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Single-cell transcriptome atlases of soybean root and mature nodule reveal new regulatory programs that control the nodulation process

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Plant Communications 2024年第8期5卷 69-91页

作者： Sergio Alan Cervantes-Perez Prince Zogli Sahand Amini Sandra Thibivilliers Sutton Tennant Md Sabbir Hossain Hengping Xu Ian Meyer Akash Nooka Pengchong Ma Qiuming Yao michael j.naldrett Andrew Farmer Olivier Martin Samik Bhattacharya jasper Klaver Marc Libault Department of Agronomy and Horticulture University of Nebraska-LincolnLincolnNE 68503USA Division of Plant Science and Technology College of AgricultureFoodand Natural ResourcesUniversity of Missouri-ColumbiaColumbiaMO 65211USA Interdisciplinary Plant Group of Missouri-Columbia ColumbiaMO 65211USA School of Computing University of Nebraska-LincolnLincolnNE 68503USA Proteomics and Metabolomics Facility Center for BiotechnologyUniversity of Nebraska-LincolnLincolnNE 68588USA National Center for Genome Resources Santa FeNM 87505USA INRAE UniversiteParis-SaclayInstitut des Sciences des Plantes de Paris SaclayIPS2Batiment 630 Plateau du MoulonRue Noetzlin91192 Gif sur Yvette CedexFrance Resolve Biosciences Monheim am RheinGermany Present address:The School of Plant Sciences University of ArizonaTucsonAZ 85721USA Present address:GALY Co. 100 Hood Park Dr.BostonMA 02126USA

The soybean root system is *** addition to being composed of various cell types,the soybean root system includes the primary root,the lateral roots,and the nodule,an organ in which mutualistic symbiosis with N-fixing rhizobia occurs.A mature soybean root nodule is characterized by a central infection zone where atmospheric nitrogen is fixed and assimilated by the symbiont,resulting from the close cooperation between the plant cell and the *** date,the transcriptome of individual cells isolated from developing soybean nodules has been established,but the transcriptomic signatures of cells from the mature soybean nodule have not yet been *** single-nucleus RNA-seq and Molecular Cartography technologies,we precisely characterized the transcriptomic signature of soybean root and mature nodule cell types and revealed the co-existence of different sub-populations of ***-infected cells in the mature soybean nodule,including those actively involved in nitrogen fixation and those engaged in *** of the single-cell-resolution nodule transcriptome atlas and the associated gene co-expression network confirmed the role of known nodulation-related genes and identified new genes that control the nodulation *** instance,we functionally characterized the role of GmFWL3,a plasma membrane microdomain-associated protein that controls rhizobial *** study reveals the unique cellular complexity of the mature soybean nodule and helps redefine the concept of cell types when considering the infection zone of the soybean nodule.

关键词： soybean root nodule single-cell RNA-seq nanodomains

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含硫化物镁铁质-超镁铁质侵入体中橄榄石Mg、Ni含量的制约:原理、模式及Voisey's Bay侵入体样品研究(英文)

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地学前缘 2007年第5期14卷 177-185页

作者： Anthony j.naldrett Edward M.Ripley Department of Geology University of TorontoToronto M5S 3B1Canada Department of Earth Sciences Indiana UniversityBloomingtonIN 47405USA

镁铁质-超镁铁质岩浆结晶分离早期形成镁铁矿物,镁铁矿物中的Ni和Mg是相容元素。随着结晶分离作用的进行,Ni、Mg在硅酸盐岩浆及后形成的硅酸盐物质中的丰度下降。橄榄石中Ni含量及硅酸盐物质MgO/FeO比值都与母岩浆的相关值相关,据此可... 详细信息

镁铁质-超镁铁质岩浆结晶分离早期形成镁铁矿物,镁铁矿物中的Ni和Mg是相容元素。随着结晶分离作用的进行,Ni、Mg在硅酸盐岩浆及后形成的硅酸盐物质中的丰度下降。橄榄石中Ni含量及硅酸盐物质MgO/FeO比值都与母岩浆的相关值相关,据此可推断母岩浆的信息,它们之间可由实验测得的系数相联系。当岩浆饱和硫化物时,在结晶分离过程中硫化物珠滴会与镁铁硅酸盐物质一道析出,同时,与硫化物非饱和岩浆相比,过多的Ni会随之析出。这也反映在Ni、Mg含量比无硫化物分离时有更迅速的降低上。Ni、Mg含量变化值可以在VoiseysBay侵入体的模式曲线上反映出,加拿大Labrador的这一侵入体赋存了一个世界级的Ni-Cu-Co硫化物矿床。过去的作法是将侵入体中橄榄石的Ni、Mg含量与Simkin和Smith得出的各种火成岩中橄榄石的Ni、Mg含量相比较以确定Ni亏损,进而假定橄榄石来自硫化物饱和、有经济价值的岩浆。现在的研究显示这种简单的对比会导致错误。将样品数据与模式曲线对比并反映出侵入体矿物结晶堆积特征是重要的方法。使用这一方法,样品数据能很好地被模式曲线拟合。以在VoiseysBay的研究为例,当硫化物液相与硅酸盐矿物被去除后,硫化物非饱和的分离作用期就会显现出来,随后是硅酸盐结晶作用期。

关键词：橄榄石镍基性-超基性岩浆硫化物矿床

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层理侵入体中铂族元素富集模式

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地质地球化学 1991年第6期19卷 47-55页

作者： A. j. naldrett 李朋四川地矿局总工办

随着层理侵入体岩浆的分异作用,溶解度的变化表现为:远在岩浆中斜长石于液相线晶出之前,该岩浆与新鲜注入的初始未分异岩浆的混合可能造成铬铁矿饱和,但不会导致硫化物的饱和。然而,当斜长石作为一种堆积矿物相从残余岩浆中晶出或即将... 详细信息

随着层理侵入体岩浆的分异作用,溶解度的变化表现为:远在岩浆中斜长石于液相线晶出之前,该岩浆与新鲜注入的初始未分异岩浆的混合可能造成铬铁矿饱和,但不会导致硫化物的饱和。然而,当斜长石作为一种堆积矿物相从残余岩浆中晶出或即将片晶出时,这种混合作用可以导致硫化物的饱和,就可以以此方式产生富含硫化物,并因而富含铂和钯的层位。这一机理可以说明斯提沃特杂岩体和布什维尔德杂岩体中铬铁岩和含硫化物“矿层”中Pt和Pd的分布。该含硫化物矿层被解释为硫化物的“分批分凝”的结果,而这种硫化物批料被认为是由湍流热缕中的含矿岩浆产生的,随后被湍流对流作用悬浮在岩浆中,这就为硫化物与岩浆之间达到彻底的平衡提供了机会。在层理侵入体分异过程的任何阶段,岩浆的简单结晶作用都可能导致硫化物的分凝,这取决于岩浆中硫化物接近初始饱和程度;但是以这种方式分凝的硫化物含量不可能大于同一时间结晶的堆积硅酸盐的2wt％。津巴布韦大岩墙中的Ⅰ(3)、Ⅱ和Ⅱ硫化物被认为是依此分凝过程的产物——硫化物形成的。而岩浆混合作用被认为对“大岩墙’的主硫化物带(Ⅰ(1)和Ⅱ(2)带)的形成起了作用。安大略省列岛湖杂岩体中的洛比(Robie)矿床的野外关系表明,含矿的宿主辉长岩经历了部分熔融和角砾岩化作用。

关键词：铂族元素富集层理侵入体

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镁铁质、超镁铁质岩石中的硫化物矿床

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宝石和宝石学杂志(中英文) 1988年第4期 98-99页

作者： H.Papunen A.j.naldrett 欧阳建平

国际地质对比计划(IGCP)161项,是在项目第一负责人A. j. naldrett(加拿大)倡导下于1977年开始进行的,该项目旨在通过实地考察,专题讨论及汇编有关矿床、主岩和地质背景资料,促进人们对与镁铁质、超镁铁质岩石伴生的岩浆型硫化物矿床的关... 详细信息

国际地质对比计划(IGCP)161项,是在项目第一负责人A. j. naldrett(加拿大)倡导下于1977年开始进行的,该项目旨在通过实地考察,专题讨论及汇编有关矿床、主岩和地质背景资料,促进人们对与镁铁质、超镁铁质岩石伴生的岩浆型硫化物矿床的关注.起初,在澳大利亚(D. Groves和***)、加拿大(W. Peredery),芬兰(H. Papunen)法国(M. Besson),挪威(R. Boyd).瑞典(G. Nilsson),南部非洲(G. V. Gruenewaldt)

关键词：超镁铁质岩石 GCP 地质铁质硫化物矿床杂岩体镁铁质岩浆

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硫化物饱和的和硫化物未饱合的科马提岩熔融体的化学和热力模拟

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华北地质 1980年第3期 61-62页

作者： I. H. Campbell A. j. naldrett j. Nilan P. Suddaby 郭永志加拿大安大略多伦多大学地质系加拿大安大略多伦多大学地质系英国伦敦帝国大学地质系英国伦敦帝国大学地质系

科马提岩熔融体的化学的和热力的模拟试验进行了我们对卡姆巴尔达型镍矿床成因的认识。化学模拟的价值明显地受工程使用资料的质量的限制。现有的模式是以Rajamani和naldrett(1978)提出的镍分配系数的实验测定为根据的。这些系数是在120... 详细信息

科马提岩熔融体的化学的和热力的模拟试验进行了我们对卡姆巴尔达型镍矿床成因的认识。化学模拟的价值明显地受工程使用资料的质量的限制。现有的模式是以Rajamani和naldrett(1978)提出的镍分配系数的实验测定为根据的。这些系数是在1200℃和1300℃间温度的玄武岩熔融体在未知S及O逸度条件下测定的。如果把这些资料用于模拟科马提熔融体的分馏,就可外推更多超镁铁质成分和超过1500℃温度条件下的结果。

关键词：硫化物科马提岩 Ni 硫化合物火山岩熔融体 FeS 热力模拟

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太古代和元古代科马提岩的野外地质特征和岩石学

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华北地质 1980年第2期 1-18页

作者： N.T.Arndt D.Francis A.j.Hynes 李上森

引言虽然现在已知有些早已描述过的超基性岩是喷出成因的(例如,naldrett & Mason, 1968),但对超基性熔岩的认识和首先作明确描述的应归功于Viljoen & Viljoen(1969),他们认为南非巴伯顿山地绿岩带中的许多超基性岩单位是火山成因的。他... 详细信息

引言虽然现在已知有些早已描述过的超基性岩是喷出成因的(例如,naldrett & Mason, 1968),但对超基性熔岩的认识和首先作明确描述的应归功于Viljoen & Viljoen(1969),他们认为南非巴伯顿山地绿岩带中的许多超基性岩单位是火山成因的。他们建议把包括这些超基性熔岩以及有关的基性火山岩和超基性岩墙和岩床的一套岩石称为科马提岩(Komatiite)。作为喷出证据,他们描述了冷却的岩流顶部构造、

关键词：太古代科马提岩基性岩床橄榄石太古宙地质年代火山岩层状侵入体岩石侵入体岛状硅酸盐矿物熔岩流火山喷出物超基性岩墙元古代元古宙野外地质岩石学

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