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牦牛基因组拷贝数变异研究进展

畜牧兽医学报 2024年第3期55卷 933-943页

作者：徐东辉徐宇辉李瑞哲成海建马志杰青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016 山东省农业科学院畜牧兽医研究所济南250100 山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室济南250100

拷贝数变异(copy number variation, CNV)是基因组结构变异(structural variation, SV)的重要组成部分。与SNP(single nucleotide polymorphism)相比,CNV显示出更丰富的复杂遗传变异,在家畜重要经济性状遗传机理、疾病诱因和物种进化等... 详细信息

拷贝数变异(copy number variation, CNV)是基因组结构变异(structural variation, SV)的重要组成部分。与SNP(single nucleotide polymorphism)相比,CNV显示出更丰富的复杂遗传变异,在家畜重要经济性状遗传机理、疾病诱因和物种进化等研究方面具有重要意义。牦牛作为青藏高原的重要牛种,近年来随着高通量测序技术的快速发展和参考基因组的不断升级,其全基因组水平上CNV的研究获得重要进展。本文在阐述基因组CNV的形成原理、作用机制和检测方法基础上,综述了近10年来牦牛基因组CNV的研究现状,分析探究了存在的一些问题与不足,并对其未来的发展和应用趋势进行了展望,以期为深入开展牦牛基因组研究和加速牦牛遗传资源的分子育种进程提供参考。

关键词：牦牛基因组拷贝数变异(CNV)

Manufacture the conducting polymer with light

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Science China Chemistry 2025年第1期68卷 8-9页

作者： Yang li Tianyu li Yan Ji Baoguang liu College of Electronic and Optical Engineering & College of Flexible Electronics (Future Technology) Nanjing University of Posts & Telecommunications

Poly(3,4-ethylenedioxythiophene) (PEDOT), heralded as the “king” of conducting polymers, is esteemed in bioelectronics for its mixed electronic and ionic conductivity, mechanical properties compatible with biological tissues, tunable healing ability and stability in diverse environments [1]. Based on additive manufacturing of three-dimensional structures,PEDOT realizes the implementation in the efficient production of flexible bioelectronics, the construction of intricate electrode-neural implantations, and the development of smart brain-computer-interfaces [2].

关键词：

野牦牛及青海地方牦牛品种全线粒体基因组母系遗传多样性、分化及系统发育分析

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畜牧兽医学报 2022年第5期53卷 1420-1430页

作者：李广祯马志杰陈生梅雷初朝李瑞哲谢银禄晁生玉青海大学畜牧兽医科学院西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室西宁810016 西北农林科技大学动物科技学院杨凌712100 青海省格尔木市畜牧兽医站格尔木816000 青海省海西州农业技术推广服务中心德令哈817099

旨在从分子水平上探究野牦牛及青海地方牦牛品种的母系遗传多样性、群体遗传结构、亲缘关系和遗传背景。本研究在测定青海省4个地方牦牛品种(即青海高原、环湖、雪多和玉树牦牛)22条全线粒体基因组(Mitogenome)序列的基础上,从GenBank... 详细信息

旨在从分子水平上探究野牦牛及青海地方牦牛品种的母系遗传多样性、群体遗传结构、亲缘关系和遗传背景。本研究在测定青海省4个地方牦牛品种(即青海高原、环湖、雪多和玉树牦牛)22条全线粒体基因组(Mitogenome)序列的基础上,从GenBank下载了已公布的野牦牛及上述4个地方牦牛品种的142条相应序列,使用BioEdit 7.2.5、Arlequin 3.11和Network 10.1等软件对共计164条线粒体基因组序列进行综合分析。结果显示:1)根据序列间核苷酸变异共确定了115种单倍型,其中野牦牛和青海地方牦牛品种分别拥有22种和93种单倍型;在野牦牛和青海高原、环湖、雪多、玉树牦牛中分别检测到22、26、18、23、19种特有的单倍型。遗传多样性分析显示,野牦牛单倍型多样度最高(0.9928±0.0144),且高于4个青海地方牦牛品种的单倍型多样度(0.9731±0.0077);4个青海地方牦牛品种单倍型多样度大小依次为:雪多牦牛(0.9885±0.0126)、玉树牦牛(0.9758±0.0187)、青海高原牦牛(0.9730±0.0166)和环湖牦牛(0.9393±0.0278)。2)野牦牛与环湖牦牛之间的固定分化指数值(F_(ST)值)最大(0.0412),分化程度最高,而与玉树牦牛间的F_(ST)值最小(-0.0088),分化程度最低。青海4个地方牦牛品种中,雪多牦牛与青海高原牦牛之间F_(ST)值最大(0.0358),分化程度最高,而雪多牦牛与环湖牦牛间F_(ST)值最小(0.0112),分化程度最低。3)聚类分析显示,4个青海地方牦牛品种各自为1类,存在明显的母系遗传差异。相比而言,环湖牦牛和雪多牦牛聚类较近,青海高原牦牛和玉树牦牛聚类较近,而野牦牛与玉树牦牛聚类关系更近,各品种(群体)间的聚类结果与其分化程度、地理分布一致。4)系统发育分析表明,115种单倍型分布在3个大的母系遗传分支(即Mt-Ⅰ、Mt-Ⅱ和Mt-Ⅲ),其中Mt-Ⅰ支系所占比例为72.17%,由A、B、E和F 4种单倍型组构成;Mt-Ⅱ支系包括C、D和H 3种单倍型组,占26.09%;而Mt-Ⅲ支系只包含G单倍型组,由雪多牦牛和野牦牛所拥有,所占比例为1.74%,提示牦牛有3个母系起源。综上所述,野牦牛和青海4个地方牦牛品种均具有丰富的母系遗传多样性,其多样性水平由高到低依次为野牦牛、雪多牦牛、玉树牦牛、青海高原牦牛和环湖牦牛。青海4个地方牦牛品种间及与野牦牛间的遗传分化程度均较弱,但各自拥有特有的母系遗传信息,存在明显的母系遗传差异。野牦牛和青海家牦牛品种由3个母系支系组成,推测牦牛有3个母系起源。

关键词：牦牛线粒体基因组遗传多样性分化聚类关系系统发育

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有机纤维与聚合物对水泥混凝土层间黏结性能影响研究

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混凝土 2015年第1期 90-93页

作者：徐方袁宗征刘苗李睿哲陈建平中国地质大学(武汉)工程学院土木工程系湖北武汉430074

水泥混凝土中掺加有机纤维或聚合物能够提高其层间黏结性能。通过层间抗剪强度试验和层间抗拉强度试验方法研究了掺加有机纤维与聚合物对提高水泥混凝土层间黏结强度的效果。对比研究在不同聚合物改性水泥净浆作为界面剂的条件下,水泥... 详细信息

水泥混凝土中掺加有机纤维或聚合物能够提高其层间黏结性能。通过层间抗剪强度试验和层间抗拉强度试验方法研究了掺加有机纤维与聚合物对提高水泥混凝土层间黏结强度的效果。对比研究在不同聚合物改性水泥净浆作为界面剂的条件下,水泥混凝土抗拉黏结性能受影响的情况,并对界面剂的配合比;并通过劈裂抗拉黏结性能试验,研究了影响界面黏结性能的浇筑方式和界面黏结剂配合。结果表明:将有机纤维与聚合物掺入水泥混凝土中能够显著提高层间黏结强度,其中丁苯DB-1乳液改性水泥净浆效果最优,尤其当改性水泥净浆作为界面剂的掺量配合比为水泥∶DB-1乳液=3∶2时,新老混凝土可得到较好的层间黏结性能。

关键词：水泥混凝土层间黏结强度有机纤维聚合物界面剂

A Wind Tunnel Experimental Study on the Wake Characteristics of a Horizontal Axis Wind Turbine

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Journal of Thermal Science 2025年第1期34卷 145-158页

作者： GUO Xingduo li Yinran li Rennian MA Yulong WEI Kui College of Energy and Power Engineering Lanzhou University of Technology Key Laboratory of Fluid Machinery and Systems Gansu Provincial Technology Centre for Wind Turbines

The characteristics of wind turbine wakes are influenced by multiple factors,including the atmospheric boundary layer(ABL) wind and wind turbine operating conditions(e.g.,tip speed ratio and yaw angle).In this study,two types of ABL winds with different velocity gradients and turbulence intensities are generated in a wind tunnel through configurations of spires,baffles,and various numbers of roughness elements.A wind turbine with a rotor diameter of 0.8 m and a hub height of 0.6 m is tested under varying tip speed ratios,yaw angles,and ABL wind *** results indicate that the streamwise velocity deficit in the near-wake region becomes more pronounced with an increase in the tip speed ratio,while the far-wake velocity deficit remains largely unaffected by changes in the tip speed *** the yaw angle increases,the wake deflection becomes more prominent and the wake narrows;the offset of the wake center at various downstream positions grows linearly,reaching a maximum value of approximately half the rotor ***,the turbulence level and influence range in the wake region are reduced when the turbine is *** ABL wind conditions,high turbulence intensity in the incoming flow accelerates wake recovery,and the Reynolds stress at different lateral positions tends to become consistent with increasing longitudinal ***,turbulence has a significant impact on the meandering characteristics of the wind turbine wake,with greater fluctuations in the wake center observed under higher turbulence ***,this study provides insights that could inform the optimal operation of wind farms.

关键词： horizontal axis wind turbine turbulence wind tunnel experiment wind turbine wake

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牦牛全基因组关联研究进展

中国畜牧杂志 2024年第12期60卷 41-47页

作者：徐宇辉吴志鹏盛欣李瑞哲马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海西宁810016

全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,GWAS)是利用全基因组范围内高密度的分子标记,以连锁不平衡为基础研究动植物复杂性状遗传机制的一种群体遗传学方法。通过GWAS挖掘影响牦牛重要性状的候选基因,探究表型与基因型间的关... 详细信息

全基因组关联研究(Genome-wide Association Study,GWAS)是利用全基因组范围内高密度的分子标记,以连锁不平衡为基础研究动植物复杂性状遗传机制的一种群体遗传学方法。通过GWAS挖掘影响牦牛重要性状的候选基因,探究表型与基因型间的关系,并将鉴定到的候选基因应用于其分子育种实践中,能够加快牦牛的选育效率,进而提高经济效益。本文介绍了GWAS的基本原理、研究策略及优缺点,综述了GWAS在牦牛生长发育、毛、角等性状研究中取得的研究进展,以期为今后深入解析牦牛经济性状的遗传机理以及开展牦牛分子育种实践提供参考。

关键词： GWAS 性状 QTL 牦牛

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BAF53a表达对口腔鳞状细胞癌患者预后的影响

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郑州大学学报（医学版） 2020年第4期55卷 512-515页

作者：李蕴蕴李瑞喆秦慧郭茹菲杨召阳尹玉慧王静李珊珊郑州大学第一附属医院口腔科郑州450052 郑州大学第一附属医院病理科郑州450052

目的:探讨BAF53a在口腔鳞状细胞癌(口腔鳞癌)组织中的表达及其与临床病理参数的关系,从而为口腔鳞癌的诊断及预后判断提供依据。方法:采用免疫组化法检测BAF53a在口腔鳞癌组织以及其对应癌旁正常组织中的表达情况,并分析其与患者的性别... 详细信息

目的:探讨BAF53a在口腔鳞状细胞癌(口腔鳞癌)组织中的表达及其与临床病理参数的关系,从而为口腔鳞癌的诊断及预后判断提供依据。方法:采用免疫组化法检测BAF53a在口腔鳞癌组织以及其对应癌旁正常组织中的表达情况,并分析其与患者的性别、年龄、组织学分级、T分期、淋巴结转移的关系,探讨其与总生存期之间的关系。结果:口腔鳞癌组织中BAF53a蛋白的高表达率高于相应癌旁正常组织(P0.05),而与T分期(P<0.001)、淋巴结转移(P=0.022)和组织学分级(P=0.026)有关。单因素分析结果显示,T分期、淋巴结转移、组织学分级及BAF53a的表达与患者的预后有关(P<0.05)。Cox分析结果显示,肿瘤的组织学分级和BAF53a是影响患者总生存期的因素。结论:BAF53a蛋白的高表达对评估口腔鳞癌的预后有潜在的应用价值,提示BAF53a可作为判断口腔鳞癌预后的有效指标。

关键词： BAF53a 口腔鳞状细胞癌总生存期

Photo‑Energized MoS_(2)/CNT Cathode for High‑Performance li–CO_(2)Batteries in a Wide‑Temperature Range

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Nano-Micro Letters 2025年第1期17卷 160-175页

作者： Tingsong Hu Wenyi lian Kang Hu Qiuju li Xueliang Cui Tengyu Yao Laifa Shen Jiangsu Key Laboratory of Materials and Technologies for Energy Storage College of Materials Science and TechnologyNanjing University of Aeronautics and AstronauticsNanjing 210016People’s Republic of China

li–CO_(2) batteries are considered promising energy storage systems in extreme environments such as Mars;however,severe performance degradation will occur at a subzero temperature owning to the sluggish reaction ***,a photo-energized strategy adopting sustainable solar energy in wide working temperature range li–CO_(2) battery was achieved with a binder-free MoS_(2)/carbon nanotube(CNT)photo-electrode as *** unique layered structure and excellent photoelectric properties of MoS_(2) facilitate the abundant generation and rapid transfer of photo-excited carriers,which accelerate the CO_(2) reduction and li_(2)CO_(3) decomposition upon *** illuminated battery at room temperature exhibited high discharge voltage of 2.95 V and mitigated charge voltage of 3.27 V,attaining superior energy efficiency of 90.2%and excellent cycling stability of over 120 *** at an extremely low temperature of−30℃,the battery with same electrolyte can still deliver a small polarization of 0.45 V by the photoelectric and photothermal synergistic mechanism of MoS_(2)/CNT *** work demonstrates the promising potential of the photo-energized wide working temperature range li–CO_(2) battery in addressing the obstacle of charge overpotential and energy efficiency.

关键词： li-CO_(2)batteries Photo-energized Wide operation-temperature Kinetics MoS_(2)

Constraints on holographic QCD phase transitions from PTA observations

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2025年第1期Mechanics & Astronomy) .卷 71-78页

作者： Song He li li Sai Wang Shao-Jiang Wang Center for Theoretical Physics and College of Physics Jilin University School of Physical Science and Technology Ningbo University Max Planck Institute for Gravitational Physics (Albert Einstein Institute) CAS Key Laboratory of Theoretical Physics Institute of Theoretical Physics Chinese Academy of Sciences School of Fundamental Physics and Mathematical Sciences Hangzhou Institute for Advanced StudyUniversity of Chinese Academy of Sciences (UCAS) School of Physical Sciences University of Chinese Academy of Sciences (UCAS) Theoretical Physics Division Institute of High Energy Physics Chinese Academy of Sciences

The underlying physics of QCD phase transition in the early Universe remains largely unknown due to its strong-coupling nature during the quark-gluon plasma/hadron gas transition, yet a holographic model has been proposed to quantitatively fit the lattice QCD data while with its duration of the first-order phase transition(FoPT) left undetermined. At specific baryon chemical potential, the first-order QCD phase transition agrees with the observational constraint of baryon asymmetry. It, therefore, provides a scenario for phase transition gravitational waves(GWs) within the standard model of particle physics. If these background GWs could contribute dominantly to the recently claimed common-spectrum red noise from pulsar timing array(PTA) observations, the duration of this FoPT can be well constrained, and the associated primordial black holes are still allowed by current observations.

关键词： pulsar timing array QCD phase transition gravitational waves primordial black holes