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Genomic features underlying the evolutionary transitions of Apibacter to honey bee gut symbionts

Insect Science 2022年第1期29卷 259-275页

作者： Wenjun Zhang Xue Zhang Qinzhi Su min Tang Hao Zheng Xin Zhou Department of Entomology College of Plant ProtectionChina Agricultural UniversityBeijingChina College of Food Science and Nutritional Engineering China Agricultural UniversityBeijingChina

The gut bacteria of honey bee recognized as a mutualistic partner with the insect host might have originated from a free-living or parasitic lifestyle. However, little is known about the genomic features underlying this lifestyle transition. Here we compared the genomes of bee gut bacteria Apibacter with their close relatives living in different lifestyles. We found that despite general reduction in the Apibacter genome, genes involved in amino acid synthesis and monosaccharide detoxification were retained, which is putatively beneficial to the host. Interestingly, the microaerobic Apibacter species specifically acquired genes encoding for the nitrate respiration (NAR). These together with nitrate transporter and enzymatic cofactor synthesis genes were found clustered in the genomes. The NAR system is also conserved in the cohabitating bee gut microbe Snodgrassella, although with a different structure. This convergence suggests a key role of respiratory nitrate reduction for microaerophilic microbiomes to colonize bee gut epithelium. Genes involved in lipid, histidine degradation were found partially or completely lost in Apibacter. Particularly, genes encoding for the conversion to the toxic intermediates in phenylacetate degradation, as well as other potential virulence factors, are specifically lost in Apibacter group. Antibiotic resistance genes are only sporadically distributed among Apibacter species, but are prevalent in their relatives, which may be related to the remotely living feature and less exposure to antibiotics of their bee hosts. Collectively, this study advanced our knowledge of genomic features specialized to bee gut symbionts.

关键词： Apibacter spp. comparative genomics evolution gut microbiome honey bee nitrate respiratory reduction

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CSBV的分离鉴定及其感染幼虫后的应答反应

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中国动物传染病学报 2024年第2期32卷 89-96页

作者：费世港刘合永王叶元冯敏王子龙孙京臣华南农业大学动物科学学院广州510642 江西农业大学蜜蜂研究所南昌330045

本研究旨在为了解江西某蜂场蜜蜂是否感染中蜂囊状幼虫病病毒(CSBV)并探究CSBV感染中蜂幼虫后的应答反应。采集该蜂场疑似感染CSBV的蜜蜂,采用RT-PCR的方法检测CSBV核酸,取阳性的蜜蜂样品进行病毒分离纯化、电镜观察及测序。将纯化鉴定... 详细信息

本研究旨在为了解江西某蜂场蜜蜂是否感染中蜂囊状幼虫病病毒(CSBV)并探究CSBV感染中蜂幼虫后的应答反应。采集该蜂场疑似感染CSBV的蜜蜂,采用RT-PCR的方法检测CSBV核酸,取阳性的蜜蜂样品进行病毒分离纯化、电镜观察及测序。将纯化鉴定后的CSBV对3日龄的中蜂幼虫进行人工感染,进行转录组测序,分析中蜂幼虫感染CSBV的应答反应。通过RT-PCR验证和电镜观察成功鉴定CSBV,并命名为CSBV-JX。CSBV-JX电镜观察直径为25~30 nm。对其进行分段扩增测序,发现基因组序列为8781 bp,对其进行系统发育分析,表明东方蜜蜂的SBV(AcSBV)与西方蜜蜂的SBV(AmSBV)明显分为两个分支,具有较强的地域分化性。转录组测序分析发现,中蜂幼虫在感染CSBV-JX后2 h有59个基因上调表达,83个基因下调表达;感染后12 h有68个基因上调表达,86个基因下调表达。本研究成功分离鉴定一株中蜂囊状幼虫病毒并命名为CSBV-JX。同时对CSBV-JX感染中蜂幼虫的转录组学分析发现,CSBV-JX感染2 h和12 h引起宿主的响应较小,这可能是CSBV-JX感染的2 h和12 h为病毒增殖的早期阶段病毒载量低,引起的宿主免疫响应小所导致。在CSBV-JX感染中蜂幼虫的2 h和12 h期间引起的差异基因与代谢通路关联较大,研究结果为阐明解析CSBV感染中蜂的分子机制提供了基础。

关键词：中蜂囊状幼虫病毒分离鉴定系统发育分析转录组学

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蜜蜂对梨和油菜花朵挥发性气味物质的响应研究

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应用昆虫学报 2024年第2期61卷 295-315页

作者：张旭凤申红英曹嵌邓晓银王锋郭丽娜武敏郭媛山西农业大学园艺学院山西农业大学动物科学学院

【目的】探究同花期的酥梨花和油菜花挥发性气味物质的种类和含量的差异，筛选影响蜜蜂采集偏好的挥发性气味物质，开发能刺激蜜蜂给梨树授粉的诱导剂，也为定向筛选梨树授粉蜜蜂品种提供理论依据。【方法】利用顶空固相微萃取（Solid p... 详细信息

【目的】探究同花期的酥梨花和油菜花挥发性气味物质的种类和含量的差异，筛选影响蜜蜂采集偏好的挥发性气味物质，开发能刺激蜜蜂给梨树授粉的诱导剂，也为定向筛选梨树授粉蜜蜂品种提供理论依据。【方法】利用顶空固相微萃取（Solid phase microextraction,SPME）和气相色谱-质谱联用技术（Gas chromatograph-mass spectrometer,GC-MS）分析砀山酥梨Pyrus bretschneideri ***和甘蓝型油菜Brassica napus的花朵挥发性气味物质，然后利用触角电位技术（Electroantennography,EAG）和Y型嗅觉仪实验分析上述鉴定的气味物质对中华蜜蜂Apis cerana cerana（简称中蜂）和意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica（简称意蜂）的影响。【结果】梨花大蕾期、初绽期和盛开期鉴定出挥发性化合物均为52种，油菜花3个花期鉴定出挥发性化合物分别为73、73和69种；梨和油菜花3个花期中特有的挥发性气味物质分别为40和61种；它们共有挥发性气味物质为12种，梨花3个花期中乙偶姻和1,3-二叔丁基苯相对含量均高于9%，苯甲酸相对百分含量3个花期均差异显著（P<0.05）；油菜中乙偶姻、1-辛醇、1,3-二叔丁基苯和2,2,4-三甲基戊二醇异丁酯相对百分含量3个花期均差异显著（P<0.05）。3个花期中，砀山酥梨和甘蓝型油菜花共有的挥发性气味物质中乙偶姻相对含量差异均极显著（P<0.01）。相较于石蜡油，中蜂和意蜂触角对所测试的71种挥发性气味物质均产生电信号响应，其中中蜂对乙酸、丙酸、异戊醇、1-戊烯-3-醇和异己酸乙酯反应较强，意蜂对乙酸、丙酸、异丁酸、乙二醇单异丁醚和异己酸乙酯反应较强。中蜂和意蜂触角对其中22种挥发性气味物质的相对响应值差异显著（P<0.05）。EAG实验表明，中蜂对苯甲醇、邻苯二甲酸二异丁酯、2-羟基-3-甲基戊酸甲酯、辛酸、异戊醇、2-甲基丁醇、芳樟醇、十一烷、十二烷、十五烷和十六烷的相对响应值显著高于意蜂（P<0.05），对苯丙酸乙酯、茴香酸乙酯和1-戊烯-3-醇响应值极显著高于意蜂（P<0.01）；意蜂对1,3-二叔丁基苯、辛酸乙酯、乙偶姻、丙酸、己酸和二甲基二硫相对响应值显著高于中蜂（P<0.05），对异丁酸和乙二醇单异丁醚响应值极显著高于中蜂（P<0.01）。在Y型嗅觉仪实验中，中蜂对苯乙醇、苯甲酸甲酯、长叶环烯和芳樟醇的选择率显著高于对照组（P<0.05）；对二甲基三硫、乙酸的选择率显著低于对照组（P<0.05）。意蜂对苯甲酸甲酯、甲基庚烯酮、α-法尼烯、植酮、2-甲基丁酸乙酯和异戊醇的选择率显著高于对照组（P<0.05）；对二甲基二硫、乙偶姻、乙酸、2-甲基丁酸、1-辛烯-3-醇和辛醇的选择率显著低于对照组（P<0.05）。【结论】梨花中释放的乙偶姻对蜜蜂有趋避作用，油菜花中释放的苯甲酸甲酯对蜜蜂有引诱作用，这可能是影响蜜蜂在梨花和油菜同花期时偏好采集油菜花的原因之一。

关键词：中华蜜蜂意大利蜜蜂梨树授粉油菜花朵挥发性气味物质触角电位

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国内外蜂蜜质量标准对比研究

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浙江农业科学 2024年第1期65卷 8-15页

作者：李勤锋王夏君陈敏雷玲郑蔚然平湖市农业行政执法队浙江平湖314200 浙江省农业科学院农产品质量安全与营养研究所浙江杭州310021 浙江理工大学浙江杭州310018

我国的蜂群数量、蜂蜜产量、消耗量和出口量均居世界前列,但产业水平和经济效益与发达国家相比仍存在一定的差距。本文以蜂蜜进出口贸易为切入点,对比分析了我国与主要贸易国制定的蜂蜜质量标准,找出国内外蜂蜜质量评价中指标差异。针... 详细信息

我国的蜂群数量、蜂蜜产量、消耗量和出口量均居世界前列,但产业水平和经济效益与发达国家相比仍存在一定的差距。本文以蜂蜜进出口贸易为切入点,对比分析了我国与主要贸易国制定的蜂蜜质量标准,找出国内外蜂蜜质量评价中指标差异。针对现状,结合我国的蜂蜜质量问题,提出健全蜂蜜质量标准的合理建议,规范国内蜂蜜市场秩序,为提高我国蜂蜜国际竞争力提供技术支撑。

关键词：蜂蜜巢蜜质量标准等级规格

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Pollinator diversity benefits natural and agricultural ecosystems,environmental health,and human welfare

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Plant Diversity 2022年第5期44卷 429-435页

作者： Daniel Mutavi Katumo Huan Liang Anne Christine Ochola min Lv Qing-Feng Wang Chun-Feng Yang CAS Key Laboratory of Aquatic Botany and Watershed Ecology Wuhan Botanical GardenChinese Academy of SciencesWuhan 430074China College of Life Sciences University of Chinese Academy of SciencesBeijing 100049China Center of Conservation Biology Core Botanical GardensChinese Academy of SciencesWuhan 430074China

Biodiversity loss during the Anthropocene is a serious ecological *** are important vectors that provide multiple essential ecosystem services but are declining rapidly in this changing ***,several studies have argued that a high abundance of managed bee pollinators,such as honeybees(Apis mellifera),may be sufficient to provide pollination services for crop productivity,and sociological studies indicate that the majority of farmers worldwide do not recognize the contribution of wild pollinator diversity to agricultural ***,we review the importance of pollinator diversity in natural and agricultural ecosystems that may be thwarted by the increase in abundance of managed pollinators such as *** also emphasize the additional roles diverse pollinator communities play in environmental safety,culture,and *** indicates that in natural ecosystems,pollinator diversity enhances pollination during environmental and climatic perturbations,thus alleviating pollen *** agricultural ecosystems,pollinator diversity increases the quality and quantity of crop ***,studies indicate that many pollinator groups are useful in monitoring environmental pollution,aid in pest and disease control,and provide cultural and aesthetic *** the uncertainties that may accompany rapid environmental changes in the Anthropocene,the conservation of pollinator diversity must expand beyond bee ***,the value of pollinator diversity maintenance extends beyond the provision of pollination ***,conservation of pollinator diversity requires an interdisciplinary approach with contributions from environmentalists,taxonomists,and social scientists,including artists,who can shape opinions and behavior.

关键词： bee Complementarity Ecological indicator Plant community Pollen limitation

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基于三类危险源理论的事故模式及隐患提取方法

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南京工业大学学报（自然科学版） 2024年第1期46卷 46-54页

作者：鲁存郁蒋鋒于曦洋沈浩宇华敏王三明潘旭海南京工业大学安全科学与工程学院江苏南京211800 中国石化集团金陵石油化工有限责任公司江苏南京210046 南京安元科技有限公司江苏南京210013

针对当前事故模式表述不明确、不清晰的问题和隐患识别不专业、不全面的缺陷,给出事故模式的一般性定义、内涵及提取步骤,并解释事故模式与隐患的关系,提出基于事故模式的生产现场隐患点的查找方法。参考《企业职工伤亡事故分类》(GB 6... 详细信息

针对当前事故模式表述不明确、不清晰的问题和隐患识别不专业、不全面的缺陷,给出事故模式的一般性定义、内涵及提取步骤,并解释事故模式与隐患的关系,提出基于事故模式的生产现场隐患点的查找方法。参考《企业职工伤亡事故分类》(GB 6441—1986),统计2000—2022年化工行业较大及以上安全事故,分析不同类别隐患的发生概率。通过分析某石化企业丙烯装车场景下的事故根源、屏障失效及事故类型,提炼丙烯装车事故模式,生成隐患特征表。结果表明:不安全状态中第一类隐患、不安全行为中第一、第六、第十三类隐患在化工行业典型事故类型中发生的概率较高。丙烯装车场景下针对防止丙烯泄漏所设屏障识别隐患条目数最多,约占48.94%;N=1,M=1、m=6,M=6、m=8,M=13涉及的隐患条目发生概率约占各类目总体发生概率的49.23%,12.78%,14.44%和26.11%,应当作为防护重点。

关键词：事故模式隐患隐患特征隐患智慧识别丙烯装车

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Effects of a non-selective TRPC channel blocker, SKF-96365, on melittin-induced spontaneous persistent nociception and inflammatory pain hypersensitivity

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Neuroscience Bulletin 2012年第2期28卷 173-181页

作者： Jing Ding Jia-RuiZhang Yan Wang Chun-Li Li Dan Lu Su-min Guan Jun Chen Institute for Biomedical Sciences of Pain and Institute for Functional Brain Disorders Tangdu Hospital Fourth MilitaryMedical University Xi ＇an 710038 China Institute for Biomedical Sciences of Pain Capital Medical University Beij＇ing 100069 China Sehool of Stomatology Fourth Military Medical University Xi＇an 710032 China Department of Anesthesiology Beo＇ing Anzhen Hospital Capital Medical University Beijing 100029 China

Objective Melittin is the main peptide in bee venom and causes both persistent spontaneous nociception and pain hypersensitivity. Our recent studies indicated that both transient receptor potential （TRP） vanilloid receptor 1 （TRPV 1） and canonical TRPs （TRPCs） are involved in mediating the melittin-induced activation of different subpopulations of pri- mary nociceptive cells. Here, we further determined whether TRPC channels are involved in melittin-induced inflamma- tory nociceptive responses in behavioral assays. Methods The anti-nociceptive and anti-hyperalgesic effects of localized peripheral administration of three doses of the non-selective TRPC antagonist, SKF-96365 （1-{[3-[3-（4-methoxyphenyl） propoxy]-4-methoxyphenyl}-lH-imidazole hydrochloride）, were evaluated in melittin tests. Pain-related behaviors were rated by counting the number of paw flinches, and measuring paw withdrawal thermal latency （s） and paw withdrawl me- chanical threshold （g）, over a l-h time-course. Results Localized peripheral SKF-96365 given before melittin prevented, and given after melittin significantly suppressed, the melittin-evoked persistent spontaneous nociception. Pre-blockade and post-suppression of activation of primary nociceptive activity resulted in decreased hypersensitivity to both thermal and mechanical stimuli applied to the primary injury site of the ipsilateral hindpaw, despite dose-effect differences between thermal and mechanical hyperalgesia. However, local administration of SKF-96365 into the contralateral hindpaw had no significant effect on any pain-associated behaviors. In addition, SKF-96365 had no effect on baseline threshold for either thermal or mechanical sensitivity under normal conditions. Conclusion Besides TRPV1, SKF-96365-sensitive TRPC channels might also be involved in the pathophysiological processing of melittin-induced inflammatory pain and hyper- sensitivity. Therapeutically, SKF-96365 is equally effective in preventing primary thermal and mech

关键词： TRPC channels melittin persistent spontaneous nociception primary thermal hyperalgesia primary mechanicalhyperalgesia

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基于深度学习的管道热图像泄漏识别

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红外技术 2024年第5期46卷 522-531页

作者：陈秋艳张新燕贺敏田义春刘宁郭瑞王晓辉游思源张修坤山东科技大学安全与环境工程学院山东青岛266590 山东科技大学矿山灾害预防控制省部共建国家重点实验室培育基地山东青岛266590 青岛市生产安全火灾事故智能控制工程中心山东青岛266590 烟台哈尔滨工程大学研究院山东烟台264000

为了降低输液管道多泄漏点微小泄漏的检测难度,提高输液管道无损检测的检测精度与检测速度,通过搭建水循环管道泄漏实验系统,改变管道泄漏点尺寸、泄漏点数量及输送介质温度,应用红外热像仪实时采集红外图像,提出基于非线性平稳小波和... 详细信息

为了降低输液管道多泄漏点微小泄漏的检测难度,提高输液管道无损检测的检测精度与检测速度,通过搭建水循环管道泄漏实验系统,改变管道泄漏点尺寸、泄漏点数量及输送介质温度,应用红外热像仪实时采集红外图像,提出基于非线性平稳小波和双边滤波算法实现图像降噪;并结合红外检测技术和YOLO(You Only Look Once)v4模型实现输液管道单、多漏点的自动化智能检测。结果表明,与传统滤波算法相比,该降噪方法的峰值信噪比、结构相似性均有所提升;该模型能够快速且准确地检测管道单、多漏点,检测精度(mAP)分别达到了0.9822及0.98,准确率分别达到了98.3%及98.36%,单帧检测时间分别达到了0.3021 s及0.3096 s,实现了在复杂背景干扰下对单、多泄漏点的识别。通过与YOLO v3、Faster R-CNN和SSD 300这3种算法比较发现,YOLO v4算法对管道单一漏点及多泄漏点检测的准确率、mAP和检测时间均更佳,具有更高的检测准确性与检测效率。

关键词：输液管道红外无损检测技术图像降噪自动检测 MATLAB

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中华蜜蜂工蜂幼虫肠道全长转录组构建与注释

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昆虫学报 2024年第2期67卷 183-192页

作者：宋宇轩李坤泽臧贺荆欣范小雪邹培缘陈大福付中民郭睿福建农林大学蜂学与生物医药学院福州350002 天然生物毒素国家地方联合工程实验室福州350002 福建省蜂疗研究所福州350002

【目的】通过纳米孔(nanopore)测序技术组装和注释中华蜜蜂Apis cerana cerana工蜂幼虫肠道高质量全长转录组。【方法】采用Nanopore PromethION系统对蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis接种的中华蜜蜂工蜂3日龄幼虫后的4, 5和6日龄幼虫肠道(... 详细信息

【目的】通过纳米孔(nanopore)测序技术组装和注释中华蜜蜂Apis cerana cerana工蜂幼虫肠道高质量全长转录组。【方法】采用Nanopore PromethION系统对蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis接种的中华蜜蜂工蜂3日龄幼虫后的4, 5和6日龄幼虫肠道(分别为AcT4, AcT5和AcT6)进行转录组测序,鉴定全长转录本序列;将前期未接种蜜蜂球囊菌中华蜜蜂工蜂4, 5和6日龄幼虫肠道转录组纳米孔测序数据中鉴定到的全长转录本与上述鉴定到的全长转录本混合后滤除冗余全长转录本;将鉴定到的非冗余全长转录本比对Nr, KOG, eggNOG和GO数据库进行注释。采用CPC, CNCI, CPAT和Pfam 4种方法预测长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)。【结果】AcT4, AcT5和AcT6分别测得14 474 634, 10 461 827和11 890 978条原始读段(raw reads),分别包含11 898 582, 8 630 186和9 091 035条全长转录本,去冗余后分别鉴定到27 815, 21 781和20 004条非冗余全长转录本,N50长度分别为1 900, 1 961和2 294 bp,平均长度分别为1 534, 1 584和1 792 bp,最长读段长度分别为10 855, 10 837和10 887 bp。鉴定到40 562条去非冗余全长转录本,分别有35 415, 24 646, 34 054和23 053条转录本可分别注释到Nr, KOG, eggNOG和GO数据库。在Nr数据库中注释全长转录本数目和占比最高的物种是东方蜜蜂***(20 310条,57.35%),其次为西方蜜蜂***(4 686条转录本,占13.23%)、大蜜蜂***(2 536条转录本,占7.16%)和小蜜蜂***(2 079条转录本,占5.87%)。非冗余全长转录本可注释到eggNOG数据库中的未知功能及翻译后修饰、蛋白质更新和分子伴侣等25个功能分类、KOG数据库中的仅一般功能预测和信号转导机制等25个功能分类、GO数据库中生物学进程、细胞组分和分子功能三大类中的50个功能条目以及KEGG数据库中核糖体和RNA转运等196条通路。共鉴定到2 301条高可信度lncRNA,涉及正义链lncRNA、反义链lncRNA、内含子lncRNA和基因间区lncRNA 4种类型。【结论】成功构建和注释了中华蜜蜂工蜂幼虫肠道的首个全长转录组,为中华蜜蜂和东方蜜蜂***其他亚种的分子生物学及组学研究提供了高质量参考背景和关键基础。

关键词：东方蜜蜂中华蜜蜂蜜蜂球囊菌肠道全长转录组长链非编码RNA 第三代测序技术纳米孔测序

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Dolphin swarm algorithm

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Frontiers of Information Technology & Electronic Engineering 2016年第8期17卷 717-729页

作者： Tian-qi WU min YAO Jian-hua YANG School of Computer Science and Technology Zhejiang University Hangzhou 310027 China

By adopting the distributed problem-solving strategy, swarm intelligence algorithms have been successfully applied to many optimization problems that are difficult to deal with using traditional methods. At present, there are many well-implemented algorithms, such as particle swarm optimization, genetic algorithm, artificial bee colony algorithm, and ant colony optimization. These algorithms have already shown favorable performances. However, with the objects becoming increasingly complex, it is becoming gradually more difficult for these algorithms to meet human＇s demand in terms of accuracy and time. Designing a new algorithm to seek better solutions for optimization problems is becoming increasingly essential. Dolphins have many noteworthy biological characteristics and living habits such as echolocation, information exchanges, cooperation, and division of labor. Combining these biological characteristics and living habits with swarm intelligence and bringing them into optimization problems, we propose a brand new algorithm named the ‘dolphin swarm algorithm＇ in this paper. We also provide the definitions of the algorithm and specific descriptions of the four pivotal phases in the algorithm, which are the search phase, call phase, reception phase, and predation phase. Ten benchmark functions with different properties are tested using the dolphin swarm algorithm, particle swarm optimization, genetic algorithm, and artificial bee colony algorithm. The convergence rates and benchmark function results of these four algorithms are compared to testify the effect of the dolphin swarm algorithm. The results show that in most cases, the dolphin swarm algorithm performs better. The dolphin swarm algorithm possesses some great features, such as first-slow-then-fast convergence, periodic convergence, local-optimum-free, and no specific demand on benchmark functions. Moreover, the dolphin swarm algorithm is particularly appropriate to optimization problems, with more calls of

关键词： Swarm intelligence Bio-inspired algorithm Dolphin Optimization

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