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Engineering and characterization of dehalogenase enzymes from Delftia acidovorans in bioremediation of perfluorinated compounds

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Synthetic and Systems Biotechnology 2022年第2期7卷 683-688页

作者： Jackson D.Harris Collin m.coon megan E.Doherty Eamon A.mcHugh margaret C.Warner Conley L.Walters Olivia m.Orahood Abigail E.Loesch David C.Hatfield John C.Sitko Erin A.Almand J.Jordan Steel Department of Biology United Stated Air Force AcademyColorado SpringsCO80840USA Department of Biochemistry United States Air Force AcademyColorado SpringsCO80840USA Department of Civil Engineering United States Air Force AcademyColorado SpringsCO80840USA

Per-and Polyfluorinated alkyl substances(PFAS)are a broad class of synthetic compounds that have fluorine substituted for hydrogen in several or all locations and are globally categorized as PFCs(perfluorochemicals;commonly called fluorinated chemicals).These compounds have unique chemical and physical properties that enable their use in non-stick surfaces,fire-fighting efforts,and as slick ***,recent concerns over the health effects of such compounds,specifically perfluorooctanoic acid and perfluorooctane sulfonic acid(PFOA,PFOS;PFOA/S),have led to increased attention and research by the global community into degradation *** this study,soil samples from PFAS-contamination sites were cultured and screened for microbes with PFOA/S degradation potential,which led to the identification of Delftia *** was found that *** isolated from PFAS-contaminated soils was capable of growth in minimal media with PFOA as a sole carbon resource,and an observable fluoride concentration increase was observed when cells were exposed to *** suggests potential activity of a dehalogenase enzyme that may be of use in PFOA or PFAS microbial remediation *** associated haloacid dehalogenases have been identified in the *** genome and have been engineered for expression in Escherichia coli for rapid production and *** enzymes have shown potential for enzymatic defluorination,a significant step in biological degradation and removal of PFOA/S from the *** hypothesize that bioremediation of PFAS using naturally occurring microbial degradation pathways may represent a novel approach to remove PFAS contamination.

关键词： iGEm PFAS Bioremediation Bioengineering Delftia acidovorans

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Search for two-neutrino double-beta decay of^(136)Xe to the 0^(+)_(1)excited state of 136Ba with the complete EXO-200 dataset

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Chinese Physics C 2023年第10期47卷 1-9页

作者： S.Al Kharusi G.Anton I.Badhrees P.S.Barbeau D.Beck V.Belov T.Bhatta m.Breidenbach T.Brunner G.F.Cao W.R.Cen C.Chambers B.Cleveland m.coon A.Craycraft T.Daniels L.Darroch S.J.Daugherty J.Davis S.Delaquis A.Der mesrobian-Kabakian R.DeVoe J.Dilling A.Dolgolenko m.J.Dolinski J.Echevers W.Fairbank Jr. D.Fairbank J.Farine S.Feyzbakhsh P.Fierlinger Y.S.Fu D.Fudenberg P.Gautam R.Gornea G.Gratta C.Hall E.V.Hansen J.Hoessl P.Hufschmidt m.Hughes A.Iverson A.Jamil C.Jessiman m.J.Jewell A.Johnson A.Karelin L.J.Kaufman T.Koffas R.Krücken A.Kuchenkov K.S.Kumar Y.Lan A.Larson B.G.Lenardo D.S.Leonard G.S.Li S.Li Z.Li C.Licciardi Y.H.Lin R.macLellan T.mcElroy T.michel B.mong D.C.moore K.murray O.Njoya O.Nusair A.Odian I.Ostrovskiy A.Perna A.Piepke A.Pocar F.Retière A.L.Robinson P.C.Rowson J.Runge S.Schmidt D.Sinclair K.Skarpaas A.K.Soma V.Stekhanov m.Tarka S.Thibado J.Todd T.Tolba T.I.Totev R.Tsang B.Veenstra V.Veeraraghavan P.Vogel J.-L.Vuilleumier m.Wagenpfeil J.Watkins m.Weber L.J.Wen U.Wichoski G.Wrede S.X.Wu Q.Xia D.R.Yahne L.Yang Y.-R.Yen O.Ya.Zeldovich T.Ziegler 无 Physics Department McGill UniversityMontrealQuebec H3A 2T8Canada Erlangen Centre for Astroparticle Physics(ECAP) Friedrich-Alexander-University Erlangen-NürnbergErlangen 91058Germany Physics Department Carleton UniversityOttawaOntario K1S 5B6Canada Department of Physics Duke Universityand Triangle Universities Nuclear Laboratory(TUNL)DurhamNorth Carolina 27708USA Physics Department University of IllinoisUrbana-ChampaignIllinois 61801USA Institute for Theoretical and Experimental Physics named by A.I.Alikhanov of National Research Centre“Kurchatov Institute” Moscow 117218Russia Department of Physics University of South DakotaVermillionSouth Dakota 57069USA SLAC National Accelerator Laboratory Menlo ParkCalifornia 94025USA TRIUmF VancouverBritish Columbia V6T 2A3Canada Institute of High Energy Physics Beijing 100049China Department of Physics Laurentian UniversitySudburyOntario P3E 2C6Canada Physics Department Colorado State UniversityFort CollinsColorado 80523USA Department of Physics and Physical Oceanography University of North Carolina at WilmingtonWilmingtonNC 28403USA Physics Department and CEEm Indiana UniversityBloomingtonIndiana 47405USA Physics Department Stanford UniversityStanfordCalifornia 94305USA Department of Physics Drexel UniversityPhiladelphiaPennsylvania 19104USA Amherst Center for Fundamental Interactions and Physics Department University of MassachusettsAmherstMA 01003USA Technische Universität münchen Physikdepartment and Excellence Cluster UniverseGarching 80805Germany Physics Department University of MarylandCollege ParkMaryland 20742USA Department of Physics and Astronomy University of AlabamaTuscaloosaAlabama 35487USA Wright Laboratory Department of PhysicsYale UniversityNew HavenConnecticut 06511USA IBS Center for Underground Physics Daejeon 34126Korea Department of Physics and Astronomy Stony Brook UniversitySUNYStony BrookNew York 11794USA Kellogg Lab CaltechPasadenaCalifornia 91125USA LHEP Albert Einstein CenterUniversi

A new search for two-neutrino double-beta(2νββ)decay of^(136)Xe to the 0+1 excited state of 136Ba is performed with the full EXO-200 dataset.A deep learning-based convolutional neural network is used to discriminate signal from background *** detection efficiency is increased relative to previous searches by EXO-200 by more than a factor of *** the addition of the Phase II dataset taken with an upgraded detector,the median 90%confidence level half-life sensitivity of 2νββdecay to the 0+1 state of 136Ba is 2.9×10^(24)yr using a total^(136)Xe exposure of 234.1 kg *** statistically significant evidence for 2νββdecay to the 0^(+)_(1)state is observed,leading to a lower limit of T2ν1/2(0^(+)→0^(+)_(1))>1.4×10^(24)yr at 90%confidence level,improved by 70%relative to the current world's best constraint.

关键词： EXO-200 experiment neutrinoless double beta decay excited state

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Procedural complexity independent of P2Y12 reaction unit(PRU)values is associated with acute in situ thrombosis in Pipeline flow diversion of cerebral aneurysms

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Stroke & Vascular Neurology 2018年第3期3卷 169-175页

作者： Bowen Jiang matthew T Bender Erick m Westbroek Jessica K Campos Li-mei Lin Risheng Xu Rafael J Tamargo Judy Huang Geoffrey P Colby Alexander L coon Department of Neurosurgery Johns Hopkins University School of MedicineBaltimoreMarylandUSA Department of Neurosurgery University of CaliforniaIrvine School of MedicineOrangeCaliforniaUSA Department of Neurosurgery University of CaliforniaLos AngelesLos AngelesCaliforniaUSA

background Acute in situ thrombosis is an ischaemic phenomenon during Pipeline embolisation device(PED)procedures with potentially high morbidity and *** is controversy regarding the role of platelet function testing with P2Y12 assay as a predictor of intraprocedural thromboembolic *** is limited knowledge on whether procedural complexity influences these *** Data were collected retrospectively on 742 consecutive PED cases at a single *** with intraprocedural acute thrombosis were compared with patients without these *** A cohort of 37 PED cases with acute in situ thrombosis(mean age 53.8 years,mean aneurysm size 8.4 mm)was matched with a cohort of 705 PED cases without intraprocedural thromboembolic events(mean age 56.4 years,mean aneurysm size 6.9 mm).All patients with in situ thrombosis received intra-arterial and/or intravenous *** two groups were evenly matched in patient demographics,previous treatment/subarachnoid hemorrhage(SAH)and aneurysm *** was no statistical difference in postprocedural P2Y12 reaction unit(PRU)values between the two groups,with a mean of 156 in the in situ thrombosis group vs 148 in the control group(p=0.5894).Presence of cervical carotid tortuosity,high cavernous internal carotid artery grade,need for multiple PED and vasospasm were not significantly different between the two *** in situ thrombosis group had statistically significant longer fluoroscopy time(60.4 vs 38.4 min,pmGy,pmbosis cohort had higher incidence of major and minor stroke,intracerebral haemorrhage and length of *** Predictors of procedural complexity(higher radiation exposure,longer fluoroscopy time,adjunctive coiling and need for balloon angioplasty)are asso

关键词： P2Y12 matched balloon

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Flow diversion covering the m1 origin as a last resort

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Stroke & Vascular Neurology 2019年第3期4卷 141-147页

作者： Li-mei Lin matthew T Bender Geoffrey P Colby Bowen Jiang Jessica K Campos David A Zarrin Robert W C Young Risheng Xu Justin m Caplan Judy Huang Rafael J Tamargo Alexander L coon Department of Neurosurgery University of California IrvineOrangeCaliforniaUSA Department of Neurosurgery Johns Hopkins University School of MedicineBaltimoreMarylandUSA Department of Neurosurgery University of California Los AngelesLos AngelesCaliforniaUSA

Introduction Internal carotid artery termination(ICAT)and proximal A1 aneurysms can be challenging for open surgical clipping or endovascular *** with flow diversion covering the middle cerebral artery(mCA),an end vessel supplying a terminal circulation,has not been *** A prospective,Institutional Review Board-approved database was analysed for patients with pipeline embolisation device(PED)placement from the anterior cerebral artery(ACA)to the ICA during cerebral aneurysm *** Nine cases were identified,including five proximal A1,three posterior communicating artery and one ICAT aneurysm *** aneurysm size was 8.3 mm(range 3-17),with 67%saccular and 78%*** indication for treatment was significant dome irregularity(44%),recurrence or enlargement(33%),underlying collagen vascular disorder(11%)and traumatic pseudoaneurysm(11%).Preservation of the ipsilateral ACA(with PED placed in A1)was performed when the anterior communicating artery(67%)or contralateral A1(33%)were absent on *** coiling was done in four cases(44%).There was one major stroke leading to mortality(11%)and one minor stroke(11%).Clinical follow-up was 27 months on ***-up digital subtraction angiography(average interval 15 months)showed complete aneurysm obliteration(88%)or dome occlusion with entry remnant(12%).The jailed mCA showed minimal or mild delay(primarily anterograde flow)in 75%of cases and significant delay(reliance primarily on ACA and external carotid artery collaterals)in 25%.Conclusions Covering the mCA with a flow diverting stent should be reserved for select rare *** attention to blood pressure augmentation during the periprocedural period is necessary to minimise potential ischaemic compromise.

关键词： primarily resort sided

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石灰莹石混合物用于铸铁脱硫的发展及工业应用

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现代铸铁 1983年第4期 41-44页

作者： P.m.coon 周翔

英国铸铁研究协会的工作,说明石灰95％与莹石5％的混合物和多孔塞包联合使用,能够迅速地把铁水含硫量降到任意需要的程度,其中包括生产球墨铸铁与蠕墨铸铁所需的低含硫量. 组成这种混合物的原料价格便宜,容易买到。脱硫时产生的渣呈干... 详细信息

英国铸铁研究协会的工作,说明石灰95％与莹石5％的混合物和多孔塞包联合使用,能够迅速地把铁水含硫量降到任意需要的程度,其中包括生产球墨铸铁与蠕墨铸铁所需的低含硫量. 组成这种混合物的原料价格便宜,容易买到。脱硫时产生的渣呈干性粒状,容易从铁水表面除去.使用这种方法.与用碳化钙脱硫相比,不会引起环境污染,所产生的废渣没有气味,处理时也没有公害. 为了达到一定的脱硫程度,石灰、莹石混合物的加入量必须是碳化钙的两倍,但总的处理费用还是降低了。石灰,莹石混合物已经成功地在英国的铸造生产中用于各种铸铁的脱硫,每次处理铁水可达20吨,也可以进行连续脱硫.脱硫成本较低,废渣处理容易,这两种优点的结合,将会使石灰、莹石混合物法,在未来得到较大的应用.

关键词：铁水脱硫加入量包子程度铁水炉外脱硫面食石灰处理电石碳化钙多孔塞球墨铸铁

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非稳定油包水乳化油在多缸柴油机上的试验

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柴油机 1982年第9期 31-41页

作者： C.m.coon.Jr. 黄毅泉 (美)西南研究院

装在美国海岸警卫队军工生产委员会舰船上的主机有四冲程和二冲程柴油机两种,本研究院在这两种柴油机上进行了燃用油包水乳化油的试验,目的是为了证明烧这种油有否明显的节油可能。试验机上安装了能供给含水量从0到25%(占所供入的燃料... 详细信息

装在美国海岸警卫队军工生产委员会舰船上的主机有四冲程和二冲程柴油机两种,本研究院在这两种柴油机上进行了燃用油包水乳化油的试验,目的是为了证明烧这种油有否明显的节油可能。试验机上安装了能供给含水量从0到25%(占所供入的燃料总容积)的不稳定乳化油的试验性燃油系统。试验结果表明,四冲程柴油机在最常用的工况下烧含水量为15～25%的乳化油时可平均省油约2.5%;对二冲程柴油机,燃油消耗率并无明显下降,从所得的结果可下如此结论:美国海岸警卫队快艇柴油机烧这种类型的油包水乳化油得不到什么好处。

关键词：乳化油含水量舰船美国海岸警卫队四冲程含水率柴油机试验掺水量油包水

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使用三氟甲烷磺酸硝鎓的新硝化作用

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火炸药 1978年第4期 120-134页

作者： C.L.coon m.E.Hill W.G.Bucher 梁文绰 Stanford Research Institute(SRI)menlo Park CA94025 二五五厂技术情报室

SRI 最先报道在得到匹克汀尼兵工厂支持的一项研究中,用三氟甲烷磺酸硝鎓作芳香化合物的硝化剂。此种硝化剂在非常低的温度下硝化,比其他硝化系统有更高的异构物选择性（Isomer Selectivity）,这是其独特的地方。最近发现三氟甲烷磺酸... 详细信息

SRI 最先报道在得到匹克汀尼兵工厂支持的一项研究中,用三氟甲烷磺酸硝鎓作芳香化合物的硝化剂。此种硝化剂在非常低的温度下硝化,比其他硝化系统有更高的异构物选择性（Isomer Selectivity）,这是其独特的地方。最近发现三氟甲烷磺酸硝鎓的一种特殊用途,用于制备氧-18(O)标记炸药。本文对其这方面的应用作一介绍。

关键词：三氟甲烷磺酸毫克分子硝化剂二氯甲烷氯代烃硝酸氮化合物

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用肾上腺素和去甲肾上腺素诱导生产无附着基单体牡蛎苗

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国外水产 1989年第4期 18-20页

作者： coon, S. L. 王昭萍

用肾上腺素(EPI)和去甲肾上腺素(NE)均能诱导生产无附着基的单体牡蛎苗,其最佳浓度为10^(-4)m,最佳处理时间为1小时。在相同条件下,EPI比NE效果好,幼虫变态率高。对不同品种其诱导效果也不一样,实验表明,对太平洋牡蛎的诱导效果优于美... 详细信息

用肾上腺素(EPI)和去甲肾上腺素(NE)均能诱导生产无附着基的单体牡蛎苗,其最佳浓度为10^(-4)m,最佳处理时间为1小时。在相同条件下,EPI比NE效果好,幼虫变态率高。对不同品种其诱导效果也不一样,实验表明,对太平洋牡蛎的诱导效果优于美国牡蛎,但原因尚不清楚。经诱导变态生产的牡蛎苗无明显的长期副作用。

关键词：牡蛎苗肾上腺素去甲肾上腺素

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红外瞬态传感器

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应用光学 1989年第6期10卷 30-33页

作者： D.D.coon R.P.G.Karunasiri K.m.S.V.Bandara 顾洪武

已完成的实验表明,非本征硅注入型红外探测器可用于模拟生物视觉系统中的瞬态神经响应。神经响应为视觉系统焦平面平行处理提供了一种高通滤波的方法。高通滤波强调图象的瞬时性。适用的红外成象应用包括:观测、运动传感及跟踪。红外探... 详细信息

已完成的实验表明,非本征硅注入型红外探测器可用于模拟生物视觉系统中的瞬态神经响应。神经响应为视觉系统焦平面平行处理提供了一种高通滤波的方法。高通滤波强调图象的瞬时性。适用的红外成象应用包括:观测、运动传感及跟踪。红外探测器的输出脉冲足够大,因此不需要放大。这可以简化焦平面上或焦平面附近的平行处理。利用探测器及铺助电路的模型,对红外瞬态传感器方法进行定量分析。人们发现,模型和实验数据之间符合得很好。

关键词：焦平面瞬态高通滤波生物视觉输出脉冲视觉系统本征硅锁模响应率读出系统

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高性能红外集成探测器

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应用光学 1991年第2期12卷 36-38,43页

作者： S.D.Gunapala D.D.coon 陆培国

描述了 Si:P 红外集成探测器的性能改进。这种探测器具有 p-i-n 二极管结构,但红外探测方式还包括有在低温下以局部杂质状态存储在 i 区内的电荷的光电发射。在红外照射之后,占有局部态的剩余电荷就场离子化。为了测出剩余电荷,对瞬态... 详细信息

描述了 Si:P 红外集成探测器的性能改进。这种探测器具有 p-i-n 二极管结构,但红外探测方式还包括有在低温下以局部杂质状态存储在 i 区内的电荷的光电发射。在红外照射之后,占有局部态的剩余电荷就场离子化。为了测出剩余电荷,对瞬态场离子电流进行数字化和集成化。增加光敏区 i 的厚度和杂质浓度可提高量子效率。随着杂质浓度的增加,110μm 厚的探测器,在波长27μm左右,其量子效率可从0.5%增加到70%左右,而最大电荷存储时间(红外集成时间)可以从12h以上减少到1s 左右。

关键词：红外探测器 Si:P 模拟集成

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