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Heterogeneity in the regenerative abilities of central nervous system axons within species: why do some neurons regenerate better than others?

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Neural Regeneration Research 2020年第6期15卷 996-1005页

作者： William Rodemer Jianli Hu michael E.Selzer michael i.shifman Shriners Hospitals Pediatric Research Center(Center for Neural Repair and Rehabilitation) the Lewis Katz School of Medicine at Temple UniversityPhiladelphiaPAUSA Department of Neurology the Lewis Katz School of Medicine at Temple UniversityPhiladelphiaPAUSA

Some neurons,especially in mammalian peripheral nervous system or in lower vertebrate or in vertebrate central nervous system(CNS)regenerate after axotomy,while most mammalian CNS neurons fail to *** is an emerging consensus that neurons have different intrinsic regenerative capabilities,which theoretically could be manipulated therapeutically to improve ***-based comparisons between"good regenerating"and"bad regenerating"neurons in the CNS and peripheral nervous system of most vertebrates yield results that are inconclusive or difficult to *** least in part,this reflects the great diversity of cells in the mammalian *** mammalian nervous system imposes several methodical ***,the small sizes and large numbers of neurons in the CNS make it very difficult to distinguish regenerating neurons from non-regenerating ***,the lack of identifiable neurons makes it impossible to correlate biochemical changes in a neuron with axonal damage of the same neuron,and therefore,to dissect the molecular mechanisms of regeneration on the level of single *** review will survey the reported responses to axon injury and the determinants of axon regeneration,emphasizing non-mammalian model organisms,which are often under-utilized,but in which the data are especially easy to interpret.

关键词： axonal regeneration identifiable neurons intrinsic factors lamprey Mauthner cell Müller cell neuronal death non-mammalian model organisms spinal cord injury zebrafish

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The expression of histone deacetylases and the regenerative abilities of spinal-projecting neurons after injury

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Neural Regeneration Research 2016年第10期11卷 1577-1578页

作者： jie chen michael i.shifman shriners hospitals pediatric research center (center for neural repair and rehabilitation) temple university school of medicine department of neuroscience temple university school of medicine

Epigenetic control of regeneration after spinal cord injury： Com- plete spinal cord injury （SCi） in humans and other mammals leads to irreversible paralysis below the level of injury, due to failure of axonal regeneration in the central nervous system （CNS）. Previous work has shown that successful axon regeneration is dependent upon transcription of a large number of regeneration-associated genes （RAGs） and transcription factors （TFs）（Van Kesteren et al., 2011）. A prominent theory in the field of axon regeneration is that the large differences in regenerative potential between peripheral nervous system （PNS） neurons, which regenerate well, and CNS neurons, which do not, reflect differences in intrinsic transcriptional net- works, rather than individual genes （Van Kesteren et al., 2011）.

关键词： HDAC gene The expression of histone deacetylases and the regenerative abilities of spinal-projecting neurons after injury

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量子场论高级专题讲座

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国外科技新书评介 2013年第2期 6-7页

作者： M.shifman() 丁亦兵不详中国科学院大学

场论是关于场的性质、相互作用和运动规律的理论，而量子场论则是把量子力学原理应用于场，把场看作无穷维自由度的力学系统实现其量子化而建立的理论。它是粒子物理学的基础理论并被广泛应用于统计物理、核理论和凝聚态理论等近代物理... 详细信息

场论是关于场的性质、相互作用和运动规律的理论，而量子场论则是把量子力学原理应用于场，把场看作无穷维自由度的力学系统实现其量子化而建立的理论。它是粒子物理学的基础理论并被广泛应用于统计物理、核理论和凝聚态理论等近代物理学的许多分支，是理解和描述固体物理与相变、高能物理、天体粒子物理以及核物理中多体问题基本现象的基础，因此是每所大学物理类研究生入学必修的一门基础理论课。

关键词：量子场论专题讲座基础理论课粒子物理学近代物理学凝聚态理论运动规律相互作用

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朗道的魅力

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国外科技新书评介 2013年第12期 13-14页

作者： M. shifman 杨盈莹不详中国科学院半导体研究所

朗道（Landau）是前苏联知名物理学家，凝聚态物理学的奠基人。在理论物理界多个领域都有重大贡献。朗道40年代创立了液体氦的超流动性理论，奠定了凝聚态物理的基础，于1962年被授予诺贝尔物理学奖。这本书是一本宝贵的回忆录，

关键词：朗道凝聚态物理学诺贝尔物理学奖物理学家理论物理超流动性前苏联液体氦

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YPED: An integrated Bioinformatics Suite and Database for Mass Spectrometry-based Proteomics Research

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2015年第1期13卷 25-35页

作者： Christopher M.Colangelo Mark shifman Kei-Hoi Cheung Kathryn L.Stone Nicholas J.Carriero Erol E.Gulcicek TuKiet T.Lam Terence Wu Robert D.Bjornson Can Bruce Angus C.Nairn Jesse Rinehart Perry L.Miller Kenneth R.Williams W.M.Keck Foundation Biotechnology Resource Laboratory School of Medicine Yale University Department of Molecular Biophysics & Biochemistry Yale University Yale Center for Medical informatics School of Medicine Yale University Department of Anesthesiology School of Medicine Yale University Department of Emergency Medicine School of Medicine Yale University VA Connecticut Healthcare System W.M. Keck Foundation Biotechnology Resource Laboratory School of Medicine Yale University Department of Computer Science Yale University Yale Center for Genome Analysis West Campus Yale University Yale West Campus Analytical Core West Campus Yale University Yale Bioinformatics Resource School of Medicine Yale University Department of Psychiatry School of Medicine Yale University Department of Cellular & Molecular Physiology School of Medicine Yale University Systems Biology institute Yale University

We report a significantly-enhanced bioinformatics suite and database for proteomics research called Yale Protein Expression Database（YPED） that is used by investigators at more than 300 institutions worldwide. YPED meets the data management, archival, and analysis needs of a high-throughput mass spectrometry-based proteomics research ranging from a singlelaboratory, group of laboratories within and beyond an institution, to the entire proteomics community. The current version is a significant improvement over the first version in that it contains new modules for liquid chromatography–tandem mass spectrometry（LC–MS/MS） database search results, label and label-free quantitative proteomic analysis, and several scoring outputs for phosphopeptide site localization. in addition, we have added both peptide and protein comparative analysis tools to enable pairwise analysis of distinct peptides/proteins in each sample and of overlapping peptides/proteins between all samples in multiple datasets. We have also implemented a targeted proteomics module for automated multiple reaction monitoring（MRM）/selective reaction monitoring（SRM） assay development. We have linked YPED＇s database search results and both label-based and label-free fold-change analysis to the Skyline Panorama repository for online spectra visualization. in addition, we have built enhanced functionality to curate peptide identifications into an MS/MS peptide spectral library for all of our protein database search identification results.

关键词： Proteomics Database Bioinformatics Mass spectrometry Repository Spectral library

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量子色动力学的持续进展2006

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国外科技新书评介 2008年第10期 6-6页

作者： M．佩洛索（编） M. shifman 胡光华 University of Minnesota USA 原中国科学院物理学研究所

第七届量子色动力学中的持续进展专题讨论会于2006年5月11～16日在美国明尼阿波利斯的威廉·i·法恩理论物理研究所举行。该系列会议自1994年起每2年举行一次，现在已成长为量子色动力学（QCD）领域的主要国际活动，吸引了在QCD前沿工... 详细信息

第七届量子色动力学中的持续进展专题讨论会于2006年5月11～16日在美国明尼阿波利斯的威廉·i·法恩理论物理研究所举行。该系列会议自1994年起每2年举行一次，现在已成长为量子色动力学（QCD）领域的主要国际活动，吸引了在QCD前沿工作的大多数活跃的研究人员。

关键词：量子色动力学物理研究所专题讨论会国际活动研究人员 QCD

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