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Evolutionary pattern of 5'-UTR of enteroviruses and primer update for the detection of enteroviral RNA in environmental samples

引用

Asian Pacific Journal of Tropical Medicine 2012年第9期5卷 703-708页

作者： Nabil Ben Salem Abid zyed rouis Mahjoub Aouni Laboratoire des Maladies Transmissibles et Substances Biologiquement Actives LR99ES27 Faculte de Pharmacie de MonastirUniversite de MonastirAvenue Avicenne5000MonastirTunisie

Objective:To study the recombination events among enterovirus strains and the development of specific primers for the detection of enteroviruses in environmental samples.Methods: Nucleotide sequence analysis of enteroviruses deposited in the international database GenBank （www.***.nlm.***.gov/Genbank） was conducted to develop specific primers for the detection of these viruses.The specificity and sensitivity of the method were tested using coxackicvirus B3 strain Nancy,environmental isolate of human hepatitis A virus and human rotavirus strain WA.Seventy sewage samples were analyzed.Results:Enterovirus genome was detected in all positive samples.The genome of enterovirus was not detected in negative samples.The level of detection of these viruses was 102 TCID50mI..Conclusions:The development of new primers is an important issue for the detection of enteroviruses in the environment and the assessment of risk factors to human health.

关键词： Enterovirus RT-PCR Recombination Primer update

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