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苏云金芽胞杆菌cry1A启动子上游区缺失体的研究

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生物技术 2000年第4期10卷 3-9页

作者：程萍 arthur i.aronson 喻子牛华中农业大学微生物科学技术系农业部农业微生物重点实验室，湖北武汉 430070 普度大学生物科学系，美国印第安纳州 West Lafayette 47907 珠海市农业科学研究中心，519070

利用PCR方法 ,设计相应的扩增引物 ,以pHT/ 2 72up -pSGMU质粒DNA为模板 ,扩增得到缺失相应序列的上游片段 ,然后将其连接到pHT -pSGMU穿梭载体的Bti启动子前 ,再将这些缺失部分cry1A上游区的重组质粒转入苏云金杆菌中 ,观察它们对Bti -... 详细信息

利用PCR方法 ,设计相应的扩增引物 ,以pHT/ 2 72up -pSGMU质粒DNA为模板 ,扩增得到缺失相应序列的上游片段 ,然后将其连接到pHT -pSGMU穿梭载体的Bti启动子前 ,再将这些缺失部分cry1A上游区的重组质粒转入苏云金杆菌中 ,观察它们对Bti -lacZ融合基因表达的影响。结果表明 ,缺失反向重复区 ,保留弯曲区 (PCRA) ,对Bti-lacZ融合基因在库斯塔克亚种菌株 80 - 2 1中的表达与完整上游区的增强作用相一致 ,而在鲇泽亚种中 ,Bti -lacZ基因表达量明显比未缺失体低。这一结果也证明cry1A上游弯曲区在转录调控上的重要作用。

关键词：苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白基因启动子上游

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苏云金芽孢杆菌的特异性结合蛋白研究

微生物学杂志 2004年第1期24卷 14-18页

作者：程萍 arthur i.aronson 喻子牛珠海市农业科学研究中心广东珠海519070 美国Purdue大学生物系 LaffeyeteIndianaUSA 华中农业大学微生物科学技术系农业部农业微生物重点实验室湖北武汉430070

用3 2 P分别标记 3 0 8bpcry1A上游和 65 0bpcry1C上游片段 ,并将标记后的DNA与不同苏云金芽孢杆菌菌株的细胞粗蛋白进行凝胶阻滞反应。结果表明 ,cry1A和cry1C上游均能被苏云金芽孢杆菌库斯塔克亚种 (Bacillusthuringinensis subsp .ku... 详细信息

用3 2 P分别标记 3 0 8bpcry1A上游和 65 0bpcry1C上游片段 ,并将标记后的DNA与不同苏云金芽孢杆菌菌株的细胞粗蛋白进行凝胶阻滞反应。结果表明 ,cry1A和cry1C上游均能被苏云金芽孢杆菌库斯塔克亚种 (Bacillusthuringinensis subsp .kurstaki)的细胞粗蛋白特异性结合 ,而同一cry1基因上游序列可被不同多肽特异或非特异性竞争结合 ,不同的cry1基因上游序列也能同时被一种蛋白结合。说明苏云金芽孢杆菌某些特异细胞蛋白参与了cry1基因上游序列的转录调控作用 ,而不同的调节因子可能会竞争同一结合位点。库斯塔克亚种和鲇泽亚种 (B .thuringinensis subsp .aizawai)所含特异细胞蛋白在种类和作用上都有差异。

关键词：苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白基因启动予上游序列结合蛋白凝胶阻滞反应生物杀虫剂

碳源对苏云金芽胞杆菌融合基因cry1D-lacZ表达的影响

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遗传 2002年第3期24卷 301-304页

作者：张利莉 aronson i.arthur 喻子牛华中农业大学农业部农业微生物重点实验室美国Purdue大学生物系 in47906

本研究检测了在不同遗传背景的苏云金芽胞杆菌菌株中不同碳源对杀虫晶体蛋白cry1D -lacZ融合基因表达的影响。研究表明 ,cry1D -lacZ在同一菌株中的表达因碳源不同而异 ,在碳源相同的条件下不同菌株的表达也不相同 ,而衍生菌株HD - 133... 详细信息

本研究检测了在不同遗传背景的苏云金芽胞杆菌菌株中不同碳源对杀虫晶体蛋白cry1D -lacZ融合基因表达的影响。研究表明 ,cry1D -lacZ在同一菌株中的表达因碳源不同而异 ,在碳源相同的条件下不同菌株的表达也不相同 ,而衍生菌株HD - 133- 5的代谢途径非常特殊。琥珀酸钠作碳源时导致芽胞形成提前 ,cry1D -lacZ融合基因表达也随之提前。而以乙酸钠作碳源时 ,在不同亚种的菌株中都能高水平、持续稳定地表达。

关键词：碳源苏云金芽胞杆菌融合基因 cry1D-lacZ 表达

苏云金芽胞杆菌鲇泽亚种HD-133 cry1D的表达调控

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微生物学报 2002年第6期42卷 662-669页

作者：张利莉 arthur aronson 喻子牛华中农业大学农业部农业微生物重点实验室微生物农药国家工程研究中心美国Purdue大学生物系 in47906

利用PCR扩增基因cry1D启动子及上游区片段 ,在测序的基础上构建含cry1D lacZ融合基因穿梭质粒 ,导入不同遗传背景的苏云金芽胞杆菌菌株中 ,并以cry1Ab lacZ融合基因为对照测定 β 半乳糖苷酶活性 ,检测启动子上游区的作用。结果表明 ,cr... 详细信息

利用PCR扩增基因cry1D启动子及上游区片段 ,在测序的基础上构建含cry1D lacZ融合基因穿梭质粒 ,导入不同遗传背景的苏云金芽胞杆菌菌株中 ,并以cry1Ab lacZ融合基因为对照测定 β 半乳糖苷酶活性 ,检测启动子上游区的作用。结果表明 ,cry1D lacZ和cry1Ab lacZ融合基因在不同遗传背景的菌株中表达完全不同 ,也许一些宿主专一性的因子参与了转录调控 ;而在同一菌株中Ccry1D lacZ和cry1Ab lacZ的表达差异是由于上游区的不同以及竞争有限的σ因子所致。利用PCR定点诱变技术突变其SD序列GGGGA为GGAGG后 ,cry1D lacZ融合基因的表达提高了 1 0～ 1 6倍。表明GGAGG是苏云金芽胞杆菌合适的SD序列。

关键词：苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白基因表达调控鲇泽亚种

苏云金芽胞杆菌鲇泽亚种HD-133 cry1D和cry1 Ab mRNA含量及稳定性研究

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微生物学报 2002年第3期42卷 335-340页

作者：张利莉 arthur aronson 喻子牛华中农业大学农业部农业微生物重点实验室美国Purdue大学生物系 in47906

苏云金芽胞杆菌鲇泽亚种菌株HD 1 3 3含有代表性的三种cry1类基因cry1Ab,cry1C和cry1D ,它们的表达量却明显不同。通过Northern杂交检测了菌株HD 1 3 3中基因cry1D和cry1Ab的mRNA含量及其稳定性。结果表明 :基因cry1DmRNA的形成比基因cr... 详细信息

苏云金芽胞杆菌鲇泽亚种菌株HD 1 3 3含有代表性的三种cry1类基因cry1Ab,cry1C和cry1D ,它们的表达量却明显不同。通过Northern杂交检测了菌株HD 1 3 3中基因cry1D和cry1Ab的mRNA含量及其稳定性。结果表明 :基因cry1DmRNA的形成比基因cry1Ab的mR NA滞后 3h ,且基因cry1D形成mRNA的量很低 ,产生过程很平稳 ,在芽胞形成中期比cry1AbmRNA低 3 7倍 ;cry1AbmRNA含量在芽胞形成前期高于后期 ,在后期仍能大量持续稳定地转录。cry1DmRNA的半衰期为 1 8min,而cry1AbmRNA的半衰期为 1 4min。尽管cry1DmRNA比cry1AbmRNA的半衰期更长。

关键词：苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白基因 mRNA含量 mRNA稳定性

初始碳源对苏云金芽孢杆菌cry—lacZ融合基因表达的影响

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微生物学杂志 2001年第1期21卷 7-9,12页

作者：程萍 aronson arthur i 喻子牛华中农业大学微生物科学技术系

分别采用携带cry1A上游区、突变或缺失上游区的重组穿棱载体pHT/pSGMU-P,电转化到苏云金芽孢杆菌不同菌株中,并经含不同初始碳源的Gtris培养基培养,检测Bti-lacZ融合基因的表达.结果表明,各种转化子的β-半乳糖苷酶活性随着培养基中初... 详细信息

分别采用携带cry1A上游区、突变或缺失上游区的重组穿棱载体pHT/pSGMU-P,电转化到苏云金芽孢杆菌不同菌株中,并经含不同初始碳源的Gtris培养基培养,检测Bti-lacZ融合基因的表达.结果表明,各种转化子的β-半乳糖苷酶活性随着培养基中初始碳源的不同而异,在以丙酮酸钠为初始碳源的培养基中,Bti-lacZ的表达量最高,以葡萄糖为初始碳源的次之,在琥珀酸钠中最低,说明cry基因的表达与初始碳源的种类和细胞的代谢有关.

关键词：苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白基因表达初始碳源 β-关乳糖苷酶活性

Survivorship characteristics and adaptive mechanisms of phytoplankton assemblages in ballast water

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Journal of Oceanology and Limnology 2019年第2期37卷 580-588页

作者： WU Huixian SHEN Chen WANG Qiong Richard B. aronson CHEN Chen XUE Junzeng College of Marine Ecology and Environment Shanghai Ocean University Shanghai 201306 China Ballast Water Detecting Lab Shanghai Ocean University Shanghai 201306 China Department of Biological Sciences Florida Institute of Technology Melbourne Florida 32901 USA

Phytoplankton diversity and abundance were determined in ballast water from 26 vessels in the Shanghai Yangshan Deep-Water Port from April 2015 to January 2016. in total, 84 species of phytoplankton were identified, belonging to 43 genera and 5 phyla. Bacillariophyta (75.0%, including 30 genera and 63 species) were the dominant algae in the ballast water. Their density ranged from (5.55±9.62) SD to (1.878±0.872)×10 3 cells/L, with a mean of 410.1 cells/L. Nine potentially harmful phytoplankton taxa were detected: Ceratium furca , Ce . marcroceros , Leptocylindrus danicus , Coscinodiscus radiatus , Co . granii , Prorocentrum micans , Melosira sulcata , Meuniera membranacea and Skeletonema costatum . Our survey and identification results showed that Microcystis aeruginosa , Ankistrodesmus falcatus and Scenedesmus survived in the high-salinity ballast water, even though they are freshwater species. We identified the common features of surviving phytoplankton and impacts on the phytoplankton assemblage of ballast water age and source. Our goal was to understand the adaptative mechanisms of phytoplankton in ballast water, providing statistical and theoretical support for future ballast water research and suggesting a scientific basis of ballast water management and inspection of vessels entering the port.

关键词： diversity abundances Yangshan Port dominant algae ballast water age source

Community structure of benthic macroinvertebrates in reclaimed and natural tidal flats of the Yangtze River estuary

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Aquaculture and Fisheries 2019年第5期4卷 205-213页

作者： Junzeng Xue Jiqiang Yang Qiong Wang Richard B.aronson Huixian Wu Ballast Water Detecting Laboratory Shanghai Ocean UniversityShanghai201306China Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources Shanghai Ocean UniversityMinistry of EducationShanghai201306China Department of Ocean Engineering and Marine Sciences Florida Institute of TechnologyMelbourneFL32901USA

Previous studies have found differences between communities of benthic macroinvertebrates living in constructed tidal flats compared with natural *** analyzed the distributional characteristics of benthic macroinvertebrates in a blowing sand reclamation area(Area A),a dike-building silting area(Area B),an out-ofsiltation area(Area C),and a natural tidal flat(Area D)in order to characterize the community structure and diversity of benthic macroinvertebrates in a human-disturbed estuarine tidal-flat wetland.A total of 32 benthic macroinvertebrate species were identified(Area A=7;Area B=12;Area C=10;Area D=27).The diversity index was variable where:Area Bigher average annual abundance of benthic macroinvertebrates was found at Area B(840.43±569.23)ind/m^(2) than in Area D(203.00±5.85)ind/m^(2),Area A(42.87±10.21)ind/m^(2),and Area C(17.64±1.50)ind/m^(2).The biomass in Area C(3.18±0.39)g/m^(2) was lower than in the other ***-Way ANOVAs detected significant differences(Pin the abundance and biomass within Area B among seasons;however,there were no significant seasonal differences(P>0.05)in the abundance and biomass of Areas A,C,and *** abundance/biomass curve showed that the habitat in Areas A,B,and C could be categorized as moderately disturbed,whereas Area D was categorized as *** results of cluster analysis suggested distinct assemblages in the four sampling *** raised the altitude of tidal flats,weakening the tidal power and changing the physical and chemical parameters of the water,leading to a change in the community structure of benthic macroinvertebrates.

关键词： Reclamation area Tidal flat Benthic macroinvertebrates Community structure

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一种新型单羧酸转运体基因的分离与克隆

复旦学报（医学版） 2001年第6期28卷 469-472页

作者：葛煜强杨超翎 Peter S aronson 复旦大学附属中山医院肾内科上海200032 耶鲁大学医学院肾脏科纽黑文美国康涅狄格州06520

目的　分离、克隆编码肾脏甲酸盐 (formate)和 (或 )草酸盐 (oxalate)转运体的cDNA ,以研究Cl-在近端肾小管转运的机制。方法　根据细菌Oxlt(formate oxalate交换体 )的基因序列在哺乳动物表达序列标签 (expressse quencetag ,EST)数据... 详细信息

目的　分离、克隆编码肾脏甲酸盐 (formate)和 (或 )草酸盐 (oxalate)转运体的cDNA ,以研究Cl-在近端肾小管转运的机制。方法　根据细菌Oxlt(formate oxalate交换体 )的基因序列在哺乳动物表达序列标签 (expressse quencetag ,EST)数据库中查找与其相似的cDNA。按筛选到的cDNA设计探针 ,应用小鼠多组织杂交膜分析该基因的组织表达谱。结果　在小鼠肾cDNA文库中有一个与Oxlt极其相似的EST ,序列分析显示了其有一编码 4 2 9个氨基酸蛋白质的开放阅读框。从编码的顺序中可发现该序列与单羧酸转运家族 (monocarboxylatetransporter,MCT)极为相近 ,与小鼠MCT1的氨基酸一致性为 30 % ,与小鼠MCT2为 33% ,与大鼠MCT3为 2 9%。其中第 14～ 15 8个氨基酸中有 2 5 %与OxlT相同。Northern印迹发现 ,新的基因在小鼠肾脏中表达最多 ,肝脏和心脏中极少表达。结论　该基因是一新型的MCT家族成员 ,主要在肾脏中表达。

关键词：单羧酸转运体克隆基因分离