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Characteristics of viral specimens collected from asymptomatic and fatal cases of COVID-19

The Journal of Biomedical Research 2020年第6期34卷 431-436页

作者： Andrew J.Gorzalski Paul Hartley Chris Laverdure Heather Kerwin Richard Tillett Subhash Verma Cyprian Rossetto Sergey Morzunov Stephanie van Hooser mark W.Pandori Nevada State Public Health Laboratory RenoNV 89597USA Nevada Genomics Center RenoNV 89557USA Washoe County Health District RenoNV 89512USA Nevada Institute of Personalized Medicine University of Nevada Las VegasLas VegasNV 89154-4022USA Nevada Center for Bioinformatics University of Nevada RenoRenoNV 89557USA Department of Microbiology and Immunology University of NevadaReno School of MedicineRenoNV 89557USA. Department of Pathology and Laboratory Medicine University of NevadaReno School of MedicineRenoNV 89557USA.

We sought to determine the characteristics of viral specimens associated with fatal cases,asymptomatic cases and non-fatal symptomatic cases of *** included the analysis of 1264 specimens found reactive for at least two SARS-CoV-2 specific loci from people screened for infection in Northern Nevada in March-May of *** these,30 were specimens from fatal cases,while 23 were from positive,asymptomatic *** assessed the relative amounts of SARS-CoV-2 RNA from sample swabs by real-time PCR and use of the threshold crossing value(Ct).Moreover,we compared the amount of human RNase P found on the same swabs.A considerably higher viral load was found to be associated with swabs from cases involving fatality and the difference was found to be strongly statistically *** this difference,we sought to assess whether any genetic correlation could be found in association with virus from fatal cases using whole genome *** no common genetic elements were discerned,one branch of epidemiologically linked fatal cases did have two point mutations,which no other of 156 sequenced cases from northern Nevada *** mutations caused amino acid changes in the 3′-5′exonuclease protein,and the product of the gene,orf8.

关键词： COVID-19 SARS-COV-2 real-time PCR Ct value viral load

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Schistosoma mansoni proteins attenuate gastrointestinal motility disturbances during experimental colitis in mice

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World Journal of Gastroenterology 2010年第6期16卷 703-712页

作者： Nathalie E Ruyssers Benedicte Y De Winter Joris G De Man Natacha D Ruyssers Ann J van Gils Alex Loukas mark S Pearson Joel V Weinstock Paul A Pelckmans Tom G Moreels Laboratory of Experimental Medicine and Pediatrics Division of GastroenterologyUniversity of Antwerp Division of Infectious Diseases and Immunology Queensland Institute of Medical Research 4006 Brisbane Division of Gastroenterology-Hepatology Tufts New England Medical Center

AIM:To investigate the therapeutic effect of Schistosoma mansoni(***) soluble worm proteins on gastrointestinal motility disturbances during experimental colitis in mice. METHODS:Colitis was induced by intrarectal injection of trinitrobenzene sulphate(TNBS) and 6 h later,mice were treated ip with *** *** were performed 5 d after TNBS *** quantified using validated inflammation parameters. Gastric emptying and geometric center were measured to assess in vivo gastrointestinal *** activity of distal colonic segments was studied in vitro using a modified Trendelenburg *** profiles of T-lymphocytes isolated from the colon were determined by real time reverse transcriptase-polymerase chain reaction. RESULTS:Intracolonic injection of TNBS caused severe *** with *** proteins significantly ameliorated colonic inflammation after 5 *** did not affect gastric emptying but significantly decreased the geometric center and impaired colonic peristaltic activity 5 d after the induction of *** with *** proteins ameliorated these in vivo and in vitro motility *** addition,TNBS injection caused a downregulation of effector T cell cytokines after 5 d,whereas a *** protein effect was no longer observed at this time point. CONCLUSION:Treatment with *** proteins attenuated intestinal inflammation and ameliorated motility disturbances during murine experimental colitis.

关键词： Schistosoma mansoni Helminth proteins Colitis Peristalsis Crohn’s disease Gastrointestinal motility Trinitrobenzene sulphate

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Evaluation of MODIS Products in the Great Australian Bight and Adjacent Coastal Waters

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Open Journal of Marine Science 2018年第4期8卷 431-449页

作者： Ana Redondo Rodriguez Edward King mark Doubell Paul van Ruth South Australian Research and Development Institute West Beach SA Australia CSIRO Oceans and Atmosphere Flagship CSIRO Hobart Australia

Satellite remote sensing data can produce global environmental data and is easily accessible and widely used by the scientific and non-scientific community. However, to use satellite data, it is important to know its limitations and how it validates against in situ measurements for the different regions. Here, field measurements of chlorophyll-a concentration and euphotic depth within the Great Australian Bight, Gulf St Vincent and Spencer Gulf were used to validate ocean colour products derived from the Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer (MODIS) onboard the Aqua satellite. The field data include in situ and in vivo chlorophyll-a concentration, which were compared against MODIS chlorophyll-a products derived from three algorithms (OC3M, Carder, and Garver-Siegel-Maritorena (GSM)), as well as euphotic depth measurements derived from photosynthetically active radiation (PAR) profiles, which were compared against two MODIS euphotic depth products (derived semi-analytically and from surface chlorophyll-a). The OC3M product performed well in open waters, with errors below the 35% NASA accepted limit, but it overestimated chlorophyll-a values in shallow (<50 m) waters. The GSM product produced the lowest errors, but also showed a smaller dynamic range, while the Carder product produced higher errors than GSM and it also showed small dynamic range. The relationships between the MODIS and in situ euphotic depth were robust, with errors lower than 20%. MODIS products showed weaker or no significant relationships to in situ measurements in the Eastern Great Australian Bight. This is thought to be due to the summertime subsurface upwelling pool that is characteristic of the area. Based on these results, the OC3M product provides the most reliable estimates of chlorophyll-a, and is recommended for further applications of MODIS imagery, if the limitations in shallow waters are taken into account. Alternatively, the GSM product could be a better option if the algorithm

关键词： Great Australian Bight MODIS Remote Sensing Ocean Color Chlorophyll Euphotic Depth

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污水流行病学用于新冠肺炎预警研究进展

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中国给水排水 2021年第14期37卷 37-45页

作者：刘然彬郝晓地 mark van Loosdrecht 江瀚北京建筑大学中-荷未来污水处理技术研发中心北京100044

突发新型冠状病毒肺炎(COVID-19)已蔓延至全球几乎所有国家,累计确诊病例已超过1亿例。这一全球大流行病尽管现阶段在我国多点散发,但已得到基本控制,由于不容乐观的全球疫情扩散,依然存在疫情反弹之巨大风险。在新冠疫苗实现大规模接... 详细信息

突发新型冠状病毒肺炎(COVID-19)已蔓延至全球几乎所有国家,累计确诊病例已超过1亿例。这一全球大流行病尽管现阶段在我国多点散发,但已得到基本控制,由于不容乐观的全球疫情扩散,依然存在疫情反弹之巨大风险。在新冠疫苗实现大规模接种之前,COVID-19暴发有效预警机制依然是最需要的技术手段。鉴于感染者粪便/尿液中存在病毒粒子或遗传物质核糖核酸(RNA),荷兰学者提出了基于污水流行病学(WBE)监控SARS-CoV-2(诱发COVID-19的病毒)出现并传播的设想。目前,污水中SARS-CoV-2有限RNA检测研究结果已经证明了这一技术作为疫情预警的可行性,亦可能根据WBE检测结果表征病毒传播动态与趋势、估算感染群体比例,甚至在一定范围内进行感染群体追踪。在总结WBE技术在我国发展应用的基础上,对已有污水中SARS-CoV-2的核酸检测研究结果、应用价值和指导意义进行综合分析,总结WBE研究标准化方案,辨析亟需深入研究的方向领域。这对我国下一阶段疫情防控具有相当启发与参考价值。

关键词：新型冠状病毒肺炎污水流行病学疫情预警病毒检测核糖核酸

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Growing Season and Phenological Stages of Small Grain Crops in Response to Climate Change in Alaska

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American Journal of Climate Change 2021年第4期10卷 490-511页

作者： Mingyuan Cheng Mingchu Zhang Robert mark van Veldhuizen Charles Winsett Knight Agricultural and Forestry Experiment Station University of Alaska Fairbanks Fairbanks USA Division of Agriculture Alaska Department of Natural Resources Division of Agriculture Fairbanks USA

The climate change in Alaska has caused earlier spring snowmelt and the growing season expanded. However, the effect of climate change on crop phenological stages, heading (BBCH 55) and maturity (BBCH 85), is unknown. In this study, the trends of growing-season length (GSL), phenological stages of crops and climatic parameters, and the correlations between climatic parameters and the phenological stages were analyzed using the climate data and crop data over the period of 1978 to 2016. The longer GSL was found in Fairbanks (64.83˚N, 147.77˚W) and in Delta Junction (64.05˚N, 145.60˚W) but not in Palmer (61.60˚N, 149.11˚W). Sowing dates did not change significantly in three locations. The decreasing trends of heading and maturity of crops were observed but varied with location. Heading of barley and oat significantly advanced 3 and 3.1 d decade-1, respectively from 1989 to 2016 in Fairbanks while no change of heading was observed in Delta Junction and Palmer. Maturity of barley, oat and wheat significantly advanced 2.6, 3.8 and 3.9 d decade-1, respectively from 1978 to 2016 in Fairbanks (P < 0.05);maturi

关键词： Heading Maturity Climate Change Growing-Season Length Growing Degree Days

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政策驱动欧洲磷回收与再利用

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中国给水排水 2017年第8期33卷 35-42页

作者：郝晓地宋鑫 mark van Loosdrecht 江瀚北京建筑大学城市雨水系统与水环境省部共建教育部重点实验室中-荷未来污水处理技术研发中心北京100044

从污水及动物粪尿中回收磷是20世纪的欧洲概念,传入中国业已十年之久。磷回收技术时至今日已经成熟,并无太大工程应用难度。然而,在我国沸沸扬扬10多年后,磷回收并没有真正步入市场轨道,一直停留在学术研究层面。究其原因,国家层面认识... 详细信息

从污水及动物粪尿中回收磷是20世纪的欧洲概念,传入中国业已十年之久。磷回收技术时至今日已经成熟,并无太大工程应用难度。然而,在我国沸沸扬扬10多年后,磷回收并没有真正步入市场轨道,一直停留在学术研究层面。究其原因,国家层面认识以及宏观政策缺乏成为阻碍我国磷回收产业化的主要瓶颈。有鉴于此,介绍欧洲国家有关磷回收计划实施的政策、法律、法规、指南等软性环境概况,从欧盟指南到各国政策,再到行动计划,全方位介绍欧洲国家有关磷回收与再利用的政策、法律等文件形成和发展过程,特别提及荷兰、瑞士、英国、法国、德国以及北欧诸国的具体行动计划,以期成为我国制定磷回收政策和法律的参考蓝本。

关键词：磷回收污水/动物粪尿政策/法律欧盟指南行动计划信息平台

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可持续除磷脱氮BCFS工艺

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给水排水 2002年第9期28卷 7-10页

作者：郝晓地汪慧贞 mark van Loosdrecht 北京建筑工程学院可持续环境生物技术研发中心 Delft University of Technology

基于UCT的BCFS 工艺突出反硝化除磷在系统中的作用 ;考虑了两种可能影响生物除磷效果的情况 ,充分利用磷细菌对磷酸盐的亲和性 ,将生物摄磷与富磷上清液 (来自厌氧释放 )离线化学沉淀有机结合 ;使系统在稳定的SVI(<12 0mL/ g)下能获得... 详细信息

基于UCT的BCFS 工艺突出反硝化除磷在系统中的作用 ;考虑了两种可能影响生物除磷效果的情况 ,充分利用磷细菌对磷酸盐的亲和性 ,将生物摄磷与富磷上清液 (来自厌氧释放 )离线化学沉淀有机结合 ;使系统在稳定的SVI(<12 0mL/ g)下能获得良好的出水水质 (总磷≤ 0 2mg/L ;总氮≤ 5mg/L)。该工艺具有处理过程中COD和O2 消耗量较少、剩余污泥量低等特点 ,这使其在可持续性方面具有一定意义。同时介绍了BCFS 工艺独特的同心圆反应池结构、在线过程控制等方面的情况。

关键词：除磷脱氮 BCFS反硝化除磷同心圆反应池氧化还原电位

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熵析污水处理资源与能源化

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环境科学学报 2022年第4期42卷 75-80页

作者：郝晓地吴道琦李季 mark van Loosdrecht 北京建筑大学城市设计高精尖中心中-荷未来污水处理技术研发中心北京100044

熵为热力学第二定律中的抽象概念.按熵之理论,自然熵增和逆熵增维系着生态平衡.人类生产、生活过程中摄取资源并排放污/废水等熵增产物会促进物质熵增并破坏生态平衡,加速生物消亡.而缓释、甚至抵消这种“人为熵增”则乃实现蓝色发展目... 详细信息

熵为热力学第二定律中的抽象概念.按熵之理论,自然熵增和逆熵增维系着生态平衡.人类生产、生活过程中摄取资源并排放污/废水等熵增产物会促进物质熵增并破坏生态平衡,加速生物消亡.而缓释、甚至抵消这种“人为熵增”则乃实现蓝色发展目标的重要一环.如今,人为熵增所引发的自然物质熵变循环塌陷是不争的事实,“自然熵增”之原生态方法显然已不适合大规模处理城市污水,“加速熵增”的传统污水处理技术显然也已不合时宜,只有发展“逆熵增”的污水处理资源、能源化技术才是人间正道.通过对熵的具象化释义,揭示出传统污水处理技术以及污泥填埋方式为“加速熵增”过程,对人类可持续发展十分不利.只有模拟元素循环的自然的“逆熵增”过程,才能使得污水处理走向可持续发展水平.因此,污水资源化与能源化首当其冲,一定是未来污水处理的发展方向.只有通过人工缓释熵增(高效低耗污水处理技术)和促进逆熵增手段(资源与能源化技术)才能抵消人为熵增造成的影响,从而维持生态平衡.

关键词：熵熵增逆熵增物质自然循环资源/能源回收缓释熵增

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数学模拟技术在污水处理工艺设计、优化、研发中的应用(上)

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给水排水 2004年第5期30卷 33-36页

作者：郝晓地甘一萍周军 mark van Loosdrecht 北京建筑工程学院北京100044 北京城市排水集团有限责任公司北京100063 荷兰代尔夫特工业大学

污水生物处理数学模型经过二三十年的发展已基本完善,不仅有了可以描述碳氧化、硝化、反硝化、生物除磷在内的宏观活性污泥模型,而且也有了可以从微观角度细述生物除磷过程的代谢模型,另外还有多维生物膜结构模型。所有这些模型借助突... 详细信息

污水生物处理数学模型经过二三十年的发展已基本完善,不仅有了可以描述碳氧化、硝化、反硝化、生物除磷在内的宏观活性污泥模型,而且也有了可以从微观角度细述生物除磷过程的代谢模型,另外还有多维生物膜结构模型。所有这些模型借助突飞猛进的计算机技术发展而日益显示出它们在工程应用与试验研究中的巨大作用。在介绍数学模型发展历程与计算机应用软件的基础上,举例说明模拟技术在工艺设计、运行优化、试验定向等方面的具体作用与应用,旨在推动数学模拟这一超级辅助工具在我国的实际应用。

关键词：数学模拟污水处理工艺设计生物除磷活性污泥模型

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欧洲城市污水处理技术新概念——可持续生物除磷脱氮工艺(下)

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给水排水 2002年第7期28卷 5-8页

作者：郝晓地,汪慧贞,钱易,mark van Loosdrecht 北京建筑工程学院可持续环境生物技术研发中心北京建筑工程学院可持续环境生物技术研发中心清华大学环境科学与工程系 Delft University of Technology 100044 北京展览馆路1号电话:(010)68322128 100044 北京展览馆路1号电话:(010)68322128 100084 (TUDelft)

以BCFS工艺为代表的反硝化除磷，及CANON工艺为代表的厌氧氨氧化作为可持续除磷脱氮关键技术的蓝本，荷兰－中国大学间合作研究提出了一针对城市污水处理的可持续除磷脱氮推荐工艺，如图7所示。这个推荐工艺突出COD甲烷化、磷酸盐回收... 详细信息

以BCFS工艺为代表的反硝化除磷，及CANON工艺为代表的厌氧氨氧化作为可持续除磷脱氮关键技术的蓝本，荷兰－中国大学间合作研究提出了一针对城市污水处理的可持续除磷脱氮推荐工艺，如图7所示。这个推荐工艺突出COD甲烷化、磷酸盐回收以及处理水回用等与可持续性密切有关的内容。

关键词：污泥消化液可持续生物污泥消化污泥反硝化除磷除磷脱氮消化池消化水池废水处理设备处理单元鸟粪石污泥量进水水回用

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