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Investigation of Target Minimum and Maximum Dosimetric Criteria for the Evaluation of Standardized Radiotherapy Plan <br/>—Target Minimum and Maximum Evaluation

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International Journal of Medical Physics, Clinical Engineering and Radiation Oncology 2020年第2期9卷 43-51页

作者： Jialu Yu huazhi geng Yutao Gong Mitchell Machtay Himanshu R. Lukka Zhongxing Liao Ying Xiao Wei Zou Department of Radiation Oncology University of Pennsylvania Philadelphia USA Department of Radiation Oncology University Hospitals of Cleveland Cleveland USA Department of Radiation Oncology Juravinski Cancer Centre at Hamilton Health Sciences Hamilton USA Department of Radiation Oncology M D Anderson Cancer Center Houston USA

Purpose: Standardization of tumor dosimetric coverage is essential for the evaluation of radiotherapy treatment plan quality. National clinical trials network RTOG protocols include tumor target dosimetric criteria that specify the prescription dose and minimum and maximum dose (Dmin and Dmax) coverages. This study investigated the impact of various minimum and maximum dose definitions using tumor control probability (TCP) models. Methods and Materials: Three disease sites (head and neck, lung, and prostate) were studied using target volume dosimetric criteria from the RTOG 0920, 1308, and 0938 protocols. Simulated target dose-volume histograms (DVHs) of Dmin and Dmax were modeled using the protocol specifications. Published TCP models for the three disease sites were applied to the DVH curves. The effects of various dose definitions on TCP were studied. Results: While the prescription dose coverage was maintained, a -3.7% TCP difference was observed for head and neck cancer when the target doses varied by 3.5% of the tumor volume from the point dose. For prostate and lung cancers, -3.3% and -2.2% TCP differences were observed, respectively. The TCPs for head and neck and prostate cancers were more negatively affected by deviations in the Dmin than the TCP for lung cancer. The lung TCP increased to a greater extent with a change in the Dmax compared with the head and neck and prostate TCPs. Conclusions: These results can be used to evaluate plan quality when the target dose only slightly deviates from the dosimetric criteria. When the overall target prescription dose coverage is maintained, the Dmax is recommended to be within 3% of the target volume: 98% (for head and neck and prostate) and 97% (for lung) of the target volume, satisfying the Dmin needed to maintain TCP variations at less than 2.1%. Using 0.03 cc instead of a point dose for Dmin and Dmax criteria minimally impacts TCPs.

关键词： Rodiotherapy Target Dosimetric Criteria

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意大利蜜蜂工蜂中肠发育过程中的差异表达环状RNA及其调控网络分析

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中国农业科学 2018年第23期51卷 4575-4590页

作者：郭睿陈华枝熊翠玲郑燕珍付中民徐国钧杜宇王海朋耿四海周丁丁刘思亚陈大福福建农林大学蜂学学院

【目的】环状RNA(circular RNA,circRNA)在可变剪接、转录调控和来源基因的表达调控等方面具有重要功能。本研究旨在探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠发育过程中circRNA的表达谱及其发育过程中的差异表达circ... 详细信息

【目的】环状RNA(circular RNA,circRNA)在可变剪接、转录调控和来源基因的表达调控等方面具有重要功能。本研究旨在探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠发育过程中circRNA的表达谱及其发育过程中的差异表达circRNA(differentially expressed circRNA,DEcircRNA),进而在转录组水平探究DEcircRNA在中肠发育中的作用。【方法】基于前期获得的意蜂7和10日龄工蜂中肠样品(Am7和Am10)的全转录组数据,利用findirc软件从质控后的数据中预测circRNA。采用RPM算法归一化处理得到circ RNA的表达量。利用DEGseq软件对circ RNA进行差异分析,按照差异倍数(fold change)≥2、P<0.05及错误发现率(false discovery rate,FDR)<0.05条件筛选DEcircRNA。通过BLAST比对GO和KEGG数据库,对DEcircRNA的来源基因进行功能和代谢通路注释。利用TargetFinder软件预测DEcircRNA-miRNA及DEcircRNA-miRNA-mRNA调控网络,通过Cytoscape v.3.2.1软件对调控网络进行可视化。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证测序数据的可靠性。【结果】意蜂中肠各样品比对上参考基因组的短序列读段数平均为19 616 356条。Am7与Am10的组内Pearson相关系数均≥0.950。共预测出256个DEcircRNA,包括105个上调circRNA和151个下调circRNA。Novelirc09675和novelirc13879分别在Am7和Am10中高量表达。DEcircRNA的来源基因可注释到包括结合、单组织进程及细胞进程在内的32个GO条目,其中分别有35、35和7个来源基因注释到催化活性、代谢进程和应激反应。上述来源基因还可注释到35条KEGG代谢通路,其中分别有5、5和4个来源基因注释到Hippo信号通路、内吞作用和吞噬体;进一步分析发现分别有1、2和2个来源基因注释到磷酸肌醇代谢、淀粉和蔗糖代谢和半乳糖代谢等物质代谢通路,5、4、3、1和1个来源基因注释到内吞作用、吞噬体、溶酶体、泛素介导的蛋白水解和MAPK信号通路等免疫通路。上述结果表明相应的DEcircRNA广泛参与意蜂工蜂中肠的生长发育、新陈代谢和免疫防御。DEcircRNA-miRNA调控网络分析结果显示,141个DEcirc RNA可靶向结合107个mi RNA,其中多数仅能结合1—2个mi RNA,但novelirc11577和novelirc10719结合的靶miRNA数可达32和28个;此外,mir-136-y、ame-miR-6001-3p及mir-136-y结合的circRNA数最多,分别为15、14和14个,表明相应的DEcircRNA可作为竞争性内源RNA在意蜂中肠发育过程发挥作用。进一步构建DEcircRNAs-ame-miR-6001-3p-mRNA调控网络,分析结果显示14个DEcircRNA可共同靶向结合ame-miR-6001-3p,表明它们可能通过调控ame-miR-6001-3p对意蜂中肠干细胞的分裂和分化进行间接调控。随机选取6个DEcircRNA进行RT-qPCR验证,结果显示5个DEcircRNA的表达量变化趋势与测序结果一致,证实了本研究测序结果的可靠性。【结论】通过对意蜂工蜂中肠发育过程中的DEcircRNA深入分析,提供了circRNA在意蜂工蜂中肠发育过程中的表达谱和差异表达信息,揭示了DEcircRNA在中肠发育过程中的作用,为中肠发育相关的关键circRNA的筛选和功能研究打下了基础。

关键词：意大利蜜蜂中肠环状RNA 调控网络发育

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微小RNA介导东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂工蜂的分子机制

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中国农业科学 2020年第15期53卷 3187-3204页

作者：耿四海石彩云范小雪王杰祝智威蒋海宾范元婵陈华枝杜宇王心蕊熊翠玲郑燕珍付中民陈大福郭睿福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)

【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)纯化孢子与侵染意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂的东方蜜蜂微孢子虫的差异表达miRNA(DEmiRNA)及其靶mRNA进行系统分析,筛选、分析和探讨病原毒力因子和侵染因子相关... 详细信息

【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)纯化孢子与侵染意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂的东方蜜蜂微孢子虫的差异表达miRNA(DEmiRNA)及其靶mRNA进行系统分析,筛选、分析和探讨病原毒力因子和侵染因子相关的DEmiRNA及调控网络,在miRNA组学层面揭示东方蜜蜂微孢子虫对意蜂的侵染机制。【方法】利用small RNA-seq(sRNA-seq)技术对东方蜜蜂微孢子虫感染7 d和10 d的意蜂工蜂中肠和东方蜜蜂微孢子虫纯化孢子(NcCK)进行深度测序,通过连续比对rRNA数据库、西方蜜蜂(Apis mellifera)基因组和东方蜜蜂微孢子虫基因组筛滤出处于侵染过程的东方蜜蜂微孢子虫(NcT1和NcT2)数据和东方蜜蜂微孢子虫孢子的测序数据。根据P≤0.05,|log2 fold change|≥1的标准,通过比较分析筛选出各比较组中的差异表达miRNA(differentially expressed miRNA,DEmiRNA)。通过相关生物信息学软件对DEmiRNA进行表达谱分析,靶mRNA预测及功能和代谢通路注释,以及调控网络的构建与分析。通过Stem-loop RT-qPCR验证DEmiRNA的差异表达趋势及测序数据的可靠性。【结果】NcCK vs NcT1、NcCK vs NcT2和NcT1 vs NcT2比较组分别包含164、122和60个DEmiRNA。Venn分析结果显示,3个比较组共有的上调和下调miRNA分别为5和6个。上述DEmiRNA分别预测出1 885、1 733和1 524个靶mRNA。这些靶mRNA分别注释到27、25和26个功能条目,其中注释数量最多的是新陈代谢进程、催化活性、细胞进程、结合和细胞。上述靶mRNA可分别注释到84、84和84条代谢通路,其中注释数量最多的是代谢途径、核糖体和次级代谢产物生物合成。此外,对于NcCK vs NcT1、NcCK vs NcT2和NcT1 vs NcT2中的DEmiRNA,分别有35、26和12个靶向结合MAPK信号通路相关靶mRNA,分别有49、40和17个DEmiRNA靶向结合糖酵解/糖异生通路相关靶mRNA。进一步分析发现,东方蜜蜂微孢子虫的DEmiRNA参与调控蓖麻毒素B凝集素、细胞凋亡抑制因子、极管蛋白和孢壁蛋白等病原毒力因子的基因表达,以及己糖激酶、ATP/ADP移位酶、ABC转运蛋白和转录因子ste12等侵染因子的基因表达。【结论】通过对东方蜜蜂微孢子虫纯化孢子与侵染意蜂工蜂的东方蜜蜂微孢子虫进行深入细致的miRNA组学分析和探讨,解析了病原侵染过程的miRNA差异表达谱,揭示了东方蜜蜂微孢子虫可能通过调节相应miRNA的表达水平对蓖麻毒素B凝集素、细胞凋亡抑制因子、极管蛋白和孢壁蛋白等毒力因子及己糖激酶、ATP/ADP移位酶、ABC转运蛋白和转录因子ste12等侵染因子基因表达进行调控,从而适应宿主细胞内的环境并促进自身的增殖与侵染。

关键词：东方蜜蜂微孢子虫意大利蜜蜂微小RNA 侵染机制调控网络

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意大利蜜蜂幼虫肠道发育过程中的差异表达microRNA及其调控网络

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中国农业科学 2018年第21期51卷 4197-4209页

作者：郭睿杜宇熊翠玲郑燕珍付中民徐国钧王海朋陈华枝耿四海周丁丁石彩云赵红霞陈大福福建农林大学蜂学学院广东省生物资源应用研究所

【目的】微小RNA(microRNA,miRNA)是一类在转录后水平对mRNA进行负调控的关键调控因子。本研究旨在通过分析意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)幼虫肠道发育过程中差异表达miRNA(differentially expressed miRNA,DEmiRNA)及其调控网络,提供miRNA的表达谱和差异表达信息,揭示DEmiRNA在幼虫肠道发育中的作用。【方法】利用small RNA-seq(sRNA-seq)技术对意蜂4、5和6日龄幼虫肠道样品(Am4、Am5和Am6)进行测序,将质控后的数据与西方蜜蜂(Apis mellifera)参考基因组进行比对,然后将比对上的序列标签(tags)注释到miRBase数据库,并利用TPM(tags per million)算法归一化处理所得miRNA的表达量,再通过相关生物信息学软件对miRNA进行表达量聚类、前体二级结构预测及差异表达分析。利用TargetFinder软件预测DEmiRNA的靶基因,使用Blast软件对靶基因进行GO和KEGG数据库注释,进而通过Cytoscape软件构建mi RNA-m RNA的调控网络。采用茎环实时荧光定量PCR(Stem-loop RT-qPCR)验证测序数据的可靠性。【结果】意蜂幼虫肠道样品的测序分别得到10 841 644、12 037 678和9 230 496条有效序列标签;Am4 vs Am5比较组包含16个上调和10个下调mi RNA,Am5 vs Am6比较组包含5个上调和7个下调mi RNA。其中,novel-m0031-3p为两个比较组所共有,并结合5个与蜕皮激素诱导蛋白相关的靶基因;二者的特有DEmi RNA数分别为25和11个。Am4 vs Am5的26个DEmi RNA结合5 742个靶基因,其中2 725个靶基因可注释到GO数据库中的46个GO term,并主要富集在结合、细胞进程、代谢进程和单组织进程等;Am5 vs Am6的12个DEmi RNA结合3 733个靶基因,且其中2 725个靶基因富集在结合、细胞进程、单组织进程和代谢进程等41个GO term;此外,两个比较组中的DEmi RNA分别有1 046和676个靶基因可注释到116和92条KEGG代谢通路,且Am4 vs Am5比较组的DEmi RNA的靶基因富集在Wnt信号通路、Hippo信号通路、嘌呤代谢和内吞作用等通路上的数量均高于Am5 vs Am6比较组。进一步分析结果显示Am4 vs Am5中的上调和下调mi RNA可分别结合611和85个靶基因,其中ame-mi R-6052结合的靶基因数最多,可通过结合5个靶基因,参与对细胞色素P450的调控;mi R-281-x结合49个靶基因,并间接调控组氨酸代谢、TGF-β信号通路以及Hippo信号通路;Am5 vs Am6中的上调和下调mi RNA可分别结合43和431个靶基因,其中mi R-iab-4-x结合靶基因数量最多,并广泛参与调控背腹轴的形成、Hippo信号通路、Wnt信号通路、Fox O信号通路、Notch信号通路以及m TOR信号通路等与生长发育相关的通路。调控网络分析结果表明,DEmi RNA与靶基因间形成较为复杂的调控网络,DEmi RNA居于调控网络的中心位置,而m RNA位于调控网络的外周。最后,通过茎环实时荧光定量PCR对随机选取的3个DEmiRNA进行验证,结果证实了测序数据的可靠性。【结论】在全基因组水平对意蜂幼虫肠道的DEmi RNA及其靶基因进行预测和分析,并对DEmi RNA的调控网络进行构建及分析,发现意蜂幼虫通过调节包括ame-mi R-6052、miR-iab-4-x、mi R-281-x和novel-m0031-3p在内的多个mi RNA的表达水平对肠道生长和发育进行调控,研究结果不仅提供了意蜂肠道发育过程的mi RNA表达谱及差异表达信息,也为阐明意蜂幼虫肠道的发育机理打下基础。

关键词：意大利蜜蜂幼虫肠道发育微小RNA 靶基因调控网络

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老年糖尿病患者发生跌倒的原因分析及预防

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中西医结合护理 2022年第6期8卷 175-178页

作者：耿雪姣王华枝贾英华李蒙曹雨贾姗清华大学玉泉医院清华大学中西医结合医院内科北京100049 清华大学玉泉医院清华大学中西医结合医院护理部北京100049

糖尿病已经成为威胁人类健康的主要疾病之一。由于糖尿病疾病特点和并发症发生会增加跌倒发生的风险,因此应加强老年糖尿病患者跌倒风险管理,提高跌倒风险意识。本文简要分析老年糖尿病患者发生跌倒的原因,总结预防跌倒的措施,旨在为临... 详细信息

糖尿病已经成为威胁人类健康的主要疾病之一。由于糖尿病疾病特点和并发症发生会增加跌倒发生的风险,因此应加强老年糖尿病患者跌倒风险管理,提高跌倒风险意识。本文简要分析老年糖尿病患者发生跌倒的原因,总结预防跌倒的措施,旨在为临床制定和实施老年糖尿病患者跌倒预防干预提供参考。

关键词：老龄化糖尿病跌倒并发症健康宣教

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三七化痔丸联合马应龙麝香痔疮膏治疗痔疮的随机双盲前瞻性临床研究

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中医临床研究 2022年第30期14卷 92-95页

作者：周家铭吴亚萍宁娜谭淑云陈晓琼李拓阳肖源律耿春贤黄秋凌黄美近中山大学附属第六医院广东广州510655 广州白云山中一药业有限公司广东广州510530

目的:评估三七化痔丸联合马应龙麝香痔疮膏治疗痔疮的临床效果及安全性。方法:采用随机、双盲、安慰剂平行对照的研究设计。选取在中山大学附属第六医院接受诊治的痔疮患者150例,随机将患者平均分为试验组75例、对照组75例。试验组给予... 详细信息

目的:评估三七化痔丸联合马应龙麝香痔疮膏治疗痔疮的临床效果及安全性。方法:采用随机、双盲、安慰剂平行对照的研究设计。选取在中山大学附属第六医院接受诊治的痔疮患者150例,随机将患者平均分为试验组75例、对照组75例。试验组给予三七化痔丸治疗,对照组给予安慰剂治疗,两组均加用马应龙麝香痔疮膏治疗。记录治疗前、治疗7 d、14 d两组患者的痔核表面黏膜、痔核大小、外痔肿胀、外痔大小等观察指标评分,同时观察不良反应,并比较两组的疗效和安全性。结果:试验组和对照组分别有58例和67例完成治疗。试验组治疗7 d外痔肿胀、外痔大小评分,以及治疗14 d痔核表面黏膜、痔核大小评分均显著低于对照组(P0.05)。结论:三七化痔丸联合马应龙麝香痔疮膏治疗痔疮可显著改善外痔红肿、缩小外痔体积。另外,在停用马应龙麝香痔疮膏后继续口服三七化痔丸可显著缓解痔核表面黏膜充血、隆起,缩小痔核体积。本治疗方案疗效确切,有利于改善病情,且安全性良好,值得临床推广。

关键词：三七化痔丸痔疮外痔痔核不良反应

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