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3D genome organization and its study in livestock breeding

Journal of Integrative Agriculture 2024年第1期23卷 39-58页

作者： Jie Cheng Xiukai Cao Shengxuan Wang Jiaqiang Zhang Binglin Yue Xiaoyan Zhang Yongzhen Huang Xianyong Lan gang ren Hong Chen Key Laboratory of Animal Genetics Breeding and Reproduction of Shaanxi ProvinceCollege of Animal Science and TechnologyNorthwest A&F UniversityYangling 712100China Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety of Ministry of Education of China Yangzhou UniversityYangzhou 225009China College of Animal Science Xinjiang Agricultural UniversityUrumqi 830052China

Eukaryotic genomes are hierarchically packaged into cell nucleus,affecting gene *** genome is organized into multiscale structural units,including chromosome territories,compartments,topologically associating domains(TADs),and DNA *** identification of these hierarchical structures has benefited from the development of experimental approaches,such as 3C-based methods(Hi-C,ChIA-PET,etc.),imaging tools(2D-FISH,3D-FISH,Cryo-FISH,etc.)and ligation-free methods(GAM,SPRITE,etc.).In recent two decades,numerous studies have shown that the 3D organization of genome plays essential roles in multiple cellular processes via various mechanisms,such as regulating enhancer activity and promoter-enhancer ***,there are relatively few studies about the 3D genome in livestock ***,studies for exploring the function of 3D genomes in livestock are urgently needed to provide a more comprehensive understanding of potential relationships between the genome and production *** this review,we summarize the recent advances of 3D genomics and its biological functions in human and mouse studies,drawing inspiration to explore the 3D genomics of livestock *** then mainly focus on the biological functions of 3D genome organization in muscle development and its implications in animal breeding.

关键词： 3D genome organization 3D genomic methodology regulatory mechanisms muscle development livestock breeding

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清初娄东诗派与太仓戏曲作家群的形成

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文学评论 2024年第2期 74-83页

作者：任刚北京师范大学文学院

苏州太仓有着良好的戏曲传统和氛围,清初涌现出吴伟业、王拆、黄祖颛、沈受宏、王吉武、王昊六位戏曲作家,形成了一个相对闭合的作家群体。该群体成员同属娄东诗派,诗曲皆擅。在观念上,认为曲为诗余,着重强调戏曲的文学性、抒情言志性... 详细信息

苏州太仓有着良好的戏曲传统和氛围,清初涌现出吴伟业、王拆、黄祖颛、沈受宏、王吉武、王昊六位戏曲作家,形成了一个相对闭合的作家群体。该群体成员同属娄东诗派,诗曲皆擅。在观念上,认为曲为诗余,着重强调戏曲的文学性、抒情言志性、自娱性,相对的舞台性、叙事性、娱他性则被置于其次。相应地,他们戏曲创作的题材选择、情感内涵、语言风格都不同程度打上了娄东诗派的印记,共同彰显为一种独具标格的诗性表达。清初太仓戏曲作家群的“发现”有助于重新审视“苏州派”“苏州剧派”“苏州作家群”等概念,完整建构苏州剧坛,对于揭示古典戏曲纠缠于诗歌的特殊形态与命运亦有重要意义。

关键词：娄东诗派太仓戏曲作家群清初苏州剧坛吴伟业诗曲互动

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Inhibition of hepatitis B virus via selective apoptosis modulation by Chinese patent medicine Liuweiwuling Tablet

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World Journal of Gastroenterology 2024年第13期30卷 1911-1925页

作者： Fei-Lin Ge Yan Yang Lan-Lan Si Yuan-Hua Li Meng-Zhen Cao Jun Wang Zhao-Fang Bai Zhi-gang ren Xiao-He Xiao Yan Liu Department of Chinese Medicine State Key Laboratory of Antiviral DrugsThe First Affiliated Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhou 450052Henan ProvinceChina The Fifth Medical Center of Chinese PLA General Hospital Beijing 100039China College of Traditional Chinese Medicine Chongqing Medical UniversityChongqing 400010China Beijing Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases Peking University Ditan Teaching HospitalBeijing 100015China Department of Infectious Diseases State Key Laboratory of Antiviral Drugsthe First Affiliated Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhou 450052Henan ProvinceChina

BACKGROUND Liuweiwuling Tablet(LWWL)is a Chinese patent medicine approved for the treatment of chronic inflammation caused by hepatitis B virus(HBV)*** studies have indicated an anti-HBV effect of LWWL,specifically in terms of antigen inhibition,but the underlying mechanism remains *** To investigate the potential mechanism of action of LWWL against *** In vitro experiments utilized three HBV-replicating and three non-HBV-replicating cell *** in vivo experiment involved a hydrodynamic injectionmediated mouse model with HBV *** and metabolomics were used to investigate the underlying mechanisms of action of *** In HepG2.1403F cells,LWWL(0.8 mg/mL)exhibited inhibitory effects on HBV DNA,hepatitis B surface antigen and pregenomic RNA(pgRNA)at rates of 51.36%,24.74%and 50.74%,*** inhibition rates of LWWL(0.8mg/mL)on pgRNA/covalently closed circular DNA in HepG2.1403F,HepG2.2.15 and HepG2.A64 cells were 47.78%,39.51%and 46.74%,*** of transcriptomics and metabolomics showed that the anti-HBV effect of LWWL was primarily linked to pathways related to apoptosis(PI3K-AKT,CASP8-CASP3 and P53 pathways).Apoptosis flow analysis revealed that the apoptosis rate in the LWWL-treated group was significantly higher than in the control group(CG)among HBV-replicating cell lines,including HepG2.2.15(2.92%±1.01%vs 6.68%±2.04%,Prences in apoptosis rates between the non-HBV-replicating HepG2 cells(5.04%±0.74%vs 5.51%±1.57%,P>0.05),L02 cells(5.49%±0.80%vs 5.48%±1.01%,P>0.05)and LX2 cells(6.29%±1.54%vs 6.29%±0.88%,P>0.05).TUNEL staining revealed a significantly higher apoptosis rate in the LWWL-treated group than in the CG in the HBVreplicating mouse model,while no noticeable difference in apoptosis rates between the two groups

关键词： Hepatitis B virus Chinese patent medicine Antiviral activity Antiviral mechanism Selective apoptosis

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硫胺素早期干预对海马神经元DNA甲基化及Aβ染毒的影响

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营养学报 2024年第3期46卷 248-254页

作者：任刚刘乃榕李晶詹杰李景辉辽宁省基础医学研究所营养与食品开发研究室

目的探索早期补充硫胺素对海马神经元细胞DNA甲基化及Aβ染毒的干预作用及机制。方法新生大鼠海马神经元细胞（HNCs）体外培养，随机分为空白组、模型组及硫胺素低、中、高剂量组，进行不同剂量硫胺素干预3d,HPLC法测定HNCs细胞DNA整... 详细信息

目的探索早期补充硫胺素对海马神经元细胞DNA甲基化及Aβ染毒的干预作用及机制。方法新生大鼠海马神经元细胞（HNCs）体外培养，随机分为空白组、模型组及硫胺素低、中、高剂量组，进行不同剂量硫胺素干预3d,HPLC法测定HNCs细胞DNA整体甲基化，质谱法检测CaMKIIα和GluR-2启动子甲基化，继续空白B27培养液培养至细胞成熟，观察硫胺素早期干预对HNCs成熟期Aβ1-42染毒后细胞增殖率（PR%）、细胞凋亡率（AR%）的影响。结果 (1)与空白组比较，硫胺素低、中剂量组HNCs整体DNA甲基化水平均有所降低，中剂量组显著低于空白组（P<0.05）；(2)与空白组比较，硫胺素低剂量组CaMKIIα基因启动子CpG＿3、CpG＿11位点甲基化水平明显降低（P<0.05）,GluR-2基因CpG＿5、CpG＿23位点甲基化水平明显升高（P<0.05）；(3)Aβ染毒后，与空白组比较，模型组HNCs PR%显著下降、AR%明显升高（P<0.05）；与模型组比较，硫胺素干预各组Aβ染毒HNCs PR%明显升高（P<0.05），高剂量组较低、中剂量组显著升高（P<0.05）；与模型组比较，硫胺素干预各组Aβ染毒HNCs AR%明显降低（P<0.05）,3个剂量组之间两两比较差异无统计学意义（P<0.05）。结论硫胺素早期干预，能调节神经元细胞的甲基化水平，通过降低CaMKIIα启动子甲基化水平的表观遗传学机制，提高成熟期神经元细胞的抗Aβ神经毒性作用。[营养学报，2024,46(3):248-254]

关键词：硫胺素 DNA甲基化阿尔茨海默病

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Measurement of atmospheric non-reciprocity effects for satellite-based two-way time-frequency transfer

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Photonics Research 2024年第6期12卷 1274-1282页

作者： TING ZENG QI SHEN YUAN CAO JIAN-YU GUAN MENG-ZHE LIAN JIN-JIAN HAN LEI HOU JIAN LU XIN-XIN PENG MIN LI WEI-YUE LIU JIN-CAI WU YONG WANG JUAN YIN JI-gang ren HAI-FENG JIANG QIANG ZHANG CHENG-ZHI PENG JIAN-WEI PAN Hefei National Research Center for Physical Sciences at the Microscale and School of Physical Sciences University of Science and Technology of ChinaHefei 230026China Shanghai Research Center for Quantum Science and CAS Center for Excellence in Quantum Information and Quantum Physics University of Science and Technology of ChinaShanghai 201315China Hefei National Laboratory University of Science and Technology of ChinaHefei 230094China Faculty of Information Science and Engineering Ningbo UniversityNingbo 315211China Key Laboratory of Space Active Opto-Electronic Technology Shanghai Institute of Technical PhysicsChinese Academy of SciencesShanghai 200083China Xinjiang Astronomical Observatory Chinese Academy of SciencesUrumqi 830011China

Future optical clock networks will require high-precision optical time-frequency transfer between satellites and ground ***,due to atmospheric turbulence,satellite motion and time delay between the satellite–ground transmission links will cause spatial and temporal variations,respectively,resulting in the breakdown of the time-of-flight reciprocity on which optical two-way time-frequency transfer is ***,we experimentally simulate the atmospheric effects by two-way spatio-temporally separated links between two stationary terminals located 113 km apart and measure the effects for optical two-way time-frequency *** experiment shows that the effect on the link instability is less than 2.3×10^(−19) at 10,000 *** indicates that when the link instability of satellite-ground optical time-frequency transfer is on the order of 10^(−19),it is not necessary to consider the atmospheric non-reciprocity effects.

关键词： breakdown transfer satellite

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Q235钢扫描激光热丝焊接工艺特性与组织性能研究

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中国激光 2024年第12期51卷 50-58页

作者：于宸乾任刚黄映杰高明华中科技大学武汉光电国家研究中心湖北武汉430074 九江中科激光技术研究院江西九江332005

以Q235低碳钢为材料,研究了光束扫描对激光热丝焊的焊缝成形特性、微观组织和力学性能的影响。结果表明:在扫描激光的作用下,焊缝的成形变得更加均匀,飞溅减少,焊缝熔深减小,熔宽增大,截面熔合区底部变得更加平滑;扫描激光的加入降低了... 详细信息

以Q235低碳钢为材料,研究了光束扫描对激光热丝焊的焊缝成形特性、微观组织和力学性能的影响。结果表明:在扫描激光的作用下,焊缝的成形变得更加均匀,飞溅减少,焊缝熔深减小,熔宽增大,截面熔合区底部变得更加平滑;扫描激光的加入降低了熔池的温度梯度,抑制了粗大柱状晶的生长,改变了铁素体晶粒形态,细化了熔合区组织,提高了焊缝韧性及延伸率;扫描激光促进了焊缝成分的均匀化分布,抑制了偏析,降低了熔合区显微硬度。由于激光作用面积增大等因素,光束扫描增强了激光热丝焊接对间隙的桥接能力。

关键词：激光技术激光热丝焊接光束扫描微观组织力学性能

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宣泄·还原·象征:清代西域文人对葡萄意象的建构

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昌吉学院学报 2024年第2期 73-79页

作者：任刚伊犁师范大学边疆中华文史研究中心新疆伊宁835000 伊犁师范大学中国语言文学学院新疆伊宁835000

较之唐人,清人开始更加关注西域百姓的日常生活,葡萄意象为诗言志功能提供一种个人情感宣泄的出口,是清代文人宣泄苦闷的完美载体,寄寓了他们的乐观旷达之情;葡萄意象频繁出现于清代西域文人笔下,还原了边疆安定的生活场景,寄寓了清代... 详细信息

较之唐人,清人开始更加关注西域百姓的日常生活,葡萄意象为诗言志功能提供一种个人情感宣泄的出口,是清代文人宣泄苦闷的完美载体,寄寓了他们的乐观旷达之情;葡萄意象频繁出现于清代西域文人笔下,还原了边疆安定的生活场景,寄寓了清代文人内心深处的风雅精神,展现了西域各民族交往交流交融的真实场景;葡萄与葡萄酒象征意义在清代西域文学中表达得更加明显,是建功边塞的象征,寄寓了清代文人为国效力的豪情壮志。清代文人借助于葡萄意象,开启了中原和西域情感认同有效融合的进程。

关键词：清代西域文人葡萄意象情感建构宣泄还原象征

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氨磺必利治疗难治性精神分裂症的临床研究

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科技与健康 2024年第1期3卷 69-72页

作者：任刚遵义市精神专科医院贵州遵义563000

研究评估了氨磺必利在治疗难治性精神分裂症方面的疗效。选取了68例观察对象,采用随机、双盲、对照设计,将患者分为观察组(采用常规药物+氨磺必利治疗)和参照组(仅常规药物治疗),对比两组患者治疗效果。结果显示,观察组患者在加用氨磺... 详细信息

研究评估了氨磺必利在治疗难治性精神分裂症方面的疗效。选取了68例观察对象,采用随机、双盲、对照设计,将患者分为观察组(采用常规药物+氨磺必利治疗)和参照组(仅常规药物治疗),对比两组患者治疗效果。结果显示,观察组患者在加用氨磺必利后,其阳性症状和阴性症状均显著改善,且不良反应发生率较低,生活质量评分较高,两种治疗方式在治疗难治性精神分裂症方面的差异具有统计学意义(P<0.05)。研究发现,氨磺必利在治疗难治性精神分裂症方面具有较高的疗效和安全性,可显著改善患者症状,不良反应发生率较低。

关键词：氨磺必利难治性精神分裂症临床研究治疗时间不良反应

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纺织品功能性及标识标志

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印染助剂 2024年第8期41卷 22-26页

作者：任刚中国纺织信息中心北京100025 中联品检(北京)检验技术有限公司北京100025

随着生活水平的不断提高,人们对服装的各种特殊要求也日益增多,在满足常规穿着需求的同时,还要求服装更加美观、时尚,能满足不同穿着环境下的特殊需求,功能性纺织产品应运而生并呈现快速发展的趋势。然而,标准的更新速度远远跟不上市场... 详细信息

随着生活水平的不断提高,人们对服装的各种特殊要求也日益增多,在满足常规穿着需求的同时,还要求服装更加美观、时尚,能满足不同穿着环境下的特殊需求,功能性纺织产品应运而生并呈现快速发展的趋势。然而,标准的更新速度远远跟不上市场发展的速度,尤其在如何正确、规范标注产品功能性这一方面欠缺较多,导致企业在宣传产品功能性时无法可依、无据可循,标注乱象时有发生,不光容易误导消费者,还会给监督执法等环节造成一定的困扰。结合功能性产品的性能以及标准的相关规定,对常见的功能性纺织产品的性能评价及标识标志给出建议。

关键词：功能性防紫外远红外抗菌防臭吸湿速干

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考虑车辆绕行的低碳校车路径优化模型

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东南大学学报（自然科学版） 2024年第1期54卷 192-199页

作者：赵星储文豪任刚申珂孙金鑫河海大学土木与交通学院南京210098 东南大学交通学院南京211189

为了合理规划校车路径以降低碳排放,建立以考虑行驶距离和载重的碳排放最小化为优化目标,及以车辆绕行和容量为约束的低碳校车路径优化模型(GCSBRPTW).针对绕行问题,引入绕行因子并转化为单侧时间窗约束;设计了一种基于Lin-Kernighan he... 详细信息

为了合理规划校车路径以降低碳排放,建立以考虑行驶距离和载重的碳排放最小化为优化目标,及以车辆绕行和容量为约束的低碳校车路径优化模型(GCSBRPTW).针对绕行问题,引入绕行因子并转化为单侧时间窗约束;设计了一种基于Lin-Kernighan heuristic(LKH)算法和莱维飞行算子的改进蚁群算法(LKH-Levy-ACO)对模型进行求解,其中LKH算法和莱维算子分别用于提高算法寻优效率和全局搜索能力.最后利用泰兴市工业园区班车线路规划实例求解,展开绕行因子取值对比、GCSBRPTW与传统校车路径模型对比、LKH-Levy-ACO与传统蚁群算法等4种算法对比实验.结果显示,绕行因子取值越小,最优解越差,GCSBRPTW比传统校车路径模型降低了约0.70%的碳排放,且LKH-Levy-ACO算法比传统蚁群算法降低了6.19%的碳排放,证明了模型的实用性和算法的有效性.

关键词：交通工程校车路径问题碳排放改进蚁群算法 LKH算法莱维飞行

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