运用WPS Office Excel软件建立数据库,应用IBM SPSS Modeler 1... 详细信息

目的基于Apriori和MIE算法分析并总结《中国药典》2020年版中关节炎成方和单味制剂的用药规律。方法检索《中国药典》2020年版一部中治疗关节炎的成方制剂和单味制剂的信息。运用WPS Office Excel软件建立数据库,应用IBM SPSS Modeler 18.0软件中Apriori算法、MIE算法和Cytoscape 3.9.1进行关联规则分析、药对相关性分析等。选取MIE分析和关联规则分析中置信度和支持度相对较高的核心药物,进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,并进行成分-靶点-通路分析。结果共收集102个成方制剂和8个单味制剂,涉及中药271味,包含毒性中药42味,依频次高低排序前6的中药为当归、红花、乳香、没药、防风和独活。功效以祛风湿、补虚、活血化瘀为主,归经以肝经、脾经和肾经为主,四气以温为主,五味以辛为主。其中大毒中药6味,小毒中药19味,有毒中药17味,依频次高低排序前4的毒性中药为制川乌、制草乌、马钱子、樟脑。关联规则分析得到“没药-乳香”“乳香-没药-当归”等配伍最常见。MIE分析得到“党参-白芍”“狗脊-淫羊藿”等强相关潜在药对。其中,MIE分析和关联规则中支持度与置信度较高的药对为“当归-川芎”,药组为“当归-川芎-白芷”。网络药理学分析显示主要潜在活性成分为β-谷甾醇、豆甾醇、杨梅酮、阿魏酸等,核心靶点为PTGS2、HSP90AB1、CASP3、Bcl2、PTGS1、Bax等,主要涉及包含癌症相关通路、花生四烯酸代谢通路、亚油酸通路等。集群分析成方制剂以治疗风寒湿痹症为主。结论关节炎为正虚邪实证,治疗应以扶正驱邪、宣通脏腑、调达经络为主。毒性中药使用较多且用量较大,可增强疗效,但应该严格控制用量,防止中毒现象的发生。核心药对“当归-川芎”、核心药组“当归-川芎-白芷”的活性成分能够通过多种途径作用于多靶点防治关节炎。

关键词：关节炎数据挖掘用药规律毒性中药 MIE 网络药理学当归-川芎当归-川芎-白芷

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基于复杂网络-关联规则-模糊联合的菟丝子保健食品组方设计与评价研究

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中草药 2024年第2期55卷 540-550页

作者：李红叶于啊香孙梦豫张燕孔令梅黎明霞王春艳刘薇邓清月李仙仙和映玉折改梅北京中医药大学中药学院北京100029 山东省胶类中药技术创新中心山东聊城252200 东阿阿胶股份有限公司山东聊城252200 北京四环制药有限公司北京101113

目的应用数据挖掘技术分析含药食同源菟丝子的保健食品、中成药和方剂的组方规律,获得具有缓解疲劳和增强免疫力功能的潜在配方。方法借助国家市场监督管理总局特殊食品信息查询平台和药智网平台收集并组建含菟丝子的保健食品、中成药... 详细信息

目的应用数据挖掘技术分析含药食同源菟丝子的保健食品、中成药和方剂的组方规律,获得具有缓解疲劳和增强免疫力功能的潜在配方。方法借助国家市场监督管理总局特殊食品信息查询平台和药智网平台收集并组建含菟丝子的保健食品、中成药和方剂的数据库。利用复杂网络分析、Apriori关联规则算法、层次分析法(analytic hierarchy process,AHP)-基于指标相关性的指标权重确定方法(criteria importance though intercrieria correlation,CRITIC)组合赋权算法和自组织映射(self-organizing maps,SOM)聚类算法从单味药、药对和药组层面研究其组方规律并设计新配方,利用逼近理想解法(technique for order preference by similarity to an ideal solution,TOPSIS)和秩和比法(rank-sum ratio,RSR)的模糊联合对配方进行排序和评价。结果收集到45个保健食品、59个方剂、103个中成药,共142种原料,Apriori关联规则获得39对高频药对,SOM聚类将不同权重原料聚为8类。结合中医药传统理论,共获得28个潜在配方,根据模糊集理论,优化获得最优配方为菟丝子-熟地黄-杜仲-黄芪。结论以药食同源菟丝子为例,以缓解疲劳和增强免疫力功能为导向,结合数据挖掘技术和中医药传统理论,得到最优保健食品组,为中药类保健食品的配方设计提供新思路。

关键词：保健食品菟丝子数据挖掘模糊联合组方规律组方设计菟丝子-熟地黄-杜仲-黄芪

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基于层次分析法的罗汉果清咽通便双功能保健食品配方设计及“功效-频率-口感”多维度立体评价

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食品与发酵工业 2024年第3期50卷 268-275页

作者：杨语哲单东杰姚鉴玲吕芳马嘉慕宋若兰钟祥健董英邓清月李仙仙和映玉李瑞雯折改梅北京中医药大学中药学院北京100029

该研究设计以罗汉果为核心的具有清咽润喉和润肠通便双功能的保健食品配方,并对其进行综合评价。通过收集整理含罗汉果的保健食品批文、专利和中成药信息建立数据库,使用关联规则算法(Apriori)、层次分析法(analytic hierarchy process,... 详细信息

该研究设计以罗汉果为核心的具有清咽润喉和润肠通便双功能的保健食品配方,并对其进行综合评价。通过收集整理含罗汉果的保健食品批文、专利和中成药信息建立数据库,使用关联规则算法(Apriori)、层次分析法(analytic hierarchy process,AHP)、熵权法、逼近理想解排序法(technique for order preference by similarity to solution,TOPSIS)等机器学习算法挖掘其中原料药味配方规律。围绕药味类别、归经和现有处方类型构建AHP评价体系计算原料功效得分,同时对原料口感、频率赋值,以此为依据筛选药味并结合中医药理论进行配方。利用AHP计算“君臣佐使”权重向量,配方中所选原料的3项得分分别按君臣佐使加权后求和,得到“配方功效-配方频率-配方口感”矩阵,利用熵权法处理矩阵后使用TOPSIS法进行综合评价,实现配方设计。收集数据建立清咽通便双功能原料数据库,得到的40味原料以补虚药与清热药居多。其中经AHP评价功效得分较高(>1.0)的共有16种不同原料,除罗汉果外排名前5的分别为甘草、蜂蜜、玉竹、陈皮和西洋参。在此基础上,结合药对组合情况与原料口感得分,筛选得到包括罗汉果在内的11味候选原料,组成10个可能配方。对其进行熵权-TOPSIS分析评价后,由罗汉果、胖大海、麦冬、蜂蜜、甘草组成的配方排名第1位且与其他配方评分相差较大。该研究以罗汉果为例探究保健食品配方设计方法并实现配方多维度立体评价,为后续保健食品研发提供新的思路和方向。

关键词：保健食品罗汉果配方规律决策方法综合评价君臣佐使

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诊断超声激励微泡空化增强胰腺癌血流灌注的临床研究

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临床超声医学杂志 2024年第2期26卷 110-113页

作者：邓晴玥董小小韩峰林庆光云苗李安华刘政陆军军医大学第二附属医院超声科重庆市400037 中山大学肿瘤防治中心

目的探讨诊断超声激励微泡空化对胰腺癌血流灌注的增强效应。方法选取经病理组织学或细胞学证实的晚期胰腺癌患者21例,在每次临床化疗结束后120 min内对病灶进行诊断超声激励微泡空化治疗,空化治疗前后分别行超声造影动态观察肿瘤血... 详细信息

目的探讨诊断超声激励微泡空化对胰腺癌血流灌注的增强效应。方法选取经病理组织学或细胞学证实的晚期胰腺癌患者21例,在每次临床化疗结束后120 min内对病灶进行诊断超声激励微泡空化治疗,空化治疗前后分别行超声造影动态观察肿瘤血流灌注情况,并根据肿瘤区域时间-强度曲线分析峰值强度(PI)、曲线下面积(AUC),比较空化治疗前后各指标的差异。结果 21例胰腺癌患者共计进行84次化疗联合诊断超声激励微泡空化治疗,治疗后胰腺癌病灶PI由(109.19±2.64)dB增加到(110.62±2.70)dB,AUC由(4752.76±149.53)dB·s增加到(4863.67±159.77)dB·s,但与治疗前比较差异均无统计学意义(P=0.16、0.33)。结论诊断超声激励微泡空化可能会增加胰腺癌的血流灌注量,有望改善胰腺癌因乏氧、乏血供导致的化疗抵抗问题。

关键词：超声空化微泡胰腺癌化疗血流灌注

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山竹壳多糖微波辅助提取工艺优化及抗氧化性研究

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中国饲料 2021年第11期 30-36页

作者：张鹏邓清月唐森谢济运广西科技师范学院食品与生化工程学院广西来宾546199 广西科技师范学院特色瑶药资源研究与开发重点实验室广西来宾546199 广西科技师范学院实验实训中心广西来宾546199

为优化微波辅助提取山竹壳多糖的工艺条件,并研究其抗氧化活性,本试验考察了微波功率、微波时间、液料比3个因素对山竹壳多糖提取量的影响,在单因素试验的基础上,采用Box-Behnken响应面试验法对山竹壳多糖的微波辅助提取工艺条件进行考... 详细信息

为优化微波辅助提取山竹壳多糖的工艺条件,并研究其抗氧化活性,本试验考察了微波功率、微波时间、液料比3个因素对山竹壳多糖提取量的影响,在单因素试验的基础上,采用Box-Behnken响应面试验法对山竹壳多糖的微波辅助提取工艺条件进行考察,并通过测定山竹壳多糖对DPPH自由基和羟基自由基(·OH)的清除能力来评价其抗氧化性。结果表明:山竹壳多糖的最佳提取工艺为微波功率550 W、微波时间190 s、液料比35:1(mL/g),在此条件下,山竹壳多糖的提取量为17.83 mg/g(n=3,RSD=0.31%)。山竹壳多糖浓度为1.4 mg/mL时,对DPPH自由基和羟基自由基(·OH)清除率分别为88.31%和86.01%,IC50值分别为0.65 mg/mL和0.79 mg/mL。经Box-Behnken响应面优化得到的微波辅助提取工艺稳定、可靠,可用于山竹壳多糖的提取。山竹壳多糖具有较好的抗氧化活性。

关键词：山竹植物多糖响应面法抗氧化

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