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疫情常态化防控期间不规律随访对肾移植术后BK病毒再激活时的病毒载量及受者预后影响

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器官移植 2024年第3期15卷 429-434页

作者：吴周庭王於尘曾文利夏仁飞邓文锋徐健苗芸南方医科大学南方医院器官移植科广州510515

目的探讨在新型冠状病毒肺炎疫情常态化防控期间不规律随访对肾移植受者术后BK病毒(BKV)再激活情况及预后的影响。方法回顾性分析363例肾移植受者的临床资料,按随访时间分为疫情前随访组与疫情期间随访组,随访期限为1年。比较疫情前随... 详细信息

目的探讨在新型冠状病毒肺炎疫情常态化防控期间不规律随访对肾移植受者术后BK病毒(BKV)再激活情况及预后的影响。方法回顾性分析363例肾移植受者的临床资料,按随访时间分为疫情前随访组与疫情期间随访组,随访期限为1年。比较疫情前随访组和疫情期间随访组的随访时间间隔,分析两组BKV感染情况,分析BKV感染进程与移植肾功能的相关性。结果疫情前随访共计1790例次,疫情期间随访共计2680例次。与疫情期间随访组比较,疫情前随访组术后3个月内、3~6个月、7~12个月的随访时间间隔较短,差异均有统计学意义(均为P0.05)。疫情前随访组术后首次检出BKV尿症时间长于疫情期间随访组,首次再激活尿BKV载量小于疫情期间随访组,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。首次再激活尿BKV载量与尿BKV载量峰值,BKV再激活后第1、3个月血清肌酐与基线血清肌酐差值呈正相关(均为P<0.05)。结论肾移植术后不规律随访可导致BKV再激活时间提前、首次尿BKV载量检出值更高,以及延迟诊断和干预,并造成不良预后。亟待建立远程随访体系以满足发生公共卫生事件时肾移植受者的随访需求。

关键词：肾移植 BK病毒术后随访新型冠状病毒疫情常态化 BK病毒血症 BK病毒尿症 BK病毒相关肾病

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Chinese Named Entity Recognition with Character-Level BLSTM and Soft Attention Model

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Journal of Beijing Institute of Technology 2020年第1期29卷 60-71页

作者： Jize Yin Senlin Luo zhouting wu Limin Pan Information System and Security&Countermeasures Experimental Center Beijing Institute of TechnologyBeijing 100081China

Unlike named entity recognition(NER)for English,the absence of word boundaries reduces the final accuracy for Chinese *** avoid accumulated error introduced by word segmentation,a deep model extracting character-level features is carefully built and becomes a basis for a new Chinese NER method,which is proposed in this *** method converts the raw text to a character vector sequence,extracts global text features with a bidirectional long short-term memory and extracts local text features with a soft attention model.A linear chain conditional random field is also used to label all the characters with the help of the global and local text *** based on the Microsoft Research Asia(MSRA)dataset are designed and *** show that the proposed method has good performance compared to other methods,which proves that the global and local text features extracted have a positive influence on Chinese *** more variety in the test domains,a resume dataset from Sina Finance is also used to prove the effectiveness of the proposed method.

关键词： Chinese named entity recognition(NER) character-level bidirectional long short-term memory soft attention model

Pan-cancer analysis of RNA 5-methylcytosine reader (ALYREF)

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Oncology Research 2024年第3期32卷 503-515页

作者： XING YE zhouting TUO KAI CHEN RUICHENG wu JIE WANG QINGXIN YU LUXIA YE AKIRA MIYAMOTO KOO HAN YOO CHI ZHANG wuRAN WEI DENGXIONG LI DECHAO FENG Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute Department of MedicineDepartment of Biomedical SciencesCedars-Sinai Medical CenterLos AngelesCA90048USA Department of Urology The Second Afiliated Hospital of Anhui Medical UniversityHefei230601China Department of Urology Institute of UrologyWest China HospitalSichuan UniversityChengdu610041China Department of Pathology Ningbo Diagnostic Pathology Center Ningbo315021China Department of Public Research Platfom Taizhou Hospital of Zhejiang Province Afliated to Wenzhou Medical UniversityLinhai317000China Department of Rehabilitation West Kyushu UniversityKanzaki shi842-8585Japan Department of Urology Kyung Hee UniversitySeoul446701South Korea Department of Rehabilitation The Afliated Hospital of Southwest Medical UniversityLuwzhou646000China

The incre asing interest in RNA modifications has signifcantly advanced epigenomic and epitranscriptomic *** study focuses on the immuno oncological impact of ALYREF in human cancer through a pan-cancer analysis,enhancing understanding of this gene's role in *** observed differential ALYREF expression between tumor and normal samples,correl ating strongly with prognosis in various cancers,particularly kidney renal papillary cell carcinoma(KIRP)and liver hepatocellular carcinoma(LIHC).ALYREF showed a negative correlation with most tumor-infitrating cells in lung squamous cell carcinoma(LUSC)and lymphoid neoplasm difuse large B-cell lymphoma(DLBC),while positive correlations were noted in IIHC,kidney chromophobe(KICH),mesothelioma(MESO),KIRP,pheochromocytoma and paraganglioma(PARD),and glioma(GBMLGG).Aditionally,ALYREF expression was closely associated with tumor heterogeneity,stemness indices,and a high mutation rate in TP53 across these *** conclusion,ALYREF may serve as an oncogenic biomarker in numerous cancers,meriting further research attention.

关键词： Pan-cancer RNA 5-methylcytosine ALYREF Immwno-oncological efects

Unraveling links between aging,circadian rhythm and cancer:Insights from evidence-based analysis

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Chinese Journal of Cancer Research 2024年第3期36卷 341-350页

作者： Dechao Feng Yuhan Xiao Jie Wang Ruicheng wu zhouting Tuo Koo Han Yoo wuran Wei Dilinaer wusiman Zhipeng Wang Dengxiong Li Yubo Yang William C.Cho Mang Ke Department of Urology Institute of UrologyWest China HospitalSichuan UniversityChengdu 610041China Division of Surgery&Interventional Science University College LondonLondon W1W 7TSUK Department of Urology Taizhou Hospital of Zhejiang Province Affiliated to Wenzhou Medical UniversityTaizhou 317000China Department of Urology the Second Affiliated Hospital of Anhui Medical UniversityHefei 230601China Department of Urology Kyung Hee UniversitySeoul 130-701South Korea Department of Comparative Pathobiology College of Veterinary MedicinePurdue UniversityWest LafayetteIN47907USA Purdue Institute for Cancer Research Purdue UniversityWest LafayetteIN 47907USA Department of Urology Sichuan Provincial People’s HospitalUniversity of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 610072China Department of Urology Three Gorges HospitalChongqing UniversityChongqing 404000China Department of Clinical Oncology Queen Elizabeth HospitalHong Kong SARChina

Aging and circadian rhythms have been connected for decades,but their molecular interaction has remained unknown,especially for *** this situation,we summarized the current research actuality and problems in this field using the bibliometric *** in the PubMed and Web of Science databases were ***,there is a rising trend in the publication volume regarding aging and circadian rhythms in the field of *** from USA,Germany,Italy,China and England have greater studies than *** three publication institutions are University of California System,UDICE-French Research Universities and University of Texas *** research hotspots include oxidative stress,breast cancer,melatonin,cell cycle,calorie restriction,prostate cancer and NF-κ*** conclusion,results generated by bibliometric analysis indicate that many approaches involve in the complex interactions between aging and circadian rhythm in *** established and emerging research directions guide our exploration of the regulatory mechanisms of aging and circadian rhythms in cancer and provide a reference for developing new research avenues.

关键词： Aging circadian rhythm human cancer bibliometric analysis oxidative stress

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基于随机掩码和对抗训练的文本隐私保护实验

实验技术与管理 2023年第8期40卷 72-76页

作者：吴舟婷罗森林北京理工大学信息与电子学院北京100081

针对深度学习文本表示隐私保护面临可用性与隐私性难以平衡的问题,该文提出一种基于随机掩码和对抗训练的文本表示隐私保护算法RMAT。该算法首先对原始输入文本序列做随机掩盖,之后注入差分隐私噪声,并结合模拟攻击器与任务分类器间的... 详细信息

针对深度学习文本表示隐私保护面临可用性与隐私性难以平衡的问题,该文提出一种基于随机掩码和对抗训练的文本表示隐私保护算法RMAT。该算法首先对原始输入文本序列做随机掩盖,之后注入差分隐私噪声,并结合模拟攻击器与任务分类器间的对抗训练,实现深度学习文本表示的隐私脱敏。文章通过理论推导证明了算法满足差分隐私要求,并用5个公开数据集的实验结果验证了算法在提供完备隐私保障的同时提升了脱敏文本的可用性。通过本项实验,学生不仅对深度学习文本表示模型面临的安全风险有了更清晰的认识,还提升了利用深度学习方法分析和解决安全问题的能力。

关键词：隐私安全文本表示差分隐私对抗训练

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多标签小样本实例级注意力原型网络分类方法

北京理工大学学报 2023年第4期43卷 403-409页

作者：罗森林张睿智潘丽敏吴舟婷北京理工大学信息与电子学院北京100081

多标签分类中,一个样本可能属于多个类别,且在小样本场景下模型性能更容易受到样本中复杂语义特征的影响。然而,目前常用的原型网络方法仅使用每类支持集样本的均值作为标签原型,导致原型中存在其他类别特征带来的噪声,弱化了原型间的... 详细信息

多标签分类中,一个样本可能属于多个类别,且在小样本场景下模型性能更容易受到样本中复杂语义特征的影响。然而,目前常用的原型网络方法仅使用每类支持集样本的均值作为标签原型,导致原型中存在其他类别特征带来的噪声,弱化了原型间的差异性,影响预测效果。本文提出一种利用实例级注意力的多标签小样本原型网络分类方法,通过提高支持集中与当前标签关联度高的样本的权重,减少其他标签特征的干扰,增大标签原型之间的区分度,进而提高预测的精确率.实验表明,方法通过引入实例级注意力强化了多标签原型网络的学习能力,分类效果明显提升.

关键词：注意力机制原型网络多标签小样本学习

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结合原型网络的远程监督命名实体识别方法

北京理工大学学报 2023年第4期43卷 410-416页

作者：罗森林林朝坤潘丽敏吴舟婷北京理工大学信息与电子学院北京100081

针对利用远程监督标注文本实体过程中存在实体类别标注错误问题导致模型难以有效区分各实体的类别特征,影响模型精准度的问题,本文提出一种利用原型网络过滤训练语料中标注错误样本的远程监督命名实体识别方法,利用预训练的原型网络编... 详细信息

针对利用远程监督标注文本实体过程中存在实体类别标注错误问题导致模型难以有效区分各实体的类别特征,影响模型精准度的问题,本文提出一种利用原型网络过滤训练语料中标注错误样本的远程监督命名实体识别方法,利用预训练的原型网络编码正确标注实体生成类别原型表示,过滤语料中距类别原型较远的样本.实验表明,使用原型网络有效地提高了语料的标注质量,提升了模型性能.

关键词：命名实体识别远程监督语料自动标注原型网络正例-无标注学习

融合序列语法知识的卷积-自注意力生成式摘要方法

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北京理工大学学报 2021年第1期41卷 93-101页

作者：罗森林王睿怡吴倩潘丽敏吴舟婷北京理工大学信息与电子学院北京100081 国家计算机网络应急技术处理协调中心北京100094

针对基于编码-解码的生成式摘要模型不能充分提取语法知识导致摘要出现不符合语法规则的问题,循环神经网络易遗忘历史信息且训练时无法并行计算导致处理长文本时生成的摘要主旨不显著以及编码速度慢的问题,提出了一种融合序列语法知识... 详细信息

针对基于编码-解码的生成式摘要模型不能充分提取语法知识导致摘要出现不符合语法规则的问题,循环神经网络易遗忘历史信息且训练时无法并行计算导致处理长文本时生成的摘要主旨不显著以及编码速度慢的问题,提出了一种融合序列语法知识的卷积-自注意力生成式摘要方法.该方法对文本构建短语结构树,将语法知识序列化并嵌入到编码器中,使编码时能充分利用语法信息;使用卷积-自注意力模型替换循环神经网络进行编码,更好学习文本的全局和局部信息.在CNN/Daily Mail语料上进行实验,结果表明提出的方法优于当前先进方法,生成的摘要更符合语法规则、主旨更显著且模型的编码速度更快.

关键词：生成式摘要编码-解码模型语法分析卷积-自注意力模型注意力机制

面向信息与通信技术供应链网络画像构建的文本语义匹配方法

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北京理工大学学报 2021年第8期41卷 864-872页

作者：罗森林杨俊楠潘丽敏吴舟婷北京理工大学信息与电子学院北京100081

针对信息与通信技术(information and communication,ICT)项目及产品数据种类多、形式复杂,难以提取其语义匹配信息,且现有句子级文本匹配模型对不同长度文本无差别编码会引入噪声导致匹配效果差的问题,本文提出一种融合局部和全局特征... 详细信息

针对信息与通信技术(information and communication,ICT)项目及产品数据种类多、形式复杂,难以提取其语义匹配信息,且现有句子级文本匹配模型对不同长度文本无差别编码会引入噪声导致匹配效果差的问题,本文提出一种融合局部和全局特征的实体文档级联合匹配模型,利用TextCNN编码器提取实体级招投标项目和产品名称的局部信息,消除产品描述中与招投标项目无关信息的影响,再利用卷积-自注意力编码器提取文档级产品描述的局部和全局信息,最后结合实体级和文档级匹配信息进行决策.实验结果表明,招投标项目与供应商产品匹配映射准确率92%以上,方法可直接实际应用.

关键词：信息与通信技术供应链文本匹配卷积网络自注意力网络联合匹配模型