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Pilot Study on the Intercalibration of a Categorisation System for FAlRer Digital Objects Related to Sensitive Data in the Life Sciences

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Data Intelligence 2022年第2期4卷 196-211页

作者： Christian Ohmann Romain David Monica Cano Abadia Florence Bietrix jan-Willem Boiten Steve Canham Maria Luisa Chiusano Walter Dastru Arnaud Laroquette Dario Longo Michaela Theresia Mayrhofer Maria Panagiotopoulou Audrey Richard Pablo Emilio Verde European Clinical Research Infrastructure Network(ECRIN) Paris 75013France European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents(ERINHA AISBL) Brussels 10ooBelgium Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure(BBMRI) Graz 8010Austria European Infrastructure for Translational Medicine(EATRIS) Amsterdam 1081 HZThe Netherlands European Advanced Translational Research Infrastructure(EATRIS)/Lygature Utrecht 3521 ALThe Netherlands European Marine Biological Resource Centre(EMBRC)Department of Agricultural Sciences University Federico Il of Naples via UniversitaNaples 80138Italy Department of Molecular Biotechnology and Health Sciences Molecular Imaging CenterUniversity of TorinoTorino I-10125Italy European Marine Biological Resource Centre(EMBRC) Paris 75252France European Research Infrastructure for Biological and Biomedical Imaging(Euro-Biolmaging) Torino 10126Italy European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents(ERINHA AISBL) Brussels 1000Belgium Coordination Centre for Clinical Trials Heinrich Heine University Dusseldorf Ringgold standard institutionNordrhein-Westfalen 40225Germany

Sharing sensitive data is a specific challenge for research infrastructures in the field of life *** that reason a toolbox has been developed,providing resources for researchers who wish to share and use sensitive data,to support the workflows for handling these kinds of digital *** and community approved annotations are required to be compliant with FAIR principles(Findability,Accessibility,Interoperability,Reusability).The toolbox makes use of a tagging(categorisation)system,allowing consistent labelling and categorisation of digital objects,in terms relevant to data sharing tasks and activities.A pilot study was performed within the Horizon 2020 project EOSC-Life,in which 2 experts from 6 life sciences research infrastructures were recruited to independently assign tags to the same set of 10 to 25 resources related to sensitive data management and data sharing(in total 110).Summary statistics of agreement and observer variation per research infrastructure are *** pilot study has shown that experts were able to attribute tags but in most cases with a considerable observer variation between *** the context of CWFR(Canonical Workflow Frameworks for Research),this indicates the necessity for careful definition,evaluation and validation of parameters and processes related to workflow *** results from this pilot study were used to tackle this issue by revising the categorisation system and providing an updated version.

关键词： Sensitive data CWFR EOSC-Life Life sciences Toolbox Categorisation system Tagging FAIR

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腰神经根CT多平面重组同层显示的解剖学特征及临床价值探讨

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中华放射学杂志 2007年第6期41卷 645-649页

作者：林井副李燕英王占宇叶红军王建和梁英魁姜力李晓娟张超葛合全王锐张燕群海军总医院影像科北京100037 北京理工大学医院放射科海军总医院骨科北京100037 海军总医院神经外科北京100037

目的探讨腰神经根(LNR)16层螺旋 CT 多平面重组同层显示的解剖学特征及临床价值。方法选55例腰椎正常者和23例经手术病理证实的 LNR 病变者(腰椎椎间盘突出症8例、椎管狭窄症5例、恶性肿瘤4例、创伤5例及结核1例)。使用美国 GE 公司生产... 详细信息

目的探讨腰神经根(LNR)16层螺旋 CT 多平面重组同层显示的解剖学特征及临床价值。方法选55例腰椎正常者和23例经手术病理证实的 LNR 病变者(腰椎椎间盘突出症8例、椎管狭窄症5例、恶性肿瘤4例、创伤5例及结核1例)。使用美国 GE 公司生产的 Light Speed 16层螺旋 CT 扫描,在工作站(ADW4.1)上利用 UNIX 操作系统进行 LNR 多平面重组,选取 LNR 走行清晰的同层显示层面,观察其解剖学特征。对病变者重点分析其异常表现。结果在斜冠状面上双侧LNR 可对称显示:55例(100%)L1～5的 LNR 均可分别单节段显示;55例(100%)L1～2或 L2～3,以及 L3～4的 LNR 均可同时显示2个节段;49例(88%)L1～3、46例(84%)L2～4、20例(36%)L3～5可同时显示3个节段;15例(27%)L1～4的 LNR 同时显示4个节段;8例(15%)同时显示5个节段LNR。每条 LNR 均能显示走行的起止点、方向、大小、形态、张力状态及毗邻关系。除斜冠状面外 LNR均不能对称显示,但显示的长度相对增加而数目减少,单根重组时 LNR 均显示的最长。LNR 异常主要表现受压23例,同时伴粘连20例,移位14例,萎缩13例,增粗9例。结论 16层螺旋 CT 的多平面重组同层显示技术是整体显示 LNR 解剖学特征极为理想的方法,它对 LNR 病变的影像学诊断奠定了基础。LNR 走行"同层显示"及"路标"的新概念,可能为其进一步影像学研究奠定基础。

关键词：神经根病腰骶丛体层摄影术,X线计算机图像处理,计算机辅助

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日本医蛭摄食前后不同组织中水蛭素基因(hirudin)的时空表达模式

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西南农业学报 2023年第7期36卷 1400-1405页

作者：石萍游华建邓小书陈仕江鲁增辉重庆市中药研究院重庆400065 重庆中医药学院重庆402760 中国中医科学院中药资源中心重庆分中心重庆400065

【目的】探究日本医蛭在不同摄食阶段、各个组织(唾液腺、肠、嗉囊、皮肤及精/卵巢)中水蛭素基因(hirudin)的时空表达模式,为水蛭药材的科学合理利用提供理论依据。【方法】基于水蛭唾液腺转录组数据筛选结果及基因克隆获得的水蛭素基... 详细信息

【目的】探究日本医蛭在不同摄食阶段、各个组织(唾液腺、肠、嗉囊、皮肤及精/卵巢)中水蛭素基因(hirudin)的时空表达模式,为水蛭药材的科学合理利用提供理论依据。【方法】基于水蛭唾液腺转录组数据筛选结果及基因克隆获得的水蛭素基因序列信息,利用实时荧光定量PCR方法,对水蛭关键活性成分的编码基因hirudin在不同摄食阶段、不同组织中的表达量进行检测分析,研究该基因的时空表达模式。【结果】水蛭素基因(hirudin)在日本医蛭的唾液腺、肠、嗉囊、皮肤及精/卵巢组织中均有表达,且在唾液腺中的表达量显著高于其他组织;Hirudin基因在不同摄食阶段的唾液腺组织中表达结果显示,摄食后第2天表达量显著升高,之后随着摄食时间的推延而呈下降趋势;Hirudin基因在嗉囊、肠中的表达量呈先升高后下降趋势,分别于摄食后第1、第2天达到最高,之后会随着停食时间延长呈下降趋势,尤其是在摄食后第7、第8天的表达量呈显著性降低;Hirudin基因在皮肤组织中也有表达,并随着停食时间的延长呈先升后降趋势,最高峰出现在摄食后第2天;在精/卵巢组织中,摄食期间hirudin基因的表达量最高,与其他摄食阶段的表达呈显著性差异。【结论】水蛭素基因(hirudin)在日本医蛭的唾液腺、肠、嗉囊、皮肤和精/卵巢组织中均有不同程度的表达,在唾液腺中的表达量显著高于其他组织。摄食行为及食物刺激可能影响水蛭素基因(hirudin)的表达,在不同摄食阶段的表达量存在显著差异。研究结果可为水蛭药材的科学采收加工、提取部位的科学选取、合理入药提供理论依据和技术支撑,对未来水蛭药材资源的可持续利用具有重要的参考价值。

关键词：日本医蛭水蛭素基因(hirudin) 摄食时空表达模式

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加快大型数据中心服务的可重构结构

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中国集成电路 2015年第1期24卷 55-68,89页

作者： Andrew Putnam Adrian M.Caulfield Eric S.Chung Derek Chiou Kypros Constantinide John Demme Hadi Esmaeilzadeh Jeremy Fowers Gopi Prashanth Gopal jan Gray Michael Haselman Scott Hauck Stephen Heil Amir Hormati Joo-Young Kim Sitaram Lanka James Larus Eric Peterson Simon Pope Aaron Smith Jason Thong Phillip Yi Xiao Doug Burger 微软公司

数据中心的工作负载要求高计算能力、灵活性、能效和低成本。同时改善所有这些因素非常具有挑战性。为了推进数据中心超出商用服务器设计可以提供的能力,我们设计并构建了一个可组合、可重构的结构,来加速部分大型软件服务。结构的每个... 详细信息

数据中心的工作负载要求高计算能力、灵活性、能效和低成本。同时改善所有这些因素非常具有挑战性。为了推进数据中心超出商用服务器设计可以提供的能力,我们设计并构建了一个可组合、可重构的结构,来加速部分大型软件服务。结构的每个实例都由嵌入48台机器的半机架6×8二维环面高端Stratix V FPGA组成。每台服务器中都放置了一个FPGA,可以通过PCIe来访问,并用成对的10 Gb SAS电缆直接连接到其他FPGA。在本文中,我们描述了这种结构在1,632台服务器组(bed)的中等规模的部署,并测量了其在加快Bing搜索引擎方面的功效。我们描述了系统的要求和架构,详细介绍了关键技术挑战,以及使系统在出现故障情况下保持鲁棒性所需的解决方案,还有根据排名候选文档测量的系统性能、功率和弹性。在高负载时,一定范围内的可重构结构提高了每台服务器固定延迟分布的吞吐量排名95%——或在保持等效吞吐量时,减少29%的尾延迟。

关键词：可重构结构服务器组数据中心 Stratix FPGA 计算能力工作负载软件服务

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钢骨轻骨料砼简支梁变形性能试验研究

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沈阳建筑工程学院学报 2000年第3期16卷 179-181页

作者：王连广李立新李敬先沈阳建筑工程学院土木系辽宁沈阳110015 辽宁建设集团工程总承包公司辽宁沈阳110006

通过钢骨轻骨料混凝土梁的抗弯性能试验研究 ,建立一个考虑交接面相对滑移影响的钢骨混凝土梁的变形微分方程 ,得到其变形计算公式 .

关键词：钢骨轻骨料混凝土梁弯曲变形试验

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Brugada syndrome: A new mutation found in Norway

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Open Journal of Internal Medicine（内科学期刊） 2012年第3期

作者： Eva-Lill Rice jan P. Loennechen Trond P. Leren Johnny Vegsundvåg Torstein Hole

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血清胱抑素C在肝硬化、肝癌患者继发肾功能改变的研究

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中国卫生检验杂志 2008年第12期18卷 2665-2666页

作者：周军杨晓莉周广军王贝晗张小丽张景王海燕首都医科大学门诊部北京100069 武警总医院北京100039

目的:探讨研究血清胱抑素C(Cystatin-C CYS-C)在肝硬化、肝癌患者继发肾功能改变的意义。方法:应用德灵公司全自动特定蛋白分析仪(BN propec)采用免疫散射比浊法测定66例肝硬化、64例肝癌与62例非肝肾病的胱抑素C。结果:肝硬化组与对照... 详细信息

目的:探讨研究血清胱抑素C(Cystatin-C CYS-C)在肝硬化、肝癌患者继发肾功能改变的意义。方法:应用德灵公司全自动特定蛋白分析仪(BN propec)采用免疫散射比浊法测定66例肝硬化、64例肝癌与62例非肝肾病的胱抑素C。结果:肝硬化组与对照组相比较,差异显著(1.25±0.51 VS 0.75±0.13,P0.05),肝硬化组异常增高的百分率为70.1%,肝癌组20.3%,对照组1.61%,肝硬化、肝癌组与对照组比较差异显著(P<0.01)。结论:胱抑素C可作为肝病合并继发肾功能损伤的首选重要指标。

关键词：肝硬化肝癌胱抑素C

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化学师范专业人才培养模式的改革与创新

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化工管理 2023年第17期 17-20页

作者：徐迈王凤武魏亦军胡云虎佟玲吴建伟梁铣淮南师范学院化学与材料工程学院安徽淮南232038

根据教育部师范类专业认证要求、理念和标准,以淮南师范学院化学专业为例,围绕“培养什么人,怎样培养人,为谁培养人”这一根本问题,文章介绍了化学专业人才培养模式改革与创新的举措及成效。

关键词：师范专业认证化学专业人才培养改革与创新

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吉林省西部苏打盐碱土GGR及植物体保水剂、吸水剂抗旱造林试验初报

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吉林林业科技 2006年第1期35卷 29-31页

作者：冷志巍张志王晓晶杨爱国刁守龙杨建芬白城市林业科学研究院吉林白城137000 镇赉县运管所吉林白城137300

在吉林省西部苏打盐碱土上抗旱造林,用保水剂处理成活率可提高20％左右;GCR+保水剂处理成活率可提高18％左右,但生长状况最好,地径平均值高出对照10％左右;而吸水剂处理的苗木,不论是在成活率上,还是在生长量上,作用均不明显。

关键词：苏打盐碱土 GGR 保水剂吸水剂抗旱造林

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爱尔兰的植物篱和竹林场之间的植物物种丰富度比较

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世界竹藤通讯 2012年第5期10卷 46-46页

作者： Litsa Bogaerts Iulia Klimina Steven Dauwe jan Ostermeyer Pieter Ostermeyer Davina VanGoethem Kris Verheyen Geert Potters 根特大学生物工程学院Coupurelinks653比利时根特B-9000 安特卫普大学生物工程系Groenenborgerlaan171比利时安特卫普B-2020 安特卫普海事学院 Noordkasteel Oost6比利时安特卫普B-2030

本研究的目的是探讨由几个外来竹种（***＇Alata’）组成的竹生物人工林是否对其周围固有的本地植物群系造成负面的影响。这项研究在爱尔兰都柏林的一个六年生的人工竹林中进行。这片竹林和与之特性相同的41个植物篱都经过了检查并得到... 详细信息

本研究的目的是探讨由几个外来竹种（***＇Alata’）组成的竹生物人工林是否对其周围固有的本地植物群系造成负面的影响。这项研究在爱尔兰都柏林的一个六年生的人工竹林中进行。这片竹林和与之特性相同的41个植物篱都经过了检查并得到了其完整物种清单。在42个取样区域共发现有101种物种。利用双向指示种分析法将这些样地分为11组，竹林和植物篱之间没有呈现出明显的区别。在记录树篱（hedges）数据的基础上，绘制了一个物种一面积关系，其关系为公式S=2．366A0．38。通过这个公式计算，竹场周围面积内所包含的物种应该只有37种而不是所发现的39种。多索伦森指数（MultipleS6rensenindices）被用来做每个树篱和竹场之间的两两相交，结果显示平均为0．41±0．10。鉴于结果显示竹场包括比预期更多的物种，并且双向指示种分析法不能明确区分竹和其邻近的之植物篱的基地环境，本研究得出以下结论，在农业环境中外来竹类资源的出现对本地植物区系的生态多样性没有不利的影响。

关键词：竹子植物篱物种丰富度双向指示种分析

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