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Uncovering key salt-tolerant regulators through a combined eqTL and GWAS analysis using the super pan-genome in rice

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National Science Review 2024年第4期11卷 55-69页

作者： Hua Wei Xianmeng Wang Zhipeng Zhang Longbo Yang qianqian Zhang Yilin Li Huiying He Dandan Chen Bin Zhang Chongke Zheng Yue Leng Xinglan cao Yan Cui Chuanlin Shi Yifan Liu Yang Lv Jie Ma Wenchuang He Xiangpei Liu qiang Xu qiaoling Yuan Xiaoman Yu Tianyi Wang Hongge qian Xiaoxia Li Bintao Zhang Hong Zhang Wu Chen Mingliang Guo Xiaofan Dai Yuexing Wang Xiaoming Zheng Longbiao Guo Xianzhi Xie qian qian Lianguang Shang Shenzhen Branch Guangdong Laboratory of Lingnan Modern AgricultureGenome Analysis Laboratory of the Ministry of Agriculture and Rural AffairsAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural Sciences Institute of Wetland Agriculture and Ecology Shandong Academy of Agricultural Sciences State Key Laboratory of Rice Biology China National Rice Research Institute National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement Institute of Crop Science Chinese Academy of Agricultural Sciences Yazhouwan National Laboratory

For sessile plants, gene expression plays a pivotal role in responding to salinity stress by activating or suppressing specific genes. However, our knowledge of genetic variations governing gene expression in response to salt stress remains limited in natural germplasm. Through transcriptome analysis of the Global Mini-Core Rice Collection consisting of a panel of 202 accessions, we identified 22 345 and 27 610expression quantitative trait loci associated with the expression of 7787 and 9361 e Genes under normal and salt-stress conditions, respectively, leveraging the super pan-genome map. Notably, combined with genome-wide association studies, we swiftly pinpointed the potential candidate gene STG5—a major salt-tolerant locus known as q STS5. Intriguingly, STG5 is required for maintaining Na+/K+homeostasis by directly regulating the transcription of multiple members of the Os HKT gene family. Our study sheds light on how genetic variants influence the dynamic changes in gene expression responding to salinity stress and provides a valuable resource for the mining of salt-tolerant genes in the future.

关键词： super pan-genome expression quantitative trait loci GWAS salt tolerance rice

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实-药芯多丝电弧复合焊中药芯焊丝位置对焊接稳定性的影响

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材料热处理学报 2024年第6期45卷 193-201页

作者：向婷方振龙马强曹增奎张健天津职业技术师范大学机械工程学院天津300222 天津市金桥焊材集团股份有限公司天津300300

为了实现高强钢的优质高效焊接,提出了一种全新的q960E高强钢的高效焊接工艺,即实-药芯多丝电弧复合焊工艺,该工艺通过一把集成式三丝焊枪实现两根实心焊丝复合一根药芯焊丝,既可以利用药芯焊丝实现焊接接头力学性能的优化,又可以利用3... 详细信息

为了实现高强钢的优质高效焊接,提出了一种全新的q960E高强钢的高效焊接工艺,即实-药芯多丝电弧复合焊工艺,该工艺通过一把集成式三丝焊枪实现两根实心焊丝复合一根药芯焊丝,既可以利用药芯焊丝实现焊接接头力学性能的优化,又可以利用3根焊丝实现高效焊接。其中药芯焊丝可以从两实心焊丝的正前方、正后方及侧面送入,通过对比分析焊接过程、焊道成形得出最佳药芯焊丝作用位置,并对最佳药芯焊丝作用位置下焊接接头的组织和显微硬度展开分析。结果表明:当药芯焊丝从正后方或侧面送入时,其中一根实心焊丝易与熔池接触发生短路过渡,前者会导致焊道宽窄不一,后者会导致焊道明显偏向药芯焊丝送入一侧。当药芯焊丝从正前方送入时,药芯焊丝呈一脉多滴过渡,且两实心焊丝均为一脉一滴过渡,此时焊接过程稳定,焊后焊道成形较好,焊道横截面形貌呈“双峰”状,是最佳的药芯焊丝送入位置。此外,当药芯焊丝从正前方送入时,焊缝区组织主要为细小的针状铁素体,粗晶区组织主要为粗大的板条马氏体和少量粒状贝氏体,细晶区组织主要为细小的马氏体,不完全淬火区组织主要为回火马氏体。此外,热影响区同时出现了软化和硬化现象,近不完全淬火区的母材硬度最低,仅为296 HV,完全淬火区硬度最高,达到396 HV,母材和焊缝区的硬度在320~340 HV之间。

关键词： q960E高强钢实-药芯多丝电弧复合焊药芯焊丝作用位置焊接稳定性焊道成形

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High-throughput phase-field simulations and machine learning of resistive switching in resistive random-access memory

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npj Computational Materials 2020年第1期6卷 1-10页

作者： Kena Zhang Jianjun Wang Yuhui Huang Long-qing Chen p.Ganesh Ye cao Department of Materials Science and Engineering University of Texas at ArlingtonArlingtonTX 76019USA Department of Materials Science and Engineering The Pennsylvania State UniversityUniversity ParkPA 16802USA Laboratory of Dielectric Materials State Key Laboratory of Silicon MaterialsCyrus Tang Center for Sensor Materials and ApplicationsSchool of Materials Science and EngineeringZhejiang UniversityHangzhou 310027China Center for Nanophase Materials Sciences Oak Ridge National LaboratoryOak RidgeTN 37831USA

Metal oxide-based Resistive Random-Access Memory(RRAM)exhibits multiple resistance states,arising from the activation/deactivation of a conductive filament(CF)inside a switching *** CF formation kinetics is critical to achieving optimal functionality of *** a phase-field model is developed,based on materials properties determined by ab initio calculations,to investigate the role of electrical bias,heat transport and defect-induced Vegard strain in the resistive switching behavior.

关键词： behavior layer phase

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持续与间歇内分泌治疗晚期前列腺癌的安全性及对miR-34b、miR-320a的影响

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临床医学研究与实践 2024年第1期9卷 81-85页

作者：曹振虎刘磊延安市人民医院泌尿外科陕西延安716000

目的探究持续与间歇内分泌治疗晚期前列腺癌的安全性及对miR-34b、miR-320a的影响。方法择取2018年3月至2021年5月我院收治的150例晚期前列腺癌患者作为研究对象,根据治疗方案不同将其分为对照组和观察组,各75例。对照组接受持续内分泌... 详细信息

目的探究持续与间歇内分泌治疗晚期前列腺癌的安全性及对miR-34b、miR-320a的影响。方法择取2018年3月至2021年5月我院收治的150例晚期前列腺癌患者作为研究对象,根据治疗方案不同将其分为对照组和观察组,各75例。对照组接受持续内分泌治疗,观察组接受间歇内分泌治疗。比较两组的治疗效果。结果观察组的不良反应总发生率低于对照组(ppSA)水平低于对照组(pq_(max))高于对照组,前列腺体积(pV)、膀胱残余尿量(pVR)低于对照组(pppSA表达,改善排尿功能,促进生活质量提升,且安全性更高,值得推广。

关键词：持续内分泌治疗间歇内分泌治疗晚期前列腺癌生活质量

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Constructions of Sidon spaces and cyclic subspace codes

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Frontiers of Mathematics in China 2022年第2期17卷 275-288页

作者： He ZHANG Xiwang cao Department of Mathematics Nanjing University of Aeronautics and AstronauticsNanjing 211100China School of Mathematics and Information Science Guangzhou UniversityGuangzhou 510006China Key Laboratory of Mathematical Modelling and High performance Computing of Air Vehicles(NUAA) MIITNanjing 211106China

In this paper,we firstly construct several new kinds of Sidon spaces and Sidon sets by investigating some known ***,using these Sidon spaces,we will present a construction of cyclic subspace codes with cardinality τ,q^(n)-1/q-1 and minimum distance 2k-2,whereτis a positive *** further-more give some cyclic subspace codes with size 2τ·q^(n)-1/q-1 and without changing the minimum distance 2k-2.

关键词： Sidon spaces Sidon sets cyclic subspace codes minimum distance

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熊果苷通过抑制巨噬细胞募集并调控Akt/NF-κB和Smad信号通路改善小鼠肝纤维化

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南方医科大学学报 2024年第4期44卷 652-659页

作者：曹家樊孙跃丁鑫李盛文陈博兰天广东药科大学药学院广东广州510006 广东药科大学中医药研究院广东广州510006 广东药科大学糖脂代谢病教育部重点实验室广东广州510006 广东药科大学、广东省代谢性疾病中医药防治重点实验室广东广州510006

目的探究熊果苷(Arb)对CCl4诱导的小鼠肝纤维化的保护作用及其机制。方法将24只C57BL/6小鼠随机分为对照组、模型组、Arb低剂量给药组(25mg/kg)和Arb高剂量给药组(50mg/kg),6只/组。通过腹腔注射CCl4建立肝纤维化小鼠模型,灌胃给药持续... 详细信息

目的探究熊果苷(Arb)对CCl4诱导的小鼠肝纤维化的保护作用及其机制。方法将24只C57BL/6小鼠随机分为对照组、模型组、Arb低剂量给药组(25mg/kg)和Arb高剂量给药组(50mg/kg),6只/组。通过腹腔注射CCl4建立肝纤维化小鼠模型,灌胃给药持续6周后取材。取血清进行生化指标检测,取肝组织进行HE染色、天狼猩红染色和免疫组化染色;q-pCR检测肝组织纤维化相关指标a-SMA,pdgfb,Col1α1,Timp-1基因以及炎症相关指标Ccl2和Tnf-a基因的mRNA水平;Westernblot法检测肝组织α-SMA蛋白表达水平。Transwell迁移实验使用Arb处理THp-1和RAW264.7细胞24h后,DApI染色检测迁移细胞数目。体外实验使用Arb处理LX-2细胞24h,Westernblot法检测Akt、p65、Smad3及其磷酸化p-Akt、p-p65、p-Smad3和α-SMA的蛋白水平。结果与模型组小鼠相比,Arb给药组小鼠血清谷丙转氨酶、谷草转氨酶水平降低(ppppdgfb,Col1α1,Timp-1,Ccl2和Tnf-a基因的mRNA水平(pp-1和RAW264.7细胞的迁移募集作用。体外实验显示,Arb可抑制LX-2细胞Akt、p65和Smad3的磷酸化,并且降低α-SMA的蛋白表达水平。结论Arb可通过减少巨噬细胞募集和浸润,同时干预Akt/NF-κB和Smad信号通路抑制肝星状细胞活化,从而改善小鼠肝脏炎症及纤维化。

关键词：熊果苷炎症肝纤维化巨噬细胞募集肝星状细胞

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基于孟德尔随机化研究房颤/房扑与失眠的因果关系

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医学新知 2024年第9期34卷 1019-1029页

作者：曹静王少卿首都医科大学附属北京天坛医院中医科北京100070

目的通过双样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法探究心房颤动(简称“房颤”)/心房扑动(简称“房扑”)与失眠潜在的双向因果关系。方法从IEU OpenGWAS project数据库中获取房颤/房扑和失眠的全基因组关联研究汇总数据... 详细信息

目的通过双样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法探究心房颤动(简称“房颤”)/心房扑动(简称“房扑”)与失眠潜在的双向因果关系。方法从IEU OpenGWAS project数据库中获取房颤/房扑和失眠的全基因组关联研究汇总数据,提取显著且独立的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNps)用于MR分析。采用逆方差加权法(inverse-variance weighted,IVW)、加权中位数、MREgger回归、简单众数法和加权众数法五种方法进行因果关系评估。Cochran's q检验评估IVW的异质性,MR-Egger检测水平多效性,MR-pRESSO方法检测离群值以检验基因多效性,留一法(leave-one-out)进行敏感性分析。结果以房颤/房扑为暴露,失眠为结局,共筛选获得47个SNps作为工具变量,IVW显示房颤/房扑与失眠间存在正向因果关系[OR=1.103,95%CI(1.008,1.208),pq检验p>0.05说明不存在异质性,MR-Egger检验p>0.05说明不存在水平多效性,同时MR-pRESSO方法未检测到离群值,表明没有基因多效性,留一法未检测到对结果影响大的SNp,表明结果稳固无偏倚。反向,以失眠为暴露,房颤/房扑为结局,筛选到12个SNps作为工具变量,IVW显示失眠与房颤/房扑间不存在因果关系[OR=0.989,95%CI(0.951,1.029),p>0.05)]。结论房颤/房扑会增加失眠的发生风险,在失眠患者的健康管理中应积极预防和治疗房颤、房扑等常见心律失常疾病。

关键词：房颤房扑失眠因果关系孟德尔随机化

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基于深度强化学习带时间窗的绿色车辆路径问题研究

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物流科技 2024年第19期47卷 72-79页

作者：曹煜叶春明上海理工大学管理学院上海200093

如何在客户规定的时间内合理安排车辆运输路线,一直是物流领域亟待解决的问题。基于此,文章提出使用基于软更新策略的决斗双重深度q网络(Dueling Double Deep q-network,D3qN),设计动作空间、状态空间与奖励函数,对带时间窗的绿色车辆... 详细信息

如何在客户规定的时间内合理安排车辆运输路线,一直是物流领域亟待解决的问题。基于此,文章提出使用基于软更新策略的决斗双重深度q网络(Dueling Double Deep q-network,D3qN),设计动作空间、状态空间与奖励函数,对带时间窗的绿色车辆路径问题进行建模与求解。选择了小、中、大规模的总计18个算例,将三种算法的实验结果在平均奖励、平均调度车辆数、平均里程和运算时间四个维度进行比较。实验结果表明:在大多数算例中,与Double DqN和Dueling DqN相比,D3qN能在可接受的增加时间范围内,获得更高的奖励函数,调度更少的车辆数,运输更短的里程,实现绿色调度的目标。

关键词：深度强化学习路径优化决斗双重深度q网络 D3qN算法车辆路径问题

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Interface dominated deformation transition from inhomogeneous to apparent homogeneous mode in amorphous/amorphous nanolaminates

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Journal of Materials Science & Technology 2022年第4期99卷 178-183页

作者： Z.q.Chen M.C.Li J.S.cao F.C.Li S.W.Guo B.A.Sun H.B.Ke W.H.Wang Songshan Lake Materials Laboratory Dongguan 523808PR China Institute of physics Chinese Academy of SciencesBeijing 100190PR China Institute of Materials Engineering Nanjing UniversityNantong 226019PR China School of physics Science and Technology Xinjiang UniversityXinjiang 830046PR China School of physical Sciences University of Chinese Academy of SciencesBeijing 100049PR China State Key Laboratory for Mechanical Behavior of Material Xi'an Jiaotong UniversityXi’an 710049PR China

The amorphous/amorphous nanolaminates(A/ANLs)have aroused great attentions owing to their tunable structure and enhanced mechanical ***,the plastic deformation mechanism of A/ANLs have yet been ***,we systematically examined the mechanical properties and deformation behavior of series of NiNb/ZrCuNi Al A/ANLs via nanoindentaion *** was found that both the amount and morphology of amorphous/amorphous interface(A/AIs)played crucial roles in the plastic deformation of A/*** and straighter A/AIs facilitated multiple shear banding deformation,of which the hardness increased with decreasing layer thickness,as the A/AIs hindered the propagation of shear bands(SBs).Whilst,more and wavier A/AIs promoted homogeneous deformation,of which the hardness stayed at a much lower value and was relatively irrelevant with the layer thickness,for the promoted activation of shear transformation zones by A/*** results provide guidance for modifying the mechanical properties of amorphous alloys with interface engineering design.

关键词： Amorphous alloys Nanolaminates Shear bands Hardness Interface

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Early paleozoic granitic magmatism related to the processes from subduction to collision in South Altyn, NW China

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Science China Earth Sciences 2015年第8期58卷 1513-1522页

作者： LIU Liang KANG Lei cao YuTing YANG Wenqiang State Key Laboratory of Continental Dynamics Department of Geology Northwest University Shandong provincial Key Laboratory of Depositional Mineralization & Sedimentary Minerals College of Earth Science & EngineeringShandong University of Science and Technology

Four episodes of granitic rocks at 517, 501-496, 462-451, and 426-385 Ma occurred in the South Altyn subduction-collision complex. The first episode of granite emplacement predates the formation of the ophiolite type mafic rock （〉500 Ma）, and the three subsequent episodes can be temporally correlated to high-pressure （Hp） to ultrahigh-pressure （UHp） metamorphism at ca 500 Ma, retrograde granulite-facies metamorphism at ca. 450 Ma, and amphibolite-facies metamorphism at ca. 420 Ma, re- spectively. A comprehensive study of these granitic rocks, along with the regional geological background, mafic-ultramafic rocks, and Hp-UHp metamorphism, indicates that the four episodes of granitic magmatism are sequentially derived from the partial melting of the earlier subducted oceanic crust at 517 Ma, the thickened continental crust due to continental subduction at ca. 500 Ma, the mid-upper crust in response to slab breakoff at ca. 450 Ma, and the tectonic transition from contraction to extension at ca. 420 Ma. The formation age of 517 Ma for oceanic adakite provides a direct constraint on the time of the oce- anic subduction in South Altyn. In addition, there is a ca. i0 Myr interval between the oceanic subduction to the continental deep subduction, suggesting that the Early paleozoic tectonic evolution might have been a successive process in South Altyn. The four episodes of formation of granitic rocks, mafic-ultramafic rocks, and Hp-UHp metamorphic rocks have fully recorded the tectonic evolution, beginning with the oceanic subduction, followed by continental subduction, and later exhumation dur- ing the Early paleozoic in South Altyn.

关键词： South Altyn granitic magmatism oceanic subduction continental deep subduction tectonic evolution

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