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Differential expression analysis and regulatory network reconstruction for genes associated with muscle growth and adipose deposition in obese and lean pigs

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Progress in Natural Science:Materials International 2008年第4期18卷 387-399页

作者： Mingzhou Li a, Xuewei Li a, Li Zhu a, Xiaokun Tengb, Huasheng Xiao b, Surong Shuaia, Lei Chen a, Qiang Li a, Yujiao guo a a Laboratory of Pork Quality, College of Animal Science and Technology, Sichuan Agricultural university, Ya’an 625014, china b National Engineering Center for Biochip at Shanghai, Shanghai 201203, china Laboratory of Pork Quality College of Animal Science and Technology Sichuan Agricultural University Ya’an 625014 China National Engineering Center for Biochip at Shanghai Shanghai 201203 China

During the growth and development of skeletal muscle cells and adipose cells, the regulatory mechanism of micro-effect polygenes determines porcine meat quality, carcass characteristics and other relative quantitative traits. Obese and lean type pig breeds show obvi- ous differences in muscle growth and adipose deposition; however, the molecular mechanism underlying this phenotypic variation remains unknown. We used pathway-focused oligo microarray studies to examine the expression changes of 140 genes associated with muscle growth and adipose deposition in longissimus dorsi muscle at six growth stages (birth, 1, 2, 3, 4 and 5 months) of Landrace (a leaner, Western breed) and Taihu pigs (a fatty, indigenous, Chinese breed). Variance analysis (ANOVA) revealed that differences in the expression of 18 genes in Landrace pigs and three genes in Taihu pigs were very significant (FDR-adjusted permutation, P < 0.01) and di?erences for 22 genes in Landrace pigs and seven genes in Taihu pigs were significant (FDR-adjusted permutation, P < 0.05) among six growth stages. Clustering analysis revealed a high level of signi?cance (FDR-adjusted, P < 0.01) for four gene expression patterns, in which genes that strongly up-regulated were mainly associated with the positive regulation of myofiber formation and fatty acid biogenesis and genes that strongly down-regulated were mainly associated with the inhibition of cell proliferation and positive regulation of fatty acid b-oxidation. Based on a dynamic Bayesian network (DBN) model, gene regulatory networks (GRNs) were reconstructed from time-series data for each pig breed. These two GRNs initially revealed the distinct differences in physiological and biochemical aspects of muscle growth and adipose deposition between the two pig breeds; from these results, some potential key genes could be identified. Quantitative real-time RT-PCR (QRT-PCR) was used to verify the microarray data for five modulated genes, and a good correlation betwee

关键词： Pig Muscle growth Adipose deposition Pathway-focused microarray Differential gene expression Gene regulatory network (GRN)

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Preparation of YBCO Superconducting Film by Chemical Solution Deposition Using a Novel Copper Precursor Derived from PEG_(200) and Sucrose

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稀有金属材料与工程 2011年第S3期40卷 346-349页

作者： Yan Wuwei1, Zhang Chengxiao1, Zhang guofang1, Jin Lihua2, Li Chengshan2, Yan guo2, Lu Yafeng2 1 Shaanxi Normal university, Xi’an 710062, china 2 Northwest Institute for Nonferrous Metal Research, Xi’an 710016, china Shaanxi Normal Univ Xian 710062 Peoples R China NW Inst Nonferrous Met Res Xian 710016 Peoples R China

Preparation and characterization of the YBCO superconducting films by chemical solution route with polyethylene glycol (PEG200) and Cu(NO3)2 as precursors are presented. It was found that PEG200 and sucrose were novel chelates and Cu (NO3)2 was an alternative precursor for the preparation of YBCO superconducting film by chemical solution route. The precursor solution was prepared by mixing yttrium trifluoroacetate, barium trifluoroacetate, and copper nitrate in solvent of methanol with chelates including PEG200 and sucrose. YBCO films were prepared by coating the precursor solution on LaAlO3 single crystal substrate, following vacuum drying, rapid calcining, firing and oxygen annealing. The prepared films were characterized by optical microscope (OM), X-ray diffraction (XRD) and scanning electron microscopy (SEM). The results showed that films were crack-free and homogeneous, stronger tendency of (00l) texture, uniform with less pore, pure c-axis orientation. The films showed good superconducting properties, with Tc of 90 K and critical current density (Jc) of 1 MA/cm2 (77 K, 0 T). This work demonstrates that the developed method is a promising method for preparation of YBCO superconducting film which has a fine superconducting characterization with advantages of simple and rapid.

关键词： coated conductor YBCO chemical solution deposition PEG200 copper nitrate sucrose

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环状RNA参与鼻咽癌发生发展

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生物化学与生物物理进展 2024年第4期51卷 809-821页

作者：左思程王丹莫勇真刘宇航蔡姣迪郭灿熊芳陈国群长沙市第四医院病理科长沙410006 中南大学肿瘤研究所国家卫健委癌变原理重点实验室长沙410078 中南大学湘雅医院耳鼻咽喉头颈外科国家老年疾病临床医学研究中心长沙410078

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种具有共价闭环结构的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),因其具有高稳定性、进化保守性和组织表达特异性的特点,越来越受到人们的关注。现有研究表明,circRNA参与恶性肿瘤等多种疾病的发生发展过程。... 详细信息

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种具有共价闭环结构的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),因其具有高稳定性、进化保守性和组织表达特异性的特点,越来越受到人们的关注。现有研究表明,circRNA参与恶性肿瘤等多种疾病的发生发展过程。鼻咽癌是一种起源于鼻咽上皮的恶性肿瘤,在中国华南和东南亚地区高发,发病与EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染密切相关。目前放疗和化疗是鼻咽癌治疗的主要手段,复发和远处转移是鼻咽癌患者死亡的主要原因。近年研究表明,circRNA作为基因表达调节因子,在鼻咽癌发生发展过程中发挥着重要的作用,影响着鼻咽癌的进展。本文主要综述了鼻咽癌中表达异常的circRNA,包括EB病毒编码的circRNA,在鼻咽癌发生发展中的研究现状,探讨了circRNA作为鼻咽癌患者治疗的潜在靶点以及诊断和预后标志物的可能性。

关键词：鼻咽癌环状RNA EB病毒发病机制生物标记物

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孤独症谱系障碍儿童父母生活质量量表在中国的修订

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中国临床心理学杂志 2024年第3期32卷 612-616,644页

作者：成夏芳郭菲陈祉妍中国科学院心理研究所北京100101 中国科学院大学心理学系北京100049

目的:修订孤独症谱系障碍儿童父母生活质量量表(quality of life in autism scale,QoLA-Parent Version)中文版,并检验其在中国孤独症谱系障碍(以下简称ASD)儿童父母群体中的信、效度。方法:采用中文版孤独症谱系障碍儿童父母生活质量... 详细信息

目的:修订孤独症谱系障碍儿童父母生活质量量表(quality of life in autism scale,QoLA-Parent Version)中文版,并检验其在中国孤独症谱系障碍(以下简称ASD)儿童父母群体中的信、效度。方法:采用中文版孤独症谱系障碍儿童父母生活质量量表、养育者压力量表、广泛性焦虑量表、认知融合量表对371名ASD儿童父母进行测量,间隔四周后对随机抽取的31名ASD儿童父母进行重测。结果:修订后的中文版孤独症谱系障碍儿童父母生活质量量表Part A验证性因素分析八因素模型拟合较好(χ^(2)/df=2.61,GFI=0.86,NFI=0.89,CFI=0.93,TLI=0.92,IFI=0.93,RMSEA=0.07),各条目标准化因素负荷值介于0.54~0.93之间,支持原量表八因素模型;Part B验证性因素分析三因素模型拟合较好(χ^(2)/df=3.47,GFI=0.88,NFI=0.91,CFI=0.93,TLI=0.92,IFI=0.93,RMSEA=0.08),各条目标准化因素负荷值介于0.59~0.87之间。全量表以及A、B分量表的Cronbach’sα系数分别为0.95,0.95,0.96,重测信度分别为0.86,0.86,0.76,且与效标量表呈显著负相关(r=-0.34~-0.58,P<0.001)。结论:中文版孤独症谱系障碍儿童父母生活质量量表具有良好的信、效度,可用于评估中国ASD儿童父母的生活质量。

关键词：孤独症儿童父母生活质量效度信度

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基于困难样本对激励的小样本图像分类方法

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计算机辅助设计与图形学学报 2024年第6期36卷 895-903页

作者：郭璐刘斌李维刚甘平武汉科技大学冶金自动化与检测技术教育部工程研究中心武汉430081 武汉科技大学信息科学与工程学院武汉430081 去哪儿大数据研究院北京100080

使用少量标签样本训练得到的传统模型往往预测精度低、泛化能力弱,很难应用到实际生产中.针对小样本图像提出一种基于困难样本对激励分类方法,包括预训练阶段和元学习阶段.预训练阶段在基类数据集上训练编码器,并作为元学习阶段的初始... 详细信息

使用少量标签样本训练得到的传统模型往往预测精度低、泛化能力弱,很难应用到实际生产中.针对小样本图像提出一种基于困难样本对激励分类方法,包括预训练阶段和元学习阶段.预训练阶段在基类数据集上训练编码器,并作为元学习阶段的初始特征编码器;元学习阶段将进一步优化此编码器,元训练过程使用本质特征法降低异常样本对质心的影响;结合度量学习与元学习设计了困难样本对激励损失函数,从样本对角度出发,在训练过程中引导模型扩大正负样本间距离,使同类样本更加紧凑.在公开数据集mini-ImageNet,tiered-ImageNet上进行实验的结果表明,分类精度分别为64.12%,70.15%,验证了所提方法的有效性和可行性.

关键词：困难样本对小样本学习元学习度量学习

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亲缘利他行为水平、冗余资源与家族企业创新绩效

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管理工程学报 2024年第06期38卷 41-57页

作者：谭庆美郭美彤严可欣天津大学管理与经济学部

创新是提升企业核心竞争力的重要源泉,是国家经济长期稳定增长的源动力。基于2008—2020年沪深两市A股家族上市企业数据,本文探究了亲缘利他行为水平对家族企业创新绩效的影响以及冗余资源对二者关系的调节作用。研究发现,亲缘利他行为... 详细信息

创新是提升企业核心竞争力的重要源泉,是国家经济长期稳定增长的源动力。基于2008—2020年沪深两市A股家族上市企业数据,本文探究了亲缘利他行为水平对家族企业创新绩效的影响以及冗余资源对二者关系的调节作用。研究发现,亲缘利他行为水平提高会显著降低家族企业创新投入及产出,但冗余资源增加能够缓解亲缘利他行为水平对创新投入及产出的消极作用。路径检验结果表明,风险承担水平、研发人员比重以及第二类代理成本对亲缘利他行为水平与创新绩效之间关系均起到部分中介作用。异质性检验结果表明,亲缘利他行为水平对创新投入及产出的负向影响在环境动态性及市场化程度较低的家族企业中更为显著。本文的研究结论对于理解亲缘利他行为对家族企业创新绩效的影响机制具有一定参考价值,对于实际控制人采取有效措施改善家族企业创新绩效、从微观层面助力国家创新驱动发展战略成功实施也有一定指导意义。

关键词：家族企业亲缘利他行为冗余资源创新绩效

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直播电商下厂家、MCN机构及主播动态运营策略

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管理工程学报 2024年第06期38卷 275-289页

作者：郭文强梁蕴泽雷明新疆财经大学信息管理学院北京大学光华管理学院

直播电商的营销模式在激活消费市场、推动经济增长等方面具有重要作用。本文综合考虑主播影响力和消费者参考质量效应的影响,针对由厂家、网红孵化机构(multi-channel network,MCN)及主播构成的直播电商体系,分别从参考质量效应、观众... 详细信息

直播电商的营销模式在激活消费市场、推动经济增长等方面具有重要作用。本文综合考虑主播影响力和消费者参考质量效应的影响,针对由厂家、网红孵化机构(multi-channel network,MCN)及主播构成的直播电商体系,分别从参考质量效应、观众打赏、MCN机构补贴以及电商平台补贴角度构建5种决策模型,并对比分析其动态均衡策略及绩效水平。研究结果表明:消费者参考质量效应有利于提高直播电商体系成员的相关努力程度和绩效水平;观众打赏能够在一定程度上激励主播相应努力水平,进而推动直播电商体系整体利润的提高;MCN机构对主播提供补贴的先决条件取决于双方的边际收益和主播所获的观众打赏情况,满足其先决条件后能够在一定程度上消除双重边际效应从而实现直播电商体系的Pareto改善;此外,来自电商平台的补贴能够实现直播电商体系的完全协调,且补贴比率受成员博弈地位、收益情况及观众打赏的共同影响。

关键词：参考质量效应主播影响力直播电商微分博弈 MCN机构

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基于协同信号的知识图注意力网络推荐算法

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计算机工程与设计 2024年第3期45卷 911-917页

作者：郭伟裴帅华西安科技大学通信与信息工程学院陕西西安710600

针对现有基于知识图谱的推荐算法大多采用随机采样的方法构建感受野导致部分重要信息丢失的问题,提出一种基于协同信号的知识图注意力网络推荐算法(CKGAN)。设计协作传播层,将用户的历史项目和待推荐项目在知识图谱中进行传播;为区分不... 详细信息

针对现有基于知识图谱的推荐算法大多采用随机采样的方法构建感受野导致部分重要信息丢失的问题,提出一种基于协同信号的知识图注意力网络推荐算法(CKGAN)。设计协作传播层,将用户的历史项目和待推荐项目在知识图谱中进行传播;为区分不同关系下的实体对中心节点的重要性不同,在聚合邻域信息时引入图注意力网络;为解决用户的不同兴趣,在预测层中,面对不同的候选集动态建模用户的向量表示。通过在***、Book-Cross、MovieLens-1M这3个真实的公共数据集上与主流的推荐算法进行对比实验,其结果表明,CKGAN在CTR预测和top-K推荐中都有显著提升。

关键词：知识图谱随机采样感受野图注意力网络异构网络隐式反馈推荐系统

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新质生产力背景下数实融合的测算与时空比较——基于专利共分类方法的研究

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数量经济技术经济研究 2024年第7期41卷 5-27页

作者：周密王雷郭佳宏南开大学中国城市与区域经济研究中心南开大学经济学院南开大学经济与社会发展研究院

促进数字经济与实体经济深度融合是形成新质生产力、建设现代化产业体系、推动经济高质量发展的关键抓手和重要支撑。本文面向新质生产力的形成需求,基于技术驱动产业融合的视角,利用2012~2021年337个城市1879余万条中国专利申请数据及... 详细信息

促进数字经济与实体经济深度融合是形成新质生产力、建设现代化产业体系、推动经济高质量发展的关键抓手和重要支撑。本文面向新质生产力的形成需求,基于技术驱动产业融合的视角,利用2012~2021年337个城市1879余万条中国专利申请数据及专利-产业匹配信息,采用专利共分类分析方法,测算中国数字经济与实体经济的融合水平,并从时间、产业、区域、网络四个维度考察数字经济与实体经济的融合特征。研究结果表明:第一,从时间维度来看,中国数字经济与实体经济融合水平整体呈上升趋势,数数融合水平明显高于数实融合水平。第二,从产业维度来看,实体产业方面,具有第三产业、第二产业、第一产业依次递减且非均衡发展的融合特征。数字产业方面,数字产品服务业与实体产业的融合水平最高,且数实融合开始逐渐由产品制造领域的融合向以要素驱动和技术应用为导向的融合转变。第三,从区域维度来看,四大板块、不同城市群以及大中小城市的融合水平均存在明显分化。第四,从网络维度来看,中国数实融合网络具有明显的核心-边缘结构特征,样本期内网络密度由0.204提高至0.254,数实融合仍有较大的产业扩展空间。本文为测算数字经济与实体经济融合提供了新思路,研究结论为推动数实融合以及新质生产力发展提供了有益参考。

关键词：新质生产力数字经济实体经济融合发展

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儿童照料费用对女性劳动参与决策的影响研究

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西北人口 2024年第2期45卷 103-113页

作者：黄乾郭建君南开大学经济学院天津300071

自我国开始市场化改革以来,我国女性劳动参与率呈现不断下降的趋势,且长期低于男性劳动参与率。受传统家庭劳动分工的影响,女性在家庭中承担着养育孩子的主要责任,因而与儿童照料相关的成本负担通常会对女性劳动供给产生一定的负面影响... 详细信息

自我国开始市场化改革以来,我国女性劳动参与率呈现不断下降的趋势,且长期低于男性劳动参与率。受传统家庭劳动分工的影响,女性在家庭中承担着养育孩子的主要责任,因而与儿童照料相关的成本负担通常会对女性劳动供给产生一定的负面影响。在我国进行托育制度改革后,公共托育体系的瓦解抬高了儿童托育服务的价格。目前,我国女性劳动参与率的持续下降与儿童照料费用的不断增加有着密切联系。基于此观察,利用中国健康和营养调查(CHNS)1991~2015年九期调查数据,创新性地利用了社区0~6岁儿童托幼机构的托儿费支出这一指标,综合使用Probit模型和工具变量法实证分析了儿童照料费用对我国女性劳动参与决策的影响。研究结果发现:儿童照料费用的增加显著降低了女性的劳动参与率。异质性分析表明,儿童照料费用的增加对于城镇、受教育程度较低、30岁以下和中低收入水平家庭的女性劳动参与率的负面影响更为明显。稳健性分析表明,儿童照料费用的增加对男性劳动参与率没有显著的负面影响;在控制内生性后,儿童照料费用对女性劳动参与率的负向影响显著增强。在生育政策完全放开的背景下,完善普惠托幼服务体系、健全女性就业保障制度和倡导男性共同承担育儿责任是提升我国女性劳动参与率的重要措施。

关键词：托幼费用劳动参与托育服务

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