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树上自旋系统的快速采样算法

计算机学报 2022年第10期45卷 2093-2116页

作者：白宗磊王捍贫曹永知王璐璐北京大学计算机学院高可信软件技术教育部重点实验室北京100871 广州大学计算机科学与网络工程学院广州510006

自旋系统是统计物理学中用来描述微观粒子相互作用的重要框架,其可以描述伊辛模型,硬核模型,玻茨模型等统计物理学中的重要模型;通过求解自旋系统的配分函数可以得出物质的能量、磁矩等物理性质.作为一种重要的图模型,自旋系统在理论计... 详细信息

自旋系统是统计物理学中用来描述微观粒子相互作用的重要框架,其可以描述伊辛模型,硬核模型,玻茨模型等统计物理学中的重要模型;通过求解自旋系统的配分函数可以得出物质的能量、磁矩等物理性质.作为一种重要的图模型,自旋系统在理论计算机、人工智能、概率论等领域中被称作马尔可夫随机场而广泛应用,其可以描述着色问题、图同态问题等图论中的重要问题.对图中的点和边赋予非负权重,自旋系统可以诱导出著名的吉布斯分布;配分函数的近似计算可以归约到对应的吉布斯采样问题,通过吉布斯采样可以求解系统的相关物理性质和统计规律.作为模型的简化,树上的自旋系统受到广泛研究;本文研究树上自旋系统的采样算法,并将其推广到树宽较小的图上.我们的主要工作可以列举如下:对于无外场的伊辛模型,基于节点的两种状态的对称性,可以直接计算出任意节点对应的边缘分布,然后通过简单变量的组合来模拟吉布斯分布.类似地,着色问题和玻茨模型也可以基于状态的对称性用简单变量来模拟吉布斯分布.对于一般的自旋系统,无法保证状态的对称性,我们先递归地计算出所有节点的边缘分布,然后基于这些边缘分布进行采样,并通过简单变量的组合来模拟吉布斯分布.对于普通图,我们引入树宽的概念来度量图与树的相似性,并且基于节点间的独立性将算法推广到树宽为2的伪森林和仙人掌图中.我们的算法仅需要线性时间来得到吉布斯分布中的一个样本,在时间复杂度上优于基于马尔可夫链蒙特卡洛模拟的采样算法.

关键词：着色问题吉布斯分布伊辛模型采样算法自旋系统

Asymmetric expression of CA2 and CA13 linked to calcification in the bilateral mandibular condyles cause crossed beaks in chickens

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Journal of Integrative Agriculture 2024年第7期23卷 2379-2390页

作者： lei Shi Yanyan Sun Yunlei Li Hao Bai Jingwei Yuan Hui Ma Yuanmei Wang Panlin Wang Aixin Ni Linlin Jiang Pingzhuang Ge Shixiong Bian Yunhe zong Jinmeng Zhao Adamu MIsa Hailai HTesfay Jilan Chen State Key Laboratory of Animal Biotech Breeding/Key Laboratory of Animal(Poultry)Genetics Breeding and Reproduction of Ministry of Agriculture and Rural Affairs/Institute of Animal Sciences Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100193China College of Animal Science and Technology Hebei Agricultural UniversityBaoding 071001China Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety Ministry of Education/Institutes of Agricultural Science and Technology DevelopmentYangzhou UniversityYangzhou 225009China

Crossed beak is a complex mode of inheritance with prevalence ranging from 0.2 to 7.4% in at least 12 chicken strains *** reveal the intrinsic factors causing crossed beaks,genes expression patterns in bilateral mandibular condyle between affected and normal birds were characterized by RNA sequencing analysis in the present *** beak was induced by short length of unilateral mandibular ramus,and a total of 110differentially expressed genes were up-or down-regulated in the affected(short)mandibular condyle side as compared to the normal *** anhydrase 2(CA2)and Carbonic anhydrase 13(CA13)were enriched in the carbonate dehydratase activity,and high-expressed in mandibular condyle and osteoblasts(P<0.05).However,both were low-expressed in short mandibular condyle side of affected birds(P<0.05).The carbonate dehydratase inhibitor experiments confirmed that there is positive association between the calcification and carbonic anhydrase *** analysis with cetylpyridinium chloride showed a decrease in calcification when the cells were transfected with an anti-CA13 *** research suggested that CA2 and CA13 are down-calcified in shortside mandibular condyle,and caused mandibular ramus to grow ***2 and CA13 have the critical role in crossed beaks by regulating calcification of mandibular condyle.

关键词： chicken crossed beak carbonic anhydrase calcification CA2 CA13

The three-dimensional structure of trichosanthin refined at 2.7resolution

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Chinese Journal of Chemistry 1993年第3期11卷 280-288页

作者： XIA,zong-Xiang ZHANG,lei ZHANG,Zhi-Ming Shanghai Institute of Organic Chemistry,Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200032WU,Shen DONG,Yi-Cheng Institute of Biophysics,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101

The three-dimensional structure of trichosanthin crystallizing in space group C2 has been refined at 2.7 resolution from a previously reported starting model at 3 resolution based on a solvent flattened map and the revised primary structure consisting of 247 *** final R-factor is 19.2% with the root mean-square deviations of 0.018 from ideal bond lengths and of 2.2° from ideal bond *** molecule is composed of two domains,the large domain consisting of 181 amino-acld residues starting from N-terminus and the small domain con- sisting of the rest of the amino-acid *** molecule contains eight α-helices,five β-sheets made of sixteen β-strands,and some reverse *** is noteworthy that some of the α-helices and β-sheets show irregular hydrogen bonding *** of the thirteen residues absolutely conserved in eleven ribosome-inactivating proteins are located in a cleft near the interface of the two domains and they are likely to be active *** additional conservative residues located in the cleft region might make some functional contribution as well.

关键词： show The three-dimensional structure of trichosanthin refined at 2.7resolution

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基于先验知识的里程碑事件时间识别方法

计算机工程与设计 2019年第6期40卷 1696-1700,1733页

作者：吕宗磊姬婷婷中国民航大学中国民航信息技术科研基地天津300300 中国民航大学计算机科学与技术学院天津300300

传统手写数字识别方法在实际应用中没有使用上下文信息,针对机场里程碑事件中的手写数字识别问题,提出基于先验知识的里程碑事件时间识别方法。在传统概率神经网络的基础上加入筛选层,删除不符合时间数据特点的结果,利用机场里程碑事件... 详细信息

传统手写数字识别方法在实际应用中没有使用上下文信息,针对机场里程碑事件中的手写数字识别问题,提出基于先验知识的里程碑事件时间识别方法。在传统概率神经网络的基础上加入筛选层,删除不符合时间数据特点的结果,利用机场里程碑事件发生时间的先验知识对识别结果进行选择。在真实的里程碑事件发生时间的识别实验中,所提方法对手写体数字的识别正确率可以达到99%,而BP神经网络对手写体数字的识别正确率仅94.5%,实验验证了所提方法的有效性。

关键词：手写数字识别神经网络先验知识机场里程碑事件概率神经网络

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交直交机车谐波特性及其诱发过电压的治理

铁道学报 2015年第10期37卷 26-34页

作者：李宗垒刘明光屈志坚王海姣国网山东省电力公司威海供电公司山东威海264200 北京交通大学电气工程学院北京100044 华东交通大学电气工程学院江西南昌330013

针对现代铁路大量采用交直交电力机车后,在牵引供电系统中频繁出现的设备绝缘击穿、避雷器爆炸、变电所跳闸、牵引网接触线烧损等问题,利用电磁暂态仿真软件PSCAD/EMTDC建立分布参数的牵引网模型和变流器-电机联合控制的电力机车模型,... 详细信息

针对现代铁路大量采用交直交电力机车后,在牵引供电系统中频繁出现的设备绝缘击穿、避雷器爆炸、变电所跳闸、牵引网接触线烧损等问题,利用电磁暂态仿真软件PSCAD/EMTDC建立分布参数的牵引网模型和变流器-电机联合控制的电力机车模型,研究分析牵引网长度、机车位置与不同谐波阻抗测量点阻频特性的关系;牵引功率和牵引网电压对交直交电力机车谐波特性的影响。基于以上两点总结谐振过电压的分布特点,利用GA算法优化高通滤波器的参数并仿真分析不同安装位置时的谐波电压分布情况,得出在变电所出线安装可使电压畸变率降为0.35%,满足公用电网电能质量3%的指标,且有充足的安全裕量。

关键词：交直交电力机车谐波特性牵引网谐振过电压高通电力滤波器

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重视乙型肝炎相关肝硬化的抗病毒治疗

胃肠病学 2009年第7期14卷 385-387页

作者：陆伦根宗蕾上海交通大学附属第一人民医院消化内科 200080

全世界每年有100万乙型肝炎病毒感染者死于其相关的肝硬化和肝癌,慢性乙型肝炎患者5年内有6%～20%进展至肝硬化,慢性乙型肝炎肝硬化的发生率、病情进展以及预后与血清HBV DNA水平密切相关,因此,对乙型肝炎相关肝硬化抗病毒治疗非常重要... 详细信息

全世界每年有100万乙型肝炎病毒感染者死于其相关的肝硬化和肝癌,慢性乙型肝炎患者5年内有6%～20%进展至肝硬化,慢性乙型肝炎肝硬化的发生率、病情进展以及预后与血清HBV DNA水平密切相关,因此,对乙型肝炎相关肝硬化抗病毒治疗非常重要,需要引起足够的重视。

关键词：慢性乙型肝炎肝硬化抗病毒药耐药性

Combined serum hepatoma-specific alpha-fetoprotein and circulating alpha-fetoprotein-mRNA in diagnosis of hepatocellular carcinoma

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Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International 2006年第4期5卷 538-544页

作者： Wei Wu, Deng-Fu Yao, Yong-Mei Yuan, Ji-Wei Fan, Xiu-Feng Lu, Xiao-Hua Li, Li-Wei Qiu, lei zong and Xin-Hua Wu Research Center of Clinical Molecular Biology, Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong 226001, China Research Center of Clinical Molecular Biology Affiliated Hospital of Nantong University Nantong 226001 China.

BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common malignant tumors worldwide, its prognosis is poor, and early detection is of utmost importance. Although alpha-fetoprotein (AFP) is a useful marker for detecting and monitoring HCC development, the false-negative or false-positive rates with AFP alone may be as high as 30%-40% for patients with small HCCs. To enhance the specificity and accuracy of AFP measurements for HCC, we analyzed AFP expression states in livers, detected the hepatoma-specific AFP (HS-AFP) fraction and AFP-mRNA from peripheral blood mononuclear cells, and explored their clinical implications for HCC diagnosis. METHODS: AFP expression and hepatocyte distributions in liver specimens were investigated by an immunohistoche- mical assay. Total RNAs were extracted from circulating blood, synthesized to cDNA through random primers and reverse transcriptase, and fragments of the AFP gene were amplified by a nested-PCR assay. The HS-AFP fraction was separated by lectin-affinity chromatography and its level was detected by radioimmunoassay. RESULTS: The incidence of AFP was 73.3% in HCC tissues and its expression in HCCs with moderate or low differentiation was significantly stronger than that of HCCs with high differentiation (P<0.05). The incidence of AFP gene fragments was 100% in HCCs, and 60% in paracancerous tissues (P<0.01). In the HCC and liver cirrhosis groups, the incidence of HS-AFP was 91.7% and 18% (P<0.01), and of AFP-mRNA was 56.7% and 16% (P<0.01), respectively, and neither was found in ***-AFP or AFP-mRNA was not significantly related to size or number of HCC, but to its differentiation, metastasis, and relapse (P<0.05). CONCLUSIONS: Different AFP expression is present in different parts of HCC tissues. HS-AFP and AFP-mRNA fragments improve sensitivity and specificity, and both are useful markers to diagnose HCC or monitor metastasis and relapse.

关键词： carcinoma, hepatocellular hepatoma-specific AFP AFP-mRNA affinity chromatography immunohistochemistry RT-PCR

伊伐布雷定治疗低血压状态射血分数降低的心力衰竭患者的疗效和安全性

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中国新药与临床杂志 2022年第1期41卷 47-51页

作者：王丹李馨秦宗磊重庆市红十字会医院心血管内科重庆400020

目的探讨伊伐布雷定治疗低血压状态射血分数降低的心力衰竭(HFrEF)患者的疗效及安全性。方法采用开放、前瞻性队列研究,纳入126例低血压状态HFrEF患者,根据是否使用伊伐布雷定分为常规治疗组(n=73)和伊伐布雷定组(n=53),共治疗180 d。... 详细信息

目的探讨伊伐布雷定治疗低血压状态射血分数降低的心力衰竭(HFrEF)患者的疗效及安全性。方法采用开放、前瞻性队列研究,纳入126例低血压状态HFrEF患者,根据是否使用伊伐布雷定分为常规治疗组(n=73)和伊伐布雷定组(n=53),共治疗180 d。主要终点为患者因心脏疾病住院或再发心力衰竭等心血管事件的累积发生率,次要终点包括6 min步行试验(6MWT)距离、氨基末端脑钠肽前体(NT-proBNP)水平和心功能改变。采用明尼苏达州心力衰竭生活问卷(MLWHFQ)评估患者生活质量,并记录安全性终点事件。结果治疗180 d后,伊伐布雷定组心血管事件的累积发生率较常规治疗组下降(9%vs.25%,P0.05)。结论伊伐布雷定能够减少低血压状态HFrEF患者心血管终点事件发生率,提高患者心功能,改善生活质量,且安全性较高。

关键词：伊伐布雷定心力衰竭生活质量低血压

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排水泵站类型的选择及应用探讨

中国给水排水 2016年第12期32卷 38-40页

作者：张建良陆宗雷广州市市政工程设计研究总院广东广州510060 格兰富水泵<上海>有限公司上海200336

传统类型钢筋混凝土结构泵站在应用中存在占地多、工期长的不利因素,近年来由于在市区内征地困难,使其应用受到一定限制。随着水泵及控制系统的技术进步和相应规范标准的完善,一体化预制泵站、闸门泵站等新的泵站形式凭借"占地少、工期... 详细信息

传统类型钢筋混凝土结构泵站在应用中存在占地多、工期长的不利因素,近年来由于在市区内征地困难,使其应用受到一定限制。随着水泵及控制系统的技术进步和相应规范标准的完善,一体化预制泵站、闸门泵站等新的泵站形式凭借"占地少、工期短"的技术优势在国内逐步取得应用。结合工程实施运行经验及规范编制研究,介绍了一体化泵站在国内的一些应用,并针对存在的问题提出建议。

关键词：传统钢筋混凝土结构泵站一体化预制泵站闸门泵站