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DNA Extraction Protocol for Biological Ingredient Analysis of Liuwei Dihuang Wan

Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2014年第3期12卷 137-143页

作者： Xinwei Cheng Xiaohua Chen Xiaoquan Su Huanxin Zhao Maozhen Han cunpei bo Jian Xu Hong Bai Kang Ning Institute of Materia Medica Shandong Academy of Medical Sciences School of Medicine and Life Sciences University of Jinan Shandong Academy of Medical Sciences Shandong Key Laboratory of Energy Genetics CAS Key Laboratory of Biofuels and Bioinformatics Group of Single Cell CenterQingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology Chinese Academy of Sciences

Traditional Chinese medicine （TCM） clinical practice. So far, the methods commonly preparations are widely used for healthcare and used for quality evaluation of TCM preparations mainly focused on chemical ingredients. The biological ingredient analysis of TCM preparations is also important because TCM preparations usually contain both plant and animal ingredients, which often include some mis-identified herbal materials, adulterants or even some biological contaminants. For biological ingredient analysis, the efficiency of DNA extraction is an important factor which might affect the accuracy and reliability of identification. The component complexity in TCM preparations is high, and DNA might be destroyed or degraded in different degrees after a series of processing procedures. Therefore, it is necessary to establish an effective protocol for DNA extraction from TCM preparations. In this study, we chose a classical TCM preparation, Liuwei Dihuang Wan （LDW）, as an example to develop a TCM-specific DNA extraction method. An optimized cetyl trimethyl ammonium bromide （CTAB） method （TCM-CTAB） and three commonly-used extraction kits were tested for extraction of DNA from LDW samples. Experimental results indicated that DNA with the highest purity and concentration was obtained by using TCM-CTAB. To further evaluate the different extraction methods, amplification of the second internal transcribed spacer （ITS2） and the chloroplast genome trnL intron was carried out.

关键词： DNA extraction Traditional Chinese medicinepreparation Biological ingredients Liuwei Dihuang Wan

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运用口腔菌群的时空变化来预测儿童龋病

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科学新闻 2016年第1期 93-93页

作者： Fei Teng Fang Yang Shi Huang cunpei bo Zhenjiang Zech Xu Amnon Amir Rob Knight 凌均棨徐健中山大学中山大学口腔医学研究所中华口腔医学会牙体牙髓病学专业委员会中科院青岛生物能源与过程所中科院单细胞研究中心

文章简介基于人体共生菌群的慢性疾病预测具有巨大前景,但其可行性尚需证明。婴幼儿龋(ECC)是儿童中最常见的感染性疾病。研究人员同时跟踪了50位四岁儿童的牙菌斑和唾液中的细菌菌群在两年内的发展过程。在此过程中,这些儿童要么保持健... 详细信息

文章简介基于人体共生菌群的慢性疾病预测具有巨大前景,但其可行性尚需证明。婴幼儿龋(ECC)是儿童中最常见的感染性疾病。研究人员同时跟踪了50位四岁儿童的牙菌斑和唾液中的细菌菌群在两年内的发展过程。在此过程中,这些儿童要么保持健康,要么从健康过渡到新发性龋病,要么经历了龋病的继续发展。本研究发现,相对健康儿童而言,儿童患龋会延迟正常口腔菌群的发育。牙菌斑和唾液菌群在龋病发生阶段与

关键词：口腔菌群儿童龋病牙菌斑

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