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利用单片段代换系定位水稻粒形QTL

中国农业科学 2006年第4期39卷 647-654页

作者：曾瑞珍 akshay talukdar 刘芳张桂权华南农业大学/广东省植物分子育种重点实验室

目的水稻谷粒形状(粒长、粒宽和长宽比)是衡量稻米外观品质的重要指标之一,为更好地开展粒形分子育种,对水稻粒形QTL进行分子定位。方法以单片段代换系(SSSL)为材料构建分离群体,利用微卫星标记对控制水稻谷粒长和谷粒宽的2个粒形QTL进... 详细信息

目的水稻谷粒形状(粒长、粒宽和长宽比)是衡量稻米外观品质的重要指标之一,为更好地开展粒形分子育种,对水稻粒形QTL进行分子定位。方法以单片段代换系(SSSL)为材料构建分离群体,利用微卫星标记对控制水稻谷粒长和谷粒宽的2个粒形QTL进行分子定位。结果粒宽QTLGw-8被定位于第8染色体长臂末端微卫星标记RM502与RM447之间,遗传距离均为0.3cM。在此基础上构建了覆盖Gw-8的物理图谱,RM502与RM447位于同一克隆AP005529,两者之间的物理距离为55.0kb。粒长QTLgl-3被定位于第3染色体着丝粒附近的微卫星标记RM6146和PSM377之间,遗传距离分别为1.5cM和11.0cM。结论利用单片段代换系能准确地定位水稻粒形QTL,这两个粒形QTL的定位为其克隆及稻米外观品质的分子育种奠定了基础。

关键词：水稻基因定位粒形单片段代换系

利用高代回交和分子标记辅助选择建立水稻单片段代换系

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Acta Genetica Sinica 2005年第8期32卷 825-831页

作者：何风华席章营曾瑞珍 akshay talukdar 张桂权华南农业大学植物分子育种广东省重点实验室广州510642

以水稻品种华粳籼74为受体,以6个水稻品种为供体,通过高代回交和微卫星标记辅助选择相结合的方法,建立了水稻的一个单片段代换系群体。该群体由86个单片段代换系组成,其中52个在BC3F2中获得,34个在BC3F3中获得。每个单片段代换系只含有... 详细信息

以水稻品种华粳籼74为受体,以6个水稻品种为供体,通过高代回交和微卫星标记辅助选择相结合的方法,建立了水稻的一个单片段代换系群体。该群体由86个单片段代换系组成,其中52个在BC3F2中获得,34个在BC3F3中获得。每个单片段代换系只含有来自一个供体的一个染色体代换片段,而遗传背景与华粳籼74相同。这些单片段代换系的代换片段分布于水稻的12条染色体,代换片段的长度为1.5～56.3cM,平均长度为23.0cM。全部代换片段在水稻基因组上的覆盖率为57.1%。

关键词：水稻微卫星标记分子标记辅助选择单片段代换系

Identification of QTLs for Plant Height and Its Components by Using Single Segment Substitution Lines in Rice (Oryza sativa)

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Rice science 2005年第3期12卷 151-156页

作者： akshay talukdar Guangdong Provincial Key Laboratory of Plant Molecular Breeding South China Agricultural University

QTLs for plant height and its components on the substituted segments of fifty-two single segment substitution lines （SSSLs） in rice were identified through t-test （P〈0.001） for comparison between each SSSL and recipient parent Huajingxian 74. On the 14 substituted segments, 24 QTLs were detected, 10 for plant height, 2 for panicle length, 4 for length of the first internode from the top, 5 for length of the second internode from the top and 3 for length of the third internode from the top, respectively. All these QTLs were distributed on nine rice chromosomes except chromosomes 5, 9 and 11. The additive effect ranged from -4.08 to 3.98 cm, and the additive effect percentages varied from -19.35% to 10.43%.

关键词： rice single segment substitution line plant height quantitative trait locus

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利用单片段代换系定位水稻抽穗期QTL

中国农业科学 2005年第8期38卷 1505-1513页

作者：何风华,席章营,曾瑞珍,akshay talukdar,张桂权华南农业大学植物分子育种广东省重点实验室华南农业大学植物分子育种广东省重点实验室华南农业大学植物分子育种广东省重点实验室华南农业大学植物分子育种广东省重点实验室华南农业大学植物分子育种广东省重点实验室广州510642 广州510642 广州510642 广州510642 广州510642

抽穗期是水稻品种的重要农艺性状之一,对抽穗期QTL进行定位并研究其遗传效应在水稻育种中是至关重要的。本研究利用以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系为试验材料,通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,对... 详细信息

抽穗期是水稻品种的重要农艺性状之一,对抽穗期QTL进行定位并研究其遗传效应在水稻育种中是至关重要的。本研究利用以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系为试验材料,通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,对代换片段上的抽穗期QTL进行了鉴定。以P≤0.001为阈值共鉴定出20个抽穗期QTL,这些QTL分布于水稻的10条染色体。QTL加性效应值为–5.9～1.1,加性效应百分率为–7.4%～1.4%。有8个QTL被定位在小于10.0cM的区段内。利用1个单片段代换系与华粳籼74杂交发展的F2群体对qHD-3-1进行了定位。在作图群体中,早抽穗和迟抽穗植株数符合3:1的分离比,早抽穗表现为显性。利用微卫星标记将qHD-3-1定位于3号染色体短臂,PSM304和RM569分别位于其两侧,遗传距离分别为2.4cM和5.1cM。

关键词：水稻单片段代换系抽穗期 QTL 基因定位

利用单片段代换系鉴定水稻株高及其构成因素的QTL

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中国水稻科学 2005年第5期19卷 387-392页

作者：何风华席章营曾瑞珍 akshay talukdar 张桂权华南农业大学植物分子育种广东省重点实验室广东广州510642

通过t测验比较了单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间的表型差异,对以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系代换片段上株高及其构成因素的QTL进行了鉴定.以P≤0.001为阈值,在14个代换片段上共鉴定出24个QTL,包括10个株高QTL、2个穗长QTL... 详细信息

通过t测验比较了单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间的表型差异,对以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系代换片段上株高及其构成因素的QTL进行了鉴定.以P≤0.001为阈值,在14个代换片段上共鉴定出24个QTL,包括10个株高QTL、2个穗长QTL、4个倒1节间长QTL、5个倒2节间长QTL、3个倒3节间长QTL,这些QTL分布于水稻的9条染色体上.QTL加性效应值为-4.08～3.98 cm,加性效应百分率为-19.35%～10.43%.

关键词：水稻单片段代换系株高数量性状座位

Identification of Multiple Alleles at the Wx Locus and Development of Single Segment Substitution Lines for the Alleles in Rice

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Rice science 2006年第1期13卷 9-14页

作者： akshay talukdar Guangdong Provincial Key Laboratory of Plant Molecular Breeding South China Agricultural University Guangzhou 510642 China

The microsatellite markers 484/485 and 484/W2R were used to identify the multiple alleles at the Wx locus in rice germplasm. Fifteen alleles were identified in 278 accessions by using microsatellite class and G-T polymorphism. Among these alleles, （CT）12-G, （CT）15-G, （CT）16-G, （CT）17-G, （CT）18-G and （CT）21-G have not been reported. Seventy-two single-segment substitution lines （SSSLs） carrying different alleles at the Wx locus were developed by using Huajingxian 74 with the （CT）11-G allele as a recipient and 20 accessions containing 12 different alleles at the Wx locus as donors. The estimated length of the substituted segments ranged from 2.2 to 77.3 cM with an average of 17.4 cM.

关键词： rice waxy gene single segment substitution line allelic variation molecular marker-assisted selection

水稻Wx复等位基因的鉴定及单片段代换系的建立

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中国水稻科学 2005年第6期19卷 495-500页

作者：曾瑞珍张泽民何风华席章营 akshay talukdar 施军琼秦利军黄朝锋张桂权南农业大学广东省植物分子育种重点实验室广东广州510642

利用微卫星标记“484/485”和“484/W2R”结合AccⅠ酶切对278份来自国内外水稻品种(系)进行了Wx座位复等位基因分析,共检测到15种等位基因,其中(CT)12G、(CT)15G、(CT)16G、(CT)17G、(CT)18G、(CT)21G为新发现的等位基因。以含不同Wx等... 详细信息

利用微卫星标记“484/485”和“484/W2R”结合AccⅠ酶切对278份来自国内外水稻品种(系)进行了Wx座位复等位基因分析,共检测到15种等位基因,其中(CT)12G、(CT)15G、(CT)16G、(CT)17G、(CT)18G、(CT)21G为新发现的等位基因。以含不同Wx等位基因的20个品种(系)为供体亲本,利用回交和微卫星标记辅助选择相结合的方法,建立了72个以Wx等位基因为(CT)11G的“华粳籼74”为受体的Wx复等位基因单片段代换系。这些单片段代换系共包含12种Wx等位基因,其代换片段长度最短为2.2cM,最长为77.3cM,平均为17.4cM。

关键词：水稻糯性基因单片段代换系

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不同Waxy基因型水稻的遗传多样性

分子植物育种 2003年第2期1卷 179-186页

作者：何风华曾瑞珍席章营 akshay talukdar 张桂权华南农业大学植物分子育种研究中心广州510642

利用均匀分布于水稻基因组的 2 38个微卫星标记对包含 15种Waxy复等位基因的 4 1个水稻品种(系 )的遗传多样性进行了分析。结果表明有 2 2 1对SSR引物在供试材料间检出多态性 ,共检出 115 6个等位基因 ,平均每个座位可检出 5 2 3个等... 详细信息

利用均匀分布于水稻基因组的 2 38个微卫星标记对包含 15种Waxy复等位基因的 4 1个水稻品种(系 )的遗传多样性进行了分析。结果表明有 2 2 1对SSR引物在供试材料间检出多态性 ,共检出 115 6个等位基因 ,平均每个座位可检出 5 2 3个等位基因 ;各个座位的多态信息量 (Polymorphisminformationcontent ,PIC值 )的变幅为 0 0 5 - 0 89,平均PIC值为 0 5 9。聚类分析结果表明 :4 1个供试品种 (系 )明显地聚为两大类群 ,分别对应于籼亚种和粳亚种 ,不同 (CT)重复次数的品种 (系 )在两大类群中有明显的分布规律 :(CT)重复次数较少 (n =8、 10、 11和 12 )的品种 (系 )只出现在籼稻类群中 ,粳稻类群的重复次数相对较多 (n =14 - 2 1) ,而 (CT) 17和 (CT) 18的品种 (系 )中既有属于籼稻类群的 ,又有属于粳稻类群的 ;Waxy基因第一内含子 5′端剪切位点上的G -T单核苷酸多态与籼粳分类没有直接联系。 4 1个品种 (系 )之间的遗传相似系数介于 0 13- 0 88之间 ,平均相似系数为 0 35。Waxy座位上丰富的等位基因 ,以及品种间较高的遗传多样性。

关键词： Waxy基因型水稻遗传多样性微卫星标记类群直链淀粉含量蜡质基因

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水稻抗白叶枯病基因的聚合育种(英文)

分子植物育种 2006年第4期4卷 493-499页

作者：巴沙拉特丁效华曾列先阿克沙张泽民曾瑞珍张桂权华南农业大学广东省植物分子育种重点实验室广州510642 广东省农科院植物保护研究所广州510642

白叶枯病是严重危害水稻生产的重要病害之一,利用聚合多个抗性基因的水稻品种是控制该病害的有效途径。本研究以携带Xa4、xa5、xa13、Xa214个抗白叶枯病基因的IRBB60与8个水稻新品系,组配8个杂交组合.应用分子标记辅助选择技术从F2和F3... 详细信息

白叶枯病是严重危害水稻生产的重要病害之一,利用聚合多个抗性基因的水稻品种是控制该病害的有效途径。本研究以携带Xa4、xa5、xa13、Xa214个抗白叶枯病基因的IRBB60与8个水稻新品系,组配8个杂交组合.应用分子标记辅助选择技术从F2和F3群体中共获得216个携带4个抗白叶枯病基因的纯合体。用华南地区的5个白叶枯病病原菌小种进行田间接种的试验表明,4个抗性基因聚合系的抗性水平高于只带1个抗性基因的近等基因系。这些聚合系可用作华南地区高抗白叶枯病水稻品种育种的亲本材料。

关键词：白叶枯病基因聚合分子标记辅助选择水稻