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Comparison of sequencing-based and array-based genotyping platforms for genomic prediction of maize hybrid performance

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The Crop Journal 2023年第2期11卷 490-498页

作者： Guangning Yu Yanru Cui Yuxin jiao Kai Zhou Xin Wang Wenyan Yang Yiyi Xu Kun Yang Xuecai Zhang pengcheng Li Zefeng Yang Yang Xu Chenwu Xu Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of Education/Jiangsu Key Laboratory of Crop Genomics and Molecular Breeding/Jiangsu Co-Innovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops College of AgricultureYangzhou UniversityYangzhou 225009JiangsuChina State Key Laboratory of North China Crop Improvement and Regulation Hebei Agricultural UniversityBaoding 071001HebeiChina International Maize and Wheat Improvement Center(CIMMYT) 06600 Mexico D.F.Mexico

Genomic selection(GS)is a powerful tool for improving genetic gain in maize ***,its routine application in large-scale breeding pipelines is limited by the high cost of genotyping *** sequencing-based and array-based genotyping platforms have been used for GS,few studies have compared prediction performance among *** this study,we evaluated the predictabilities of four agronomic traits in 305 maize hybrids derived from 149 parental lines subjected to genotyping by sequencing(GBS),a 40K SNP array,and target sequence capture(TSC)using eight GS *** GBS marker dataset yielded the highest predictabilities for all traits,followed by TSC and SNP array *** investigated the effect of marker density and statistical models on predictability among genotyping platforms and found that 1K SNPs were sufficient to achieve comparable predictabilities to 10K and all SNPs,and BayesB,GBLUP,and RKHS performed well,while XGBoost performed poorly in most *** also selected significant SNP subsets using genome-wide association study(GWAS)analyses in three panels to predict hybrid *** facilitated selecting effective SNP subsets for GS and thus reduced genotyping cost,but depended heavily on the GWAS *** conclude that there is still room for optimization of the existing SNP array,and using genotyping by target sequencing(GBTS)techniques to integrate a few functional markers identified by GWAS into the 1K SNP array holds great promise of being an effective strategy for developing desirable GS breeding arrays.

关键词： Genomic selection Maize GBS SNP array Marker density

Augmentation-based discriminative meta-learning for cross-machine few-shot fault diagnosis

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Science China(Technological Sciences) 2023年第6期66卷 1698-1716页

作者： XIA pengcheng HUANG YiXiang WANG YuXiang LIU ChengLiang LIU Jie State Key Laboratory of Mechanical System and Vibration Shanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China MoE Key Lab of Artificial Intelligence AI InstituteShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China Department of Mechanical and Aerospace Engineering Carleton UniversityOttawa ON K1S 5B6Canada

Deep learning methods have demonstrated promising performance in fault diagnosis *** the scarcity of data in industrial scenarios limits the practical application of such methods,transfer learning effectively tackles this issue through crossmachine knowledge ***,the cross-machine few-shot problem,which is a more general industrial scenario,has been rarely *** studies have not considered the cross-machine domain shift problem,which results in poor testing *** paper proposes an augmentation-based discriminative meta-learning method to address this *** the meta-training process,signal transformation is proposed to increase the meta-task diversity for more robust feature learning,and multi-scale learning is combined for more adaptive feature *** the meta-testing process,limited labeled fault information is used to promote model generalization in the target domain through quasi-meta-training based on data ***,a novel hyperbolic prototypical loss is proposed for more discriminative feature representation and separable category prototypes by designing a hyperbolic decision ***-machine few-shot diagnosis experiments were conducted using three datasets from different machines,namely,the bearing,motor,and gear *** effectiveness of the proposed method was verified through ablation and comparison studies.

关键词： fault diagnosis few-shot learning meta-learning data augmentation cross-machine discriminative loss

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二次抛物线形曲线梁平衡与几何解析方程

沈阳建筑大学学报（自然科学版） 2008年第5期24卷 757-761页

作者：赵颖华张金良焦鹏程孙国帅大连海事大学道路与桥梁研究所辽宁大连116026 沈阳建筑大学土木工程学院辽宁沈阳110168

目的对形心轴线为二次抛物线形曲线梁的内力、几何方程进行理论分析与公式推导.方法应用矢量几何与微分学理论,推导出平面二次曲线梁在空间分布力系作用下的内力、几何解析方程,其表达式方程最终可表示为全局坐标系下的解析函数.结果为... 详细信息

目的对形心轴线为二次抛物线形曲线梁的内力、几何方程进行理论分析与公式推导.方法应用矢量几何与微分学理论,推导出平面二次曲线梁在空间分布力系作用下的内力、几何解析方程,其表达式方程最终可表示为全局坐标系下的解析函数.结果为了验证其正确性,在最后通过令参数取值趋向于极限值,其内力、几何方程恰好回归到直梁表达方程形式.结论本例推导所采用的构件形式是不考虑截面尺寸的平面曲线构件,得到的只是在各横截面位置处的内力、曲率表达形式,并不涉及到应力在横截面内的具体分布问题.

关键词：二次曲梁均布荷载连续曲率高阶小量解析方程

Characteristics of Eddy Current Attenuation and Thickness Measurement of Metallic Plate

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Chinese Journal of Mechanical Engineering 2019年第6期32卷 92-100页

作者： Zhiwei Zeng pengcheng Ding Jiayi Li Shaoni jiao Junming Lin Yonghong Dai School of Aerospace Engineering Xiamen UniversityXiamen 361005China Work Station of Academicians Fujian Province(Eddysun)Xiamen 361008China

In eddy current testing, the law of attenuation of eddy current(EC) is of great concern. In conductive half space under the excitation of uniform magnetic field, the EC density decreases exponentially in the depth direction. However, in conductor with finite thickness tested by coil, the distribution of EC in the depth direction is more complicated. This paper studies the characteristics of EC attenuation in metallic plate of finite thickness. Simulation results show that there is an EC reflection at the bottom of plate, which changes the law of EC attenuation. A new concept, namely the equivalent attenuation coefficient, is proposed to quantify the speed of EC attenuation. The characteristics of EC attenuation are utilized to explain the nonmonotonic relation between coil voltage and plate thickness. Procedure of selecting frequency is discussed. Thereafter, measurement of plate thickness is carried out and accurate result is obtained.

关键词： Eddy current testing Attenuation of eddy current Thickness measurement Metallic plate

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新疆罗布泊盐湖深部钾盐找矿新进展

地质学报 2014年第6期88卷 1011-1024页

作者：焦鹏程刘成林颜辉陈永志顾新鲁孙小虹宣之强赵海彤李文学中国地质科学院矿产资源研究所北京100037 国投新疆罗布泊钾盐开发有限责任公司新疆哈密839000 新疆第二水文地质工程地质大队新疆昌吉831100

罗布泊是世界最大干盐湖之一,罗布泊超大型钾盐矿床从1995年发现至今,经历了找钾远景预测、勘查、系统科学研究、扩大找矿及开发利用快速推进的过程,浅部(200m以浅)钾盐资源量已基本查明,但没有一个穿透第四系的较深地质科学钻井。通过... 详细信息

罗布泊是世界最大干盐湖之一,罗布泊超大型钾盐矿床从1995年发现至今,经历了找钾远景预测、勘查、系统科学研究、扩大找矿及开发利用快速推进的过程,浅部(200m以浅)钾盐资源量已基本查明,但没有一个穿透第四系的较深地质科学钻井。通过区域气候条件、盐类矿物分布、碎屑岩层储卤等方面与柴达木盆地西部的对比分析以及罗布泊地堑式断陷带储卤的发现,提出罗布泊深部具有钾盐成矿远景。在罗布泊罗北凹地西北部实施盐湖深部钾盐找矿第一深井(LDK01井),首次发现钾芒硝、钾锶矾、红钾铁盐等盐类矿物;在深部地层碎屑岩层中发现钾盐矿物钾石盐、光卤石等,地层中KCl含量高达2.86%,揭示地层深部存在低品位固体钾矿,确定为一种新类型钾矿,即碎屑岩型钾矿,为罗布泊深部钾盐找矿拓展了方向和空间;深层碎屑岩地层储集卤水,卤水KCl平均品位1.50%,揭示出罗布泊盐湖深部存在富钾卤水。重力探测发现罗布泊盆地西部发育次级凹地,初步确定凹地中心第四系沉积厚度大于1200m。结合地质分析,预测库鲁克塔格山前断陷盆地和罗北盆地为进一步寻找深部隐伏钾盐矿床的重要靶区。综合遥感、物探、物性特征等资料及研究成果,估算罗北凹地深部钾盐预测资源量为1.60×108t,并提出罗北凹地西部及附近区域的深部地层中还蕴藏有丰富的钾盐资源,罗布泊深部找钾潜力巨大。该成果对深化认识罗布泊盐湖的形成演化及满足钾肥生产企业大规模开发均具有重要意义。

关键词：新疆罗布泊 LDK01井固体钾盐富钾卤水深部找钾

他莫昔芬联合左炔诺孕酮对大鼠子宫肌瘤的影响及机制研究

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陕西医学杂志 2024年第5期53卷 589-592,597页

作者：徐霞张红王鹏程韩璐上海交通大学医学院苏州九龙医院妇科江苏苏州215000 苏州大学附属第一人民医院妇科江苏苏州215006

目的:探讨他莫昔芬联合左炔诺孕酮对大鼠子宫肌瘤的影响及其作用机制。方法:选择SPF级成年雌性SD大鼠30只,采用苯甲酸雌二醇联合黄体酮腹腔注射建立子宫肌瘤模型。将大鼠随机分为对照组(正常大鼠2 ml 0.9%氯化钠溶液灌胃)、模型组(子宫... 详细信息

目的:探讨他莫昔芬联合左炔诺孕酮对大鼠子宫肌瘤的影响及其作用机制。方法:选择SPF级成年雌性SD大鼠30只,采用苯甲酸雌二醇联合黄体酮腹腔注射建立子宫肌瘤模型。将大鼠随机分为对照组(正常大鼠2 ml 0.9%氯化钠溶液灌胃)、模型组(子宫肌瘤大鼠2 ml 0.9%氯化钠溶液灌胃)、他莫昔芬组(子宫肌瘤大鼠1.70 mg/kg他莫昔芬灌胃)、左炔诺孕酮组(子宫肌瘤大鼠0.1 mg/kg左炔诺孕酮灌胃)和联合组(子宫肌瘤大鼠他莫昔芬联合左炔诺孕酮灌胃),每组6只,连续灌胃30 d。ELISA检测大鼠血清雌二醇(E2)、孕激素、促卵泡激素(FSH)、促黄体生成素(LH)水平。测量子宫系数、左右宫颈角长度及宫角最大直径。HE染色观察子宫组织结构及内膜厚度。Western blot检测子宫组织Wnt5b、β-连环蛋白(β-catenin)蛋白表达。结果:与对照组比较,模型组血清E2、孕激素、FSH、LH水平升高(均P<0.05)。联合组血清E2、孕激素、FSH、LH水平低于他莫昔芬组和左炔诺孕酮组(均P<0.05)。模型组子宫系数、左右宫颈角长度、宫角最大直径及子宫内膜厚度较对照组增加(均P<0.05)。联合组子宫系数、左右宫颈角长度、宫角最大直径及子宫内膜厚度低于他莫昔芬组和左炔诺孕酮组(均P<0.05)。联合组子宫损伤程度较模型组减轻。模型组子宫组织Wnt5b、β-catenin蛋白表达高于对照组(均P<0.05)。联合组Wnt5b、β-catenin蛋白表达低于他莫昔芬组和左炔诺孕酮组(均P<0.05)。结论:他莫昔芬联合左炔诺孕酮能够缩小大鼠子宫肌瘤,改善子宫形态,抑制子宫平滑肌细胞增大,其机制可能与抑制Wnt/β-catenin通路有关。

关键词：子宫肌瘤他莫昔芬左炔诺孕酮 Wnt通路 β-连环蛋白大鼠

罗布泊盐湖富钾卤水成因再探讨--碎屑层卤水蒸发实验分析

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矿床地质 2016年第6期35卷 1190-1204页

作者：孙小虹刘成林焦鹏程颜辉陈永志马黎春张永明王春连李文学中国地质科学院矿产资源研究所国土资源部成矿作用与资源评价重点实验室北京100037 中国科学院青海盐湖研究所青海西宁810008 国投新疆罗布泊钾盐有限责任公司新疆哈密839000

罗布泊盐湖钙芒硝岩孔隙中蕴藏有超大型规模的卤水钾矿,富钾卤水成因一直备受关注。罗北凹地从统一的罗布泊大湖区中分隔出来后,成盐过程中其湖水仍以南部大湖的补给为主,罗北凹地卤水化学演化与"大耳朵"湖水密切相关。"大耳朵"湖区含... 详细信息

罗布泊盐湖钙芒硝岩孔隙中蕴藏有超大型规模的卤水钾矿,富钾卤水成因一直备受关注。罗北凹地从统一的罗布泊大湖区中分隔出来后,成盐过程中其湖水仍以南部大湖的补给为主,罗北凹地卤水化学演化与"大耳朵"湖水密切相关。"大耳朵"湖区含石膏碎屑层普遍储藏有卤水,应该是罗北凹地盐湖的"源卤水",钾离子(ρ(K^+)为3.12 g/L左右)已初步富集,平均矿化度为198.83 g/L。为了查明该卤水的化学演化趋势及析盐序列,笔者于2009年、2010年两次采集了大量卤水样品,分别进行室内等温蒸发和自然蒸发实验。蒸发实验结果表明:随着卤水浓缩首先析出(硬)石膏,随后析出大量石盐,最后出现少量钾石盐和光卤石,与EQL/EVP卤水蒸发模型模拟结果相似。将碎屑层卤水蒸发过程中化学组成变化与罗北凹地卤水进行对比,结果显示罗布泊古湖水蒸发至石膏沉积之后,在罗北凹地水化学组成明显发生变化,没有大量石盐沉积,而以钙芒硝沉积为主。推测应是受到深部"富钙水"的持续补给,而"大耳朵"湖起到"预备盆地"的作用,罗布泊古湖水经"大耳朵"湖蒸发浓缩后,钾离子得到初步富集,在流入罗北凹地后与深部"富钙"水混合,强烈蒸发浓缩,大量钙芒硝矿物析出,最后形成富钾卤水。

关键词：地球化学蒸发实验化学演化富钾卤水 “大耳朵"干盐湖罗布泊

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莎车盆地蒸发岩及盐矿物特征初探

化工矿产地质 2011年第3期33卷 137-142页

作者：曹养同焦鹏程宣之强刘成林赵宪福高超中国地质科学院矿产资源研究所北京100037

莎车盆地喀什皮拉里剖面岩矿扫描电镜及能谱仪分析表明,大量石膏岩中含有石盐、钙芒硝、杂卤石、天青石、白云石及钾镁硫酸盐组合,说明盆地已达到钾镁盐化学沉积阶段,是成钾找钾重要线索,值得研究关注。

关键词：莎车盆地喀什皮拉里剖面石膏与含钾矿物

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植物非生物逆境学科发展综述

植物生理学报 2024年第2期60卷 248-270页

作者：赵杨杨永青丁杨林张蘅谢彦杰赵春钊刘林川王鹏程中国科学院分子植物科学卓越创新中心/上海植物逆境生物学研究中心上海200032 中国农业大学生物学院北京100193 上海交通大学生命科学技术学院上海200240 南京农业大学生命科学学院南京210095 华南农业大学林学与风景园林学院广州510642 南方科技大学前沿生物技术研究院广东深圳518055

干旱、盐碱和极端温度等非生物胁迫严重抑制植物的生长和发育,是影响农业生产的主要环境因素。植物应答环境胁迫的分子机制一直是植物生物学的热点研究领域。本文邀请在非生物胁迫应答分子机制领域非常活跃的青年科学家,简要综述相关研... 详细信息

干旱、盐碱和极端温度等非生物胁迫严重抑制植物的生长和发育,是影响农业生产的主要环境因素。植物应答环境胁迫的分子机制一直是植物生物学的热点研究领域。本文邀请在非生物胁迫应答分子机制领域非常活跃的青年科学家,简要综述相关研究领域近年来的主要研究进展,并展望未来这一领域值得深入研究的一些科学问题,希望能引起对这一领域的更多的关注和思考。

关键词：非生物胁迫感受信号转导分子机制