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Selection and Validation of Reference Genes for Normalization of RT-qPCR Analysis in Developing or Abiotic-Stressed Tissues of Loquat (Eriobotrya japonica)

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Phyton-International Journal of Experimental Botany 2023年第4期92卷 1185-1201页

作者： Shoukai Lin Shichang Xu Liyan Huang Fuxiang Qiu Yihong Zheng Qionghao Liu Shiwei Ma bisha wu Jincheng wu Fujian Provincial Key Laboratory of Ecology-Toxicological Effects&Control for Emerging Contaminants College of Environmental and Biological EngineeringPutian UniversityPutian351100China Key Laboratory of Ecological Environment and Information Atlas(Putian University) Fujian Provincial UniversityPutian351100China

Loquat(Eriobotrya japonica Lindl.)is a subtropical evergreen fruit tree that produces fruits with abundant nutrients and medicinal *** suitable reference genes for a set of loquat samples before qRT-PCR experiments is essential for the accurate quantification of gene *** this study,eight candidate reference genes were selected from our previously published RNA-seq data,and primers for each candidate reference gene were designed and *** Cq values of the candidate reference genes were calculated by RT-qPCR in 31 different loquat samples,including 12 subgroups of developing or abiotic-stressed *** combinations of stable reference genes were screened according to a comprehensive rank,which was synthesized from the results of four algorithms,including the geNorm,NormFinder,BestKeeper andΔCt *** screened reference genes were verified by normalizing EjLGA1 in each *** obtained suitable combinations of reference genes for accurate normalization were GAPDH,EF1αand ACT for floral development;GAPDH,UBCE and ACT for fruit setting;EF1α,GAPDH and eIF2B for fruit ripening;ACT,EF1αand UBCE for leaves under heat stress;eIF2B,UBCE and EF1αfor leaves under freezing stress;EF1α,TUA and UBCE for leaves under salt stress;ACT,EF1αand eIF2B for immature pulp under freezing stress;ACT,UBCE and eIF2B for immature seeds under freezing stress;EF1α,eIF2B and UBCE for both immature pulp and seeds under freezing stress;UBCE,TUB and TUA for red-fleshed fruits under cold-storage stress;eIF2B,RPS3 and TUB for white-fleshed fruits under coldstorage stress;and eIF2B,UBCE and RPS3 for both red-and white-fleshed fruits under cold-storage *** study obtained different combinations of stable reference genes for accurate normalization in twelve subgroups of developing or abiotic-stressed tissues in *** our knowledge,this is the first report to obtain stable reference genes for normalizing gene expression of abiotic-stressed t

关键词： Loquat Eriobotrya japonica reference genes qRT-PCR gene expression normalization developing tissues abiotic-stressed tissues

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Overexpression of pyruvate decarboxylase1 in Saccharomyces cerevisiae

Overexpression of pyruvate decarboxylase1 in Saccharomyces c...

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生命的分子机器及其调控网络——2012年全国生物化学与...

作者： Chongrong Ke bisha wu Songgang wu Jianzhong Huang Engineering Research Center of Industrial Microbiology Ministry of Education

The demand for energy has risen markedly with the social and economic ***,traditional energy such as coal and oil has been consumed increasingly and en-vironmental pollution is growing serious,which has severely restricted the development of national ***,the discovery of renewable energy will play a significant role in the near future,which will bring considerable benefits to the economic growth and so-cial *** from contamination,fuel ethanol turns out to be green energy and has attracted widespread *** cerevisiae is the traditional pro-duction strains of fuel ethanol,which

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分子生物学虚实结合实验教学模式探索与研究

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创新创业理论研究与实践 2019年第4期2卷 131-132页

作者：吴毕莎莆田学院环境与生物工程学院

虚拟仿真实验可以弥补传统实验的不足,传统实验又可锻炼学生的实验能力,为适应应用型大学发展的需要,提高分子生物实验教学效果,探索新的分子生物学实验教学模式,在实验教学中进行虚实结合可互为补充,强化教学效果,提高教学质量。

关键词：实验教学分子生物学虚拟仿真

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两种枇杷成花基因EjFCA的表达

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应用与环境生物学报 2021年第3期27卷 768-775页

作者：吴毕莎范金连林授锴许歆马世伟吴锦程莆田学院环境与生物工程学院莆田351100 枇杷种质资源创新与利用福建省高校重点实验室莆田351100 中华人民共和国莆田海关莆田351100

为了解不同普通栽培品种枇杷中FCA基因对花发育的影响,延长枇杷的销售时间,以花期相差一个月且开花数量差异较大的‘解放钟’及西班牙枇杷品种‘爱沙拉’两个枇杷品种的芽、花苞和花为材料,提取RNA并克隆获得‘解放钟’和‘爱沙拉’两... 详细信息

为了解不同普通栽培品种枇杷中FCA基因对花发育的影响,延长枇杷的销售时间,以花期相差一个月且开花数量差异较大的‘解放钟’及西班牙枇杷品种‘爱沙拉’两个枇杷品种的芽、花苞和花为材料,提取RNA并克隆获得‘解放钟’和‘爱沙拉’两个枇杷品种的EjFCA基因,将获得的EjFCA基因进行测序以及生物信息学分析.结果显示,‘解放钟’和‘爱沙拉’中EjFCA基因的CDS序列分别为1125 bp和1137 bp、分别编码374和378个氨基酸,二者的相似度高达98.15%.利用生物信息学软件分析表明两个枇杷EjFCA基因均含有1个RRM结构域和1个WW结构域,保守性较高,为GATA类转录因子;亚细胞定位预测显示EjFCA蛋白位于细胞核,与苹果和白梨的亲缘关系最近.对EjFCA在上述两个枇杷品种的表达分析显示EjFCA基因在两个枇杷品种的芽、花苞和花中均有表达,在‘解放钟’中呈"先上升后下降"的趋势,花苞时期表达量最高,在盛花期略有下降,但在‘爱沙拉’枇杷的3个花期中表达量变化不大,且始终低于‘解放钟’.本研究表明调控‘爱沙拉’枇杷花期的主要基因不是EjFCA,但其花芽的形成可能受EjFCA调控.上述结果可为进一步研究蔷薇科植物的成花机理以及枇杷的遗传改良育种奠定基础.

关键词：枇杷成花 EjFCA 序列分析荧光定量

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Ca2+参与外源NO诱导增强枇杷幼苗抗冻性的信号转导

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2019年第10期47卷 146-154页

作者：吴锦程林授锴林素英吴毕莎王燕瑜洪雅惠莆田学院环境与生物工程学院

[目的]从影响枇杷幼苗Ca2信号通路的角度,分析外源Ca2+、钙离子通道抑制剂和钙调素拮抗剂对低温胁迫下幼苗抗氧化能力的影响,探讨Ca2+信号在外源NO诱导增强枇杷幼苗抗冻性中的调控机制.[方法]以2年生的早钟6号枇杷(Eriobotrya Japonica ... 详细信息

[目的]从影响枇杷幼苗Ca2信号通路的角度,分析外源Ca2+、钙离子通道抑制剂和钙调素拮抗剂对低温胁迫下幼苗抗氧化能力的影响,探讨Ca2+信号在外源NO诱导增强枇杷幼苗抗冻性中的调控机制.[方法]以2年生的早钟6号枇杷(Eriobotrya Japonica *** No.6)容器苗为试材,采用叶面喷施外源NO供体硝普钠(SNP)、氯化钙(CaCl2)、钙离子通道抑制剂三氯化镧(LaCl3)和钙调素拮抗剂N-(6-氨基己基)-5-氯-1-萘磺胺(W7)处理低温胁迫下的枇杷幼苗,试验共设6个处理,分别为叶面喷施SNP处理(T1)、CaClz+SNP处理(T2)、LaCl3+SNP处理(T3)、W7+ SNP处理(T4)、W7+LaCl3+ SNP处理(T5)以及叶面喷施HzO(对照,CK),研究不同处理对幼苗过氧化氢(H2O2)、丙二醛(MDA)和钙调素(CaM)含量及过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)、抗坏血酸过氧化物酶(APX)活性的影响,最后对低温胁迫下枇杷叶片各生理指标的相关性进行了分析.[结果]与对照相比,SNP处理(T1)和CaCl2+ SNP处理(T2)显著促进了叶片细胞CaM含量的增加以及CAT、POD、SOD和APX活性的上升,降低了细胞H2O2和MDA含量,从而减轻了细胞的膜脂过氧化程度,提高了枇杷幼苗的抗冻性.与对照相比,LaCl3+ SNP处理(T3)提高了叶片MDA含量,但是叶片H2O2、CaM含量以及CAT、POD、SOD和APX活性总体均显著降低.与对照相比,W7+ SNP处理(T4)、W7+ LaCl3+ SNP处理(T5)均显著增加了细胞Hz O2和MDA含量,明显降低了叶片细胞CaM含量以及CAT、POD、SOD和APX活性.相关性分析表明,CaM含量与CAT、POD、SOD和APX等保护酶活性的相关系数均高于0.88,呈极显著正相关;而CaM含量与H2 Oz和MDA含量的相关系数分别为-0.721和-0.884,呈极显著负相关;4种保护酶活性与H2 O2和MDA含量之间也呈现极显著负相关.[结论]外源Ca2+和NO具有协同增强枇杷幼苗抗冻性的诱导效应,而LaCl3和W7对外源NO诱导增强枇杷幼苗的抗冻性起阻遏作用,Ca2+参与了外源NO诱导增强枇杷幼苗抗冻性的信号转导.

关键词：枇杷幼苗低温胁迫 Ca2+ 外源NO诱导抗冻性

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酿酒酵母SNF4基因敲除缺失菌株的构建

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生物工程学报 2011年第4期27卷 572-578页

作者：林晓华柯崇榕吴毕莎郑永标李力陈由强黄建忠福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心生命科学学院福建省现代发酵技术工程研究中心福州350108 福建师范大学生命科学学院农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室福州350108

构建一株酿酒酵母SNF4基因缺失菌株并研究其对乙醇产量的影响。扩增带有SNF4基因上下游同源序列和Kanr筛选标记的SNF4基因敲除组件,转化到酿酒酵母YS2获得阳性克隆子,然后将质粒pSH65转到阳性克隆子中,半乳糖诱导pSH65表达Cre酶切除Kan... 详细信息

构建一株酿酒酵母SNF4基因缺失菌株并研究其对乙醇产量的影响。扩增带有SNF4基因上下游同源序列和Kanr筛选标记的SNF4基因敲除组件,转化到酿酒酵母YS2获得阳性克隆子,然后将质粒pSH65转到阳性克隆子中,半乳糖诱导pSH65表达Cre酶切除Kanr筛选标记,获得SNF4等位基因完全缺失菌株YS2-△SNF4。发酵实验结果表明,缺失菌株YS2-△SNF4乙醇产量较出发菌株提高了7.57%。利用Cre-LoxP系统,成功构建了SNF4等位基因完全缺失菌株并提高乙醇产生量。

关键词：酿酒酵母 SNF4 基因敲除

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福建霉素A和B的合成在有机化学教学中的应用

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保山学院学报 2017年第2期36卷 31-33页

作者：周北斗许桂芬吴毕莎莆田学院药学与医学技术学院莆田学院环境与生物工程学院福建莆田351100

适时适度地介绍福建霉素A和B的结构特征、生物活性和合成过程,阐述了臭氧化、碘代、钯催化的交叉偶联、金属氢化物的还原、狄尔斯-阿尔德等反应及其相关的知识点,为福建霉素A和B的合成被引入有机化学教学中奠定基础,使科研促进教学被有... 详细信息

适时适度地介绍福建霉素A和B的结构特征、生物活性和合成过程,阐述了臭氧化、碘代、钯催化的交叉偶联、金属氢化物的还原、狄尔斯-阿尔德等反应及其相关的知识点,为福建霉素A和B的合成被引入有机化学教学中奠定基础,使科研促进教学被有效地实践。

关键词：福建霉素合成有机化学教学应用

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果树基因组学研究进展

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莆田学院学报 2021年第2期28卷 1-8页

作者：吴锦程林授锴吴毕莎林顺权莆田学院环境与生物工程学院福建莆田351100 莆田学院枇杷种质资源创新与利用福建省高校重点实验室福建莆田351100 华南农业大学园艺学院广东广州510642

首先,简述了果树基因组测序的历史,列出迄今已完成基因组测序的72种果树的测序基本信息、文献来源和基因组数据库;然后,择要综述基因组学在果树起源与演化问题研究、功能基因研究等方面的应用;最后,展望了果树基因组测序研究的应用前景。

关键词：果树基因组学基因组测序起源演化特征性状功能基因

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转基因农产品检测虚拟仿真实验项目建设研究

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广东化工 2021年第4期48卷 206-206,208页

作者：林授锴吴毕莎吴锦程莆田学院环境与生物工程学院福建莆田351100

分子生物学技术是检测转基因农产品的主要技术手段。随着转基因农产品逐渐走进人们的生活,转基因农产品检测技术已成为了生物类和食品类专业本科学生需要掌握的重要技能。本文阐述了在分子生物学课程中开设转基因农产品检测实验存在的问... 详细信息

分子生物学技术是检测转基因农产品的主要技术手段。随着转基因农产品逐渐走进人们的生活,转基因农产品检测技术已成为了生物类和食品类专业本科学生需要掌握的重要技能。本文阐述了在分子生物学课程中开设转基因农产品检测实验存在的问题,分析了虚拟仿真实验项目的优势并提出了项目建设的思路。

关键词：生物类专业食品类专业分子生物学转基因农产品检测虚拟仿真实验项目建设

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厄立特里亚GASH金矿集区地球化学特征及信息提取

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西北地质 2024年第2期57卷 184-196页

作者：向文帅吴颖赵凯曾国平姜军胜张紫程白洋张元培罗军强郑雄伟中国地质调查局武汉地质调查中心/中南地质科技创新中心湖北武汉430205 湖北省地质局地球物理勘探大队湖北武汉430056 中国地质矿业有限公司北京100029

GASH金矿集区位于厄立特里亚西部的碧沙Au多金属成矿带,具有良好的区域成矿背景。区内1∶10万水系沉积物测量数据的地球化学特征表明,Au、Hg、As、W、Bi等元素呈强分异的分布特征,Au、As、Sb、W具有强富集的分布特征,显示优异的Au找矿... 详细信息

GASH金矿集区位于厄立特里亚西部的碧沙Au多金属成矿带,具有良好的区域成矿背景。区内1∶10万水系沉积物测量数据的地球化学特征表明,Au、Hg、As、W、Bi等元素呈强分异的分布特征,Au、As、Sb、W具有强富集的分布特征,显示优异的Au找矿前景。通过元素相关性分析,筛选出能够有效指导Au矿勘查的F5因子(Au-Hg元素组合)、指示区域断裂构造分布的F2因子(Ag-Bi-Mo-W元素组合)及F3因子(As-Sb-Pb元素组合),指示基性–超基性地质体分布的F1、F4特征因子。对F5因子得分开展异常信息提取,并结合矿产地质特征,圈定出可开展进一步原生岩金矿勘查工作的异常区8处,基于指示成矿热液活动的F2、F3、F5特征因子推断出NE、N–NE向的规模较大的断裂12条,为研究区的找矿预测及勘查工作部署提供了有利的地球化学依据。

关键词：非洲厄立特里亚金矿地球化学异常提取断裂构造

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