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Long non-coding RNA FPFSC promotes immature porcine Sertoli cell growth through modulating the miR-326/EHMT2 axis

Journal of Integrative Agriculture 2024年第11期23卷 3830-3842页

作者： Dan Chu Bin Chen Bo Weng Saina Yan Yanfei Yin Xiangwei Tang maoliang ran Hunan Provincial Key Laboratory for Genetic Improvement of Domestic Animal College of Animal Science and Technology Hunan Agricultural University Xiangxi Vocational and Technical College for Nationalities

Sertoli cells are indispensable for guaranteeing normal spermatogenesis and male fertility. Although a huge number of long non-coding RNAs(lncRNAs) are identified from developing porcine testicular tissues and have been predicted with crucial regulatory roles in spermatogenesis, their functions and regulatory mechanisms are still in infancy. Herein, we mainly explored the regulatory and functional roles of lncFPFSC in proliferation and apoptosis of immature porcine Sertoli cells. The results demonstrated that lncFPFSC was predominantly located in the cytoplasm of immature porcine Sertoli cells. lncFPFSC overexpression promoted cell cycle progression and cell proliferation,as well as inhibited cell apoptosis, whereas siRNA-induced lncFPFSC knockdown resulted in the opposite ***, lncFPFSC acted as a sponge for miR-326. Overexpression of miR-326 inhibited cell proliferation and induced cell apoptosis, which further abolished the effects of lncFPFSC overexpression. The euchromatic histone-lysine N-methyltransferase 2(EHMT2) gene was directly targeted by miR-326, and its mRNA and protein expressions were both negatively regulated by miR-326 in immature porcine Sertoli cells. Then, siRNA-induced EHMT2 knockdown resulted a similar effect of miR-326 inhibition. Collectively, lncFPFSC promoted proliferation and inhibited apoptosis in immature porcine Sertoli cells through modulating the miR-326/EHMT2 axis. This study expanded our understanding of non-coding RNAs in participating porcine spermatogenesis through deciding the fate of Sertoli cells, and the competing endogenous RNA(ceRNA) network, and provided new molecular markers to treat Sertoli cell disorder inducing male infertility.

关键词： porcine Sertoli cells proliferation apoptosis lncRNA FPFSC miR-326 EHMT2 gene

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miR-542-3p生物信息学分析及对未成熟猪睾丸支持细胞的影响

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黑龙江畜牧兽医 2024年第11期 47-56,119页

作者：尹艳飞蒋芊芊冉茂良翁波湘西民族职业技术学院湖南湘西416007 湖南农业大学动物科学技术学院畜禽遗传改良湖南省重点实验室长沙410128

为了探讨miR-542-3p的生物信息学信息及其对未成熟猪睾丸支持细胞的影响,试验通过AliBaba 2.1和AnimalTFDB 3.0软件预测miR-542-3p转录因子结合位点(TFBS);并分析miR-542-3p在不同物种间的保守性;采用CCK-8试剂、ATP试剂盒、流式周期检... 详细信息

为了探讨miR-542-3p的生物信息学信息及其对未成熟猪睾丸支持细胞的影响,试验通过AliBaba 2.1和AnimalTFDB 3.0软件预测miR-542-3p转录因子结合位点(TFBS);并分析miR-542-3p在不同物种间的保守性;采用CCK-8试剂、ATP试剂盒、流式周期检测试剂盒和实时荧光定量PCR方法探究过表达miR-542-3p对未成熟猪睾丸支持细胞的影响;利用TargetScan、miRDB和miWalk 3种在线软件预测miR-542-3p靶基因后取交集,并对猪源靶基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析;最后利用Cytoscape 3.2.0软件构建TF-miR-542-3p-靶基因相互作用网络。结果表明:经预测miR-542-3p受GATA1、TBP、Sp1、Ap1、SRF等多个转录因子调控,且在多物种间具有高度的保守性;miR-542-3p可显著或极显著抑制未成熟猪睾丸支持细胞增殖活性(P<0.05或P<0.01),极显著降低细胞内ATP含量(P<0.01),显著或极显著抑制细胞增殖基因和周期基因的相对表达量(P<0.05或P<0.01),进而抑制细胞周期和细胞增殖;转染miR-542-3p mimic后G1期猪睾丸支持细胞比例显著升高(P<0.05),S期细胞比例极显著降低(P<0.01);共发现7个猪源miR-542-3p潜在靶基因,miR-542-3p调控的UBE2E1基因相对表达量极显著下降(P<0.01),KCMF1、ILK基因相对表达量显著下降(P<0.05),HIPK3基因相对表达量极显著升高(P<0.01),AP3D1、PLEKHM3基因相对表达量显著升高(P<0.05),各靶基因主要在激酶活性和结合上发挥作用;miR-542-3p靶基因主要参与MAPK、cAMP、TGF-β和cGMP-PKG等信号通路;构建的TF-miR-542-3p-靶基因相互作用网络包含5个转录因子和50个mRNA。说明miR-542-3p受多种转录因子调控,在多物种间高度保守,能够抑制未成熟猪睾丸支持细胞增殖,并通过调控下游靶基因的表达参与MAPK、cAMP和TGF-β等信号通路,从而调控未成熟猪睾丸支持细胞生长。

关键词： miR-542-3p 生物信息学未成熟公猪睾丸支持细胞靶基因

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Deep carbon recycling viewed from global plate tectonics

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National Science Review 2024年第6期11卷 37-55页

作者： maoliang Zhang Sheng Xu Yuji Sano School of Earth System Science Tianjin University Marine Core Research Institute Kochi University Atmosphere and Ocean Research Institute The University of Tokyo

Plate tectonics plays an essential role in the redistribution of life-essential volatile elements between Earth's interior and surface, whereby our planet has been well tuned to maintain enduring habitability over much of its history. Here we present an overview of deep carbon recycling in the regime of modern plate tectonics,with a special focus on convergent plate margins for assessing global carbon mass balance. The up-to-date flux compilation implies an approximate balance between deep carbon outflux and subduction carbon influx within uncertainty but remarkably limited return of carbon to convecting mantle. If correct, carbon would gradually accumulate in the lithosphere over time by（i） massive subsurface carbon storage occurring primarily in continental lithosphere from convergent margins to continental interior and（ii） persistent surface carbon sinks to seafloors sustained by high-flux deep CO2emissions to the atmosphere. Further assessment of global carbon mass balance requires updates on fluxes of subduction-driven carbon recycling paths and reduction in uncertainty of deep carbon outflux. From a global plate tectonics point of view, we particularly emphasize that continental reworking is an important mechanism for remobilizing geologically sequestered carbon in continental crust and sub-continental lithospheric mantle. In light of recent advances,future research is suggested to focus on a better understanding of the reservoirs, fluxes, mechanisms, and climatic effects of deep carbon recycling following an integrated methodology of observation, experiment,and numerical modeling, with the aim of decoding the self-regulating Earth system and its habitability from the deep carbon recycling perspective.

关键词： deep carbon recycling convergent plate margins subduction continental reworking global carbon mass balance

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Taxonomic Status of Three Recently Proposed Species of the Genus Kurixalus(Anura,Rhacophoridae),with Discussion on the ZooBank Registrations for Electronical Publication

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Asian Herpetological Research 2024年第1期15卷 31-40页

作者： Zhitong LYU maoliang LI Guanqi WANG Gang LIU Min LIU Ke JIANG Dechun JIANG Jiatang LI CAS Key Laboratory of Mountain Ecological Restoration and Bioresource Utilization Ecological Restoration and Biodiversity Conservation Key Laboratory of Sichuan ProvinceChengdu Institute of BiologyChinese Academy of SciencesChengdu 610040SichuanChina Chengdu Nature Reserve and Wildlife Protection Center Chengdu 610081SichuanChina University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China

In the present study,we propose the synonymization of Kurixalus silvaenaias with Kurixalus *** conclusion is based on morphological examination and phylogenetic analysis of a series of newly collected specimens,as well as the type series of both *** publication dates of the two species were determined according to the related articles of the International Code of Zoological *** note,the ZooBank registrations for both species are ***,the publication of *** does not qualify as a published work and the correct publication date of *** should be the date on which it was physically ***,based on the results presented in this study and its original description,the proposal of *** is deemed untenable and should,therefore,be considered a junior synonym of *** further provide suggestions for the authors,editors,and publishers who are working on taxonomic publications,as well as for ZooBank to improve the registering service.

关键词： Kurixalus inexpectatus Kurixalus qionglaiensis Kurixalus silvaenaias nomenclature the Code

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睾丸发育和精子生成相关miRNA研究进展

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遗传 2014年第7期36卷 646-654页

作者：冉茂良陈斌尹杰杨岸奇蒋明湖南农业大学动物科学技术学院长沙410128 中国科学院亚热带农业生态研究所中国科学院亚热带农业生态过程重点实验室湖南省畜禽健康养殖工程技术中心农业部中南动物营养与饲料科学观测实验站长沙410125 中国科学院研究生院北京100049

MicroRNA(miRNA)是一类长约22nt的非编码小RNA,广泛存在于各种生物中,调节生物体生长、发育和凋亡等过程。研究表明,miRNA在人和动物睾丸发育及精子生成等过程也起着重要的调控作用。但miRNA在不同种属的睾丸组织及其不同发育时间段均... 详细信息

MicroRNA(miRNA)是一类长约22nt的非编码小RNA,广泛存在于各种生物中,调节生物体生长、发育和凋亡等过程。研究表明,miRNA在人和动物睾丸发育及精子生成等过程也起着重要的调控作用。但miRNA在不同种属的睾丸组织及其不同发育时间段均存在特异性表达。此外,miRNA在动物精子生成过程中也存在时空特异性。文章综述了睾丸发育和精子生成过程中miRNA的差异性表达、表达调控以及一些miRNA对精子生成的调节作用,旨在为睾丸miRNA的进一步研究提供参考,为利用miRNA调控和促进种公畜精液品质提供研究思路。

关键词： miRNA 睾丸发育精子生成

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氧化应激与DNA损伤

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动物营养学报 2013年第10期25卷 2238-2245页

作者：冉茂良高环尹杰陈斌湖南农业大学动物科学技术学院长沙410128 中国科学院亚热带农业生态研究所中国科学院亚热带农业生态过程重点实验室湖南省畜禽健康养殖工程技术中心农业部中南动物营养与饲料科学观测实验站长沙410125 中国科学院研究生院北京100049

人和动物机体细胞在遭受氮氧化合物、钙和病原体等体内外环境的刺激后,氧化和抗氧化系统之间的平衡被破坏,从而促进细胞内活性氧分子(ROS)的大量产生和积累,最终导致机体产生氧化应激。氧化应激可以导致DNA链断裂、DNA位点突变、DNA双... 详细信息

人和动物机体细胞在遭受氮氧化合物、钙和病原体等体内外环境的刺激后,氧化和抗氧化系统之间的平衡被破坏,从而促进细胞内活性氧分子(ROS)的大量产生和积累,最终导致机体产生氧化应激。氧化应激可以导致DNA链断裂、DNA位点突变、DNA双链畸变和原癌基因与肿瘤抑制基因突变等形式的DNA损伤;同时,DNA也在遭受脱嘌呤和脱嘧啶、X射线、紫外线、烷化剂和嵌入剂等体内外物理或化学因素的刺激下造成DNA损伤,DNA损伤也能诱导机体产生氧化应激。本文主要对氧化应激与DNA损伤之间的联系作一综述,以期为后续的相关研究提供参考。

关键词：氧化应激 ROS DNA损伤

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哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通道与自噬的相关研究

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动物营养学报 2014年第7期26卷 1738-1745页

作者：蒋明冉茂良陈斌杨岸奇李智湖南农业大学动物科学技术学院长沙410128

自噬是生物进化中的一个非常保守的分解代谢过程,是细胞通过双膜空泡包裹胞质内容物形成自噬体,然后与溶酶体融合到一起降解胞质内容物和器官的一种生理机制,维持和更新动物体内细胞器;哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)主要存在2种形式:mTO... 详细信息

自噬是生物进化中的一个非常保守的分解代谢过程,是细胞通过双膜空泡包裹胞质内容物形成自噬体,然后与溶酶体融合到一起降解胞质内容物和器官的一种生理机制,维持和更新动物体内细胞器;哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)主要存在2种形式:mTORC1和mTORC2,mTOR可以根据机体营养、能量和生长因子的水平调节细胞生长和增殖。本文主要对mTOR的功能及调控机制、自噬以及mTOR与自噬之间的联系进行综述。

关键词： mTOR 自噬 microRNAs 细胞器自噬动物

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泛素?蛋白酶体途径在精子生成中的作用

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遗传 2016年第9期38卷 791-800页

作者：董莲花冉茂良李智彭馥芝陈斌湖南农业大学动物科学技术学院长沙410128 畜禽遗传改良湖南省重点实验室长沙410128

泛素?蛋白酶体途径(Ubiquitin–proteasome pathway,UPP)是真核细胞内蛋白质主要降解途径,通过调节蛋白质相互作用、蛋白活性、蛋白定位及信号转导,进而在细胞周期进程、细胞凋亡、应激反应及机体生长发育等过程发挥重要作用。研究表明,... 详细信息

泛素?蛋白酶体途径(Ubiquitin–proteasome pathway,UPP)是真核细胞内蛋白质主要降解途径,通过调节蛋白质相互作用、蛋白活性、蛋白定位及信号转导,进而在细胞周期进程、细胞凋亡、应激反应及机体生长发育等过程发挥重要作用。研究表明,UPP在人和动物精子生成中的顶体生物合成及精子尾部形成过程起着关键的调控作用,精子变态过程中UPP调控异常导致精子畸形及精子活力降低,并引发少精子症、不育及睾丸肿瘤等生殖系统疾病。本文综述了UPP在动物精子生成过程中的信号传导及调节机制,以期为后续相关研究提供参考。

关键词：泛素-蛋白酶体途径泛素化精子发生

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猪microRNA组学研究进展

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遗传 2014年第10期36卷 974-984页

作者：冉茂良陈斌尹杰杨岸奇李智蒋明湖南农业大学动物科学技术学院长沙410128 畜禽遗传改良湖南省重点实验室长沙410128 中国科学院亚热带农业生态研究所长沙410125 中国科学院研究生院北京100049

MicroRNA(miRNA)是一类长约22 nt的非编码小RNA,广泛存在于各种生物中,调节生物体生长、发育和凋亡等过程。研究表明,miRNA在猪肌肉、脂肪、生殖系统以及免疫系统等的发育过程中发挥着重要的调控作用。此外,高通量的新一代测序技术在猪m... 详细信息

MicroRNA(miRNA)是一类长约22 nt的非编码小RNA,广泛存在于各种生物中,调节生物体生长、发育和凋亡等过程。研究表明,miRNA在猪肌肉、脂肪、生殖系统以及免疫系统等的发育过程中发挥着重要的调控作用。此外,高通量的新一代测序技术在猪miRNA的挖掘和差异表达研究中发挥着巨大的作用。文章综述了高通量的新一代测序技术在挖掘猪miRNA中的应用以及一些miRNA在猪脂肪代谢、肌肉发育、卵母细胞成熟和B、T淋巴细胞发育中的调控作用,旨在为猪miRNA的研究提供参考,为利用miRNA调控和改善猪肉品质、生长性能、繁殖性能以及免疫机能提供理论基础和研究思路。

关键词：猪 microRNA 脂肪代谢肌肉发育卵母细胞成熟免疫

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猪睾丸组织定量PCR分析中内参基因的选择

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中国农业科学 2017年第15期50卷 3033-3041页

作者：彭馥芝冉茂良翁波李智董莲花陈斌湖南农业大学动物科学技术学院/畜禽遗传改良湖南省重点实验室

【目的】采用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)对基因表达进行分析时,选择适当的内参基因是获得准确分析结果的关键。在猪睾丸分子生物学研究中,表达稳定的蛋白编码内参基因和micro RNA(miRNA)内参基因均有哪些目前尚不清楚。本研究旨在筛... 详细信息

【目的】采用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)对基因表达进行分析时,选择适当的内参基因是获得准确分析结果的关键。在猪睾丸分子生物学研究中,表达稳定的蛋白编码内参基因和micro RNA(miRNA)内参基因均有哪些目前尚不清楚。本研究旨在筛选出合适的内参基因,为准确定量不同时期猪睾丸组织中目的基因的表达提供可靠依据。【方法】选用8个不同发育时期(E 90、D 1、D 30、D 60、D 90、D 120、D 150、DM)的猪睾丸组织为材料,采用Trizol裂解法提取各样品的总RNA,利用Nan Drop ND-2000分光光度计检测总RNA的浓度和纯度。设计并合成已报道的猪其他组织中表达相对稳定的5个编码内参基因(GAPDH、TBP、β-actin、SDHA和B2M)以及5个miRNA内参基因(U6、ssc-miR-17-5p、ssc-miR-26a、ssc-miR-27a和ssc-miR-103)的特异性引物序列,逆转录得到cDNA模板后,按1:10梯度稀释为7个浓度梯度进行qRT-PCR反应以构建标准曲线。并对10个候选内参基因在各时期睾丸组织中的表达情况进行实时荧光定量全面检测,采用Ge Norm法对定量结果进行综合分析,最后根据内参基因稳定性值(M值)的大小筛选出最稳定的参考基因;M值越小,表明内参基因的稳定性越好,反之则越差。【结果】对GAPDH、TBP、β-actin、SDHA、B2M、U6、ssc-miR-17-5p、ssc-miR-26a、ssc-miR-27a和ssc-miR-103 10个候选内参基因的熔解曲线进行分析发现,均无非特异扩增及引物二聚体,说明各内参基因特异性良好,qRT-PCR反应的专一性高;以Ct值为纵坐标,相对拷贝数的对数为横坐标进行标准曲线分析可知,各内参基因在系列稀释的浓度梯度内具有良好的线性关系;通过对10个候选内参基因在不同时期猪睾丸组织中的表达稳定性分析发现,蛋白编码基因中,最稳定的为TBP,最不稳定的是GAPDH;miRNA候选内参中,最稳定的为U6,最不稳定的是ssc-miR-26a。【结论】成功筛选出猪睾丸组织基因表达分析中稳定表达的内参基因TBP和U6,可作为猪睾丸组织基因表达研究中最佳内参基因候选者。

关键词：猪睾丸组织内参基因 qRT-PCR miRNA

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