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Virologica Sinica 2016年第5期31卷 425-436页

作者： Zheng Fang Jingxu Shao qingbei weng School of Life Sciences Guizhou Normal University

Cells of the P8-Se301-C1 strain are Spodoptera exigua cell clones that each harbor a partial version of the S. exigua multiple nucleopolyhedrovirus （SeMNPV） genome and which are resistant to homologous SeMNPV infections. The cells produce no viral progeny, suggesting that the infection is a latent-like viral infection. To investigate the SeMNPV genes harbored in the P8-Se301-C1 cells, the de novo transcriptomes of P8-Se301-Cl cells and S. exigua Se301 cells were analyzed and compared. A total of 54,569,296 reads were obtained from the P8-Se301-C1 cells that yielded 112,565 final unigenes with a mean length of 1,093 nt. A total of 56,865,504 reads were obtained from the Se301 cells that yielded 102,996 final unigenes with a mean length of 1,082 nt. Ten SeMNPV gene transcripts （se5, se7, se8, se12, se43, se45, se89, se90, se124, and se126） were detected in the P8-Se301-C1 cells by RNA-Seq but not in the Se301 cells, which was verified by RT- PCR. 5＇/3＇ RACE analyses showed that the 3＇- or 5＇-end sequences of the viral transcripts are aligned to the host gene sequences in P8-Se301-C1 cells, suggesting that the SeMNPV genes may integrate into and be transcribed with the host genes in the P8-Se301-C1 cells. Furthermore, six additional viral gene transcripts, sell, se42, se44, se88, se91, and se127 （incorporated into chimeric fusion transcripts in the P8-Se301-C1 cells）, were detected in the RACE analyses. Taken together, sixteen SeMNPV transcripts were identified in the P8-Se301-C1 cell strain. This study provides information to develop the understanding of baculovirus latent infections and superinfection exclusion.

关键词： RNA-Seq SeMNPV baculovirus latent infection Spodoptera exigua

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环境中的微生物与微生物在环境中的作用

微生物学通报 2024年第6期51卷 1811-1813页

作者：蒋建东翁庆北南京农业大学生命科学学院黔南民族师范学院

环境微生物学是一门研究微生物与其生活环境之间相互作用的科学，主要包括环境中的微生物和微生物在环境中的作用两大研究领域。《微生物学通报》本期推出的“环境微生物学主题刊”报道了研究报告21篇，内容涵盖环境微生物学研究前沿、... 详细信息

环境微生物学是一门研究微生物与其生活环境之间相互作用的科学，主要包括环境中的微生物和微生物在环境中的作用两大研究领域。《微生物学通报》本期推出的“环境微生物学主题刊”报道了研究报告21篇，内容涵盖环境微生物学研究前沿、环境微生物生态学及生物修复、环境微生物资源的发掘与利用、环境微生物生理学及生物制剂、环境污染修复与微生物多样性等领域，希望该主题刊的出版有助于促进我国环境微生物学领域的学术交流，推动我国环境微生物学学科的发展。

关键词：环境微生物学微生物群落结构与功能微生物降解微生物修复

TmNAS1,a nicotianamine synthase gene from Triticum monococcum improve Fe accumulation of transgenic tobacco under Fe stress

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TmNAS1,a nicotianamine synthase gene from Triticum monococcu...

圆锥南芥叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析

第十届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者： Xuye Du Jialian Wei Bin Zhu Feng Yu Hongcheng Wang Tuo Zeng qingbei weng Jiefang He School of Life Sciences Guizhou Normal University

Nicotianamine synthase(NAS) plays a key role in maintaining homeostasis of heavy metals in *** this study,the TmNAS1 gene from Triticum monococcum has been transformed into tobacco and the tolerance of Fe stress of transgenic and wild type(WT) tobacco was *** of TmNAS1 in tobacco led to enhance Fe stress tolerance,which was demonstrated by the growth and higher Fe content of transgenic tobacco plants compared with WT when exposed to 500 mM *** investigation showed that transgenic tobacco plants displayed lower malondialdehyde(MDA) level,higher contents of chlorophyll,Fe and proline accompanied by increased peroxidase(POD),superoxide dismutase(SOD),and catalase(CAT) *** results indicate that TmNAS1 plays a positive role in Fe tolerance by improving the antioxidant defense system.

关键词： TmNAS1 Fe tolerance transgenic tobacco molecular mechanism

来源： cnki会议评论

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分子植物育种 2022年第7期20卷 2261-2270页

作者：罗茜方正余婕翁庆北朱斌贵州师范大学生命科学学院贵阳550025 黔南民族师范学院都匀558000

为探究圆锥南芥(Arabis paniculata Franch)叶绿体基因组特征及密码子使用偏好性,本研究利用MISA、CUSP和CodonW等软件对圆锥南芥的叶绿体基因组的SSR位点、系统发育及密码子偏好性进行分析。研究结果表明,圆锥南芥的完整叶绿体基因组... 详细信息

为探究圆锥南芥(Arabis paniculata Franch)叶绿体基因组特征及密码子使用偏好性,本研究利用MISA、CUSP和CodonW等软件对圆锥南芥的叶绿体基因组的SSR位点、系统发育及密码子偏好性进行分析。研究结果表明,圆锥南芥的完整叶绿体基因组长度为153541 bp,基因组平均GC含量为36.41%,其IR、LSC及SSC区长度分别26419 bp、82679 bp及18024 bp。注释得到128个基因,包括85个蛋白编码基因,35个tRNA基因和8个核糖体rRNA基因。SSR分析共发现67个SSR位点,绝大多数属于单碱基重复的A/T类型。系统进化分析表明,圆锥南芥与所选的两个南芥属物种遗传距离较远,单独聚为一支。密码子偏好性分析显示,圆锥南芥叶绿体基因组密码子使用模式主要受到自然选择和突变双重因素的影响,共筛选出22个最优密码子,其中21个(95.45%)以A/U结尾。本研究可为圆锥南芥系统发育、叶绿体基因组密码子优化、外源基因表达效率以及进一步的遗传改良和育种相关研究提供参考依据。

关键词：圆锥南芥叶绿体基因组密码子偏好性

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聚羟基脂肪酸酯生产菌种及发酵工艺研究进展

太阳能学报 2024年第3期45卷 145-154页

作者：龙婷婷庄新姝周桂雄翁庆北方正吴庆珊贵州师范大学生命科学学院贵阳550025 中国科学院广州能源研究所广州510640

首先对聚羟基脂肪酸酯(PHAs)发酵菌种的选育情况及发酵特性进行比较全面的介绍,对已报道过的发酵工艺进行系统性综述、比较及分析。最后,归纳目前利用微生物发酵生产PHAs存在的问题,并对PHAs发酵菌种及工艺的未来发展趋势及重点研究方... 详细信息

首先对聚羟基脂肪酸酯(PHAs)发酵菌种的选育情况及发酵特性进行比较全面的介绍,对已报道过的发酵工艺进行系统性综述、比较及分析。最后,归纳目前利用微生物发酵生产PHAs存在的问题,并对PHAs发酵菌种及工艺的未来发展趋势及重点研究方向进行展望。

关键词：聚羟基脂肪酸酯菌种选育发酵工艺高效率低成本研究进展

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金钗石斛内生细菌的组成及多样性分析

植物资源与环境学报 2018年第1期27卷 79-90页

作者：吴庆珊雷珣雷友梅蒲星刘颖翁庆北贵州师范大学生命科学学院贵州贵阳550001

采用9种培养基对贵州省的赤水市旺隆镇(P1)、贵阳市贵州师范大学生命科学学院大棚(P2)和金沙县台金生态农业观光园(P3)内栽培的金钗石斛(Dendrobium nobile Lindl.)根、茎和叶中的内生细菌进行了分离,并采用扩增核糖体DNA限制性分析(ARD... 详细信息

采用9种培养基对贵州省的赤水市旺隆镇(P1)、贵阳市贵州师范大学生命科学学院大棚(P2)和金沙县台金生态农业观光园(P3)内栽培的金钗石斛(Dendrobium nobile Lindl.)根、茎和叶中的内生细菌进行了分离,并采用扩增核糖体DNA限制性分析(ARDRA)法对分离的内生细菌进行了多样性分析。结果表明:从3个样地金钗石斛的根、茎和叶中共分离出1 081株内生细菌,隶属2门5科12属40种1亚种,可分成41个OTUs;其中,芽孢杆菌属(Bacillus)和短芽孢杆菌属(Brevibacillus)为优势属,Bacillus subtilis ***和Brevibacillus invocatus为优势种(亚种)。金钗石斛的内生细菌在不同器官中的分布存在差异,根中内生细菌的菌株数量最多(695),且根中内生细菌的Shannon-Wiener多样性指数(2.20)和Margalef丰富度指数(5.81)均高于茎和叶中内生细菌,而叶中内生细菌的Pielou均匀度指数却最高(0.69);并且,茎和叶间内生细菌的Sorenson相似性系数最高(0.82),显著高于根和茎间以及根和叶间内生细菌的Sorenson相似性系数。3个样地金钗石斛内生细菌的共有OTUs有14个,分离菌株数占金钗石斛内生细菌分离菌株总数的96.5%;并且,3个样地金钗石斛内生细菌的Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数差异较小,仅P1样地金钗石斛内生细菌的Margalef丰富度指数明显高于P2和P3样地。NA、TSA、LB、KB、R2A和TB培养基从金钗石斛中分离出的内生细菌菌落数和OTU数量均高于YPD、YT和YG培养基。研究结果显示:金钗石斛体内含有丰富的内生细菌资源,并且,其内生细菌的组成和多样性与分离器官、种植地和培养基密切相关。

关键词：金钗石斛内生细菌扩增核糖体DNA限制性分析(ARDRA) 组成分析多样性分析

甜菜夜蛾Secrt基因克隆及其对甜菜夜蛾核型多角体病毒DNA复制的影响

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基因组学与应用生物学 2022年第8期41卷 1608-1616页

作者：韩敏敏孙紫德方正吴庆珊翁庆北贵州师范大学生命科学学院贵阳550000 黔南民族师范学院都匀558000

钙网蛋白(calreticulin,CRT)是一类真核生物中高度保守的Ca^(2+)结合蛋白,在病毒复制中起重要作用。为研究甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)Secrt基因及其在甜菜夜蛾核型多角体病毒(Spodoptera exigua multiple nucleopolyhedrovirus,SeMNPV)感染细胞中的作用,本研究以宿主Se301细胞cDNA为模板,通过无缝克隆技术获得Secrt基因的完整开放阅读框1200 bp,其编码399个氨基酸。SeCRT蛋白的相对分子量为45.86 kDa,生物信息学分析发现其含有信号肽、无跨膜结构域,含有2个O-糖基化位点及28个磷酸化位点,C结构域末端具ER驻留信号HDEL,是定位于内质网上的亲水性蛋白质。以最大似然法(Maximum likelihood method)构建系统进化树,聚类结果表明SeCRT与其他鳞翅目(Lepidoptera)昆虫CRT聚为一类,其中与斜纹夜蛾(Spodoptera litura)CRT的相似性高达98.25%。实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,RT-qPCR)检测表明,SeMNPV感染Se301细胞后,其Secrt基因表达在mRNA水平上呈现先降低后升高最终趋于平稳的趋势,表明Secrt基因响应病毒的感染。随后通过RNAi干扰技术敲低Secrt基因,发现SeMNPV病毒DNA复制减少43.4%,表明Secrt基因影响病毒DNA复制。研究结果为进一步阐明宿主基因Secrt在SeMNPV感染中的分子机理及病毒和宿主间相互作用机制奠定基础。

关键词：基因克隆钙网蛋白甜菜夜蛾核型多角体病毒(SeMNPV) 甜菜夜蛾病毒DNA复制

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重组型白菜的细胞学及分子遗传解析

贵州师范大学学报（自然科学版） 2017年第5期35卷 30-35页

作者：朱斌蔡梦鲜翁庆北李再云贵州师范大学生命科学学院贵州贵阳50001 华中农业大学植物科学技术学院湖北武汉430070

异源四倍体甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38)是研究异源多倍体植物起源、进化的一种模式植物。先前的研究中,通过甘蓝型油菜与近缘种植物杂交,诱导C亚基因组染色体优先消除,重建了祖先种白菜类型(restituted ***,RBR,AA)。本研究... 详细信息

异源四倍体甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38)是研究异源多倍体植物起源、进化的一种模式植物。先前的研究中,通过甘蓝型油菜与近缘种植物杂交,诱导C亚基因组染色体优先消除,重建了祖先种白菜类型(restituted ***,RBR,AA)。本研究通过雌蕊细胞染色体压片技术,扩增片段长度多态性(AFLP)技术对已获得的2个重组白菜及其连续自交后代进行细胞遗传及系统聚类分析。结果显示:2个重组白菜及其自交后代的染色体数稳定在2n=20;与天然白菜相比,RBR在表型上表现一些特有的性状;经AFLP分子标记分析RBR Oro与白菜"Chiifu"聚为一类,RBR ZS11与本土的白菜型油菜"白油1号"亲缘关系紧密。结论:重组白菜在染色体组水平上具有稳定性,且重组白菜主要依赖于亲本甘蓝型油菜的起源。

关键词：甘蓝型油菜重组型白菜扩增片段长度多态性遗传解析

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铅胁迫对不同品种玉米根系钾吸收的影响

分子植物育种 2024年第6期22卷 1968-1972页

作者：贺鹏亮崔玲翁庆北牛晓娟方正王玉倩贵州师范大学生命科学学院贵阳550001 黔南民族师范学院都匀558000

为阐明铅胁迫对植物根系钾吸收的机制及重金属铅植物修复的模式,本研究以不同浓度Pb^(2+)处理4种玉米,探究其对玉米总钾吸收速率和由NSCCs介导的钾吸收速率诱导的影响,以及4种玉米对Pb吸收的变化趋势。结果表明,Pb^(2+)可以影响NSCCs的... 详细信息

为阐明铅胁迫对植物根系钾吸收的机制及重金属铅植物修复的模式,本研究以不同浓度Pb^(2+)处理4种玉米,探究其对玉米总钾吸收速率和由NSCCs介导的钾吸收速率诱导的影响,以及4种玉米对Pb吸收的变化趋势。结果表明,Pb^(2+)可以影响NSCCs的钾吸收,但不同品种玉米根系NSCCs对铅的敏感性不同,随着Pb^(2+)浓度的增大,品种间的总钾吸收差异和NSCCs钾吸收差异趋近于零。‘金玉818’的铅吸收量增幅最显著,可作为潜在的铅污染治理的备选品种。本研究补充了玉米根系通过NSCCs进行离子吸收方面的资料,为进一步了解铅、钾离子的吸收机制提供了研究基础。

关键词：铅胁迫非选择性阳离子通道钾吸收

织金洞钟乳石沉积物表面可培养细菌多样性和网络分析

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微生物学通报 2021年第5期48卷 1514-1527页

作者：杨珺董乙乂吴庆珊方正牛晓娟王玉倩翁庆北贵州师范大学生命科学学院贵州贵阳550025 中国科学院西双版纳热带植物园热带森林生态学重点实验室云南勐腊666303 黔南民族师范学院贵州都匀558000

【背景】洞穴环境中蕴含丰富而独特的细菌资源,对洞穴环境中细菌的分离培养有助于了解洞穴细菌多样性及细菌资源的挖掘和利用。【目的】利用不同培养基分离细菌,探究钟乳石表面可培养细菌的多样性及其种间互作关系。【方法】通过11种培... 详细信息

【背景】洞穴环境中蕴含丰富而独特的细菌资源,对洞穴环境中细菌的分离培养有助于了解洞穴细菌多样性及细菌资源的挖掘和利用。【目的】利用不同培养基分离细菌,探究钟乳石表面可培养细菌的多样性及其种间互作关系。【方法】通过11种培养基对织金洞内钟乳石沉积物表面的细菌进行分离纯化,并利用16S rRNA基因序列分析初步确定分离菌株的分类地位。在R软件下,通过Bipartite包分析可培养细菌属间的相互作用。【结果】从钟乳石沉积物表面共分离出206株细菌,它们隶属于4门25属45种,香农(Shannon)指数为4.78,辛普森(Simpson)指数为0.95。变形菌门(Proteobacteria)和芽孢杆菌属(Bacillus)分别为样品中可培养细菌的优势门(47.09%)和优势属(29.61%)。无机寡营养培养基有助于洞穴钟乳石沉积物细菌的分离。属水平-采样点网络分析表明,可培养细菌分布具有非随机、显著的嵌套性。芽孢杆菌属(Bacillus)、德沃斯氏菌属(Devosia)、产碱杆菌属(Alcaligenes)、节杆菌属(Arthrobacter)和短杆菌属(Brevibacterium)在细菌群落中存在较多的有效合作值(Effective Partners)和亲密度(Closeness),被其他细菌所依赖程度(Species Strength)较高,是该群落中的重要组成类群。【结论】织金洞内钟乳石沉积物表面存在丰富的细菌资源,分析细菌类群在群落中的作用应结合细菌相对丰度和网络分析。

关键词：钟乳石沉积物可培养细菌多样性织金洞网络分析寡营养