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色谱研究最新进展

化学通报 2014年第7期77卷 720-730页

作者：石先哲李攻科梁振郭志谋叶明亮闫竞宇许国旺中国科学院大连化学物理研究所大连116023 中山大学化学与化学工程学院广州510275

色谱作为一种强大的分离分析手段,为推动生物医学和人类健康、环境监测与保护、食品安全与质检等领域的发展提供着解决问题的关键技术。最近几年来,我国色谱学科经历了全面快速发展,取得了令人瞩目的成绩,研究水平和国际地位得到巨大提... 详细信息

色谱作为一种强大的分离分析手段,为推动生物医学和人类健康、环境监测与保护、食品安全与质检等领域的发展提供着解决问题的关键技术。最近几年来,我国色谱学科经历了全面快速发展,取得了令人瞩目的成绩,研究水平和国际地位得到巨大提升,色谱相关SCI论文发表数量居世界第一位。色谱应用领域也在不断扩大,尤其在蛋白质组学、代谢组学等新兴领域,以及药物、环境、食品分析等传统领域发挥越来越重要的作用。本文对近年来色谱学科(重点是我国色谱学科)在色谱技术、色谱填料和色谱柱、样品前处理方法、应用领域等方面的进展情况进行介绍。共引用109篇参考文献。

关键词：色谱蛋白质组学代谢组学分析

Integration of Liquid-Solid Phase Fractionation with RPLC-APCI／MS and MALDI-TOF MS for Analysis of Complex Samples

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Integration of Liquid-Solid Phase Fractionation with RPLC-AP...

Hippo通路在原发性肝癌发生发展中的作用

第十五次全国色谱学术报告会

作者： Hanfa Zou, Xueguo Chen, Songchen Pan, Lianghai Hu, mingliang ye, Songyun Xu National Chromatographic R&A Center, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, 457 Zhongshan Road, Dalian 116023, China.

＜正＞An approach for integration of liquid-solid fractionation to RPLC-APCI/MS and MALDI-TOF MS analysis is particularly developed for separation and identification of low-mass compounds in the complex samples. By this approach, a sample is fractionated with the solid-phase extraction cartridges, particles packed and monolithic HPLC columns, respectively. The collected fractions are further enriched and analyzed

关键词：

来源： cnki会议评论

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临床肝胆病杂志 2020年第5期36卷 1171-1174页

作者：洪莹晖王纯叶明亮罗杰刘佳良任超蓝偲瑜赵秋常莹武汉大学中南医院消化内科湖北省肠病医学临床研究中心肠病湖北省重点实验室武汉430071

原发性肝癌在全球范围内发病率持续上升,发病年龄趋于年轻化,并且总体预后不良。Hippo通路作为最经典的感知细胞极性和密度、机械信号转导并促进细胞增殖、器官发育的调节器,能够促进包括原发性肝癌在内多种癌症的发生发展。YAP作为Hipp... 详细信息

原发性肝癌在全球范围内发病率持续上升,发病年龄趋于年轻化,并且总体预后不良。Hippo通路作为最经典的感知细胞极性和密度、机械信号转导并促进细胞增殖、器官发育的调节器,能够促进包括原发性肝癌在内多种癌症的发生发展。YAP作为Hippo通路的经典核效应器在原发性肝癌中显著上调,并且促进原发性肝癌耐药的发生。原发性肝癌中Hippo信号通路的失调与肝癌的发生发展相联系,Hippo信号通路作为原发性肝癌发生的早期事件,影响原发性肝癌耐药的发生机制,这对于探索新的原发性肝癌临床治疗策略具有重要意义。

关键词：肝肿瘤信号传导 Hippo通路

加权基因共表达网络分析联合免疫浸润分析筛选肝癌关键基因

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武汉大学学报（医学版） 2023年第4期44卷 480-484页

作者：刘佳良王纯叶明亮罗杰洪莹晖常莹武汉大学中南医院消化内科/湖北省肠病临床研究中心/肠病湖北省重点实验室湖北武汉430071

目的:通过生物信息学方法筛选肝细胞癌中免疫细胞浸润相关的关键基因,为肝癌免疫治疗提供新的思路。方法:从GEO数据库中下载GSE15765肝癌组织的基因表达数据,应用ImmuCellAI数据库对下载的肝癌表达数据进行免疫浸润分析,得到各个肝癌组... 详细信息

目的:通过生物信息学方法筛选肝细胞癌中免疫细胞浸润相关的关键基因,为肝癌免疫治疗提供新的思路。方法:从GEO数据库中下载GSE15765肝癌组织的基因表达数据,应用ImmuCellAI数据库对下载的肝癌表达数据进行免疫浸润分析,得到各个肝癌组织中的免疫细胞的浸润评分;在R语言中使用WGCNA包对肝癌表达数据构建加权基因共表达网络,筛选与免疫细胞浸润相关的共表达网络基因模块,挑选相关模块中的枢纽基因(hub gene)。利用Metascape数据库对枢纽基因进行功能富集分析。STRING数据库联合Cytoscape软件用于获取连结度最高的前10个基因,并通过Kaplan-Meier Plotter网站绘制关键基因在肝癌患者中的生存曲线图。结果:R中使用WGCNA分析GEO下载的70例肝细胞癌数据,共得到10个基因模块。分析ImmuCellAI得到的免疫浸润评分与各个基因模块的相关性,并绘制热图;其中,褐色模块和肝癌组织巨噬细胞浸润有着较高的相关性(P<0.001,cor=0.79),筛选模块内免疫相关的枢纽基因共得到72个。功能富集分析显示枢纽基因主要涉及白细胞激活、淋巴细胞激活、吞噬作用、免疫调节等生物学功能。枢纽基因的蛋白质互作网络分析筛选连接度高的基因得到LCP2、ITGB2、TYROBP、CD86等基因;从中挑选LCP2分子作为关键分子,生存分析显示LCP2低表达与肝癌患者预后不良相关(P=0.0054)。结论:LCP2被筛选作为肝细胞癌巨噬细胞浸润的有关的关键基因,可作为肝细胞癌免疫治疗的潜在靶点。

关键词：肝细胞癌免疫浸润加权基因共表达网络分析生物信息

江淮丘陵区土壤可蚀性K值研究——以肥东县为例

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中国农学通报 2020年第1期36卷 105-111页

作者：管飞叶明亮马友华安徽农业大学资源与环境学院合肥230036

水土流失是当前较为严重的环境问题之一。江淮丘陵区是水土流失较为严重的区域。本研究以肥东县为例研究土壤侵蚀问题,依据第二次土壤普查资料,采用分段3次Hermite插值法对土壤质地粒径进行转换及几何平均粒径修正模型进行计算,运用数... 详细信息

水土流失是当前较为严重的环境问题之一。江淮丘陵区是水土流失较为严重的区域。本研究以肥东县为例研究土壤侵蚀问题,依据第二次土壤普查资料,采用分段3次Hermite插值法对土壤质地粒径进行转换及几何平均粒径修正模型进行计算,运用数理统计方法及SPSS相关性分析和ArcGIS软件地统计分析对研究区土壤质地类因子和可蚀性K值特征进行了研究。结果表明:(1)水稻土、黄褐土土壤质地组分含量变异系数差异较显著,黄棕壤变异系数差异较低;(2)水稻土、黄褐土质地类各因子主要通过CLA和Dg对土壤可蚀性进行作用,且均为负向作用;(3)肥东县土壤可蚀性K均值为0.02797,水稻土0.0279,黄褐土0.0281,黄棕壤0.0263;(4)不同土壤质地K值平均值中粉壤土最大,砂壤土最小,且土壤质地K值均呈弱变异性;(5)肥东县土壤可蚀性以中等可蚀性、高可蚀性为主。肥东县土壤可蚀性K值空间分布呈现由北向南先降低、后增高、再降低的趋势,由东向西逐渐增高的趋势,存在极大的土壤侵蚀风险。

关键词：土壤可蚀性土壤质地 K值江淮丘陵区 GIS

B(A)血型分子生物学鉴定及家系调查——附6例报告

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中国输血杂志 2015年第12期28卷 1469-1472页

作者：武文张业翠姜志坚张志波叶明亮济南军区总医院输血科解放军71761部队

目的探讨稀有B(A)血型的遗传特性、鉴定方法及输血策略。方法对6例ABO定型正反不符的标本,采用试管法做血清学鉴定、流式细胞分析仪做表型鉴定、DNA序列测定方法等做分子生物学鉴定及相关家系分析,研究B(A)血型的遗传学特点,并讨论B(A)... 详细信息

目的探讨稀有B(A)血型的遗传特性、鉴定方法及输血策略。方法对6例ABO定型正反不符的标本,采用试管法做血清学鉴定、流式细胞分析仪做表型鉴定、DNA序列测定方法等做分子生物学鉴定及相关家系分析,研究B(A)血型的遗传学特点,并讨论B(A)血型献血者与受血者临床安全和合理用血。结果血清学表现为ABO血型正反定型不一致,正定型为AB型,且H抗原明显增强,反定型血清中存在抗-A1,初定为AwB型。测序表明:第7外显子在B101序列的基础上,出现了B(A)02型nt700C/G的典型等位基因突变。结论通过血清学及分子生物学方面的分析,确定6例标本的基因型皆为B(A)02型与O01型杂合,B(A)血型患者应尽量配合性输注O型或B型洗涤红细胞及AB型血浆。

关键词： B(A)血型基因突变流式细胞分析术

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开管毛细管电色谱进展

分析测试学报 1999年第1期18卷 78-82页

作者：叶明亮邹汉法刘震朱军张玉奎中国科学院大连化学物理研究所国家色谱研究分析中心

开管毛细管电色谱是近年发展起来的一种高效、快速的新型微柱分离方法。它是在毛细管管壁涂布或键合固定相，以电渗流驱动流动相的一种色谱分离模式。该文对开管毛细管电色谱的发展、柱制备、理论进行了较为详细的综述。

关键词：毛细管电色谱开管柱 OTCEC

蛋白质组衍生肽段文库用于鉴定酪蛋白激酶2的底物模体

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色谱 2011年第8期29卷 706-711页

作者：张曼玉王春丽边阳阳程凯卫晓鸾叶明亮邹汉法中国科学院大连化学物理研究所中国科学院分离分析化学重点实验室国家色谱研究分析中心辽宁大连116023

模体是蛋白质二级结构上的一种特征序列,激酶底物通常具有一类特征性的模体,识别底物模体对鉴定激酶底物具有重要意义。为了快速鉴定激酶底物模体,将全细胞蛋白质酶解液作为肽段文库的来源,采用碱性磷酸酶去除肽段的固有磷酸化后构建了... 详细信息

模体是蛋白质二级结构上的一种特征序列,激酶底物通常具有一类特征性的模体,识别底物模体对鉴定激酶底物具有重要意义。为了快速鉴定激酶底物模体,将全细胞蛋白质酶解液作为肽段文库的来源,采用碱性磷酸酶去除肽段的固有磷酸化后构建了用于筛选激酶底物模体的肽段文库。该肽段文库是大量非磷酸化肽段的混合物,将此混合肽段与酪蛋白激酶2和三磷酸腺苷作用30min后,通过固定化金属离子亲和色谱法富集磷酸化肽段,采用反相液相色谱-串联质谱分析,成功地鉴定到472条非冗余底物肽段,包含451个非冗余磷酸化位点,并由此得到底物模体S/T-D/E-x-D/E。该法能够快速准确地筛选出激酶底物模体,对研究激酶-底物识别以及信号转导过程具有重要意义。

关键词：固定化金属离子亲和色谱反相液相色谱-串联质谱模体激酶肽段文库蛋白质组学

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赖氨酸胍基化对蛋白质组分析的影响

色谱 2014年第4期32卷 376-380页

作者：郑昊毛家维潘彦博刘忠山刘哲益叶明亮邹汉法中国科学院分离分析化学重点实验室国家色谱研究分析中心中国科学院大连化学物理研究所辽宁大连 116023 中国科学院大学北京 100049

赖氨酸胍基化在蛋白质组学定性和定量研究中起着重要作用,本文系统分析了胍基化前后,HeLa细胞蛋白质经胰蛋白酶酶解产生的3种不同类型肽段的质谱鉴定情况,并探讨了不同肽段质谱响应改变的内在原因。发现赖氨酸在侧链能选择性地发生胍基... 详细信息

赖氨酸胍基化在蛋白质组学定性和定量研究中起着重要作用,本文系统分析了胍基化前后,HeLa细胞蛋白质经胰蛋白酶酶解产生的3种不同类型肽段的质谱鉴定情况,并探讨了不同肽段质谱响应改变的内在原因。发现赖氨酸在侧链能选择性地发生胍基化反应(其选择性达到96.8%),转化为高精氨酸,碱性增强。因此在正离子质谱模式下,C端为赖氨酸的肽段产生了更多的y离子,提供了许多新的离子碎片信息。在鉴定结果中,此类肽段所占总肽段的比例由原来的51.7%上升为57.3%,并且有1 015条新的肽段被检测到。对于不含有赖氨酸的肽段,其鉴定结果在胍基化前后基本没有变化。结果表明,胍基化可以在一定程度上提高质谱鉴定的灵敏度和互补性,提高蛋白质分析的覆盖率。

关键词：质谱蛋白质组学胍基化肽段碎裂