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Design and synthesis of synthetic UP elements for modulation of gene expression in Escherichia coli

Synthetic and Systems Biotechnology 2019年第2期4卷 99-106页

作者： Kristin V.Presnell Madeleine Flexer-Harrison hal salper McKetta Department of Chemical Engineering The University of Texas at Austin200 E Dean Keeton St.Stop C0400AustinTX78712USA Institute for Cellular and Molecular Biology The University of Texas at Austin2500 Speedway AvenueAustinTX78712USA

Metabolic engineering requires fine-tuned gene expression for most pathway optimization *** develop a suitable suite of promoters,traditional bacterial promoter engineering efforts have focused on modifications to the core region,especially the−10 and−35 regions,of native ***,we demonstrate an alternate,unexplored route of promoter engineering through randomization of the UP element of the promoter—a region that contacts the alpha subunit carboxy-terminal domain instead of the sigma subunit of the RNA polymerase *** this work,we identify five novel UP element sequences through library-based searches in Escherichia *** resulting elements were used to activate the *** core promoter,rrnD promoter,to levels on par and higher than the prevalent strong bacterial promoter,*** relative levels of expression activation were transferrable when applied upstream of alternate core promoter sequences,including rrnA and *** work thus presents and validates a novel strategy for bacterial promoter engineering with transferability across varying core promoters and potential for transferability across bacterial species.

关键词： UP element Promoter engineering Expression modulation

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