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Genome-wide association mapping in a sweet cherry germplasm collection(Prunus avium L.)reveals candidate genes for fruit quality traits

引用

Horticulture Research 2023年第10期10卷 227-249页

作者： Armel S.L.Donkpegan Anthony Bernard Teresa Barreneche José Quero-García Hélène Bonnet mathieu fouché Loïck Le Dantec Bénédicte Wenden Elisabeth Dirlewanger UMR BFP INRAEUniversity of Bordeaux71 Avenue Edouard BourlauxF-33882 Villenave d’OrnonFrance UMR BOA SYSAAFCentre INRAE Val de Loire37380 NouzillyFrance

In sweet cherry(Prunus avium L.),large variability exists for various traits related to fruit *** is a need to discover the genetic architecture of these traits in order to enhance the efficiency of breeding strategies for consumer and producer *** this objective,a germplasm collection consisting of 116 sweet cherry accessions was evaluated for 23 agronomic fruit quality traits over 2-6 years,and characterized using a genotyping-by-sequencing *** SNP coverage collected was used to conduct a genome-wide association study using two multilocus models and three reference *** identified numerous SNP-trait associations for global fruit size(weight,width,and thickness),fruit cracking,fruit firmness,and stone size,and we pinpointed several candidate genes involved in phytohormone,calcium,and cell wall ***,we conducted a precise literature review focusing on the genetic architecture of fruit quality traits in sweet cherry to compare our results with potential colocalizations of marker-trait *** study brings new knowledge of the genetic control of important agronomic traits related to fruit quality,and to the development of marker-assisted selection strategies targeted towards the facilitation of breeding efforts.

关键词： breeding germplasm traits

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